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《广西大学》 2013年
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施氏獭蛤(Lutraria siebaldii)群体遗传学的研究

何俊锋  
【摘要】:本实验采用形态差异以及AFLP技术、线粒体16S rRNA基因片段序列2种分子标记方法,对广西钦州、北海、防城港和广东湛江的施氏獭蛤4个野生群体以及海南、越南2个菲律宾獭蛤野生群体的遗传多样性和系统发育进行了研究,以期为施氏獭蛤分类鉴定、遗传育种和种质资源管理提供理论依据。主要研究结果如下:1、采用主成分分析、聚类分析和判别分析3种分析方法,对施氏獭蛤4个群体和菲律宾獭蛤2个群体的形态差异进行了比较分析。获得了 3个主成分,其贡献率分别为47.52%、21.39%和19.69%,累计贡献率为88.60%。聚类分析结果显示:施氏獭蛤钦州、湛江、北海和防城港4个群体的形态较为接近,而菲律宾獭蛤海南和越南群体与施氏獭蛤4个群体的趋异较大,已达到种间水平。判别分析建立的判别函数的判别准确率P1为80.0%-93.3%,判别准确率P2为83.3%-89.7%,综合判别率为86.7%。2、运用AFLP技术对施氏獭蛤4个群体和菲律宾獭蛤2个群体共176个样品进行遗传多样性分析,所筛选的5对引物扩增共得到438个位点,平均多态位点比率85.16%,平均每对引物组合扩增出87.6个位点。检测到39个特异性位点,可以用作2个物种鉴别的分子标记。施氏獭蛤4个群体和菲律宾獭蛤2个群体的Nei's基因多样性(H)和香农多样性指数(I)检测的遗传多样性是一致的,由高到低的顺序依次为防城港群体湛江群体越南群体北海群体海南群体钦州群体。施氏獭蛤4个群体的遗传距离为0.0287~0.0567,菲律宾獭蛤海南和越南群体的遗传距离为0.0214,施氏獭蛤4个群体和菲律宾獭蛤2个群体的遗传距离为:0.0820~0.1053,用UPGMA法进行聚类分析表明,施氏獭蛤4个群体和菲律宾獭蛤2个群体主要分成2支,在施氏獭蛤群体内,钦州与湛江群体先聚在一起,然后与北海群体聚在一起,最后再与防城港群体聚成一支,菲律宾獭蛤海南和越南2个群体聚成一支,最后这两支再聚成一个整体。结合遗传距离和聚类分析,说明了施氏獭蛤4个群体属于种群间水平。施氏獭蛤4个群体和菲律宾獭蛤2个群体的分子变异分析(AMOVA)结果表明:施氏獭蛤4个群体和菲律宾獭蛤2个群体间的遗传分化指数(Φst)为0.2014(p0.001),79.86%的遗传变异存在于群体内,而只有20.14%的变异存在于种群间,说明施氏獭蛤4个群体和菲律宾獭蛤2个群体的遗传变异主要来源于群体内个体间的遗传差异。3、在系统发育方面,对施氏獭蛤4个群体115个样品的线粒体16S rRNA基因片段进行PCR扩增和序列测定,得到长度为449 bp的基因片段,共获得15种单倍型,平均单倍型基因多样性(Hd)为0.230,平均核苷酸差异数(K)为0.915。从施氏獭蛤4个群体得到的15个单倍型与2种獭蛤(弓獭蛤和菲律宾獭蛤)以及菲律宾蛤仔和杂色蛤仔分子系统树可以看出,施氏獭蛤4个群体所有单倍型与弓獭蛤先聚在一起,然后与菲律宾獭蛤聚成一支,而亲缘关系较近的外源种群菲律宾蛤仔和杂色蛤仔先聚为一支,然后2支再聚为一大支。
【学位授予单位】:广西大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2013
【分类号】:S917.4

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