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林麝(Moschus berezovskii)微卫星的筛选与鉴定及遗传多样性研究

张述超  
【摘要】: 林麝(Moschus berezovskii)是当今世界现存五种麝中的一种,它主要分布在中国西南部及其临近地区。在中国,超过半数的林麝分布在四川省,是重要的资源动物。由于野外乱捕滥猎和栖息地的不断破坏,野外麝类数量急剧减少,在20世纪60年代超过1000万只而在20世纪90年代下降到不足20万只,现存麝类已面临濒危。所以从1979年所有麝类被编入“濒危野生动植物种国际贸易公约”(Convention on International Trade in Endangered Species of Wild Flora and Fauna,CITES)。2002年11月,麝科所有种都调整为中国一级保护野生动物。在中国,很多林麝被圈养在农场中。但已有的研究工作主要集中于麝的形态学、分类学、组织学等方面,对麝的遗传多样性的研究很缺乏。 微卫星(microsatellite)又称为简单序列重复(simple sequence repeat,SSR),是指以1~6个核苷酸为基本重复单位的串联重复序列,它们广泛存在于各类真核生物和原核生物基因组的编码区与非编码区中。微卫星属于共显性的遗传标记,具有高度的多态性,是中性遗传的,所以在目前被认为是最好的用于群体基因研究的孟德尔分子标记。由微卫星所提供的信息能够解决很多生物问题,列如生物个体种类及亲缘关系的确定,群体遗传结构和生物间的进化关系以及基因图谱的建立等。 目前仅有少量的林麝微卫星座位被筛选出来,这对于林麝遗传多样性研究是不够的。在本次研究中,我们通过PCR优化以及借用近缘物种具有多态性的微卫星位点两种方法从林麝基因组中筛选新的微卫星位点。共有13个新位点被筛选出来,其中通过PCR优化获得的5个座位具有高度的多态性。用这5个座位对都江堰金凤山和马尔康养殖场的圈养林麝做遗传多样性分析。 在金凤山和马尔康圈养林麝群体中,这5个座位等位基因数量为4~13个,平均每个座位在金凤山居群中为8.8个,马尔康居群中为6.8个;5个微卫星座位在金凤山居群中有效等位基因数在2.341~8.605之间,而马尔康居群有效等位基因数在3.328~9.020之间,而有效等位基因数在两个居群中的平均值分别为4.979和4.830;金凤山居群表观杂合度(Ho)和期望杂合度(He)分别为0.429~0.957和0.587~0.902。马尔康居群表观杂合度(Ho)和期望杂合度(He)分别为0.391~0.913和0.716~0.920。5个微卫星座位的多态信息含量(PIC)最低为0.519,最高为0.891。这表明金凤山和马尔康圈养林麝群体具有较高的遗传多样性。


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