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《广东海洋大学》 2018年
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弓背青鳉线粒体DNA遗传多样性分析

龙水生  
【摘要】:弓背青鳉(Oryzias curvinotus)隶属怪頜鳉科(Adrianichthyidae),青鳉属(Oryzias),是一种广盐性、广温性、产卵量大、世代周期短及易于在实验室饲养的小型鱼类。弓背青鳉(O.curvinotus)是南方沿海分布的土著鱼类,与同属中研究最为清晰的日本青鳉(Oryzias latipes)亲缘关系密切,且都具有XX-XY性别控制系统,具有极好的理论研究价值。对弓背青鳉(O.curvinotus)生态学调查及其线粒体DNA遗传多样性分析,丰富了其生物学背景研究,为发展弓背青鳉(O.curvinotus)为模式生物的研究提供支撑。具体研究结果主要包括五部分:1.弓背青鳉(O.curvinotus)的生态学调查水的理化指标:盐度范围为0.14-33.57;水温范围为9.58-40.9℃;p H值范围为7.2-9.38;溶解氧的范围为2.11-17.12 ppm。弓背青鳉(O.curvinotus)栖息生境特征是:生活在水流平缓并有植物的水域中,一旦食蚊鱼(Gambusia affinis)发展成为优势种,弓背青鳉(O.curvinotus)的数量将大大减少。2.盐度对弓背青鳉(O.curvinotus)受精卵孵化的影响粤西高桥地区弓背青鳉(O.curvinotus)的受精卵在淡水到45盐度范围内均可孵化,在25盐度时,受精卵的孵化率最高;在20盐度时,受精卵的孵化周期、培育周期均最长,而低盐度(0-10)和高盐度(40-45)周期相对较短。3.弓背青鳉(O.curvinotus)遗传性别鉴定开发了1对可以快速、准确鉴定弓背青鳉(O.curvinotus)遗传性别的引物,该对引物通过PCR扩增和琼脂糖凝胶电泳可以判定检测个体的遗传性别,雄性个体(XY)可以扩增出959 bp和656 bp 2条条带,而雌性个体(XX)只能扩增出1条656 bp条带。4.弓背青鳉(O.curvinotus)线粒体基因组全序列测定与系统进化分析测定并注释了弓背青鳉(O.curvinotus)线粒体基因组全序列,结果表明,弓背青鳉(O.curvinotus)线粒体基因组序列全长为16676 bp,基因排列和构成与其他硬骨鱼大体一致,包含37个基因和1个控制区。13个蛋白质编码基因,除了COⅠ基因以GTG为起始密码子外,其余编码蛋白基因均以ATG为起始密码子。22个t RNA基因的二级结构均呈典型的三叶草状。基于9种青鳉属(Oryzias)鱼类线粒体基因组全序列构建的进化树表明,弓背青鳉(O.curvinotus)与吕宋青鳉(Oryzias luzonensis)的亲缘关系比较近。5.基于COⅠ基因与D-loop区的南方沿海弓背青鳉(O.curvinotus)遗传多样性分析基于mtDNA COⅠ基因分析结果:136条COⅠ基因序列(579 bp)中,共发现77个变异位点,碱基转换/颠换比值(TS/TV)为5.42;平均核苷酸差异数、核苷酸多样性、单倍型多样性及单倍型数分别为9.709、0.01677、0.967、52;AMOVA分析揭示遗传差异主要发生在群体间;基于COⅠ基因序列构建的进化树绝大多数个体按照采样点进行聚类。基于mtDNA D-loop分析结果:141条D-loop区序列(507 bp)中,共检测到37个变异位点,碱基转换/颠换比值(TS/TV)为2.79;平均核苷酸差异数、核苷酸多样性、单倍型多样性及单倍型数分别为2.923、0.00577、0.911、29;AMOVA分析揭示遗传差异主要发生在群体间;基于D-loop区构建的进化树,多数个体没能按照采样点进行聚类。研究表明,弓背青鳉(O.curvinotus)线粒体COⅠ基因比D-loop区具有更多的信息位点,更适合用于弓背青鳉(O.curvinotus)的遗传多样性研究。根据COⅠ基因和D-loop区序列检测群体遗传多样性的结果,南方沿海弓背青鳉(O.curvinotus)群体的遗传多样性高,群体经历过群体扩张事件,遗传结构分化明显,因此需要划定保护单元。
