收藏本站
《南华大学》 2007年
收藏 | 手机打开
二维码
手机客户端打开本文

红鲫(Carassius auratus red variety)Sox基因的研究

龙黎南  
【摘要】: 目的进一步理解鱼类Sox基因的进化,推测红鲫与斑马鱼的分化时间,了解红鲫的起源。 方法根据脊椎动物Sox基因HMG盒保守区的氨基酸序列,设计两对兼并引物,以红鲫基因组DNA为模板进行PCR扩增,对扩增产物进行亚克隆和测序,并对获得的序列进行同源性比较和系统进化树分析。 结果(1)从红鲫基因组DNA中克隆和测序了9个Sox基因HMG盒序列,分别命名为Sox1-1、Sox1-2、Sox1-3、Sox4-1、Sox4-2、Sox9、Sox11b1-1、Sox11b1-2和Sox11b2。(2) Sox1-1、Sox1-2和Sox1-3编码相同的氨基酸序列,然而,在核苷酸水平,红鲫Sox1-1与斑马鱼Sox1a基因的同源性最高(96.1%),Sox1-2和Sox1-3与斑马鱼Sox1b基因的同源性最高(分别为95.1%和95.5%);系统进化树分析显示,红鲫Sox1-1与斑马鱼Sox1a聚在一起,Sox1-2和Sox1-3与斑马鱼Sox1b聚在一起。(3) Sox4-1与Sox4-2的氨基酸序列相似性为98.1%,均与小鼠Sox4的同源性最高,分别为88.9%和90.7%。(4) Sox11b1-1和Sox11b1-2编码相同的氨基酸序列。系统进化树分析显示,红鲫Sox11b1和Sox11b2基因与斑马鱼Sox11b基因聚在一起,而远离斑马鱼Sox11a基因。(5)基于真骨鱼Sox1、Sox9和Sox11基因核苷酸序列构建的系统进化树显示,Sox1、Sox9和Sox11基因的复制时间发生在红鲫、斑马鱼、河豚、鲈鱼及丽体鱼的分化之前。(6)以Sox1、Sox9和Sox11基因为分子钟标记,推测红鲫(分类于鲤形目,鲤科,鲫属)与斑马鱼(分类于鲤形目,鲤科,鱼丹属)的分化时间大约发生在8×107年前。 结论(1) Sox1、Sox4和Sox11b基因在红鲫中发生了复制,首次报道鱼类的Sox11b基因有2个平行同源基因。(2)在鱼类某些物种的进化过程中,可能发生了Sox11基因的复制、丢失与分化。(3)支持“鱼类Sox基因的复制时间发生在真骨鱼分化之前”的观点。(4)红鲫(分类于鲤形目,鲤科,鲫属)与斑马鱼(分类于鲤形目,鲤科,鱼丹属)的分化时间大约发生在8×107年前。 目的探讨红鲫Sox1和Sox11b基因的组织表达特异性及Sox1和Sox11b基因复制子的功能。 方法采用RT-PCR技术,研究Sox1和Sox11b基因在红鲫成熟个体的肝、肾、脾、心脏、脂肪、端脑、中脑、下丘脑、小脑、延脑、肌肉、卵巢和睾丸共13种组织中的表达,并对部分扩增产物进行亚克隆和测序。 结果(1)在红鲫成熟个体脂肪、肌肉、卵巢和睾丸中,没有检测到Sox1-1、Sox1-2/Sox1-3、Sox11b基因的表达。(2) Sox1-1、Sox1-2/Sox1-3在肝、脾、肾、心脏和脑组织(端脑、中脑、下丘脑、小脑、延脑)中均有不同程度的表达,尤其在脑组织中检测到大量的转录物。(3)在肝、脾、肾、心脏、端脑、中脑和延脑中,均检测到Sox11b1-1、Sox11b1-2和Sox11b2基因的转录物。然而,在下丘脑和小脑中,只检测到Sox11b1-1和Sox11b1-2转录物,而没有检测到Sox11b2基因的转录物。 结论(1) Sox1和Sox11b基因在红鲫中具有一定的组织表达特异性。(2)红鲫Sox1基因可能在神经系统中起着重要的作用。(3)红鲫Sox11b基因发生复制后,复制子(Sox11b1-1、Sox11b1-2和Sox11b2)具有相似而不同的表达方式。
