收藏本站
《湖南师范大学》 2019年
收藏 | 手机打开
二维码
手机客户端打开本文

stat1b基因突变对斑马鱼胚胎早期发育转录组调控的研究

万思瑶  
【摘要】:信号转导与转录激活因子(STAT1)与多种细胞因子和生长因子的信号转导相关联,同时参与多种细胞功能的调节,例如参与调节免疫系统,抑制肿瘤细胞的增长,抑制细胞分化,促进细胞的凋亡。本实验室在前期分析了人类STAT1基因在低骨密度(BMD)中高表达,以及在stat1b突变品系斑马鱼中破骨细胞(OC)含量增加。斑马鱼与人类在遗传上和生理上都具有比较高的同源性,并且斑马鱼具有较强的基因编辑能力、世代时间较短和发育阶段比较快速等等特点,使得斑马鱼常被选定为研究对象。本研究运用高通量测序获得了有关于stat1b基因纯系突变品系和野生型斑马鱼的大量转录组数据,有助于人类从分子水平上对stat1b基因进行深入研究。本研究利用CRISPR/Cas9基因编辑技术对斑马鱼stat1b基因进行了敲除。通过一系列实验,包括DNA基因组提取、目的片段的扩增、DNA纯化回收、T7核酸内切酶Ⅰ酶切、TA克隆和Sanger测序鉴定stat1b突变型斑马鱼并且成功获得了stat1b F3代纯合突变品系斑马鱼,建立了stat1b~(-/-)突变模型。本文通过Illumina HiSeq平台分别对stat1b-S2基因纯合突变体和野生型斑马鱼的胚胎的1-细胞时期、2-细胞时期、4-细胞时期、8-细胞时期、16-细胞时期这五个细胞时期进行高通量测序,使用GO富集和KEGG通路来分析每个发育阶段胚胎的差异基因。结果显示,在stat1b纯合突变品系与野生型斑马鱼的胚胎的比较组合中,1-细胞时期、2-细胞时期、4-细胞时期、8-细胞时期、16-细胞时期分别筛选出4791、3623、4319、7648、7889个差异基因。突变体与野生型斑马鱼胚胎五个细胞时期的相互比较样品的前50个差异表达显著的基因中,fl1a基因表达为上调,adcy8基因和me3基因表达为下调。GO富集分析显示,在五个细胞时期的差异基因主要富集在代谢过程、细胞内组分等方面;KEGG通路富集分析结果表明,在五个细胞时期的差异基因主要与RNA转运、泛素介导的蛋白水解、蛋白质在内质网上的加工等通路相关联。根据结果数据分析,stat1b基因敲除后,使得斑马鱼胚胎早期发育过程中,eif4e2、eif3jb、senp2基因的表达下调,从而影响RNA转运通路。此外,分别对stat1b纯合突变品系和野生型斑马鱼每个细胞时期的比较组合的差异基因进行了初步的筛选,发现其大部分的差异基因与锌指蛋白相关,推测stat1b基因可能与细胞分化相关,从分子水平上揭示了stat1b基因突变伴随的相关生物学功能和通路所发生的变化。
【学位授予单位】:湖南师范大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2019
【分类号】:Q953

