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《广西医科大学》 2009年
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飞行时间质谱技术检测肺癌差异蛋白的研究

黄斯明  
【摘要】: 目的:本研究应用表面增强激光解吸电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术筛选出肺癌血清、肺泡灌洗液(BALF)和肺癌组织差异蛋白,找出蛋白与肺癌的关系,并探讨其意义。 方法:应用SELDI-TOF-MS技术通过弱阳离子交换蛋白芯片(WCX-2芯片)分别检测20例肺癌患者和10例肺良性病变患者的血清、肺泡灌洗液(BALF)和肺组织匀浆中的蛋白质图谱,采用Protein Chip Biomarker SystemⅡ-C型蛋白质芯片阅读仪读取芯片信息,采用Ciphergen Protein Chip 3.2版本的分析软件自动采集数据,读取峰高值,获得蛋白表达图谱,进行统计学处理。用Biomarker Pattern软件分析NSCLC差异蛋白并初步建立诊断模型。通过盲筛进一步验证诊断模型。 结果:肺癌患者与肺良性病变患者相比较,蛋白质有以下差别:(1)血清:发现20个有统计学差异的蛋白峰,其中肺癌患者血清中显著高表达蛋白质波峰有14个(P0.05),质荷比(M/Z)分别是3270.07Da,4095.44Da,5309.20Da,5340.15Da,5852.02Da,5906.89Da,6436.01Da,6632.41Da,6933.33Da,7768.18Da,7973.40Da,8065.61Da,8691.12Da,8142.28Da;显著低表达蛋白质波峰有6个(P0.05),M/Z分别是2014.68 Da,2137.45 Da,2280.16Da,2503.32Da,3588.92 Da,2090.78Da;采用Biomarker Pattern Software(BPS)对经过Biomarker Wizard Software获得的数据进行分析处理,通过选用M/Z为2090.77 Da和2503.31 Da的差异蛋白峰建立分类树模型,其诊断的灵敏度为90%,特异度为100%。盲筛验证结果显示,其灵敏度为90%,特异度为100%,粗符合率(crude accuracy,CA)为93.33%,Youden指数(Youdens index,γ)为0.9。 (2)BALF:发现18个有统计学差异的蛋白峰,其中肺癌组BALF中显著高表达蛋白峰有4个(P0.05),M/Z分别是7280.59 Da,7766.12Da,7824.82Da,11510.51Da;显著低表达蛋白质波峰有14个(P0.05),M/Z分别是2368.58Da,2382.53Da,2618.62Da,3377.17Da,3448.29Da,3494.11Da,3512.82Da,4140.77Da,4996.49Da,5426.08Da,6925.46Da,10837.31Da,13160.91Da,12691.68Da。通过选用M/Z 2611.61 Da和3252.80 Da的差异蛋白峰建立分类树模型,其诊断的灵敏度为100%,特异度为100%。盲筛验证结果显示,其灵敏度为95%,特异度为100%,CA为96.67%,γ为0.97。 (3)肺癌组织匀浆:发现11个有统计学差异的蛋白峰,其中肺癌组织匀浆中显著高表达蛋白质波峰有3个(P0.05),M/Z分别是4230.06Da,5757.93Da,11497.18Da;显著低表达蛋白质波峰有8个(P0.05),M/Z分别是2301.92Da,2315.62Da,2331.54Da,2488.96Da,3507.10Da,3525.91Da,4770.84Da,4742.71Da。通过选用M/Z为5757.92 Da、4742.71 Da的差异蛋白峰建立分类树模型,其诊断的灵敏度为90%,特异度为100%。盲筛验证结果显示,其灵敏度为90%,特异度为100%,CA为93.33%,γ为0.9。