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《华中农业大学》 2003年
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黄鳍鲷D-loop基因序列多态性及几种鲷科鱼类的分子系统学

刘红艳  
【摘要】: 利用PCR技术扩增海南海口市、福建厦门市和广东珠海市3个地理群体海捕黄鳍鲷(Sparus latus)线粒体D-loop基因片段,测定了该基因片段580bp序列。结果发现,3个地理群体内和群体间都存在丰富的DNA序列多态性,共检测到33个多态性核苷酸位点(5.7%),24个个体具有22种单倍型(haplotype)。UPGMA法构建的分子系统树中,海南群体内所有的单倍型聚成一支,福建与广东的单倍型混杂在一起,聚成一支。从序列差异的分析中得出,海南群体与福建和广东群体的亲缘关系较远;福建群体和广东群体亲缘关系较近。 对鲷科鱼类中黄鳍鲷(S. latus)、黑鲷(S. macrocephaIus)、真鲷(Pagrosomus major)和平鲷(Rhabdosargus sarba)的线粒体DNA细胞色素b 408bp序列进行分析,并结合GeneBank中灰鳍鲷(S. berda)、黄鲷(Taius tumifrons)、犁齿鲷(Evynnis japonica)和高背四长棘鲷(Argyrops spinifer)的该区段DNA序列的比较,共发现126个核苷酸位点存在变异(30.7%)。黑鲷和灰鳍鲷亲缘关系最近,序列差异为3.8%;而黄鲷和平鲷的亲缘关系最远,序列差异为21.7%。用MEGA2.0软件中的NJ法和MP法构建分子系统树,其中黄鲷属、平鲷属和鲷属分类的结果与形态分类学的观点相吻合;而在NJ分子系统树中,犁齿鲷、真鲷和高背四长棘鲷聚成一支,在MP分子系统树中,犁齿鲷和真鲷聚成一支,这与传统分类学上把这三种鲷归为三个不同属的观点不一致。
【学位授予单位】:华中农业大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2003
【分类号】:Q959

【引证文献】
中国硕士学位论文全文数据库 前2条
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2 钱开诚;中国鸭绿江香鱼的分类地位与遗传多样性研究[D];暨南大学;2006年
【参考文献】
中国期刊全文数据库 前10条
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【共引文献】
中国期刊全文数据库 前10条
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10 单潇潇;贾守菊;石磊;;南麂野生种群等边浅蛤同工酶的生化遗传分析[A];“亚运食品安全与广东食品产业创新发展”学术研讨会暨2009年广东省食品学会年会论文集[C];2009年
中国博士学位论文全文数据库 前10条
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中国硕士学位论文全文数据库 前10条
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7 王健;文蛤线粒体基因组序列测定及进化分析[D];辽宁师范大学;2010年
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10 许志恒;紫菜中抗紫外线活性物质的提取及其性质的研究[D];中国海洋大学;2010年
【同被引文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 王莹,赵华斌,郝家胜;分子系统学的理论、方法及展望[J];安徽师范大学学报(自然科学版);2005年01期
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中国博士学位论文全文数据库 前2条
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中国硕士学位论文全文数据库 前10条
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【二级引证文献】
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中国硕士学位论文全文数据库 前8条
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中国期刊全文数据库 前10条
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【相似文献】
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中国重要会议论文全文数据库 前10条
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6 周世良;;腊梅科的分子系统学与地理学[A];中国植物学会七十周年年会论文摘要汇编(1933—2003)[C];2003年
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5 本报记者 熊燕;执著探索遗传科学之谜[N];云南日报;2006年
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9 报特约撰稿人 温瑾;学习,贯穿我人生的宝贵财富[N];中华读书报;2008年
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6 孟雷;甘草属(Glycyrrhiza L.)的系统学研究[D];中国科学院研究生院(植物研究所);2005年
7 芦荣胜;中国斑腿蝗科部分种类分子系统学研究[D];陕西师范大学;2005年
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中国硕士学位论文全文数据库 前10条
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4 逄洪波;蜡梅科植物的分子系统学研究[D];辽宁师范大学;2006年
5 朱伟铨;扬子鳄种群遗传多样性及几种鳄的分子系统学关系研究[D];南京师范大学;2002年
6 唐桂英;锥果芥属及其近缘属植物的花粉形态和分子系统学研究[D];山东师范大学;2006年
7 李伟;澳洲红千层属(Callistemon R.Br)植物的分子系统学探讨[D];西南大学;2006年
8 梁姗;两株海洋亚历山大藻的分子鉴定以及Alexandrium catenella中细胞核增殖抗原基因的克隆和分析[D];中国海洋大学;2007年
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