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《华南理工大学》 2012年
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低剂量抗生素刺激条件下耐药基因水平传播的机制研究

鲁曦  
【摘要】:食品的安全性,不仅是民生大计,更是国家文明程度的重要象征。而食源性致病菌,作为食品安全最重要的风险因素之一已成为了全球性公共安全问题。而耐药基因在食物链中的传递在食品安全的研究中往往被忽略。由于抗生素在医疗领域和畜牧业中的大量使用,使一些残留抗生素随医疗垃圾和动物粪便流入到了环境当中并发生扩散,形成亚抑菌浓度的抗生素。然而,目前对于人们对于低剂量抗生素刺激下耐药基因水平传播的影响机制了解的尚不透彻,这限制了人们对于食源微生物中的耐药基因向人体传递这一潜在风险的认知。本研究从食品安全角度出发,以食源性致病菌作为研究对象,围绕耐药基因水平传播的机理及抑制方法进行了系统和深入的研究,首先在四种不同抑菌机制的抗生素的分别刺激条件下,研究了对大肠杆菌耐药基因水平传播效率的影响,发现在低于50%MIC(最小抑菌浓度)的环丙沙星、链霉素、氨苄西林的刺激条件对于耐药基因水平传播具有促进作用。随后利用蛋白质双向电泳技术,研究了亚抑菌浓度抗生素刺激条件下发生表达差异的蛋白,在所有差异蛋白中有7种与细菌耐药基因水平传播相关,分别是gspE、tesB、lexA、ftsZ、ftsY、kdsD、sul1。经过实时荧光定量PCR对编码上述7种蛋白的基因在RNA转录水平验证,证实了其中2个基因gspE、tesB在四种不同抑菌机制抗生素的分别刺激下均发生了差异表达,且变化趋势一致。然后通过构建gspE和tesB基因表达载体,并在大肠杆菌体内进行诱导,发现tesB基因高效表达时能够有效抑制耐药基因的水平传播(p0.01);而gspE基因的高效表达具有促进耐药基因水平传播的作用(p0.01)。研究结果说明,tesB基因和gspE基因是大肠杆菌耐药基因水平传播的过程的关键基因。这一发现对于科学地缓解耐药基因水平传播、抑制耐药基因在食物链中的传递提供可行的研究方向。
【关键词】:食品安全 大肠杆菌 耐药基因 水平传播 亚抑菌浓度抗生素
【学位授予单位】:华南理工大学
【学位级别】:博士
【学位授予年份】:2012
【分类号】:TS201.6;R155.5
【目录】:
  • 摘要5-6
  • Abstract6-7
  • 英文缩写词表7-11
  • 第一章 绪论11-27
  • 1.1 食源微生物中耐药基因的安全性问题11-17
  • 1.1.1. 食源微生物中耐药基因的存在状况11-15
  • 1.1.2. 食源微生物中耐药基因的安全性问题15-17
  • 1.2 环境中的低剂量抗生素的分布17-21
  • 1.2.1 环境中低剂量抗生素的分布17-18
  • 1.2.2 低剂量抗生素对微生物的影响18-21
  • 1.3 细菌抗性机制及抗性基因的鉴定21-25
  • 1.3.1 耐药基因的移动机制21-22
  • 1.3.2 细菌耐药基因快速检测技术22-25
  • 1.4 本课题的研究意义及主要内容25-27
  • 1.4.1 研究背景及意义25-26
  • 1.4.2 主要研究内容26-27
  • 第二章 耐药基因快速检测平台的建立以及在食品样本检测中的应用27-37
  • 2.1 引言27-28
  • 2.2 实验材料与设备28-31
  • 2.2.1 菌株和耐药质粒28
  • 2.2.2 食品样本28
  • 2.2.3 主要试剂28
  • 2.2.4 主要仪器设备28
  • 2.2.5 实验引物28-31
  • 2.3 实验过程与方法31-32
  • 2.3.1 样品处理31
  • 2.3.2 耐药菌株分离培养31
  • 2.3.3 样本及菌株DNA提取31
  • 2.3.4 PCR方法扩增样本中的耐药基因31-32
  • 2.3.5 LAMP方法筛查样本中的耐药基因32
  • 2.4 结果与讨论32-36
  • 2.4.1 试验结果32-34
  • 2.4.1.1 食品样本中耐药菌株筛选计数32-33
  • 2.4.1.2 PCR法检测食源菌中的耐药基因33-34
  • 2.4.1.3 LAMP法检测食源菌中的耐药基因34
  • 2.4.2 讨论34-36
  • 2.5 本章小结36-37
  • 第三章 亚抑菌浓度抗生素刺激条件下耐药基因的水平传播规律研究37-51
  • 3.1 引言37
  • 3.2 实验材料与设备37-40
  • 3.2.1 主要仪器设备37-38