【学位授予单位】:南华大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2007
【分类号】:Q953

手机知网App
【共引文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 章力;黄希贵;焦保卫;吴风瑞;王德寿;;南方鲇两种生长激素受体的结构分析及其组织分布和激素调节[J];动物学报;2006年06期
2 周莉;汪洋;桂建芳;;鱼类特异的基因组复制[J];动物学研究;2006年05期
3 Jason McDermott;Ram Samudrala;Gane Ka-Shu Wong;;Evolutionary Transients in the Rice Transcriptome[J];Genomics, Proteomics & Bioinformatics;2010年04期
4 龙黎南;贺庆芝;刘运莲;杨露青;殷杰;郑济芳;;红鲫Sox4基因保守区的克隆与序列分析[J];南华大学学报(医学版);2007年04期
5 郑济芳;龙黎南;刘俊;贺庆芝;秦志峰;;红鲫Sox1和Sox11b基因保守区的克隆与表达分析[J];南华大学学报(医学版);2008年02期
6 ;Cloning and sequence analysis of Sox genes in a tetraploid cyprinid fish,Tor douronensis[J];Chinese Science Bulletin;2008年13期
7 李敏;王菁;田晓轩;谢强;刘华希;卜文俊;;基于四个Hox基因的水生蝽类昆虫(半翅目-异翅亚目:蝎蝽次目)系统发育研究(英文)[J];昆虫分类学报;2012年01期
8 郭宝成;李俊兵;童超波;何舜平;;一种四倍体鲤科鱼Sox基因的克隆和序列分析[J];科学通报;2008年12期
9 李鸿健;谭军;;基因倍增研究进展[J];生命科学;2006年02期
10 孙新;魏振邦;孙效文;;鱼类特异的基因组复制及鱼类多样性(英文)[J];生命科学研究;2007年S1期
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 史宝;牙鲆繁殖内分泌分子机理研究[D];中国海洋大学;2010年
2 赵心怡;斑马鱼Tol2转座子介导的诱变及突变体stac的研究[D];清华大学;2010年
3 张华;水稻基因组重复片段上籼粳间杂种不育主效位点qS12的遗传分析和精细定位[D];武汉大学;2011年
4 夏晓华;两种泥鳅SoxE亚族和DMRT1基因的结构与功能分析[D];河南师范大学;2011年
5 孙静;协同刺激分子B7-H3两种异构体的基因演化及其生物学功能差异的研究[D];苏州大学;2011年
6 薛良义;脊椎动物Hoxall基因进化分析与研究[D];浙江大学;2006年
7 许金山;家蚕微孢子(Nosema bombycis)全基因组结构与系统进化分析[D];西南大学;2007年
8 黄希贵;黑鲷两种促乳素受体的分子克隆、表达调控和功能研究[D];西南大学;2007年
9 游翠红;两种小型鱼类的某些基因组特征研究[D];中国科学院研究生院(水生生物研究所);2007年
10 刘东;多倍体鱼转座子的遗传变异和雌核发育鱼性腺发育的分子生物学研究[D];湖南师范大学;2009年
中国硕士学位论文全文数据库 前6条
1 张燕;长江草鱼群体MHC Class Ⅱ B基因的克隆、表达及多态性分析[D];华中农业大学;2010年
2 肖珍;鳙鱼性别特异片段的筛选和克隆[D];河南师范大学;2011年
