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《华中农业大学》 2002年
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用分子标记研究柑橘属及其近缘属植物的亲缘关系和枳的遗传多样性

庞晓明  
【摘要】: 柑橘属及其近缘属植物的亲缘关系研究 柑橘植物种类和类型繁多,但无融合生殖的广泛存在、不同的种和属之间杂交容易、无性系变异较频繁以及野生种难以寻找等因素,给柑橘植物的系统学研究带来了很大的困难,在种的划分和演化关系等方面的观点也存在着较大的分歧。本研究在国内首次用胞质基因组区特定区域的PCR-RFLP、AFLP和SSR等方法研究了29份柑橘属及近缘属生物型的亲缘关系。主要结果如下: 1.4个叶绿体区段的PCR-RFLP共得到142个酶切位点,其中52个为多态性位点,多态性比率为36.62%。两个线粒体区段的PCR-RFLP得到43个切点,枳属有3个特异位点,其他生物型之间没有差异。 2.采用7对SSR引物在29个样品中扩增得到114个等位基因,平均每个位点有16.3个等位基因,平均多态性信息含量为0.648。 3.筛选了130个EcoRI/MseI引物对,其中16对表现最好。采用6个引物对在29个生物型中共得到599条带其中571条为多态性带,79个为生物型特异性的标记。平均多态性比率为95.33%,平均多态性信息含量为0.253。 4.综合三种标记聚类的结果可得到如下一些结论: 1) 澳洲指橘与柑橘属的亲缘关系很近。哈里米与金柑属的关系较紧密,不支持其为柑橘亚属的基本种,归入金柑属可能更合适; 2) 胞质基因组的证据表明富民枳不是枳与柑橘属生物型的杂种,其很高的SSR位点的纯合频率和数目众多的特异性的AFLP标记都支持富民枳种的地位; 3) 枳与柑橘属的关系较远,枳不可能是从柑橘属衍生而来; 4) Swingle的亚属的划分以及田中的原生柑橘类和后生柑橘类的划分界线都不清晰。现代栽培柑橘的起源与大翼橙关系密切。宜昌橙是非常独特的一个生物型,将其放在后生柑橘类并不合适; 5) 柑橘属的枸橼、柚和宽皮桔都能很好地分离,支持其为现代栽培柑橘的三个基本种的观点; 6) 根据胞质基因组的差异和聚类分析的结果对一些生物型的起源进行了分析,得出如下一些结论:葡萄柚是柚与甜橙的杂种,可能是与柚的回交种;本研究所包括的两个来檬生物型,其中之一的起源与枸橼、柚和澳洲指橘有关,另一个被误认为是枸橼的来檬生物型最后被认定为墨西哥来檬,来源与大翼橙和枸橼有关;粗柠檬是枸橼与宽皮橘的杂种;红黎檬可能是宽皮橘与粗柠檬的杂种;酸橙和甜橙为柚与宽皮橘的后代。 枳资源的遗传多样性研究 我国是积的原产地,存在大量的变异类型,但还有众多变异尚未被发现和鉴定。由 于人为因素、自然灾害和病虫害等原因,大量珍贵的积资源面临流失的危险。因而加速 积资源的搜集、保存和鉴定刻不容缓。本课题组收集了13个省市的35份积资源,各资 源圃的积选系34份共69份材料建立起全国最大的积资源收集圃。测定了其中54份材 料的过氧化物酶活性,用AFLP标记分析了69份材料的遗传多样性。结果如下: l)所有的材料POD活性有显著差异,积选系的POD活性与它们的矮化能力能较 好的符合,这些数据可为矮化砧木预选提供参考。 2)对69份材料进行AFLP分析,8个Ec口Rl从介eI引物对和7个PstF入fsel引物对 分别得到193个和168个多态性标记。EcoRF卉众el引物对和Pstl从介eI引物对得 出的平均多态性比率分别为26.69%和30.21%,平均多态性信息含量分别为 0.094和0.121,标记指数分别为2.27和2.90。