经平行试验(paralleltest),上述盲筛试验中,30例患者中有20例被判为肺癌患者,10例被判为肺良性病变患者。根据病理结果,20例肺癌患者中20例被准确判断,10例肺良性病变患者10例被准确判断,没有误判。 结论:(1)SELDI-TOF-MS技术筛选出的肺癌患者相对特异的蛋白标记物,其灵敏度高、特异性好。(2)肺癌患者与肺良性病变患者血清存在20个有统计学差异的蛋白峰,BALF存在18个有统计学差异的蛋白峰,组织匀浆存在11个有统计学差异的蛋白峰。这些蛋白可能与肺癌的生物学特性有关。(3)三法联合应用诊断肺癌,其灵敏度、特异性均为100%。
【学位授予单位】:广西医科大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2009
【分类号】:R734.2

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【参考文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 孙健;支气管肺泡灌洗液的蛋白质组研究[J];国外医学(卫生学分册);2004年01期
2 侯可勇;董璨;王俊德;李海洋;;飞行时间质谱仪新技术的进展及应用[J];化学进展;2007年Z1期
3 肖雪媛,卫秀平,何大澄;应用蛋白质芯片技术从血清中筛选肺癌标志蛋白[J];中国科学(C辑:生命科学);2003年04期
4 戴嵩玮;王小敏;刘丽云;刘吉福;武珊珊;黄凌云;肖雪媛;何大澄;;一个在肺癌血清中高表达的标志分子SAA的发现及鉴定[J];中国科学(C辑:生命科学);2007年02期
5 崔振玲,黄静,谢芳,吴自荣;蛋白质芯片技术研究进展[J];生物学通报;2002年07期
6 丁娜;李树花;;支气管肺泡灌洗液肿瘤标志物检测对肺癌诊断的价值[J];天津医药;2007年01期
7 杨德昌,杨拴盈;肺癌诊断水平的现状与进展[J];中华结核和呼吸杂志;2001年08期
8 高云朝,王美琴,陆云,程伟,张学平,刘兴党,林祥通;血清肿瘤标志物的检测对肺癌患者的诊断价值[J];中华结核和呼吸杂志;2005年04期
9 王敬慧,张树才,刘志东,陈效友,李传友,韩毅马;肺癌患者外周血癌胚抗原、细胞角蛋白19 mRNA表达水平与肿瘤分期、近期疗效及预后的关系[J];中华结核和呼吸杂志;2005年11期
10 杨拴盈;肖雪媛;张王刚;孙秀珍;张丽娟;张潍;周斌;杨德昌;何大澄;;用蛋白质芯片技术筛选非小细胞肺癌患者血清中标志蛋白[J];中华结核和呼吸杂志;2006年01期
【共引文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 吴坤;苑林宏;;膳食因素与癌症[J];癌变.畸变.突变;2006年01期
2 段沅杏;陈进雄;张涛;刘巍;崔柱文;张霞;许永;金永灿;;飞行时间质谱在烟草化学中的应用概述[J];安徽农业科学;2012年07期
3 单晓梅;;MS/MS原理及GC/MS/MS技术在农残检测中应用[J];安徽预防医学杂志;2008年06期
4 闵锐,李梅梅;自发性荧光支气管镜在肺癌早期定位诊断中的应用[J];癌症;2003年10期
5 戴明;罗荣城;;蛋白质组学在肺癌诊治研究中的应用[J];癌症;2007年06期
6 陈创;陈利琴;杨国梁;李雁;;肿瘤标志物在结直肠癌诊断和监测中的价值和改进策略:130例患者的临床资料分析(英文)[J];癌症;2007年11期
7 林妙霞;文卓夫;冯智英;何丹;;Bmi-1、Ki67在大肠肿瘤组织中的表达及其意义[J];癌症;2008年12期
8 李曼,侯浚;恶性肿瘤的登记报告[J];癌症进展;2004年02期
9 齐学远;陈余清;;胸水LUNX mRNA检测对肺癌胸膜转移的诊断价值[J];蚌埠医学院学报;2008年02期
10 佟玉品;;飞行质谱技术在临床检验医学上的应用[J];北京医学;2006年07期
中国重要会议论文全文数据库 前8条
1 张晓棣;陈文;蔡行;;修正Szabo声波方程模拟乳腺癌CARI医学超声检测的频率依赖耗散[A];第三届全国压电和声波理论及器件技术研讨会论文集[C];2008年