【学位授予单位】:广东海洋大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2018
【分类号】:S917.4

【参考文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 刘军;赵良杰;刘其根;张宏;;不同水系银鲴自然群体线粒体COI基因遗传变异研究[J];淡水渔业;2015年06期
2 曹艳;章群;宫亚运;吕金磊;杨喜书;;基于线粒体COI序列的中国沿海蓝点马鲛遗传多样性[J];海洋渔业;2015年06期
3 傅建军;王荣泉;沈玉帮;宣云峰;徐晓雁;刘承初;李家乐;;我国草鱼野生群体D-Loop序列遗传变异分析[J];水生生物学报;2015年02期
4 朱惠敏;连一阳;王中铎;郭昱嵩;刘楚吾;;基于cox1条形码的鱼肚DNA分子鉴定[J];广东海洋大学学报;2014年06期
5 胡静;侯新远;尹绍武;祝斐;贾一何;胡亚丽;;基于mtDNA ND1基因序列研究不同地理群体波纹唇鱼的遗传多样性和遗传分化[J];海洋通报;2014年02期
6 姬南京;常亚青;赵冲;宋坚;高银雪;;3个地理群体仿刺参D-loop序列的变异及系统发生分析[J];水产学报;2014年04期
7 张陆伟;蔡磊明;赵学平;刘新洋;;3种杀菌剂对日本青鳉早期生命阶段毒性效应初步研究[J];环境科学学报;2013年10期
8 董志国;李晓英;王普力;王文进;张庆起;阎斌伦;孙效文;;基于线粒体D-loop基因的中国海三疣梭子蟹遗传多样性与遗传分化研究[J];水产学报;2013年09期
9 蒋霞敏;彭瑞冰;罗江;唐锋;;温度对拟目乌贼胚胎发育及幼体的影响[J];应用生态学报;2013年05期
10 尤宏争;郑艳坤;尤广超;;不同盐度对鱼类养殖生物学的影响研究进展[J];河北渔业;2013年03期
中国重要会议论文全文数据库 前2条
1 龙水生;廖健;黄承勤;张海瑞;黄顺楷;王中铎;;雷州半岛3种棘鲷属鱼类cox1基因序列分析及系统进化[A];2016年中国水产学会学术年会论文摘要集[C];2016年
2 郭昱嵩;王中铎;刘楚吾;陈志明;刘筠;;勒氏笛鲷(Lutjanus russellii)线粒体DNA全序列的测定与分析[A];中国海洋学会2007年学术年会论文集(下册)[C];2007年
中国硕士学位论文全文数据库 前9条
1 程亚欣;基于线粒体控制区和细胞色素B基因的江豚种群遗传多样性和遗传结构分析[D];上海海洋大学;2016年
2 郑淑贤;基于FVCOM的琼州海峡潮汐潮流数值模拟与研究[D];中国海洋大学;2015年
3 张久盘;基于mtDNA Cyt b基因和D-loop区的祁连山裸鲤遗传多样性及分类地位分析[D];甘肃农业大学;2015年
4 张静;青鳉性腺发育的组织学观察和DMY、Dmrt1基因的表达分析[D];上海海洋大学;2013年
5 赵旭;黄河流域大鳞副泥鳅遗传多样性分析[D];河南师范大学;2012年
6 李志国;青鳉的生态学调查及其在不同盐度下的繁殖生物学研究[D];河北农业大学;2010年
7 乐小亮;中国野生香鱼(Plecoglossus altivelis)遗传多样性分析[D];暨南大学;2010年