Pst功呛eI引物对的效率高于 EcoRU人众el引物对的效率。结合三对以上的Pstl/人fsel引物对可区分所有的样品。 3)69份材料的AFLP标记多态性比率为26.21%,远高于国外报道的美国积资源的多 态性比率10%,表明我国现存的积资源要比美国保存的资源含有更高的遗传多 样性。在所比较的五个省的材料中,湖北省和河南省的积资源多态性信息含量 和多态性比率最高,平均距离最大,表明这两个省的材料含有更多的变异。山 东、安徽和江苏三省省内和省间材料的遗传差异都很小。野外收集的积资源与 从各资源圃收集的资源包含的遗传变异有较大的差异,表明种质圃外资源还包 含较丰富的遗传多样性。 4)14个样品的形态距离和AFLP标记遗传距离存在显著正相关(厂0.82)。
【学位授予单位】:华中农业大学
【学位级别】:博士
【学位授予年份】:2002
【分类号】:S666

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【引证文献】
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5 朱新平;杜合军;郑光明;焦宗垚;陈赛;陈子安;;大口黑鲈养殖群体遗传多样性的分析[J];大连水产学院学报;2006年04期
6 侯杰;程广有;;3种药用枸杞过氧化物同工酶遗传多样性研究[J];北华大学学报(自然科学版);2006年06期
7 杨艳;韩建国;孙彦;单战;;新麦草遗传多样性等位酶分析[J];草业科学;2007年08期
8 李小白;崔海瑞;张明龙;;EST-SSRs检测油菜(Brassica napus)亲本遗传多样性[J];农业生物技术学报;2007年04期
9 赵杨;骈瑞琪;陈晓阳;王秀荣;;二色胡枝子种子储藏蛋白多样性研究[J];西北植物学报;2007年09期
10 张涛;路宏朝;曹亮;曾祯;;宁强矮马微卫星遗传多样性研究[J];湖北农业科学;2008年08期
中国重要会议论文全文数据库 前10条
1 刘彦群;秦利;李玉萍;王欢;夏润玺;齐永红;李喜升;鲁成;向仲怀;;家蚕、柞蚕和蓖麻蚕的遗传多样性与遗传结构比较(英文)[A];中国蚕学会第八届暨国家蚕桑产业技术体系家(柞)蚕遗传育种及良种繁育学术研讨会论文集[C];2011年
2 张春晓;李悦;沈熙环;陈雪梅;;油松10个天然与人工群体两个同工酶系统的遗传多样性研究[A];面向21世纪的中国生物多样性保护——第三届全国生物多样性保护与持续利用研讨会论文集[C];1998年
3 丁平;刘瑾;仰铁锤;邱金英;;巴戟天遗传多样性的RAPD研究[A];全国第8届天然药物资源学术研讨会论文集[C];2008年
4 沈镝;朱德蔚;李锡香;宋江萍;;云南芋种质资源遗传多样性的RAPD分析[A];全国蔬菜遗传育种学术讨论会论文集[C];2002年
5 郭江波;赵来喜;;中国苜蓿地方品种遗传多样性研究[A];第二届中国苜蓿发展大会暨牧草种子、机械、产品展示会论文集[C];2003年
6 祁建民;梁景霞;徐建堂;林荔辉;陶爱芬;方平平;吴建梅;;应用SRAP与ISSR分析烟草种质资源遗传多样性及遗传演化分析[A];2008中国作物学会学术年会论文摘要集[C];2008年
7 方平平;郑鹭;祁建民;林荔辉;吴建梅;陶爱芬;;蓖麻种质资源遗传多样性与亲缘关系ISSR分子标记研究[A];2008中国作物学会学术年会论文摘要集[C];2008年
8 林新春;俞志雄;裘利洪;肖国民;刘力;;濒危植物华木莲的遗传多样性研究[A];中国植物学会七十周年年会论文摘要汇编(1933—2003)[C];2003年
