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《西南大学》 2006年
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萝卜种质资源遗传多样性的SSR分析和初级核心种质构建

李建春  
【摘要】:萝卜(Raphanus sativus L.)是我国的一种重要的蔬菜,我国萝卜种质资源十分丰富。随着社会经济和现代农业的发展与新品种的选育,栽培品种的遗传背景日益狭窄,萝卜遗传资源多样性遭到破坏或丧失。因此科学家开始重视萝卜种质资源的收集和保存工作,而开展萝卜种质资源遗传多样性的研究,有利于现有萝卜种质资源的高效利用。 分子标记能直接从DNA水平反映各材料间的遗传差异,是研究生物遗传多样性的有力工具。SSR标记具有简单、快速的优点,被广泛地用于遗传多样性和种质分类研究。本试验采用SSR标记,结合系统聚类分析和主坐标分析,对47份萝卜种质资源的遗传多样性进行了研究,为了提高现有萝卜种质资源的利用效率,开展了构建萝卜核心种质的初步研究。 主要试验结果如下: (1)从20对引物中筛选出6对引物,对47份萝卜种质进行了SSR分析,共扩增出24条带,其中多态性带为16条,多态性百分率为63.89%,平均期望杂合度为0.8750。种质间的相似系数范围为0.33333-0.958333,系统聚类分析将47份种质分为4个大组,主坐标分析将其分为4个大组,两种分类方法结果基本上一致。 (2)利用441分萝卜种质,在不同抽样比例下,构建核心种质,比较了马氏距离和欧式距离在核心种质中的优劣,认为马氏距离更适合于构建萝卜核心种质;本研究采用最短距离法、最长距离法、可变类平均法和离差平方和法聚类,结果表明4种方法构建的核心种质都能极显著地增加性状的方差和变异系数。四种聚类方法中,以最小距离法为最好,经过分析确认在构建中小规模萝卜核心种质时15%的比例是合适的。 (3)本研究以1281份为试材,基于表型形状构建了萝卜初级核心种质,由于各抽样比例的核心种质都能代表原群体的遗传多样性,确定了15%的最佳比例,构建了192份材料组成的初级核心种质。构建的萝卜初级核心种质级代表了原有群体的遗传变异,又有广泛的地域代表性
【学位授予单位】:西南大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2006
【分类号】:S631.1

【引证文献】
中国博士学位论文全文数据库 前2条
1 陈建华;苎麻资源核心种质构建方法及遗传多样性研究[D];中国农业科学院;2012年
2 李力强;萝卜属和芸薹属中的种传双链RNA病毒的研究[D];浙江大学;2013年
中国硕士学位论文全文数据库 前4条
1 杨丽娟;硫代葡萄糖苷标记鉴定萝卜种质资源遗传多样性的研究[D];安徽农业大学;2010年
2 陈巍;基于生物学性状和SSR标记进行桃种质遗传多样性的研究[D];南京农业大学;2007年
3 崔娜;基于萝卜EST序列的SSR标记开发与应用研究[D];中国农业科学院;2012年
4 卢利佩;萝卜优良单株选择及主要性状的遗传分析[D];河南科技大学;2012年
【参考文献】
中国期刊全文数据库 前10条
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中国硕士学位论文全文数据库 前2条
1 孙志民;冰草属植物的收集与遗传多样性研究[D];中国农业科学院;2000年
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【共引文献】
中国期刊全文数据库 前10条
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中国重要会议论文全文数据库 前10条
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9 王强;张茂君;;分子标记技术在苹果属植物遗传育种研究上的应用[A];中国园艺学会第六届青年学术讨论会论文集[C];2004年
10 程中平;;分子标记用于桃种质资源的保存方法[A];全国首届野生果树资源与开发利用学术研讨会论文汇编[C];2004年
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 刘名;太平洋鲱和大头鳕的群体遗传学研究[D];中国海洋大学;2010年
2 于海洋;牙鲆微卫星标记的筛选和美洲牡蛎抗病相关基因SNP的初步分析[D];中国海洋大学;2010年
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中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 李良;湖北省油茶优良单株遗传多样性及品质初步分析[D];华中农业大学;2010年
2 郭一鸣;全球白菜型油菜遗传多样性分析[D];华中农业大学;2010年
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4 董巍;分子标记辅助选择改良光温敏核不育系的稻瘟病抗性和稻瘟病抗性基因的初步定位[D];华中农业大学;2010年