2 周燕荣;;恶性肿瘤死亡流行趋势与控制[A];重庆市预防医学会2010年论文集[C];2011年
3 ;饮奶与人体健康 “牛奶有害”争论的研究背景[A];补充营养素和饮奶对人体有害吗媒体论坛会/学术研讨会会议资料[C];2007年
4 沈福杰;周建军;张帆;胡兵;张金峰;江莉莉;宋桂香;姜庆五;;黄浦区主要恶性肿瘤死亡纵向观察和分析[A];上海市预防医学会第二届学术年会论文汇编[C];2006年
5 郑燕华;邹德威;冯凯;崔彦;张铭;许洋;李宁;张建中;;应用SELDI蛋白芯片技术筛选肝癌血清标志蛋白[A];第十届全军检验医学学术会议论文汇编[C];2005年
6 叶玉坤;;肺癌早期诊断近展与思考[A];第三届中国肿瘤学术大会教育论文集[C];2004年
7 卢路;;“知识沟假设”在我国城乡癌症传播中的实证研究[A];第二届中国健康传播大会十佳论文集[C];2007年
8 卢路;;“知识沟假设”在我国城乡癌症传播中的实证研究[A];第五届中国健康传播大会论文集[C];2010年
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 李小兰;HAX-1在人结直肠癌中的表达及其对人结直肠癌细胞周期和细胞凋亡影响的研究[D];华中科技大学;2010年
2 毕经旺;“肺复康”调控PI3K/Akt/mTOR通路和端粒酶治疗非小细胞肺癌的临床和基础研究[D];山东中医药大学;2010年
3 刘海鹏;泽漆的体外抗肿瘤作用及其生物活性组分研究[D];兰州大学;2011年
4 张治中;RUNX3基因遗传变异、表达水平与膀胱癌和黑色素瘤发生的流行病学及机制研究[D];南京医科大学;2011年
5 李宝红;对应分析方法及其在肿瘤学中的应用研究[D];中南大学;2011年
6 任剑珍;结肠癌T-cadherin基因的表达及甲基化影响的探讨[D];中南大学;2011年
7 李莉;蛋白质组学技术对胃癌、肝癌、卵巢癌血清差异蛋白表达的研究[D];新疆医科大学;2011年
8 施京华;基于数据挖掘的癌症诊疗决策优化研究[D];上海交通大学;2011年
9 张电波;支气管动脉栓塞术应用研究[D];第二军医大学;2002年
10 魏启春;分子靶向治疗在肿瘤放疗中的应用研究[D];浙江大学;2003年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 戴伟;铁线莲皂苷对人胃癌SGC-7901细胞增殖、凋亡及NF-κB表达的影响[D];南京医科大学;2010年
2 姜平;新密市农村地区子宫颈癌认知现状及筛查结果分析[D];郑州大学;2010年
3 张华杰;模糊神经网络在肺癌诊断中的应用[D];郑州大学;2010年
4 李超;苏州市放射治疗资源与利用现状及其思考[D];苏州大学;2010年
5 金玉晶;针灸对环磷酰胺化疗小鼠骨髓组织中粘附分子ICAM-1、VCAM-1蛋白表达的研究[D];河南中医学院;2010年
6 高明;女贞子有效成分齐墩果酸对S180荷瘤小鼠P53蛋白表达及TNF-α的诱生作用[D];黑龙江中医药大学;2010年
7 胡夏菊;北京市三甲医院住院癌症患者的疼痛控制结局现状及影响因素的研究[D];北京协和医学院;2010年
8 张晓翔;飞行时间质谱仪在线检测二恶英指示物的试验研究[D];浙江大学;2010年
9 李有朝;IGFBP7与胰岛素关键结合位点的研究[D];浙江大学;2011年
10 杨勇;FHIT及DCP4在胃癌中的表达及其临床意义[D];安徽医科大学;2010年
【二级参考文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 李龙芸,汪斌超,陈勇,姚连昌,操乐杰,王瑜玲,毛琦善;改良Saccomanno法用于肺癌患者痰标本处理的应用体会[J];中国肺癌杂志;2000年04期
2 陈焕文;张燮;罗明标;;电喷雾解析电离质谱法对食品中苏丹红染料的快速检测[J];分析化学;2006年04期
3 张光明,邓守真,王赟,徐莲琴,何婉婷,高泉,林祥通;肿瘤标志物联合检测在肺癌诊断中的临床价值[J];核技术;2002年05期
