林麝(Moschus berezovskii)微卫星分子标记筛选及其应用研究
【摘要】:麝是我国极其重要的资源动物,由于乱捕乱猎和生境破坏,麝的数量急剧减少,濒临灭绝,现为国家一级重点保护野生动物。目前对于麝的研究多为形态学、分类学、组织学研究,但是少有用分子生物学方法对于麝进行研究,尤其是对于麝的遗传学方面的研究。
微卫星DNA属于共显性的遗传标记,广泛的存在于基因组内,含有丰富的多态性,能够忠实反映个体特征,个体间的亲缘关系,在人类、家畜中已经得到广泛应用,目前看来它是最适合于研究林麝遗传多样性问题的工具。因此,我们选择了构建林麝的微卫星文库,筛选多态性好的座位对于林麝的遗传多样性进行初步的分析。
在本次研究中,我们利用了链亲和素和生物素之间有强亲和的原理,构建了林麝的三个碱基重复的微卫星富集文库(CAA)_8和(AGC)_8文库各一个。每个文库含有几百个转化子,用PCR的方法从2个文库中筛选阳性克隆。发现所建微卫星富集文库(CAA)_8和(AGC)_8中的阳性克隆率大致为10%,而测序结果表明,用该方法筛选的阳性克隆中含有(CAA)_n和(AGC)_n重复比率不高,各找到含有(CAA)_n和(AGC)_n重复序列一个。又在以前建立的(AC)_(12)文库中选取24个阳性克隆进行测序,并对其进行多态性筛选,找到较好多态性座位6个。
用这6个座位对于都江堰金凤山和马尔康养殖场的圈养林麝做遗传多样性