收藏本站
收藏 | 手机打开
二维码
手机客户端打开本文

凝血系统基因相关SNPs及其单体型与长沙地区汉族人群脑出血的关系研究

曾艺  
【摘要】: 研究目的本研究旨在长沙地区汉族人群中,按多基因复杂疾病研究策略及方案,首次同时在散发性脑出血患者与健康对照人群及有家族聚集现象的脑出血家系中研究凝血因子Ⅰ(coagulation factorⅠ, F1)基因、凝血因子Ⅶ(coagulation factorⅦ, F7)基因、蛋白Z (protein Z, ProZ)基因、凝血因子Ⅻ(coagulation factorⅫ, F12)基因及血小板膜糖蛋白Ⅰa(glycoproteinⅠa, GPⅠa)基因等凝血系统基因相关单核苷酸多态(single nucleotide polymorphisms, SNPs)位点,比较其在不同群体中等位基因、基因型及单体型(haplotype)等遗传学分子标记物的差异并分析其与脑出血的关联,从分子水平探讨脑出血的可能发病机理,为预防和治疗脑出血提供坚实的理论依据和实践指导。 研究方法收集2006年1月至2009年10月在湘雅医院神经内科就诊的脑出血患者及部分家属的资料,所有病例均经CT和/或MRI确诊(依照第四届全国脑血管病学术会议诊断标准);对照组来自同期湖南省长沙地区汉族健康体检人员。研究对象分为3组:(1)有家族聚集现象的脑出血家系(cerebral hemorrhage with family history, CHFH)组(65个家系共281例,包括脑出血患者65例,Ⅰ级亲属133例,Ⅱ级亲属36例、Ⅲ级亲属10例和健康无血缘关系亲属37例),(2)散发性脑出血(sporadic cerebral hemorrhage, SCH)组(195例),及(3)对照组(116例)。CHFH组、SCH组与对照组的年龄、性别具有可比性。采用多重单碱基延伸SNP (Multiplex SnaPshot)分型技术对F1基因相关SNPs位点(rs1800790、rs1800787、rs6050)、F7基因相关SNPs位点(rs510317、rs6046)、ProZ基因相关SNPs位点(rs2273971、rs3024718、rs3024731)、F12基因相关SNP位点(rs1801020)及GPⅠa基因相关SNP位点(rs1126643)进行基因分型。对不同人群的基因分型结果分两部分进行统计:(1)SCH组和对照组采用基于人群的病例-对照研究法,采用x2检验按Hardy-Weinberg平衡法检测样本的群体代表性。用x2检验及Logistic回归分析,研究等位基因及基因型分布规律,从而筛查出与散发性脑出血相关的基因;用haploview软件构建单体型块(haplotype block);用PHASE软件构建单体型,用x2检验及Logistic回归分析探讨单体型与脑出血的相关性,进一步筛查出与散发性脑出血相关的基因;(2) CHFH组采用基于家系的传递不平衡检验(transmission disequilibrium test, TDT)及关联分析法,用FBAT软件研究等位基因及单体型与脑出血的相关性,从而筛查出与有家族聚集现象的脑出血相关的基因。 结果1.本研究结果显示在长沙地区汉族人群中存在F1基因rs1800790、rs1800787、rs6050, F7基因rs510317、rs6046, ProZ基因rs2273971、rs3024718、rs3024731, F12基因rs1801020及GPIa基因rs1126643此10种SNPs位点。 2.本研究结果显示在长沙地区汉族人群中,GPIa基因rs1126643多态的T等位基因在SCH组中的频率为0.339,明显高于对照组(0.228, P=0.004)。Logistic回归分析显示T等位基因与散发性脑出血相关,是散发性脑出血的保护性因素(OR=0.577,95%CI:0.396-0.840,P=0.004)。但F1基因rs1800790、rs1800787、rs6050SNPs位点,F7基因rs510317、rs6046 SNPs位点,ProZ基因rs2273971、rs3024718、rs3024731 SNPs位点及F12基因rs1801020 SNP位点的等位基因频率在SCH组与对照组间比较均无显著性差异(PO.05)。 3.本研究结果显示在长沙地区汉族人群中,GPIa基因rs1l26643多态的CT及TT基因型在SCH组中的频率分别为0.455与0.111,明显高于对照组(分别为0.404与0.026,P=0.022)。Logistic回归分析显示CT及TT基因型均与散发性脑出血相关,且均是散发性脑出血的保护性因素(OR=0.180,95%CI:0.051-0.631,P=0.007;OR=0.267,95%CI:0.076-0.943,P=0.040)。