3 温晓;水稻基因组倍增研究[D];浙江大学;2005年
4 夏建军;文昌鱼AmphiANT和AmphiTRAPβ基因的鉴定、表达和进化研究[D];中国海洋大学;2005年
5 章力;南方鲇和罗非鱼生长激素受体(GHR2)的克隆和两种生长激素受体在南方鲇表达的初步研究[D];西南大学;2006年
6 刘小红;稀有鮈鲫(Gobiocypris rarus)脑垂体结构及POMC基因cDNA序列克隆和分析[D];西南大学;2010年
【相似文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 龙黎南;贺庆芝;刘运莲;杨露青;殷杰;郑济芳;;红鲫Sox4基因保守区的克隆与序列分析[J];南华大学学报(医学版);2007年04期
2 伍爱荣;刘冬娥;陈勇;;红鲫Sox基因的聚合酶链反应扩增[J];南华大学学报(医学版);2007年06期
3 杜启艳,常重杰,华慧颖,邵宏伟;鲤鱼中5个Sox基因保守区的克隆和比较[J];河南师范大学学报(自然科学版);2004年04期
4 黄银久,梁玉华,胡明洁;黑斑蛙SOX基因PCR扩增产物研究[J];蚌埠医学院学报;2003年04期
5 陈冬生,聂刘旺;两种蛙Sox基因的PCR-SSCP分析[J];激光生物学报;2005年02期
6 聂刘旺,单祥年,郭超文,汪鸣,张海军,鲁晓萱;平胸龟Sox基因的克隆和序列分析[J];激光生物学报;2000年02期
7 吴端生,王宗保,张轩杰,刘冬娥,姚峰,刘鑫,徐诗平;红鲫近交系的建立[J];中国实验动物学报;2001年02期
8 周慧,许春晓;旅游地进化过程中的竞争与协作[J];热带地理;2005年01期
9 常重杰,周荣家,余其兴;两种泥鳅中Sox基因的检出(英文)[J];Developmental and Reproductive Biology;1999年02期
10 杜启艳,常重杰,牛红星,李惠;东北虎中SOX基因的检测[J];动物学报;2001年S1期
中国重要会议论文全文数据库 前10条
1 张成;潘速跃;刘焯霖;;Dystrophin基因51号外显子缺失连接片段克隆和测序[A];第四次全国中西医结合神经系统疾病学术研讨会论文集[C];2002年
2 吴端生;罗琛;王宗保;张轩杰;刘冬娥;姚峰;刘鑫;徐诗平;;红鲫近交系的建立[A];中国实验动物学会第五届学术年会论文汇编[C];2000年
3 胡荣;李妤;吴端生;;镉致实验红鲫生物学毒性的研究[A];第九届中国实验动物科学年会(2010新疆)论文集[C];2010年
4 杨爱梅;陈福勇;;禽流感病毒HA基因的克隆和测序[A];中国畜牧兽医学会禽病学会分会第十次学术研讨会论文集[C];2000年
5 王娟;;躯体进化特征与审美功能探讨[A];北京市社会心理学会2009年学术年会论文摘要集[C];2009年
6 李洁;郑萍萍;芮金龙;宋娇莲;聂刘旺;;山地麻蜥Sox 3基因的克隆及序列分析[A];中国动物学会两栖爬行动物学分会2005年学术研讨会暨会员代表大会论文集[C];2005年
7 史建伍;盛军庆;曾柳根;王军花;洪一江;;萍乡红鲫卵母细胞透明带糖蛋白ZP3基因及其侧翼序列的克隆和分析[A];中国南方十六省(市、区)水产学会渔业学术论坛第二十六次学术交流大会论文集(下册)[C];2010年
8 王晓锋;王欣睿;葛晨霞;王秀英;;表皮葡萄球菌四种基因的扩增、克隆和测序[A];吉林省畜牧兽医学会2007学术年会论文集[C];2007年
9 王东方;赵惠祥;曲俊延;张弘;;高校自然科学学报编辑工作的进化特征[A];学报编辑论丛(第十四集)[C];2006年
