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五株芽胞杆菌鉴定

张福特  
【摘要】:根据多相分类鉴定原则,应用传统分类(表型特征)、化学分类(磷酸类脂、脂肪酸)和分子分类(16S rDNA、(G+C) mol%、DNA-DNA杂交)相结合的方法,对分离于海南文昌八门湾红树林沉积物和尖峰岭、佳西热带雨林土壤的五株芽胞杆菌HB12575、HB12576、HB12037、DB13031和DB13260进行了分类鉴定,结果如下: 菌株HB12575:革兰氏阳性,杆状,好氧,有运动性。在TSB固体培养基上培养1d可见清晰菌落,菌落圆、乳白色至淡黄色、表面光滑、凸起。耐盐度0-14%(最适0-2%);生长pH范围7.0-9.5(最适pH7.5);生长温度范围5-45℃(最适300C)。主要的磷酸类脂类型:磷脂酰肌醇甘油糖脂(PIM)、磷酸酰肌醇(PI)、磷酸酰甘油(LPG)、磷脂酰甲基乙醇胺(PME)和双磷脂酰甘油(DPG)。主要的脂肪酸:iso-C14:0(4.9%)、iso-C15:0(10.4%)、anteiso-C15:0(51.9%)、iso-C16:0(10.8%)和anteiso-C17:0(10.1%)。DNA (G+C)为45.3mo1%。对16S rDNA序列进行比对分析,同源性最高的模式菌株为Bacillus decolorationis LMG19507T(97.7%),并在发育树上处于同一分支,二者DNA-DNA杂交率为91.5%。因此,将菌株HB1257鉴定为Bacillus decolorationis(脱色芽胞杆菌)。 菌株HB12576T:革兰氏阳性,杆状,好氧,有运动性,菌体大小范围0.7-1.0×2.8-3.5μm。在TSB固体培养基上培养1d可见清晰菌落,菌落边缘不整齐、扁平、表面光滑、乳白色;耐盐度0-15%(最适1-4%),生长pH范围6.0-11.0(最适pH9.0-10.5),生长温度范围20-55℃(最适32-37℃)。主要的磷酸类脂:磷脂酰胆碱(PC)、磷脂酰乙醇胺(PE)、磷脂酰甲基乙醇胺(PME)和双磷脂酰甘油(DPG);主要的脂肪酸:iso-C14:0(21.7%)、C15:0(11.7%)、aneiso-C15:0(33.1%)、iso-C16:0(8.6%)和C12:1ω9c(10.9%)。 DNA (G+C)为51.7mol%。对16SrDNA序列进行比对分析,同源性最高的模式菌为Bacillus okuhidensis GTC854T (95.2%).因此,将菌株HB12576T鉴定为Bacillus(芽胞杆菌属)的一个新种,命名为Bacillus dongjiaoensis sp. nov.(东郊芽胞杆菌)。 菌株HB12037T:革兰氏阳性,好氧,杆状,有运动性,菌体大小范围0.8-1.2×3.5-4.5μm。在TSB培养基上培养24h后,菌落扁平、灰白色、表面光滑;耐盐度0-15%(最适1-4%),生长pH范围5.5-11.5(最适pH7.5-9.0),生长温度范围20-45℃(32-37℃)。主要的磷酸类脂:双磷脂酰甘油(DPG)、磷脂酰甲基乙醇胺(PME)、磷脂酰乙醇胺(PE)。主要的脂肪酸:anteiso-C15:0(43.1%), C15:0(3.2%), iso-C15:0(5.7%), iso-C16:0(10.1%), C17:0(11.6%)和cis-C16:1(4.3%)。DNA(G+C)为53.9mol%。对16S rDNA序列进行比对分析,同源性最高的模式菌为Paenibacillus xylanilyticus XIL14T (95.9%)。因此,将菌株HB12037T鉴定为Paenibacillus(类芽胞杆菌属)的一个新种,命名为Paenibacillus bamenwangensis sp. nov.(八门湾类芽胞杆菌)。 菌株DB13031T:革兰氏阴性,好氧,杆状,有运动性,菌体大小范围0.5-0.7×2.0-3.0μm。在TSB固体培养基上培养1d可见清晰菌落。菌落圆形、扁平、表面光滑、乳白色;耐盐度0-4%(最适0-2%),生长pH范围5.5-11.5(最适pH7.5-9.5),生长温度范围10-53℃(最适30-37℃)。主要的磷酸类脂:磷脂酰胆碱(PC)、双磷脂酰甘油(DPG)、磷酸酰肌醇(PI)、磷脂酰乙醇胺(PE)、磷酸酰甘油(LPG)和磷酸酰甘油(PG)。主要的脂肪酸:iso-C15:0(4.2%、anteiso-C15:0(54.8%)、iso-C16:0(12.1%)、C16:0(13.7%)和anteiso-C18:0(4.4%)。(G+C) mol%为49.7%。对16S rDNA序列进行比对分析,同源性最高的模式菌为Paenibacillus barcinonensis BP-23T (98.3%),并在发育树上处于同一分支上,二者DNA-DNA杂交率为38.1%。将菌株DB13031T鉴定为Paenibacillus(类芽胞杆菌属)的一个新种,命名为Paenibacillus jiaxiensis sp. nov.(佳西芽胞杆菌)。 菌株DB13260T:革兰氏阴性,好氧,杆状,有运动性,菌体直径1.0-1.6×3.0-5.0μm。在TSB固体培养基上培养1d可见清晰菌落,菌落圆、扁平、表面光滑、乳白色。耐盐度0-4%(最适0%),生长pH范围6.0-10.5(最适pH8.5-9.0),生长温度范围5-40℃(最适30-37℃)。主要的磷酸类脂:双磷脂酰甘油(DPG)、磷脂酰甲基乙醇胺(PME)、磷脂酰乙醇胺(PE)、磷脂酰胆碱(PC)、磷酸酰甘油(LPG)、磷脂酰肌醇甘油糖脂(PIM)和磷酸酰肌醇(PI);主要的脂肪酸:iso-C14:0(7.13%)、C14:0(3.0%)、iso-C15:0(5.9%)、anteiso-C15:0(43.9%)、 iso-C16:0(19.7%)、C16:0(13.6%)和anteiso-C17:0(2.4%)。DNA (G+C) mol%为53.7%。对16S rDNA序列进行比对分析,同源性最高的模式菌株为Paenibacillus anaericanus MH21T (98.3%),并在发育树上处于同一分支上,二者DNA-DNA杂交率为60.4%。将菌株DB13260T鉴定为Paenibacillus(类芽胞杆菌属)的一个新种,命名为Paenibacillus jianfenglingensis sp. nov.(尖峰岭芽胞杆菌)。


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