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《四川农业大学》 2006年
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疥螨第二内部转录间隔区基因的分子系统学研究

古小彬  
【摘要】:疥螨病是由疥螨(Sarcoptes scabiei)寄生于人和其他哺乳动物皮肤表皮内,引起称为疥癣的一种顽固性、传染性皮肤病,严重威胁畜牧业的发展。本研究利用PCR技术扩增疥螨的ITS2基因,从而探讨几种动物疥螨的亲缘关系和疥螨的分类地位。 试验以分离自四川雅安和自贡兔疥螨分离株、四川荥经猪疥螨分离株和四川简阳山羊疥螨分离株为材料,对这4株疥螨分离株进行了分子系统学研究。本研究设计一对引物M1/M2,通过PCR的方法成功地扩增了4株中国疥螨分离株ITS2基因的目的片断,并通过克隆、序列测定获得了4株疥螨分离株ITS2基因的核苷酸序列,4株疥螨分离株ITS2基因全长均为361bp。对ITS2基因核苷酸序列进行了比较,结果表明:这4株疥螨分离株彼此间的核苷酸同源性为93.9%~98.3%,序列间不存在碱基插入或缺失;4株疥螨分离株的AT含量都明显高于GC含量,分别为61.10%和38.90%。通过MEGA2.0软件分析,分析结果表明疥螨ITS2基因的碱基替代方式存在转换T←→C的偏倚。 基于ITS2基因序列,以背肛螨属的猫背肛螨为外群,用距离法和最大简约法构建了分子系统树,所构建四种树的拓扑结构存在较大的相似性,因而得到的系统树比较可靠。自贡兔疥螨和雅安兔疥螨分离株在每种系统树上都相聚在一起,且自举值都比较高;此外,中国的猪疥螨分离株和西班牙的猪疥螨分离株在四种系统树上也始终聚居在一起,而山羊疥螨分离株在不同系统树上的位置则有所变动。 通过DNAstar软件分析4株疥螨分离株的同源性以及用MEGA2.0软件分析碱基组成和构建系统树,分析结果表明:自贡和雅安兔疥螨分离株、简阳羊疥螨分离株和荥经猪疥螨分离株属于同一个种,从而从分子水平上为以形态学分类为基础的疥螨传统分类系统提供了佐证,同时可为疥螨的临床医学、免疫学、流行病学监控以及防治策略的制定等方面的研究提供参考。
【学位授予单位】:四川农业大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2006
【分类号】:S852.74

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【引证文献】
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【参考文献】
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【同被引文献】
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7 张小霞;ClanGV的分子生物学特性和棉铃虫PM的研究[D];中国科学院研究生院(武汉病毒研究所);2005年
8 晏立英;侵染花生的Cucumoviruses病毒基因组全序列分析和转基因抗性研究[D];中国农业科学院;2005年
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1 古小彬;疥螨第二内部转录间隔区基因的分子系统学研究[D];四川农业大学;2006年
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6 姜辛;白草花叶病毒变异的初步研究[D];中国农业大学;2005年
7 闫峻;乌苏里蝮蛇具抑制血小板聚集活性的金属蛋白酶分离纯化及基因信息学分析[D];吉林大学;2005年
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