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超级杂交稻母本株1S CHLH cDNA的生物信息学分析与克隆

赵玄之  
【摘要】: 超级杂交稻是在我国种植面积极广的一种水稻品种,目前我国的超级杂交稻在超高产育种领域已取得了令世界瞩目的成就。对脱落酸结合蛋白研究是研究脱落酸受体的重要途径,脱落酸受体一直是研究脱落酸信号转导的热点,并取得了很多进展。本研究利用生物信息学方法结合分子生物学、遗传学等手段,为研究脱落酸受体镁离子螯合酶H亚基(Mg-chelatase H subunit,CHLH)提供了帮助。 本研究通过生物信息学分析为基础,利用拟南芥中编码CHLH的cDNA,对水稻核酸数据库和水稻EST数据库进行检索,通过得到的EST序列和检索到的水稻核酸序列进行比较分析,得到水稻CHLH的cDNA。以超级杂交稻母本株1S为材料提取总RNA,并反转录成cDNA,用得到的序列设计特异引物,经PCR扩增出株1S cDNA片段,cDNA片段经T-A克隆后进行测序,获得一条长1350bp序列和一条长871bp序列。提交1350bp序列至GenBank数据库后接收,登录号为EU569725。


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