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《四川农业大学》 2009年
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棉花优异种质遗传多样性分析及其SSR数字指纹图谱构建

王希文  
【摘要】: 棉花优异种质资源的遗传多样性研究是进行棉花品种改良的基础。同时随着新品种的不断出现,新品种侵权行为的案例也逐渐增多,因此,新品种的指纹图谱鉴定对其进行知识产权保护意义重大。本实验采用111对多态性SSR引物对330份棉花优异种质进行了多样性分析,明确了材料间的遗传关系,并从中选择了25对多态性较好的引物构建了这些优异种质的SSR指纹,从DNA水平上对它们进行了区分。同时还对不同种质的部分农艺性状进行了主成分分析,期望找到有用的农艺性状综合指标,从而为育种和生产服务。主要研究结果如下: 1.不同优异种质间主要表型性状差异极显著,纤维品质性状中纤维黄度值变异系数最大,其它性状变异相对较小,因此在纤维品质相关性状的选择上可主要对黄度值进行选择;部分农艺性状主成分分析结果,贡献率大于85%的前三个主成分为:纤维品质性状因子、株高和病指因子、生育期因子,说明在材料选择上,应选择纤维品质好、抗病、早熟的材料。 2.多态性SSR标记特征分析发现:扩增片段中二核苷酸和三核苷酸重复类型较多,其中AG/TC基序最多;在D染色体亚组上分布的多态性SSR位点最多,其次为AD染色体亚组、D染色体亚组;Genomic-SSR和EST-SSR两类标记的比较发现,在多态性等位位点数方面差异显著,PIC值和扩增片段大小差异不显著。表明不同材料间D染色体亚组上的简单重复序列中二核苷酸和三核苷酸重复类型较容易发生变异。 3.111对多态性SSR引物在330份棉花种质中共检测到498个等位位点,多态性位点占87.15%,PIC平均值为0.6452,多态性较好。用于构建指纹的25对核心引物的PIC值变化范围为0.5121-0.8501,平均值为0.7463,值较大。 4.SSR标记揭示的材料间相似系数较大,平均值为0.7671,主要分布在0.7730-0.8120之间,说明大部分材料间遗传差异较小。同时,SSR标记相似系数矩阵标准误分析发现,当多态性SSR标记数目大于80时,标准误几乎不再变化而趋于一个恒定值,说明要对遗传差异较小的材料进行多样性分析,至少需要80个标记才能较正确的反映材料间的遗传关系。 5.330份棉花优异种质的SSR标记聚类结果:陆地棉和海岛棉明显的分成两大类;在陆地棉类群中,退化陆地棉被单独分成一个亚类,遗传差异较小的材料聚在一起,部分农艺性状相近的材料也聚在一起;整体水平上看,陆地棉优异种质间遗传差异较小,遗传基础较狭窄。SSR标记聚类揭示的种质间的遗传关系与系谱相一致,可作为一种鉴别材料亲缘关系的较好的标记。 6.用25对核心SSR引物构建了330份棉花优异种质的指纹图谱,从而将这些不同品种区分开(除2个遗传背景完全一样的种质外,即309号和310号)。同时我们研究表明用十进制数字串条形码表示方法区分不同品种的指纹,比01数字串指纹更简单方便。
【学位授予单位】:四川农业大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2009
【分类号】:S562

【引证文献】
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中国硕士学位论文全文数据库 前5条
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【参考文献】
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【共引文献】
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【同被引文献】
中国期刊全文数据库 前10条
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中国博士学位论文全文数据库 前1条
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