8 伊西庆;中国东部6个大型湖泊翘嘴鲌(Culter alburnus)遗传多样性的线粒体ND2基因序列分析[D];暨南大学;2009年
9 刘念;隆额网翅蝗线粒体基因组全序列的测定与分析[D];陕西师范大学;2006年
【共引文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 彭瑞冰;乐可鑫;蒋霞敏;丰迅;汪元;韩庆喜;;虎斑乌贼受精卵卵黄营养成分分析[J];水产学报;2015年07期
2 傅建军;徐如卫;薛婷;杨福生;姜虎成;李家乐;;3种泥鳅微卫星标记和D-Loop部分序列遗传变异分析[J];水产学报;2015年04期
3 王景;张凤英;蒋科技;马春艳;宋炜;林楠;姜亚洲;李圣法;程家骅;马凌波;;基于线粒体COⅠ基因序列的三疣梭子蟹东海区群体遗传多样性分析[J];海洋渔业;2015年02期
4 廖朝选;张清海;杨鸿波;欧明烛;陈迎丽;李荣华;段亚玲;;灭菌唑对日本鹌鹑的急性毒性评价[J];贵州科学;2014年06期
5 杨子拓;刘丽;;线粒体分子标记技术在水产养殖行业的应用[J];广东农业科学;2014年22期
6 钟全福;;黑莓鲈胚胎发育观察及温度对胚胎发育的影响[J];福建水产;2014年05期
7 高银雪;常亚青;庞震国;白雪秋;姬南京;;基于微卫星标记的地理群体仿刺参遗传结构判别分析模型的建立[J];水产学报;2014年09期
8 乐可鑫;蒋霞敏;彭瑞冰;罗江;唐锋;王春琳;;4种生态因子对虎斑乌贼幼体生长与存活的影响[J];生物学杂志;2014年04期
9 杨爽;宋娜;张秀梅;王云中;王四杰;高天翔;;基于线粒体控制区序列的三疣梭子蟹增殖放流亲蟹遗传多样性研究[J];水产学报;2014年08期
10 王洪盼;赵艳民;秦延文;刘宪斌;;Cu~(2+)和Cd~(2+)对日本青鳉(Oryzias latipes)早期发育阶段的急性毒性效应研究[J];生态毒理学报;2014年04期
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 龙水生;弓背青鳉线粒体DNA遗传多样性分析[D];广东海洋大学;2018年
2 高玉雪;大黄鱼性别决定候选基因Dmrt1功能的初步研究[D];集美大学;2018年
3 方冬冬;淮河源区(?)遗传多样性的研究[D];河南师范大学;2018年
4 首智宇;基于流场数值模拟的灌门航道船舶航行研究[D];大连海事大学;2018年
5 陈月华;中国沿海双带缟虾虎鱼的亲缘地理的研究[D];上海海洋大学;2017年
6 李珺;似然法在物种鉴定中的可行性研究[D];东北林业大学;2017年
7 彭亚;玻璃扯旗鱼性腺发育及其相关基因Vasa的克隆与表达研究[D];湖南农业大学;2017年
8 闫浩;两类生殖激素在滩头雅罗鱼性腺发育周期中的作用研究[D];上海海洋大学;2017年
9 常会会;四种蝗虫线粒体基因组的测定及比较和谱系基因组学分析[D];陕西师范大学;2017年
10 庞坤;基于CFD的琼州海峡峡口处潮流场数值模拟[D];大连海事大学;2017年
【二级参考文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 薛丹;章群;郜星晨;宫亚运;曹艳;;基于线粒体控制区的粤闽三线矶鲈地理群体的遗传变异分析[J];海洋渔业;2014年06期
2 胡静;侯新远;尹绍武;祝斐;贾一何;王小军;;基于mtDNA COⅠ和Cytb基因序列对南中国海不同海域波纹唇鱼群体遗传多样性的研究[J];水生生物学报;2014年06期
3 李树华;陈大庆;段辛斌;刘绍平;汪登强;;基于线粒体DNA标记的长江中游草鱼亲本增殖放流的遗传效果评估[J];淡水渔业;2014年03期
