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《四川农业大学》 2008年
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优质鸡PRKAG3基因单核苷酸多态性与屠宰性状和肉质性状的相关研究

周娜娜  
【摘要】: 一磷酸腺苷酸激活蛋白激酶γ3亚基(AMP-activated protein kinaseγ3,PRKAG3)基因不仅对糖代谢、脂肪代谢有影响,对肉质也有影响,包括PH值、肉色、系水力、滴水损失、嫩度和剪切力。因此PRKAG3基因是近年来确定的一个影响猪肉pH值、肉色以及系水力的主效基因,其突变R200Q与过量肌糖原含量有关,被认为是汉普夏猪发生RN~-突变的根本原因。而在不同的物种间,PRKAG3基因的遗传变异可能与肉质有着密切的联系。 本试验以四川大恒家禽育种公司培育的5个优质肉鸡新品系纯系及3个杂交组合群体为研究素材。采集不同组合血样和进行屠宰性状(slaughter traits)及肉质性状(meat quality traits)的测定。采用测序同单链构象多态性(SSCP)检测技术结合的方法,检测供试群体内PRKAG3基因存在的单核苷酸多态性(SNPs)位点。采用分子生物学方法分析研究各SNPs位点对基因所编码蛋白的生物学影响,并通过数量遗传学及统计学分析,揭示各SNPs位点对优质肉鸡重要经济性状的遗传效应。研究结果表明: 通过SSCP检测和测序证实PRKAG3基因共有3个SNPs位点,分别位于PRKAG3基因发布序列的1744位、2698位和3207位。 通过分子生物学分析,发现PRKAG3基因1744为同义突变;2698位在内含子8内,不存在密码子改变;3207位为密码子错义突变,位点A-G颠换造成编译氨基酸由Thr-Ala。 对各位点基因型频率分布进行计算,发现PRKAG3-1744位点,PRKAG3-2698位点,PRKAG3-3207位点属于中度多态性位点(0.25<PIC<0.5),多态信息含量PIC值分别为0.353、0.349、0.353,适合进行与生产性状相关的统计分析。χ~2适合性检验显示,供试群体除PRKAG3-2698位点(P>0.05)没有达到哈温(Hardy-Weinberg)平衡,其余群体在各个位点均达到平衡。 遗传效应的最小二乘及方差分析显示,PRKAG3-1744SNPs位点对屠宰性状中的胸肌率有显著影响(P<0.05),对肉质性状中水分、粗蛋白(CP)影响极显著(P<0.01),对灰分影响差异显著(P<0.05);PRKAG3-2698SNPs位点对屠宰性状中腿肌重和腿悸氏灾跋?P<0.05);PRKAG3-3207SNPs位点对屠宰性状有不同程度的影响(P<0.05,P<0.01),对肉质性状中水分和粗蛋白性状影响差异极显著(P<0.01)。 复合单倍型的最小二乘及方差分析显示,CC-GG-GG组合表现出高腿肌率,而在GC-AA-AA组合中表现出低的腿肌率。
【学位授予单位】:四川农业大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2008
【分类号】:S831.2

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