4 肖雪媛,卫秀平,何大澄;应用蛋白质芯片技术从血清中筛选肺癌标志蛋白[J];中国科学(C辑:生命科学);2003年04期
5 肖雪媛,赵小冬,刘剑凯,郭福政,刘丹慧,何大澄;利用蛋白质组学方法筛选及确定喉癌诊断的标志分子[J];中国科学C辑:生命科学;2004年01期
6 王赟,陈小东,张静,张斯为,姜丽敏;肿瘤标志物CEA、CA153、SCC、CY211联合检测肺癌[J];中国临床医学;2002年03期
7 廖秋林,陈铭声;肺癌患者血清肿瘤活性标志物的检测及其临床意义[J];中国实用内科杂志;2005年06期
8 何大澄,肖雪媛;SELDI蛋白质芯片技术在蛋白质组学中的应用[J];现代仪器;2002年01期
9 林其昌,林晓,陈公平,陈美云,潘玉凤;支气管肺泡灌洗液肿瘤标志物联合检测诊断肺癌的研究[J];中国内镜杂志;1999年04期
10 陈效友,马玙;定量聚合酶链反应技术研究进展[J];中华结核和呼吸杂志;2001年03期
【相似文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 杨拴盈;南岩东;温雪萍;;肺癌蛋白质组学研究的现状与进展[J];国际呼吸杂志;2006年06期
2 乔滨;王文静;;蛋白质组学及其研究技术在肺癌分子生物标志物研究中的应用[J];中国癌症杂志;2006年01期
3 刘萍;丁旭峰;章怡祎;乔健;;双向电泳—质谱法探索实验性重症肌无力大鼠疾病相关蛋白[J];中华中医药学刊;2007年12期
4 袁文伟;张冠群;司徒强;李宏肇;;广州市海珠区洪德街和跃龙街肺癌的对比研究(摘要)[J];广东药学院学报;1987年02期
5 麻新梅;张云莲;;1192例肺癌患者住院情况分析[J];中国医药指南;2007年06期
6 魏巍;尚秀娟;吕保洲;;遗传性非息肉病性结直肠癌血清的蛋白质组学[J];世界华人消化杂志;2011年13期
7 刘志臻;欧阳学农;;蛋白质组学在肺癌中医证实质研究中的应用[J];现代中西医结合杂志;2009年02期
8 潘俊;刘延盛;陈海泉;曾嵘;;蛋白质组学技术及其在肺癌诊断研究中的应用进展[J];医学研究生学报;2008年06期
9 廖萍;王文静;朱佩云;刘茶珍;陆晔;刘国星;罗晓阳;项翠琴;;SELDI-TOF-MS技术检测肺腺癌血清生物标志物[J];中国肿瘤;2006年04期
10 郭振华;高原;白光彦;高晓春;;蛋白质组学及其在布鲁氏菌中的研究进展[J];内蒙古民族大学学报(自然科学版);2009年04期
中国重要会议论文全文数据库 前10条
1 吴正正;严京;;蛋白质组学方法分析STZ诱导Ⅱ型糖尿病大鼠模型后视网膜差异蛋白变化[A];中华中医药学会第五次眼科学术交流会论文汇编[C];2006年
2 吴正正;严京;;蛋白质组学方法分析STZ诱导Ⅱ型糖尿病大鼠模型后视网膜差异蛋白变化[A];中华医学会第十二届全国眼科学术大会论文汇编[C];2007年
3 林祥明;林建峰;贺量;张茜;傅婉辉;陈清西;石艳;;菜青虫不同生长期相关蛋白的蛋白质组学研究[A];中国生物化学与分子生物学会农业生物化学与分子生物学分会第八次学术研讨会论文集[C];2008年
4 何春涤;朱红;周海涛;陈洪铎;;蛋白质组学主要技术及其在皮肤科学研究中的应用——HaCaT细胞和人皮肤鳞状细胞癌细胞系SCL-1细胞蛋白质组的差异蛋白的研究[A];中华医学会第十二次全国皮肤性病学术会议论文集[C];2006年
5 韩新爱;曾慧兰;葛峰;黄雪松;古建泉;贾海涛;钟启;朱海扬;郁志;卢育洪;张学利;何庆瑜;;6-姜酚对K562细胞生物学特性的影响及蛋白质组学研究[A];第12届全国实验血液学会议论文摘要[C];2009年
6 杨红莲;吴纯启;廖明阳;;氯丙嗪肝脏毒性的蛋白质组学初步研究[A];2006年全国药物毒理学会议论文集[C];2006年
7 洪桢;刘军;丁健青;陈生弟;;磷酸化修饰的蛋白质组学研究揭示胶质细胞源性神经营养因子下游信号分子[A];第十一届全国神经病学学术会议论文汇编[C];2008年
8 张英华;魏路清;;SELDI-TOF-MS技术对特发性肺纤维化患者的蛋白质组学研究[A];中华医学会第三届全国间质性肺病暨弥漫性泛细支气管炎学术会议论文汇编[C];2010年
