核rDNA ITS序列在侧耳属分子分类学上的应用

【摘要】：侧耳属是一类广为分布的且具有食(药)用价值的木腐生真菌,种类较多,分类较为混乱。本文利用PCR产物克隆测序测定了侧耳属7个种和中国各地区栽培的11个侧耳品种以及外群黑木耳的核rDNA ITS(内转录间隔区)序列,另外从GenBank获得23个侧耳种与外群亚侧耳的ITS序列。运用Bioedit与Phylip软件对所获得的ITS序列进行分析,构建了侧耳属系统发育树及我国各地区侧耳品种的亲缘关系树,获得了各供试侧耳之间的平均遗传距离,研究了供试侧耳的分类及系统亲缘关系。现将实验结果报告如下: 1.供试侧耳的ITS区(含ITS1,5.8S rDNA和ITS2)序列的长度范围为627-667bp,比对(alignment)后长度为731bp,变异位点为317个,信息位点为247个;其中,ITS1和ITS2的长度范围分别为225—266bp和228—262bp,变异位点分别为176个和139个,信息位点分别为142个和103个;5.8S rDNA长度范围为155-158bp,变异位点为4个,信息位点为2个。 2.以亚侧耳作为外群,利用MP(最大简约法)构建的系统发育树及它们之间的平均遗传距离表明:供试材料中已定种名的30个侧耳可以分为六组:第一组包括P.abieticola、P.fossulatus、刺芹侧耳、白阿魏蘑、杨侧耳、P.subarelatus、P.albitus、阿魏蘑、灰白侧耳、哥伦比亚侧耳、凤尾菇、佛罗里达侧耳和糙皮侧耳。第二组含P.australis、美味侧耳、肺形侧耳和P.oputiae。第三组含红侧耳、P.incarnatus、扇形侧耳和贝盖侧耳,它们之间具有非常近的亲缘关系。第四组含P.euosmus、黄白侧耳和金顶侧耳。第五组含囊盖侧耳、P.fusscosquamulosus、P.smithii和栎侧耳。第六组有P.javanicus与具核侧耳,这两者与其它侧耳的亲缘关系较远。其中金顶侧耳与黄白侧耳、佛罗早达侧耳与糙皮侧耳、红侧耳与P.incarnates、灰白侧耳与哥伦比亚侧耳为同一个种两个不同的名称;白阿魏蘑与刺芹侧耳和阿魏蘑有较密切的亲缘关系,但它们不是同一个种。而肺形侧耳与凤尾菇关系很远,应属于两个不同的种。 3.以黑木耳作为外群,利用MP(最大简约法)构建的亲缘关系树及它们之间的平均遗传距离表明:我国各地区主要栽培的侧耳品种按亲缘关系可分为五大组:第一组包括凤尾菇、灰白侧耳、佛罗里达侧耳、糙皮侧耳、缘刺侧耳、平802、日本秀珍和姬菇。其中糙皮侧耳与佛罗里达侧耳为同一个种,日本秀珍、缘刺侧耳及姬菇都为哥伦比亚侧耳下的栽培品种。第二组含杏孢菇、香侧耳、白阿魏蘑、刺芹侧

【关键词】：侧耳属 PCR ITS 分类 亲缘关系
【学位授予单位】：华中农业大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2005
【分类号】：Q949.32
【目录】：