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《重庆医科大学》 2017年
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新整合方法的建立及其在突触质膜蛋白质组学研究中的应用

乔芮  
【摘要】:研究背景传统突触质膜分离纯化方法存在细胞器污染、脑组织样本需求量较多等问题,用于微小脑区突触质膜蛋白质组学研究的样品制备方法仍需发展。目的我们提出新的整合方法,旨在富集微小脑组织中的突触质膜蛋白质,由此开展有效的突触质膜蛋白质组学分析。方法我们提出了一种新的样品制备方法,即将基于生物素标记的细胞表面蛋白的亲和捕获、突触体分离和突触质膜蛋白的生化提取进行有效整合。通过免疫印迹分析初步评估方法有效性后,采用质谱和生物信息学技术对突触质膜蛋白富集组分进行分析。结果我们通过突触蛋白标志物的免疫印迹分析初步证实了这种整合方法的有效性。通过突触质膜蛋白富集组分的质谱和生物信息学分析,241个突触质膜蛋白被鉴定,包括85个已报道的经典突触质膜蛋白和156个目前尚未报道的非经典突触质膜蛋白(但同时具有质膜和突触定位)。进一步分析表明这两类蛋白质在理化性质和功能方面有很多相似之处。通过STRING分析,我们发现它们构成了一个具高度功能相关性的互作网络;采用MCODE聚类分析,进一步观察到有65个非经典突触质膜蛋白与47个经典突触质膜蛋白形成了12个高度互联的群集;表明它们更可能是潜在的突触质膜蛋白。结论我们成功建立了一种新的用于微小脑区突触质膜蛋白质组学研究的整合方法,同时还发现了一些潜在的新的突触质膜蛋白质,可增进我们对海马突触可塑性的理解。
【学位授予单位】:重庆医科大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2017
【分类号】:Q51;Q42

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