但F1基因rs1800790、rs1800787、rs6050 SNPs位点,F7基因rs510317、rs6046 SNPs位点,ProZ基因rs2273971、rs3024718、rs3024731 SNPs位点及F12基因rs1801020SNP位点的基因型频率在SCH组与对照组间比较均无显著性差异(P0.05)。 4.本研究结果显示在长沙地区汉族人群SCH组及对照组中,F1基因的rs1800790、rs1800787、rs6050 SNPs位点位于同一单体型块(D’均>0.7),其构成的单体型GCA (rs1800790+rs1800787+ rs6050)、单体型GA (rs1800790+rs6050)及单体型CA(rs1800787+rs6050)均可增加散发性脑出血的危险度近2倍(OR=1.738,95%CI:1.103-2.740,P=0.017)。其构成的其它所有主要单体型频率在SCH组及对照组间比较,结果无显著性差异(P0.05)。蛋白Z基因rs2273971、rs3024718、rs3024731 SNPs位点位于同一单体型块(D’均0.7),而F7基因rs510317及rs6046 SNPs位点可能位于同一单体型块(D’0.5),F7基因rs6046及蛋白Z基因rs3024718亦可能位于同一单体型块(D’0.5)。但上述3个单体型块中的SNPs构建出的所有主要单体型频率在SCH组及对照组间比较,结果亦均无显著性差异(P0.05)。GPIa基因rs1126643及F12基因rs1801020 SNPs位点可能不在同一单体型块中(D’0.5)。 5.本研究结果显示在长沙地区汉族人群CHFH组中,ProZ基因rs2273971多态的G等位基因存在过度传递现象,与有家族聚集现象的脑出血相关(Z=1.882,P=0.049882);而其A等位基因及rs3024718、rs3024731 SNPs位点的各等位基因无过度传递现象,与有家族聚集现象的脑出血无关(Z0和/或P0.05)。且F1基因rsl800790、rs1800787、rs6050 SNPs位点,F7基因rs510317 SNP位点,GPIa基因rs1126643及F12基因rs1801020 SNPs位点的各等位基因亦均无过度传递现象,与有家族聚集现象的脑出血无关(Z0和/或P0.05)。因本研究样本中携带F7基因rs6046 SNP位点的核心家系数不足FBAT软件的要求的最低10个,其等位基因TDT检验未能得到结果。 6.本研究结果显示在长沙地区汉族人群CHFH组中,F7基因rs510317、rs6046与蛋白Z基因rs2273971、rs3024718、rs3024731SNPs位点在同一个单体型块中(0D’≤1),其构成的单体型CGA(rs6046+rs2273971+rs3024731)、单体型GA(rs2273971+rs3024731)及单体型CG(rs6046+rs2273971)均存在过度传递现象,与有家族聚集现象的脑出血相关(Z=1.977,P=0.048076;Z=1.922,P=0.044644;Z=1.826,P=0.047838);其构成的其余所有单体型均无过度传递现象,与有家族聚集现象的脑出血无关(Z0和/或P0.05)。F1基因rs1800790、rs1800787、rs6050 SNPs位点在同一个单体型块中(0D'≤1), GPIa基因rs1126643与F12基因rs1801020 SNPs位点亦在同一个单体型块中(0D’≤1),但它们各自构成的所有单体型均无过度传递现象,与有家族聚集现象的脑出血无关(Z0和/或P>0.05)。 结论1.本研究首次发现长沙地区汉族人群中凝血系统基因存在遗传异质性,为遗传因素可能是长沙地区汉族人群脑出血的发病机理之一提供了进一步的证据。 2.本研究在国内外首次发现F1基因单体型GCA(rs1800790+rs1800787+rs6050)、单体型GA(rs1800790+rs6050)及单体型CA(rs1800787+rs6050)均是散发性脑出血的遗传易感因素,但与有家族聚集现象的脑出血无关;且F1基因rs6050位点可能是散发性脑出血的重要遗传易感因素。而GPIa基因rs1126643多态的T等位基因及CT、TT基因型则均是散发性脑出血的保护性因素,但与有家族聚集现象的脑出血无关;且T等位基因可能是散发性脑出血的重要遗传保护性因素。 3.本研究在国内外首次发现ProZ基因rs2273971多态的G等位基因、单体型GA (ProZ基因rs2273971+rs3024731)、单体型CG(F7基因rs6046+ProZ基因rs2273971)及单体型CGA(F7基因rs6046+ProZ基因rs2273971、rs3024731)均与有家族聚集现象的脑出血相关,但与散发性脑出血无关。且ProZ基因rs2273971 SNP位点G等位基因可能是有家族聚集现象脑出血的重要相关因素。 4.本研究首次发现在长沙地区汉族人群中,F7基因rs510317多态、ProZ基因rs3024718多态及F12基因rs1801020多态与散发性脑出血及有家族聚集现象的脑出血均无关。


