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《华中农业大学》 2005年
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中国部分地方鸡种MHC B-LBⅡ、B-G基因变异及其群体遗传结构研究

徐日福  
【摘要】:鸡的主要组织相容性复合体(major histocompatibility complex,MHC)是指16号染色体上的一组紧密连锁、高度多态的基因群,位于MHC B区的基因群包括B-F(Ⅰ类)、B-L(Ⅱ类)和B-G(Ⅳ类)三个基因座,它们所编码的抗原决定着机体的主要组织相容性,其不仅与免疫应答和免疫调节密切相关,而且对许多重要经济性状也有一定影响。将MHC与分子生物学、免疫遗传学、群体遗传学等相结合研究,将成为家禽遗传育种,尤其是抗病育种领域的焦点。本研究利用生物信息学与群体遗传学、分子生物学技术相结合的方法,以12个中国地方鸡品种为实验材料,对其MHCB-G基因和B-LB Ⅱ基因的遗传变异及群体遗传结构进行研究,取得了如下结果: 1.采用RT-PCR和RACE技术,获得了鸡的MHC B-G基因的全长cDNA序列,推导出了相应的MHC型B-G抗原分子氨基酸序列,并对其抗原性进行了初步预测。 2.对中国8个地方鸡品种B-G基因第二外显子序列的遗传多态性进行研究表明,核苷酸的多态变异位点为37个,其中简约性信息位点29个,单变异位点8个;各变异位点的核苷酸变异指数为0.206-1.462;第二外显子核苷酸异义替换率为9.26±1.92%,高于同义替换率,2.34±0.90%。 3.发现了属于10个等位基因主型的31个B-G新等位基因,利用人和哺乳动物的等位基因命名规则对其进行命名,并将DNA序列提交GenBank数据库;GenBank收录号分别为:AY744339-AY744348,AY792330-AY792338,AY792340和AY792342-AY792352。对B-G新等位基因在中国地方鸡品种中的不均衡分布及其不同等位基因间的系统发生关系进行了分析。 4.对中国8个地方鸡品种B-LB Ⅱ基因第二外显子序列的遗传多态性进行研究表明,核苷酸的多态变异位点为68个,其中简约性信息位点51个,单变异位点17个;序列同源性达90.6%-99.5%;核苷酸异义替换率为14.64%±2.67%,高于同义替换率,2.92%±0.94%。为鸡B-LB Ⅱ基因多态性进化机制研究提供了参考资料。 5.共发现了34个B-LB Ⅱ新等位基因,对其进行命名后,将DNA序列提交GenBank;GenBank收录号分别为:AY744338,AY744349-AY744363,AY770594-AY770606和AY7786309-AY7786313。并对B-LB Ⅱ新等位基因间的系统发生关系进行了分析。 6.对B-LB Ⅱ基因和B-G基因第二外显子所分别编码的β1、类Ig-V结构域氨基酸序列的遗传变异进行了分析,并对其抗原性、亲水性和疏水性进行了初步预测。 7.本研究首次对部分家禽(家鸡、雉鸡、鹌鹑)B-LB Ⅱ基因第二外显子与哺乳动物(人、猪、奶牛、绵羊、山羊、小白鼠和大鼠)MHC Ⅱ类β基因第二外显子序列进行了比较。结果表明,该序列在家鸡间的同源性达91.1-97.8%,家鸡与雉鸡、鹌鹑间
【学位授予单位】:华中农业大学
【学位级别】:博士
【学位授予年份】:2005
【分类号】:S831

【引证文献】
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【参考文献】
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【共引文献】
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中国博士学位论文全文数据库 前10条
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9 韩瑞丽;鸡visfatin和PRDM16基因遗传变异及其效应与表达研究[D];西北农林科技大学;2010年
10 荣立苹;东北地区野生百合种质资源及遗传多样性研究[D];沈阳农业大学;2010年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 武欣;武汉城市乡村聚落植物物种组成与多样性研究[D];华中农业大学;2010年
2 郭一鸣;全球白菜型油菜遗传多样性分析[D];华中农业大学;2010年
3 高伟;四倍体棉种的遗传多样性分析[D];华中农业大学;2010年
4 于斯惟;野生动物园规划与设计初探[D];中南林业科技大学;2009年
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【同被引文献】
中国期刊全文数据库 前10条
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中国重要会议论文全文数据库 前2条
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中国博士学位论文全文数据库 前5条
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中国硕士学位论文全文数据库 前6条
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【二级引证文献】
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中国重要会议论文全文数据库 前2条
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中国博士学位论文全文数据库 前1条
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中国硕士学位论文全文数据库 前6条
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中国硕士学位论文全文数据库 前1条
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【相似文献】
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3 杜宏;关伟军;赵倩君;浦亚斌;马月辉;;应用微卫星标记分析云南、西藏4个地方鸡种遗传多样性[A];第十二次全国畜禽遗传标记研讨会论文集[C];2010年
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2 姜长春 张晨;国家地方鸡种基因库在江都建成[N];新华日报;2010年
3 王道坤;怎样做好地方鸡种保护工作[N];河南科技报;2008年
4 本报记者 雷莉云 实习记者 龙梦晴;土鸡也能变“凤凰”[N];湖南科技报;2002年
5 莫广;我国优质肉鸡的发展前景[N];中国畜牧兽医报;2005年
6 本报记者 冯芸;康相涛:从“小鸡舍”走出的“大教授”[N];河南日报;2010年
7 水清;有些三黄鸡不宜自繁苗种[N];江苏农业科技报;2006年
8 记者 魏东 通讯员 刘涛 王祥峰;“鲁禽1号、3号麻鸡”培育成功[N];科技日报;2006年
9 ;景阳有鸡重9斤[N];湖北科技报;2002年
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中国博士学位论文全文数据库 前9条
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3 韩瑞丽;鸡visfatin和PRDM16基因遗传变异及其效应与表达研究[D];西北农林科技大学;2010年
4 徐日福;中国部分地方鸡种MHC B-LBⅡ、B-G基因变异及其群体遗传结构研究[D];华中农业大学;2005年
5 张跟喜;边鸡遗传多样性及Myostatin基因对生长和繁殖性状的遗传效应研究[D];扬州大学;2010年
6 安锋利;静宁鸡肌肉发育调控机理[D];兰州大学;2013年
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4 童海兵;地方鸡种类型对优质鸡配套系肉用性能及肉品质的影响[D];中国农业大学;2004年
5 金明;安徽省4个地方鸡保种群遗传多样性及3个产蛋性状基因聚合效应分析[D];安徽农业大学;2012年
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