4 郑元甲;李建生;张其永;洪万树;;中国重要海洋中上层经济鱼类生物学研究进展[J];水产学报;2014年01期
5 贺刚;方春林;吴斌;傅培峰;王生;陈文静;;银鲴生物学及遗传多样性的研究现状[J];江西水产科技;2013年03期
6 张峻德;赵良杰;刘其根;;千岛湖细鳞鲴和黄尾鲴COI种群遗传结构比较的初步研究[J];淡水渔业;2013年05期
7 赵良杰;何光喜;周小玉;贾佩峤;武震;宋固;张宏;刘其根;;千岛湖大眼华鳊形态度量学和D-loop序列分析[J];水产学报;2013年03期
8 傅建军;李家乐;沈玉帮;王荣泉;宣云峰;徐晓雁;陈勇;;草鱼野生群体遗传变异的微卫星分析[J];遗传;2013年02期
9 朱叶;章群;李贵生;刘海林;马奔;黄小彧;司从利;;中国近海角木叶鲽(Pleuronichthys cornutus)种群遗传多样性研究[J];海洋通报;2012年05期
10 胡玉婷;杨少荣;黎明政;曹文宣;刘焕章;;鄱阳湖及邻近水系银鲴的种群分化研究[J];四川动物;2012年05期
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 马云龙;南海北部环流观测研究[D];大连海洋大学;2014年
2 方雪原;北部湾冬夏季环流及其水交换的数值模拟研究[D];中国海洋大学;2014年
3 贾向阳;拟缘(鱼央)(Liobagrus marginatoides)遗传多样性及其种群结构分析[D];重庆师范大学;2014年
4 吴坤俊;琼州海峡客滚船服务型海事监管模式研究[D];大连海事大学;2013年
5 杨万康;南海北部潮汐潮流的数值模拟与研究[D];中国科学院研究生院(海洋研究所);2012年
6 齐继峰;大连獐子岛附近海域三维潮汐潮流数值模拟与研究[D];中国海洋大学;2011年
7 赵琦;利用Cyt b基因和CO Ⅰ基因探讨威海和青岛海域文昌鱼的分类地位及遗传学多样性[D];山东大学;2010年
8 梁佳轩;基于Cytb和D-loop区序列分析太白山溪鲵的谱系地理学[D];陕西师范大学;2010年
9 张艳春;大口鳒Psettodes erumei线粒体全序列的研究和鲽形目鱼类系统进化分析[D];中国海洋大学;2009年
10 周丽;大鳍鳠(Mystus macropterus Bleeker)遗传多样性及其线粒体控制区结构的研究[D];西南大学;2008年
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中国期刊全文数据库 前2条
1 董忠典;龙水生;黄承勤;黄顺楷;张宁;应子钰;郭昱嵩;王中铎;;一种快速鉴定弓背青鳉遗传性别的方法[J];广东海洋大学学报;2018年03期
2 郭昱嵩;王中铎;刘皓;张艳苹;刘丽;刘楚吾;;弓背青鳉在生物科学专业发育生物学综合性实验设计中的应用[J];教育现代化;2017年43期
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1 黄承勤;龙水生;王中铎;郭昱嵩;;基于转录组测序的弓背青鳉微卫星标记筛选[A];2017年中国水产学会学术年会论文摘要集[C];2017年
2 龙水生;黄承勤;张海瑞;黄顺楷;马江茹;汪淳;董忠典;郭昱嵩;王中铎;;基于mtDNA COⅠ基因和D-loop区的中国南海弓背青鳉遗传多样性分析[A];2017年中国水产学会学术年会论文摘要集[C];2017年
中国硕士学位论文全文数据库 前2条
1 龙水生;弓背青鳉线粒体DNA遗传多样性分析[D];广东海洋大学;2018年
2 廖健;雷州半岛红树林区仔稚幼鱼多样性及弓背青鳉对壬基酚的响应[D];广东海洋大学;2017年
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