5 郑瑜;银杏核心种质构建初探[D];华中农业大学;2010年
6 张庆路;利用重组自交系群体定位一般配合力相关性状QTL[D];华中农业大学;2010年
7 高伟;四倍体棉种的遗传多样性分析[D];华中农业大学;2010年
8 陈龚莉;不同居群栝楼分子遗传多样性及生物碱分析[D];华中农业大学;2010年
9 田伶俐;马铃薯体细胞杂种胞质遗传组成及其与青枯病抗性的关系[D];华中农业大学;2010年
10 宋一萍;猪BMP15和BMPR-IB基因的遗传变异及其与产仔性能关系的研究[D];山东农业大学;2010年
【同被引文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 付娟娟;王淑芬;何启伟;王秀峰;刘贤娴;;低温春化过程中萝卜幼苗生长点的生理生化变化[J];山东农业科学;2008年02期
2 刘贤娴;王淑芬;李莉娜;王伟;牟晋华;;萝卜肉质根膨大过程中主要农艺学性状的变化[J];山东农业科学;2010年04期
3 韩晓雨;王淑芬;魏佑营;刘贤娴;付卫民;;萝卜EST-SSR反应体系的建立与优化[J];山东农业科学;2011年10期
4 孙秀波;慕美财;李玫瑰;于岩;连序海;程杰山;;十字花科蔬菜硫代葡萄糖苷含量比较[J];安徽农学通报;2007年19期
5 陈贤;关文灵;杨磊;杨德;;番茄品系产量构成因素的通径分析[J];安徽农业科学;2007年08期
6 刘长友;田静;范保杰;曹志敏;王素华;;河北省小豆种质资源初选核心种质构建[J];安徽农业科学;2010年01期
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中国博士学位论文全文数据库 前8条
1 尹载皓;基于SSR技术和ITS序列进行桃(Prunus persica L.Batsch)品种间亲缘关系的研究[D];中国农业大学;2005年
2 王红霞;核桃遗传多样性分析及核心种质的构建[D];河北农业大学;2006年
3 陈新娟;中国芸薹属蔬菜硫代葡萄糖苷及其影响因子研究[D];浙江大学;2006年
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8 张春雨;新疆野苹果(Malus sieversii)群体遗传结构与核心种质构建方法[D];山东农业大学;2008年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 吕婧;黄瓜种质资源群体结构分析与核心种质集筛选[D];中国农业科学院;2011年
2 孔秋生;萝卜种质资源遗传多样性和亲缘关系的研究[D];华中农业大学;2003年
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4 沈志军;基于微卫星标记的核果类果树亲缘关系研究[D];南京农业大学;2003年
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【二级引证文献】
中国博士学位论文全文数据库 前1条
1 沈玉英;基于REMAP和IRAP分子标记的梅(Prunus mume Sieb. et Zucc.)遗传多样性分析[D];南京农业大学;2010年
中国硕士学位论文全文数据库 前2条
1 张君玉;利用SSR和SRAP分子标记构建葡萄核心种质[D];河南科技大学;2012年
2 杨军;梨野生资源及杂交F_1代的遗传多样性研究[D];南京农业大学;2012年
【二级参考文献】
中国期刊全文数据库 前10条
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【相似文献】
中国期刊全文数据库 前10条
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中国重要报纸全文数据库 前10条
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3 记者 王国文;全市萝卜种植面积新增两千亩[N];石狮日报;2010年
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5 本报记者 柯士雨;小萝卜做成了大产业[N];贵阳日报;2007年
6 谷洪梅 张云安;萝卜越夏栽培技术[N];中国特产报;2007年
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中国博士学位论文全文数据库 前4条
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中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 刘贤娴;萝卜营养及风味物质积累规律研究[D];山东农业大学;2009年
2 胡晓林;西藏萝卜的遗传变异分析[D];中国农业科学院;2012年
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