  • 3.2.2 主要试剂38
  • 3.2.3 实验质粒和菌株38-39
  • 3.2.4 常用溶液和培养基配制39-40
  • 3.3 实验过程与方法40-46
  • 3.3.1 实验流程40-41
  • 3.3.2 试验方法41-46
  • 3.4 结果与讨论46-50
  • 3.4.1 试验结果46-48
  • 3.4.2 讨论48-50
  • 3.5 本章小结50-51
  • 第四章 亚抑菌浓度抗生素刺激下耐药基因水平传播的比较蛋白质组学研究51-72
  • 4.1 引言51
  • 4.2 实验材料与设备51-55
  • 4.2.1 实验菌株51
  • 4.2.2 实验试剂51-54
  • 4.2.3 主要仪器设备54-55
  • 4.3 实验过程与方法55-62
  • 4.3.1 试验方法55-62
  • 4.4 结果与讨论62-70
  • 4.4.1 试验结果62-68
  • 4.4.2 讨论68-70
  • 4.5 本章小结70-72
  • 第五章 亚抑菌浓度抗生素刺激条件下耐药基因水平传播的转录水平研究72-89
  • 5.1 引言72
  • 5.2 实验材料与设备72-74
  • 5.2.1 实验样品72-73
  • 5.2.2 主要试剂73
  • 5.2.3 主要仪器设备73-74
  • 5.3 实验过程与方法74-77
  • 5.3.1 样品RNA提取74-75
  • 5.3.2 样品RNA琼脂糖电泳75
  • 5.3.3 RNA的逆转录75-76
  • 5.3.4 荧光定量PCR76-77
  • 5.3.5 数据分析与处理77
  • 5.4 结果与讨论77-87
  • 5.4.3 RNA提取结果77-78
  • 5.4.4 荧光定量PCR特异性验证78-83
  • 5.4.5 实时荧光定量PCR试验结果83-86
  • 5.4.6 讨论86-87
  • 5.5 本章小结87-89
  • 第六章 大肠杆菌耐药基因水平传播的机制研究89-120
  • 6.1 引言89
  • 6.2 材料与方法89-95
  • 6.2.1 主要仪器设备89-90
  • 6.2.2 主要试剂和耗品90
  • 6.2.3 菌株90
  • 6.2.4 培养基和常用溶液配制90-95
  • 6.2.5 引物95
  • 6.3 实验方法95-105
  • 6.3.1 克隆载体pMD18-gspE和pMD18-tesB的构建95-99
  • 6.3.2 表达载体pET19b-gspE和pET19b-tesB的构建99-100
  • 6.3.3 E. coli GSPE-E 和E. coli TESB-E表达产物鉴定及诱导条件优化100-104
  • 6.3.4 工程菌E. coli TESB-E和E. coli GSPE-E感受态细胞的制备104
  • 6.3.5 R388 质粒分别转化工程菌E. coli TESB-E和E. coli GSPE-E104
  • 6.3.6 工程菌E. coli TESB-E和E. coli GSPE-E的诱导104
  • 6.3.7 低剂量抗生素刺激条件下耐药基因水平传播实验104
  • 6.3.8 无抗生素刺激条件下耐药基因水平传播实验104-105
  • 6.3.9 整合效率测定105
  • 6.4 结果与讨论105-118
  • 6.4.1 克隆载体pMD18-tesB和pMD18-gspE的验证结果105-107
  • 6.4.2 表达载体pET19b-tesB和pET19b-gspE的构建与验证107-112
  • 6.4.3 Western blot对E. coli TESB-E 和E. coliGSPE-E表达产物鉴定及诱导条件优化112-114
  • 6.4.4 诱导tesB基因高效表达对耐药基因水平传播效率的影响114-116
  • 6.4.5 诱导gspE基因高效表达对接合效率的影响116-118
  • 6.5 本章小结118-120
  • 结论与展望120-124
  • 结论120-122
  • 创新之处122-123
  • 展望123-124
  • 附录 1124-133
  • 附录 2133-147
  • 附录 3147-148
  • 附录 4148-149
  • 附录 5149-150
  • 附录 6150-151
  • 参考文献151-163
  • 攻读博士学位期间取得的研究成果163-166
  • 致谢166-168
  • 附件168

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