知网文化
【相似文献】
中国期刊全文数据库 前20条
1 沈洪兵;基因多态性与疾病易感性的分子流行病学研究:问题与对策[J];中华流行病学杂志;2004年09期
2 贡昌春,耿建平,沈维干,刘国仰;Amp-FLP连锁分析法应用于Wilson病的产前基因诊断[J];江苏临床医学杂志;1998年06期
3 李峰,冒长峙!650101,邵剑春,李学平!650101,安肇璋,邓丹琪!650101,胡大春,周晓鸿!650101;云南汉族系统性红斑狼疮与HLA-DRDQ相关性的研究[J];中华风湿病学杂志;2000年03期
4 胡蓉,伍新尧;单核苷酸多态性及其在法医学中的应用前景[J];法医学杂志;2001年04期
5 李婧,潘玉春,李亦学,石铁流;人类基因组单核苷酸多态性和单体型的分析及应用[J];遗传学报;2005年08期
6 马巧玲;韩明哲;;HLA半相合造血干细胞移植的研究进展[J];国际输血及血液学杂志;2005年03期
7 吴雄文,张文杰,RL Dawkins,赵修竹;HLA-B与TNF基因间区的单体型特异性的多态现象[J];免疫学杂志;1993年02期
8 马永平,易发平;焦磷酸测序技术及其在分子生物学领域的应用[J];国外医学.分子生物学分册;2003年02期
9 赵英,吴艳,符生苗;HLA单体型与性别有关[J];海南医学;2000年04期
10 李恒;傅振坤;李殿俊;;免疫调节基因多态性与乳腺癌关联的研究进展[J];国际免疫学杂志;2007年06期
11 汪一波;郑翼;张禅那;罗芳;樊晓寒;惠汝太;;KDR基因多态性与中国人群冠心病风险相关[J];临床内科杂志;2008年03期
12 季雪莲;贾龙飞;贾建平;;PLAU基因单体型与晚发性阿尔茨海默病的相关性研究[J];中风与神经疾病杂志;2008年03期
13 王珏;罗玫;邹海;甘静;李星洁;陈强;郑忠伟;;最大似然法和方根法计算HLA三座位单体型频率的比较[J];中国输血杂志;2009年07期
14 李湘民;李静;曾凤;易红;;ITGA9基因rs189897与rs2212020及其单体型分子标志影响脑梗死发生[J];南方医科大学学报;2011年07期
15 何柳;唐迅;胡永华;;DNA混合分析技术的单体型频率估计方法[J];中南大学学报(医学版);2011年05期
16 于雅琴,谢林;精神分裂症多基因遗传位点的筛检[J];中华流行病学杂志;2003年12期
17 包广宇;单核苷酸多态性的研究进展及其应用[J];国外医学.遗传学分册;2003年01期
18 张伟丽;调控性SNPs[J];中国分子心脏病学杂志;2003年04期
19 唐双柏,郭景元,刘超,梁赏猷,王穗保;广州汉族人群DYS19、DYS389Ⅰ/Ⅱ、DYS390多态性及其单体型[J];遗传;2000年01期
20 赵玉琼;姚春涛;赵权;赵亚力;郭雄明;张铁军;陈华;;我国特有三个小型猪品系PGC-1基因外显子8的多态性分析[J];中国比较医学杂志;2008年10期
中国重要会议论文全文数据库 前10条
1 张继红;吴凌云;王勇;李珍萍;章祥荪;;由基因型SNP数据推断相应单体型的Markov链统计方法(英文)[A];中国运筹学会第七届学术交流会论文集(下卷)[C];2004年
2 林忠宁;;环境-致癌过程相关基因启动子区多态性及其单体型的功能分析[A];广东省环境诱变剂学会、广东省预防医学会卫生毒理专业委员会2010年学术会议资料汇编[C];2010年
3 王瑞省;吴凌云;李珍萍;章祥荪;;单体型装配问题及其遗传算法(英文)[A];中国运筹学会第七届学术交流会论文集(中卷)[C];2004年
4 徐新娟;梁晓慧;陈玉岚;珠勒皮亚;李素华;;VEGF基因单核苷酸多态性及其单体型与新疆维吾尔族长寿的关联研究[A];第十三次全国心血管病学术会议论文集[C];2011年
5 陈悦;佟彤;高文英;宋力;乔丽津;;应用Amp-FLP单体型连锁分析检测Wilson's患者的基因突变[A];中国优生优育协会第三届学术研讨会专辑[C];2003年
6 陈慧峰;林育纯;林丽娜;李文;罗洁;张树江;万建新;陈雯;林忠宁;;广东汉族人群PP2A-Aα亚基基因5'-侧翼区多态性的单体型分析[A];广东省环境诱变剂学会、广东省预防医学会卫生毒理专业委员会2010年学术会议资料汇编[C];2010年
