广义竹叶青蛇属的分类及系统发育研究(蛇亚目:蝮亚科)
【摘要】:广义竹叶青蛇属Trimeresurus (sensu lato)是蝮亚科蛇中一个较大的类群,包含有40多个物种,广泛分布于东亚、南亚、东南亚国家和地区。Trimeresurus(sensu lato)物种表现出了丰富的多样性。首先,在地理分布上,既有广泛分布的物种,也有局限分布在较小范围的物种;既有分布在高海拔地区的种类,也有仅见于低中海拔的。其次,在生活环境上,有树栖、半树栖和陆栖三种类型。第三,在生殖上,有卵生、卵胎生两种方式。另外,体色丰富多样,个体大小差异大。该类群一般认为可划分为6属(Trimeresurus sensu stricto, Ovophis,Protobothrops, Zhaoermia, Tropidolaemus, Triceratolepidophis)。最近,主要依据半阴茎形态和分子系统学研究结果,Trimeresurus (Sensu stricto)和Ovophis又被进一步划分为多个属。
尽管,过去的几十年里,不少学者从形态、细胞和分子水平上对该类群的分类和系统演化作了大量的工作。但是由于受各种条件和因素的限制(如,难以获得足够数量和种类的标本),目前还存在着一些争议和不同的意见。首先,各属应包含哪些物种;其次,一些分布区域狭窄,而且种群数量十分稀少的种类的系统地位如何?第三,一些分布范围非常广泛的种类的种下系统关系不清楚;最后,一些属缺乏相应的形态学证据。
本文对Trimeresurus (sensu lato)10种的半阴茎形态和9种的头骨特征进行了比较解剖;采用最大简约法(MP)、似然法(ML)和贝叶斯法(BI)三种方法对43种(未包括Tropidolaemus)的3个线粒体基因序列(cyt.b、12S rRNA、16S rRNA)进行了系统发育分析。主要目的在于:重新评价Trimeresurus (sensulato)的系统关系;阐明一些稀有和分布狭窄物种的系统地位;初步探讨一些广泛分布的物种的种下关系;为一些属、种的分类提供必要的形态学证据。研究结果表明:
【关键词】:Trimeresurs(sensu lato) 形态 半阴茎 头骨 分类 分子系统 【学位授予单位】:四川大学
【学位级别】:博士
【学位授予年份】:2005
【分类号】:Q959.62;Q951
【目录】:
- 中文摘要6-8
- 英文摘要8-11
- 第一部分 综述:广义竹叶青蛇属Trimeresurus(sensu lato)的分类及系统学研究进展11-27
- 1.概述11-13
- 2.基于形态上的分类研究13-20
- 2.1 Tropidolaemus13-14
- 2.2 Ovophis14-15
- 2.3 Protobothrops15-17
- 2.4 Triceratolepidophis17
- 2.5 Zhaoermia17
- 2.6 Trimeresurus(sensu stricto)17-20
- 3.细胞遗传学研究20-21
- 4.分子系统学研究21-24
- 5.有待解决的问题24-27
- 第二部分 Trimeresurus(sensu lato)的形态研究27-65
- 1.半阴茎形态的比较27-44
- 1.1 先前蛇类半阴茎形态的研究概述27-30
- 1.2 材料和方法30
- 1.3 半阴茎形态的描述30-34
- 1.4 讨论34-44
- 1.4.1 相关物种的分类问题34-36
- 1.4.2 广义竹叶青蛇属半阴茎形态的比较36-44
- 2.头骨形态的比较44-65
- 2.1 材料和方法44-45
- 2.2 结果45-54
- 2.3 讨论54-65
- 2.3.1 与先前头骨形态研究的比较54-55
- 2.3.2 相关问题的讨论55-65
- 第三部分 Trimeresurus(sensu lato)的分子系统学研究65-93
- 1.前言65-68
- 2.材料和方法68-75
- 2.1 样品收集68
- 2.2 PCR扩增68-71
- 2.3 序列测定71-72
- 2.4 序列编辑及排序72-73
- 2.5 数据相合性检验73
- 2.5.1 Partition Homogeneity Test73
- 2.5.2 后验概率检验(Posterior Probability Test)73
- 2.6 系统发育分析73-75
- 2.6.1 最大简约法(Maximum Parsimony,MP)74
- 2.6.2 最大似然法(Maximum Likelihood,ML)74-75
- 2.6.3 贝叶斯推断(Bayesian Inference or BI)75
- 3.结果75-82
- 3.1 测序和序列分析75-76
- 3.2 数据相合性检验76-77
- 3.3 系统发育分析77-82
- 3.3.1 MrBayes推断树77-81
- 3.3.2 最简约树81
- 3.3.3 最大似然树81-82
- 4.讨论82-93
- 4.1 Trimeresurus(sensu lato)的系统学82-83
- 4.2 Trimeresurus(sensustricto)的再划分83-85
- 4.3 Viridovipera的系统关系85-87
- 4.4 烙铁头蛇属Ovophis87
- 4.5 原矛头蝮属Protobothrops87-93
- 第四部分 结论93-95
- 致谢95-97
- 参考文献97-115
- 附录115-143
- 博士期间发表的论文及获奖情况115-116
- 声明116-117
- Trimeresurus(sensu lato)所含属种名录117-135
- Log Likelihood scores135-136
- 核苷酸频率136-142
- 图版Ⅰ142-143