10 彭杰军;燕飞;陈剑平;;Dicer结构和功能研究进展[A];植物保护与农产品质量安全论文集[C];2008年
中国重要报纸全文数据库 前10条
1 于秀;萍乡红鲫有望“游向”全国市场[N];中国特产报;2009年
2 刘霞;进化过程关键点出现在约12亿年前[N];科技日报;2010年
3 ;动物是怎么从地面飞起来的?[N];新华每日电讯;2006年
4 刘启红;萍乡红鲫成为我省淡水渔业新品种[N];江西日报;2008年
5 董映璧;复杂物理系统存在多样性共振[N];科技日报;2006年
6 健康时报特约专家 徐庆;饮食:“远亲”胜“近邻”[N];健康时报;2005年
7 实习生 姜海;植物适应环境变化机理被发现[N];科技日报;2007年
8 大可;新基因疗法置换致病突变基因[N];大众科技报;2006年
9 记者  陈超;蝙蝠与马和狗同属一个祖先[N];科技日报;2006年
10 本报实习记者 李京淑;可爱是种自我保护策略[N];北京科技报;2006年
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 郭新红;不同倍性鱼类mtDNA及三倍体湘云鲫Sox基因研究[D];湖南师范大学;2004年
2 何伟国;红鲫与翘嘴红鲌不同倍性水平杂交鱼的形成及其生物学特征研究[D];湖南师范大学;2012年
3 郑济芳;扬子鳄(Alligator sinensis)和中华鳖(Trionyx sinensis)的Sox基因研究[D];浙江大学;2003年
4 蒋圣娟;青岛文昌鱼TRP14和ycaCR基因的表达和功能鉴定[D];中国海洋大学;2007年
5 郜玉钢;鹿源BVDV分离鉴定、E_0基因的克隆与表达及免疫原性研究[D];吉林农业大学;2005年
6 王蔚;白氏文昌鱼BAC文库的构建及Pax基因家族的进化分析[D];厦门大学;2006年
7 刘季芳;异源四倍体鲫鲤Sox基因及黄鳝类固醇激素合成酶研究[D];湖南师范大学;2007年
8 张巨源;蓝细菌基因组比较分析:异形胞发育进化及3’,5’-二磷酸核苷酸酶HalA的功能研究[D];华中农业大学;2008年
9 刘江东;刺鳅性染色体的显微分离和X涂绘文库的研究[D];武汉大学;2003年
10 游翠红;两种小型鱼类的某些基因组特征研究[D];中国科学院研究生院(水生生物研究所);2007年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 龙黎南;红鲫(Carassius auratus red variety)Sox基因的研究[D];南华大学;2007年
2 高丽君;苯酚对实验红鲫DNA损伤及氧化胁迫研究[D];南华大学;2012年
3 张小爱;虎纹蛙Sox基因的研究[D];安徽师范大学;2002年
4 程双怀;中华绒螯蟹Sox基因的研究[D];安徽师范大学;2003年
5 董先辉;实验红鲫对苯酚富集及微卫星标记预警的实验研究[D];南华大学;2012年
6 史建伍;萍乡红鲫ZP3蛋白组织差异性表达及其在卵母细胞中免疫荧光定位[D];南昌大学;2011年
7 刘志鹏;萍乡红鲫Hira基因及其启动子的特征和在卵巢周年发育中的研究[D];南昌大学;2012年
8 胡荣;实验红鲫的AFLP标记及重金属镉对实验红鲫的生物学毒性的研究[D];南华大学;2010年
9 杨超;赤链蛇Sox基因的研究[D];安徽师范大学;2002年
10 王鹏;萍乡红鲫Hira基因的克隆、表达分析及多克隆抗体制备[D];南昌大学;2010年
 快捷付款方式  订购知网充值卡  订购热线  帮助中心
  • 400-819-9993
  • 010-62791813
  • 010-62985026