小鼠PDIP1基因的克隆及功能研究
【摘要】:
PDIP1(polymerase delta-interacting protein 1)基因是在人HepG2细胞中克隆的一个基因。初步证实了PDIP1基因能与DNA聚合酶δ的小亚基p50和辅助蛋白PCNA相互作用。因此推测,PDIP1蛋白可能部分协助或参与DNA的复制和修复。此外,通过BLAST检索发现PDIP1蛋白与一个受TNF-α诱导的蛋白质B12十分相似,彼此的氨基酸序列高达70%是相同的。因此,推测PDIP1蛋白质可能与之有相似的生物功能。TNF-α是由激活的巨噬细胞产生的细胞激活素,能诱导细胞凋亡,特别是对肿瘤细胞。而B12在细胞凋亡过程中也有一定的作用。因此,PDIP1可能在细胞凋亡中也起到一定的作用。TNF-α的另一个重要功能是在肝脏受伤后启动肝脏再生。因此PDIP1基因也可能在肝脏再生过程中有一定的功能。
为了进一步研究PDIP1基因对细胞凋亡、肝脏再生的作用,我们首先采用RACE PCR的方法克隆了小鼠PDIP1基因的cDNA全长。小鼠PDIP1基因cDNA全长为1677bp,编码329个氨基酸残基。通过生物信息学分析,我们得知小鼠PDIP1基因位于7号染色体的F3位点上,可能是一个转录因子在细胞核内发挥生物功能。并且得知哺乳动物体内存在一个PDIP1基因家族,此家族至少含有三个基因,分别命名为PDIP1-α、PDIP1-β、PDIP1-γ。我们设计合适的探针,采用核酸酶保护反应等技术测定了PDIP1-α基因在肝脏部分切除后不同时间在小鼠肝脏中的表达,发现PDIP1-α基因在肝脏部分切除后表达增强,12小时表达最强,以后表达减弱。初步表明该基因对肝脏损伤后的修复与再生有关。