PD多基因关联分析及AD-PD基因诊断平台的建立
【摘要】:背景:帕金森病(Parkinson's Disease,PD)是一种常见的神经系统退行性疾病,临床主要表现为静止性震颤、运动迟缓、肌强直和姿势步态异常,病理特征是黑质多巴胺(Dopamine,DA)能神经元变性缺失和路易小体(Lewy body,LB)的形成。随着PD相关易感基因的发现,遗传因素在PD的发病机制中起到的作用越来越受到重视。然而,流行病学调查研究显示,只有约5-10%的帕金森病患者有家族史。大部分的PD患者为散发患者,单基因发病形式非常罕见。SNCA、LRRK2、MAPT及GBA基因的某些位点改变普遍被认为是散发性PD的危险因素。近年来,复杂疾病如癌症、2型糖尿病等的研究发现基因或者多态位点的相互作用可以导致疾病患病风险增加。已有不同的研究提出PD可能具有多基因的发病形式,基因之间可能存在相互作用。我们的研究对以上四个基因进行了一个多基因关联分析。
目的:通过对中国汉族人群散发PD患者及对照组进行SNCA基因的Repl.rs11931074.rs356165,LRRK2基因的G2385R.R1628P, MAPT基因的rs242562.rs2435207及GBA基因的L444P位点进行个系统的综合评估,探讨PD的多基因关联。
方法:本研究拟采用PCR结合DNA直接测序法,对1011例散发PD及1016例正常对照进行SNCA、LRRK2、MAPT及GBA基因相应位点的多态分析,并探讨PD的多基因关联。
结果:SNCA基因的Rep1位点、rs356165位点.LRRK2基因G2385R位点、GBA基因的L444P位点的等位基因频率在年龄和性别校正后病例组和对照组具有显著性差异(P0.05)。以上述为基础建立4个位点之间的多因素回归分析模型,对多态位点进行交互作用分析。SNCA基因的Rep1与rs356165位点、SNCA基因的Rep1与LRRK2基因G2385R位点、SNCA基因的rs356165与LRRK2基因的G2385R位点交互作用后,其发病风险较其单独存在时增高。具有较多位点时PD易感性明显增高(带有5个位点时OR=8.456)。
结论:本研究发现SNCA基因的Rep1、rs356165以及LRRK2基因G2385R位点具有单独及协同作用。GBA基因的L444P位点可能是独立危险因素。多态位点之间具有累加作用。第二章帕金森病显性家系的诊断平台的建立
背景:目前分子遗传学研究已经克隆了常染色体显性遗传(autosomal dominant,AD)PD相关致病基因LRRK2、SNCA、UCHL1、HTRA2和GIGYF2基因,这为ADPD基因诊断平台建立奠定了理论基础。
目的:通过对ADPD患者的进行LRRK2、SNCA、UCHL1、HTRA2和GIGYF2基因的突变筛查,探讨ADPD致病基因突变情况,建立ADPD基因诊断平台。
方法:用PCR结合DNA直接测序方法对16例ADPD家系先证者进行LRRK2、SNCA、UCHL1、HTRA2和GIGYF2基因的突变筛查,建立中国ADPD人群基因诊断平台。
结果:在16例ADPD家系先证者中:发现了1例家系先证者存在LRRK2基因的突变(c.1847AG/p.K616R),并且该改变在200例正常对照中没有发现。我们对该家系进行了家系共分离,说明该位点可能是一个致病的突变。该改变在突变数据库检测中未发现,则为一个新发现的突变。没有发现SNCA、UCHL1、HTRA2和GIGYF2基因的基因突变。发现了LRRK2基因的4个新的SNPs(Ivs1+47CA、Ivs28+44GA、Ivs33+33TA及Ivs45+27GA)及GIGYF2基因的1个新的SNP(Ivs6+117TA)。
结论:本研究发现中国汉族人群ADPD家系中,LRRK2基因的突变相对多见;初步建立了ADPD基因诊断平台。
【关键词】:帕金森病 DNA直接测序 关联分析 帕金森病 DNA直接测序 突变分析 基因诊断 【学位授予单位】:中南大学
【学位级别】:博士
【学位授予年份】:2011
【分类号】:R742.5
【目录】:
- 摘要5-8
- ABSTRACT8-13
- 缩略词表13-14
- 第一章 帕金森病多基因关联分析14-64
- 1.1 前言14-16
- 1.2 研究对象和方法16-26
- 1.3 结果26-56
- 1.4 讨论56-63
- 1.5 结论63-64
- 第二章 常染色体显性遗传性帕金森病基因诊断平台的建立64-91
- 2.1 前言64-65
- 2.2 研究对象和方法65-71
- 2.3 结果71-84
- 2.4 讨论84-90
- 2.5 结论90-91
- 参考文献91-108
- 综述108-124
- 参考文献117-124
- 附录124-128
- 致谢128-129
- 攻读学位期间主要的研究成果129
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