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《南华大学》 2012年
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广西沿海及邻近海区拟穴青蟹群体遗传多样性分析

孙奉玉  
【摘要】:目的:本文采用ISSR标记、RAPD标记和16SrRNA基因标记3种分子标记,分析广西沿海及其邻近海区拟穴青蟹的遗传多样性和群体遗传结构,为种质资源的保护和选育提供依据。 方法:1.应用ISSR标记技术分析来自广西沿海及其邻近海区的拟穴青蟹6个地理群体的遗传变异和遗传结构。2.采用随机扩增多态技术检测广西沿海及其邻近海区拟穴青蟹6个地理群体的遗传变异和遗传结构。3.采用线粒体16SrRNA基因片段分析广西沿海及其邻近海区拟穴青蟹6个地理群体遗传变异和遗传结构。 结果:1. ISSR标记用8条ISSR引物扩增111个个体,分析其中的66个位点,56个位点表现出多态性,结果表明在种水平上的多态位点百分率是84.85%。拟穴青蟹6个群体的多态位点百分率在51.52%-63.64%之间,平均为57.58%。群体的遗传多样性按自高至低顺序排列是清化群体党江群体钦州湾群体流沙湾群体珍珠湾群体闸口群体。总的遗传分化系数值(Gst=0.1841)AMOVA分析表明,群体内遗传变异占87.97%,群体间遗传变异占12.03%,流(Nm=2.2164)和两两群体间基因流(2.7348-6.7574)。 2. RAPD扩增得到8条10bp寡核苷酸随机引物扩增99个个体,分析其中的44个位点,31个位点表现出多态性,表明在种水平的多态位点百分率是70.45%。POPGENE分析结果表明,6个群体的多态位点百分率在29.55%-54.55%之间,平均为36.97%;群体的遗传多样性高低按自高至低顺序排列是钦州湾群体党江群体珍珠湾群体闸口群体清化群体流沙湾群体;AMOVA分析表明,群体内遗传变异占87.03%,群体间遗传变异占12.97%。 3.16SrRNA技术检测广西沿海及其邻近海区拟穴青蟹共得到528bp的片段,21种单倍型,6个群体的平均单倍型多样性(h)、核苷酸多样性(π)分别为0.6259、0.001851。6个群体间的遗传分化指数Fst为-0.1400-0.02977,仅0.1%的变异来自群体间(AMOVA分析),而基因交流值达-51.29-95.23,群体间K2-P遗传距离为0.0006-0.0016。结论:1.拟穴青蟹遗传多样性在甲壳类动物中处于较高的层次,但比甲壳类以外的几类经济海产动物遗传多样性低。 2. AMOVA分析表明拟穴青蟹群体内的遗传变异大于群体间的遗传变异。Mantel test显示拟穴青蟹6个群体间的遗传距离与地理距离之间的相关性不显著,6个群体间存在有效的基因流。 3.核DNA标记(ISSR、RAPD)和线粒体DNA标记揭示同一群体遗传背景表现出一定的差距,缘于核DNA标记扫描整个基因组,而线粒体基因标记针对的是单个基因位点。
【学位授予单位】:南华大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2012
【分类号】:S917.4

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【参考文献】
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