手机知网App
【相似文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 臧晓霞;纪明山;左平春;陈仕红;孙中华;杜芳;;啶酰菌胺对斑马鱼胚胎及成鱼的毒性[J];农药;2016年12期
2 沈自慧;杨淋清;吴德生;郭昱嵩;袁建辉;周丽;刘建军;庄志雄;;基于斑马鱼胚胎进行化学品毒性评价的方法[J];中国热带医学;2016年12期
3 王鸿奎;巩杰;王新;刘东;;非肌性肌球蛋白Ⅱ-C在斑马鱼胚胎发育过程中的表达[J];交通医学;2016年01期
4 郭樱子;栾亚楠;周玉玲;白承连;任湘鹏;;低剂量氯氟氰菊酯对斑马鱼胚胎运动行为的影响[J];温州医科大学学报;2016年07期
5 赵崇军;田敬欢;倪媛媛;冯娅茹;代一航;王金凤;樊娇娇;杨冉;马志强;林瑞超;;马钱子对斑马鱼胚胎发育的影响[J];中华中医药学刊;2016年11期
6 刘迎;胡燕;姜蕾;潘波;秦涵淳;林勇;;6种表面活性剂对斑马鱼胚胎发育的毒性效应[J];生态毒理学报;2014年06期
7 何秋霞;董贞兰;楚杰;孙桂金;韩利文;韩健;刘可春;;芦荟大黄素对斑马鱼胚胎发育及运动行为学的毒性研究[J];山东科学;2015年03期
8 陈怡君;蒲韵竹;颜慧;钟玉绪;王卓;李春杰;查晓丹;赵宝全;刘萍;;冰片对斑马鱼胚胎发育的安全性评价[J];中国药房;2014年19期
9 刘迎;胡燕;姜蕾;潘波;秦涵淳;林勇;;5种酰胺类除草剂对斑马鱼胚胎发育的毒性效应[J];农药;2014年11期
10 王雪;彭维兵;王希敏;刘可春;陈锡强;张云;;富马酸二甲酯对斑马鱼胚胎早期发育的影响[J];动物学杂志;2013年04期
中国重要会议论文全文数据库 前10条
1 沈自慧;吴德生;郭昱嵩;;基于斑马鱼胚胎进行化学品毒性评价的方法[A];2016年中国水产学会学术年会论文摘要集[C];2016年
2 陈锡强;韩利文;王希敏;王思锋;侯海荣;刘可春;;促渗剂氮酮对斑马鱼胚胎的透皮作用及其毒性影响(英文)[A];2012年中国药学大会暨第十二届中国药师周论文集[C];2012年
3 张利军;郭家彬;苑晓燕;史慧勤;赵君;束玉磊;彭双清;;应用斑马鱼胚胎和幼鱼评价布洛芬的心脏毒性[A];2013年(第三届)中国药物毒理学年会暨药物非临床安全性评价研究论坛论文摘要[C];2013年
4 侯佳;桂永浩;张立凤;王跃祥;宋后燕;钟涛;;视黄酸缺乏对斑马鱼胚胎心脏发育的影响[A];中华医学会第五次全国儿科中青年学术交流大会论文汇编(上册)[C];2008年
5 常成;朱加进;孙启;;瓶装水对斑马鱼胚胎生长发育的影响[A];2017浙江省营养学会年会暨西湖营养学术论坛资料汇编[C];2017年
6 于永利;杨景峰;王思珍;董武;;高残留农药福美双对斑马鱼胚胎体节以及脊索的影响[A];持久性有机污染物论坛2010暨第五届持久性有机污染物全国学术研讨会论文集[C];2010年
7 巴雅斯胡;杨景峰;于永利;王思珍;董武;;高残留农药代森锌诱导斑马鱼胚胎脊索变形[A];持久性有机污染物论坛2011暨第六届持久性有机污染物全国学术研讨会论文集[C];2011年
8 杨维超;苑晓燕;张利军;吴卫东;彭双清;;纳米二氧化硅致斑马鱼胚胎发育毒性的初步研究[A];2014线粒体毒性与基于毒性通路的安全性评价新策略学术研讨会暨中国毒理学会毒理学替代法与转化毒理学专业委员会成立大会论文集[C];2014年
9 涂文清;徐超;刘维屏;;乙草胺对于斑马鱼胚胎在发育和免疫毒性方面的对映体选择性[A];第四届全国分子手性学术研讨会暨2011绿色手性论坛论文摘要集[C];2011年
10 朱小山;朱琳;李燕;端正花;;富勒烯(C_(60))对斑马鱼胚胎发育毒性的初步研究[A];第三届全国环境化学学术大会论文集[C];2005年
中国重要报纸全文数据库 前7条
1 实习生 杨阳;斑马鱼可为癌症病人试药[N];科技日报;2017年
2 记者 张梦然;燃煤中发现未知潜在毒副产品[N];科技日报;2017年
3 记者 刘霞;科学家绘出首个脊椎动物发育蓝图[N];科技日报;2008年
4 记者 陈丹;研究发现一些3D打印物品有毒[N];科技日报;2015年
5 宗华 编译;为细胞“立传”[N];中国科学报;2018年
6 记者 毛黎;2008年10大科学突破[N];科技日报;2008年
7 本报驻日内瓦记者 陈建;“中国创新”领跑日内瓦发明展[N];经济日报;2015年
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 祝琴芳;核仁蛋白Rcl1在斑马鱼肝脏发育过程中的功能研究[D];浙江大学;2019年
2 赵纾奕;Sas10和Mpp10的稳定性及其在斑马鱼肝脏发育过程中生物学作用研究[D];浙江大学;2018年
3 曹灵慧;利用斑马鱼模型研究HDCG1基因在血液发育中的功能[D];湖南师范大学;2018年
4 展延栋;斑马鱼尾动脉经内皮造血转化产生造血干细胞及前体细胞[D];西南大学;2019年
5 谢华平;利用斑马鱼模型研究Pygo1与fhlA基因的发育生物学功能[D];湖南师范大学;2012年
6 倪睿;Hars非经典功能调控斑马鱼血管发育机制研究[D];西南大学;2018年
7 熊舒婷;miR-200家族在斑马鱼生殖发育中的功能研究[D];华中农业大学;2018年
8 路畅;Dmrt2a和igf2bp1在斑马鱼胚胎发育中的功能研究[D];华中农业大学;2017年
9 邢延奕;斑马鱼dishevelled家族基因调节胚胎图式形成和原肠运动的突变分析[D];山东大学;2018年
10 肖超强;利用斑马鱼探讨氟喹诺酮结构与毒性的关系研究[D];北京协和医学院;2018年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 郑静;基于CRISPR/Cas9技术构建自闭症风险基因katnal2斑马鱼突变模型[D];华中科技大学;2019年
2 吴琼;cAMP/PKA通路介导的戊唑醇对斑马鱼性别分化影响的机制研究[D];浙江大学;2019年
3 卓凌;丙硫菌唑对斑马鱼生长繁殖的影响研究[D];湖南农业大学;2018年
4 吕冬俊;睡眠剥夺对鱼藤酮诱导的斑马鱼PD模型学习记忆和情绪的作用研究[D];苏州大学;2018年
5 王焱;斑马鱼stat1a/stat1b基因双突变对骨骼发育的影响研究[D];湖南师范大学;2019年
6 王宏波;利用CRISPR/Cas9技术构建斑马鱼cxxc5a基因敲除品系[D];湖南师范大学;2019年
7 万思瑶;stat1b基因突变对斑马鱼胚胎早期发育转录组调控的研究[D];湖南师范大学;2019年
8 左优;聚苯乙烯微塑料与四溴双酚—A对斑马鱼的复合毒性研究[D];长安大学;2019年
9 郑雪丹;Hedgehog信号在斑马鱼牙齿发育及再生中的作用[D];重庆医科大学;2019年
10 吕亚旗;UNC5C在淋巴管系统发育中的作用研究[D];厦门大学;2017年
中国知网广告投放
 快捷付款方式  订购知网充值卡  订购热线  帮助中心
  • 400-819-9993
  • 010-62791813
  • 010-62985026