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《广西大学》 2004年
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广西猪瘟病毒扁桃体和流产胎儿来源株E2基因的克隆、测序及遗传学分析

袁朝霞  
【摘要】:本研究采用RT-PCR技术对来自广西不同地区的120份健康猪扁桃体和84份流产胎儿进行CSFV检测,从得到的9份阳性病料中选取6份进行猪瘟病毒E2全基因的扩增、克隆、测序和遗传学分析,得到长度为1119bp、编码373个氨基酸残基的目的基因片段。 应用DNAstar序列分析软件对所测定的6个广西毒株与已知序列的HCLV、Shimen等毒株的相应片段进行同源性分析比较。结果显示,HCLV与Shimen核苷酸和推定的氨基酸的同源性分别为95.5%和94.6%,广西株与HCLV、Shimen株的核苷酸同源性分别为92.5%96.6%和89.8%~93.9%,推定的氨基酸同源性分别为90.0%~98.4%和86.3%~94.1%。广西毒株之间核苷酸和推定的氨基酸同源性分别为93.1%~99.6%和86.3%~99.2%。说明广西毒株之间的同源性很高,而广西毒株与Shimen之间同源性比较低,但与HCLV同源性较高。6个广西毒株E2基因的所有Cys位点都没变,可推测CSFV E2蛋白在抗原结构方面依然保持很高的稳定性。与标准毒株和疫苗毒相比,广西毒株在具有中和特性的B、C区域内721和724氨基酸位点发生了变异,这些变异可能导致E2蛋白的抗原性发生改变,从而使广西CSFV逃离疫苗毒的免疫保护。 广西大学硕士论文广西猪疽病毒扁桃体和流产胎儿来源株E2基因的克隆、侧序及遗传学分析 把6个广西毒株与国内外已发表的CSFV相应序列进行比较, 并建立了遗传进化树。该遗传树主要分为两大群和一个另类,广西 株皆属于基因群I,与我国的主要参考毒株HCLV、Shimen属于同 一基因群,说明广西CSFV株与HCLV、Shimen变异不大。
【学位授予单位】:广西大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2004
【分类号】:S852.65

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【引证文献】
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