9 祁明信;黄秀榕;严京;;复方SZ滴眼液防护人晶状体上皮细胞紫外线损伤的蛋白质组学研究[A];中华中医药学会第七次眼科学术交流会论文汇编[C];2008年
10 梁清华;曾年菊;陈疆;区健刚;萧梅芳;张雨星;;蛋白质组学方法研究TPx在肝风内动证中的表达及关系[A];第九届中国中西医结合实验医学学术研讨会论文汇编[C];2009年
中国重要报纸全文数据库 前10条
1 记者 吴月辉;蛋白质组学在美逐步形成市场[N];新华每日电讯;2001年
2 ;抓紧蛋白质组学的研究[N];中国医药报;2002年
3 黎明;科学新宠——蛋白质组学[N];医药经济报;2001年
4 前线;蛋白质组学产业正逐渐形成[N];中国经营报;2001年
5 麦国荣;蛋白质组学[N];中国医药报;2001年
6 王雪飞 吴志军;首建人类器官蛋白质组“蓝图”[N];健康报;2006年
7 特约记者 郝成涛 记者 于春光;为肿瘤疾病的防治研究开辟新途径[N];解放军报;2009年
8 本报特约记者 吴志军 郝成涛;为科学攀登搭建精神高地[N];解放军报;2010年
9 阳光;中科院大连化物所为蛋白质组学研究提供新方法[N];中国医药报;2007年
10 潘文;提高基础及应用研究水平[N];中国医药报;2011年
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 缪爱珠;HSF4对HLECs蛋白表达的影响及与老年性白内障的相关性研究[D];复旦大学;2009年
2 杨涛;应用蛋白质组学方法研究小鼠Cyclin B1反义全长cDNA抑制肿瘤增殖的分子机制[D];四川大学;2007年
3 郑朝旭;胰腺癌相关SELDI-TOF-MS血清蛋白谱型的研究[D];中国协和医科大学;2007年
4 余敏;自发性高血压大鼠肾脏组织蛋白质表达谱的研究及氯沙坦对其的影响[D];浙江大学;2007年
5 庞博;前列腺癌细胞系分泌蛋白质组比较及相关蛋白功能研究[D];中国人民解放军军事医学科学院;2008年
6 王尔松;帕金森病的脑深部电刺激治疗与脑脊液蛋白变化的相关性研究[D];复旦大学;2008年
7 白雪;结直肠癌发生和肝转移相关蛋白质差异表达及其意义的研究[D];第三军医大学;2008年
8 马海鸥;紫草素对JAR/MTX细胞毒性作用机制的蛋白质组学研究[D];吉林大学;2009年
9 詹曦;HER-2作为外科治疗非小细胞肺癌预后评估因素的蛋白质组学鉴定[D];华中科技大学;2007年
10 丁琛;HBV转基因小鼠肝脏实质细胞比较蛋白质组学及血清组学研究[D];中国科学技术大学;2008年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 黄斯明;飞行时间质谱技术检测肺癌差异蛋白的研究[D];广西医科大学;2009年
2 龙强;龙眼(Dimocarpus longan Lour.)成花逆转蛋白质组学的初步研究[D];福建农林大学;2006年
3 庞盼姣;2型猪链球菌强毒株与无毒株比较蛋白质组学研究[D];吉林大学;2007年
4 陈敏;运用SELDI蛋白质芯片技术检测变应性鼻炎和鼻息肉病患者血清蛋白质的差异表达[D];青岛大学;2006年
5 陈建平;应用SELDI-TOF-MS诊断早期食管癌的研究[D];第二军医大学;2008年
6 张国云;蛋白组学技术筛选大鼠小肠移植排斥反应相关蛋白的初步研究[D];重庆医科大学;2008年
7 陈娟娟;矽肺发生的蛋白质组学研究及手掌参醇提取物对其表达的影响[D];重庆医科大学;2009年
8 陈蓉艳;运用SELDI-TOF MS筛选肾移植急性排斥反应特异性标志物的初步研究[D];福建医科大学;2009年
9 何伟伟;SELDI筛选的肺腺癌血清标志蛋白和传统肿瘤标志物的比较研究[D];上海交通大学;2007年
10 曾江辉;SELDI蛋白芯片技术筛选乙肝后肝硬化与原发性肝癌腹水蛋白标记物的研究[D];广西医科大学;2009年
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