7 田正芹;朱平;陈艳;刘红星;龚艺文;傅玉;王明英;夏君燕;白德成;;骨髓增殖性疾病46/1基因单体型和Jak2V617F的关系以及民族基因多态性差异[A];第13届全国实验血液学会议论文摘要[C];2011年
8 尹东;王海江;王琦三;孟涛;帕尔哈提;葛磊;王飞;;TNF-A基因多态及单体型与维、汉民族胃癌关系的研究[A];中华医学会肿瘤学分会第七届全国中青年肿瘤学术会议——中华医学会肿瘤学分会“中华肿瘤 明日之星”大型评选活动暨中青年委员全国遴选论文汇编[C];2011年
9 王凤丽;曾翠平;楚原梦冉;刘榜;;猪FKTN基因的SNPs扫描及其与经济性状的关联分析[A];第十二次全国畜禽遗传标记研讨会论文集[C];2010年
10 邹喻苹;葛颂;;新一代分子标记——SNPs及其应用[A];中国植物学会七十周年年会论文摘要汇编(1933—2003)[C];2003年
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 曾艺;凝血系统基因相关SNPs及其单体型与长沙地区汉族人群脑出血的关系研究[D];中南大学;2010年
2 汪颖;单体型和基因型问题的优化模型和算法[D];大连理工大学;2007年
3 谢民主;单体型组装问题参数化建模及算法研究[D];中南大学;2008年
4 王红星;弹性蛋白及其代谢通路相关基因SNPs及单体型与长沙汉族人群脑出血的关系研究[D];中南大学;2012年
5 黄生强;SNP标记定位猪4号染色体QTLs及DECR1基因SNPs与猪经济性状关联研究[D];湖南农业大学;2010年
6 姜波;中国汉族人群PAX6基因多态性与高度近视的关联研究[D];浙江大学;2011年
7 王涛;中国人苯丙氨酸羟化酶基因突变的研究[D];中国协和医科大学;1994年
8 李楠;PDE4D及IL-1基因多态性与中国汉族人群缺血性卒中的关联研究[D];中国医科大学;2010年
9 刘榜;15个猪品种MHCⅡ类区4个基因的SNPs分析及与免疫性状的关联[D];华中农业大学;2003年
10 汤月芬;孕期心理干预对产后抑郁影响、相关危险因素和雌激素受体的关联研究[D];复旦大学;2007年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 李自保;GSK-3β的rs334558和rs6438552位点基因多态性及其单体型与AD的相关性研究[D];中南大学;2010年
2 陈治中;湖北汉族人群TIM-3基因单体型与变应性哮喘相关性研究[D];华中科技大学;2008年
3 周伟;单体型组装加权最小字符翻转问题参数化算法研究[D];中南大学;2008年
4 赵正中;AKT1基因多态性与重性抑郁症的关联性研究[D];重庆医科大学;2009年
5 王颖;基于分块的单体型推导算法及缺失问题研究[D];中国科学技术大学;2011年
6 尤加永;脑源性神经营养因子单体型及载脂蛋白E基因多态性与晚发性抑郁症关系研究[D];南京医科大学;2009年
7 宋波;白细胞介素-8基因多态性与胃癌恶病质的关系[D];青岛大学;2009年
8 戚玲;云南汉族FZD3基因rs2241802、rs2323019、rs352203多态性及其单体型与精神分裂症关联研究[D];昆明医学院;2008年
9 方哲翔;基于连锁不平衡的标签SNP预测[D];华中科技大学;2007年
10 袁荣发;FAT10基因遗传变异与肝细胞癌发生发展的关联性研究[D];南昌大学;2012年
中国重要报纸全文数据库 前10条
1 本报记者 李雪墨 李斌;单体型图破解人类基因组奥秘[N];医药经济报;2003年
2 张荔子;血样有助于破解遗传之谜[N];大众卫生报;2003年
3 张荔子 张清润;注释“天书”[N];健康报;2006年
4 记者 裴闯 陈斌华;猝死多为基因突变所致,遗传概率高达50%[N];新华每日电讯;2004年
5 ;NOTCH1基因突变可引发白血病[N];医药经济报;2004年
6 本报记者 童光来;基因突变易致二成国人患骨刺[N];北京科技报;2004年
7 记者 崔志坚;河南发现一罕见念珠状毛发家族[N];光明日报;2006年
8 黄守勤;福建发现难治性高血压家族[N];健康报;2007年
9 通讯员 冯瑶 记者 佳学;基因突变与乳腺癌发病密切相关[N];江苏科技报;2007年
10 星辰 编译;百岁老人基因突变相同[N];大众科技报;2003年
中国知网广告投放
 快捷付款方式  订购知网充值卡  订购热线  帮助中心
  • 400-819-9993
  • 010-62982499
  • 010-62783978