9 袁理春;;丽江山慈姑遗传多样性研究[A];2004年全国学术年会农业分会场论文专集[C];2004年
10 邓洁;路国辉;王英强;;黄花大苞姜的遗传多样性及遗传分化[A];广东省植物学会第十九期学术研讨会论文集[C];2010年
中国重要报纸全文数据库 前10条
1 记者 胡德荣;亚洲人群遗传多样性研究获最新成果[N];健康报;2009年
2 王小龙;科学家完成柑橘基因组测序[N];科技日报;2011年
3 胡云章;绚丽的民族文化 丰富的遗传多样性[N];大众科技报;2008年
4 本报记者 游雪晴;中国的人类遗传多样性研究成果丰硕[N];科技日报;2001年
5 记者 刘欣 陈云芬;保护和利用作物遗传多样性 控制病虫害促进可持续农业发展国际执委会会议在昆举行[N];云南日报;2007年
6 记者 耀辉;云南5成果喜获国家科技奖[N];云南经济日报;2006年
7 刘燕玲;深入研究珍稀濒危中药资源保护[N];健康报;2006年
8 李倩;我国永生细胞库初具规模[N];人民日报;2007年
9 中国科学院院士 张亚平;家养动物的起源、进化与遗传多样性[N];光明日报;2004年
10 陈云芬;云南珍稀濒危植物研究部分成果国际领先[N];云南日报;2008年
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 庞晓明;用分子标记研究柑橘属及其近缘属植物的亲缘关系和枳的遗传多样性[D];华中农业大学;2002年
2 于杰;柑橘及其近缘属植物DNA条形码研制及其物种的鉴定研究[D];西南大学;2011年
3 李小孟;柑橘及其近缘属植物的分子进化与栽培柑橘的起源研究[D];西南大学;2010年
4 蔡礼鸿;枇杷属的等位酶遗传多样性和种间关系及品种鉴定研究[D];华中农业大学;2000年
5 车永和;小麦族P基因组植物的遗传多样性与系统演化研究[D];西北农林科技大学;2004年
6 周连第;板栗种质资源遗传多样性研究[D];中国农业大学;2005年
7 邓传良;石蒜属植物系统学及长筒石蒜遗传多样性研究[D];南京林业大学;2005年
8 石胜友;变叶海棠起源及其遗传多样性分化研究[D];西南大学;2005年
9 王红霞;核桃遗传多样性分析及核心种质的构建[D];河北农业大学;2006年
10 桂富荣;紫茎泽兰的遗传多样性及其种群结构分析[D];中国农业科学院;2006年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 闫化学;柑橘及其近缘属植物DNA条形码研究[D];西南大学;2010年
2 张丽;西南山地丘陵生态区主要玉米自交系SSR遗传多样性及其与杂种优势的关系[D];四川农业大学;2003年
3 王奕华;青岛文昌鱼遗传多样性的RAPD分析[D];中国海洋大学;2003年
4 陈纹;沙棘属几个中国特有类群的遗传多样性研究[D];西北师范大学;2004年
5 文自翔;小豆种质资源遗传多样性的RAPD分析及生态类群遗传关系研究[D];新疆农业大学;2004年
6 张国强;ISSR分子标记揭示黑斑侧褶蛙中国种群的遗传结构和遗传多样性[D];南京师范大学;2005年
7 彭珺;荧光假单胞菌的分离、鉴定及遗传多样性研究[D];上海师范大学;2006年
8 张春晖;穿龙薯蓣微形态特征研究及生物多样性的RAPD分析[D];佳木斯大学;2007年
9 邱源;23个油橄榄品种的RAPD分析[D];四川农业大学;2007年
10 何玮;麻疯树遗传多样性的ISSR分析[D];四川大学;2007年
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