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基于年龄因素对肠道息肉发生相关的肠道菌群构成和多样性分析研究

鲁弘骎  
【摘要】:背景:结直肠息肉是来源于肠黏膜上皮的局限性隆起,具有潜在进展为结直肠癌的风险。肠道菌群对结直肠息肉发生发展有促进作用,已有研究显示,结直肠息肉患者存在肠道菌群失调。肠道菌群与饮食、地域等因素有关,目前关于广西人群中结直肠息肉患者菌群特征的研究尚少。目的:探讨广西结直肠息肉患者和肠镜检查阴性人群肠道菌群的差异。方法:收集2018年6月至2019年1月在广西医科大学第一附属医院就诊的结直肠息肉患者及健康对照组粪便样本。试剂盒提取样本总DNA,使用338F和806R作为引物扩增16S rDNA基因的V4可变区,用凝胶回收试剂盒纯化扩增产物,在Miseq PE300平台上将纯化后的扩增片段构建文库。在I-Sanger云平台上进行高通量测序分析并用统计学方法分析数据。结果:粪便样本来源于7例结直肠息肉患者以及46例健康志愿者。(1)结直肠息肉组和健康对照组粪便细菌的群落丰富度无显著差异(Shannon指数:P=0.703)。(2)结直肠息肉组与健康对照组微生物结构存在显著差异。在门分类水平上,结直肠息肉组与健康对照组均以厚壁菌门(Firmicutes)、拟杆菌门(Bacteroidetes)、和变形菌门(Proteobacteria)为主,其中结直肠息肉组梭杆菌门(Fusobacteria)的相对丰度显著低于健康对照组(P=0.046)。(3)在科分类水平上,结直肠息肉组与健康对照组均以拟杆菌科(Bacteroidaceae)、毛螺菌科(Lachnospiraceae)、胃瘤菌科(Ruminococcaceae)为主。其中,结直肠息肉组的伯克氏菌科(Burkholderiaceae)(P=0.032)、产碱杆菌科(Alcaligenaceae)(P=0.034)、梭杆菌科(Fusobacteriaceae)(P=0.039)的相对丰度显著低于对照组。(4)在属分类水平上,结直肠息肉组与健康对照组均以拟杆菌属(Bacteroides)、粪杆菌属(Faecalibacterium)、毛螺菌属(Lachnospira)为主。其中,结直肠息肉组的洋葱伯克霍尔德菌(Burkholderia-Paraburkholderia)相对丰度显著低于健康对照组(P=0.022)。(5)健康对照组中符合条件的人群分为HC1组(高风险组,年龄≥40岁)、HC2组(低风险组,年龄40岁)后,三组样本的肠道菌群的丰度和多样性差异无统计学意义(Shannon指数:P=0.661);三组粪便样本的韦荣球菌科(Veillonellaceae)(P=0.023)、洋葱伯克霍尔德(Burkholderia-Paraburkholde-ria)(P=0.029)相对丰度不同,差异有统计学意义。结直肠息肉组韦荣球菌科相对丰度显著低于HC1组(P=0.017)及HC2组(P=0.028),结直肠息肉组洋葱伯克霍尔德菌相对丰度显著低于HC2组(P=0.014)结论:此次研究展示了广西结直肠息肉患者肠道菌群的特点以及改变的菌群。


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