用RAPD标记检测庙台槭自然居群的遗传结构和遗传分化
【摘要】:
庙台槭(Acer miaotaiense)是槭树科槭属的多年生乔木,为我国特有种,现
仅零星分布于陕西秦岭、巴山山地及甘肃天水一带,总计百余株个体,已被列为
国家三级珍稀濒危保护植物。庙台槭是槭属中较为原始的一类,在大巴山北坡有
分布东移的现象,对探讨该属的系统演化、地理分布及秦岭植物区系有相当重要
的价值。目前对庙台槭的研究较少且主要集中在生殖生物学领域,本文试图通过
RAPD分子标记研究庙台槭自然居群的遗传结构和种内遗传多样性,探讨导致其濒
危的可能原因,预测其遗传学命运并提出一些保护意见作为参考。
研究结果表明:用改良的CTAB法提取庙台槭总DNA的效果良好,可有效地
去除酚类化合物、多糖、小分子有机物等杂质的干扰,提取物可用于随后的多态
性分析。通过优化RAPD反应体系可得到清晰稳定可重复性高的扩增带型,最终反
应体系为:Taq酶(3U/μl)lul,PCR缓冲液(10×)3μl,MgCl_2(50mmol/L)1.5μl,
dNTP(10mmol/L)0.6μl,引物(10mer)12μl,模板DNA(4ng/μl)3μl,纯净水
8.9μl。
用RAPD标记对庙台槭3个居群共39个个体进行了遗传多样性检测,20个10
碱基寡聚核苷酸引物共检测到128个位点,其中多态位点68个,多态位点比率为
53.13%。秦岭北坡居群、秦岭南坡和巴山居群、甘肃天水居群检测到的多态位点
数依次为:24、58、47个,多态位点比率分别为:18.75%、42.9%、32.78%。用Shannon
多样性指数估计3个居群的遗传多样性,得到了与多态位点比率相似的结果。说
明庙台槭的遗传多样性水平较低,这可能是导致庙台槭濒危的原因之一。庙台槭
居群的遗传分化系数(Gst)为0.4154,表明居群之间已有明显的遗传分化发生。
根据RAPD数据对庙台槭39个个体进行Ward聚类分析,结果可将39个个体
分开,3个居群都有明显的以彼此为中心聚集的趋势,说明居群之间已有较高程
度的遗传分化,居群内部个体之间的相似程度较高。各居群内的条带共享率较高、
欧氏距离均数、Nei遗传距离均数都较小,反映出居群内部有较高的一致度。产
生这种现象的可能原因是地理隔离形成小种群,使有效居群大小减小,引起近交
衰退,增加了居群内的纯合性。同时遗传漂变的发生可能造成一些等位基因的丢
失和另一些等位基因的固定使居群内遗传多样性减少。
用PCA法分析了遗传变异与生境间的关系,前三个主分量共代表了83.33%的
变异。X轴为第一主分量,代表了37.39%的变异,从个体的梯度变化规律来看,
此轴与纬度有关,基本上反映了纬度的差异。Y轴为第H个主分量,代表了26.30%
的变异,基本上反映了水分变化的趋势。Z轴代表第三个主分量,表示了19.64%
的变异,在很大程度上反映了温度变化的规律。PCA分析可将不同居群区分开,
结果与Ward聚类一致。
根据本文的结果,并结合以前的有关研究分析,导致庙台械濒危的可能原因
是:l)有性生殖过程存在障碍。2)地理隔离严重,基因流受阻,受遗传漂变影
响很大,遗传多样性水平较低。3)人为破坏十分严重。建议应采取的保护措施是:
l)同时进行就地和迁地保护,迅速增加庙台械个体的数量。2)通过撒播种子或
利用营养繁殖来增加有效居群大小。3)加强宣传教育,提高公民保护意识。同时
建议将庙台械的种质资源纳入国家超低温种质保存库中。
【关键词】:庙台槭 遗传多样性 RAPD标记 【学位授予单位】:西北大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2001
【分类号】:Q949.7
【目录】:
- 中文摘要5-7
- 英文摘要7-9
- 前言9-18
- 一. 关于槭属9-10
- 1.1 槭属的概况9
- 1.2 槭属的研究9-10
- 二. 关于庙台槭10-11
- 2.1 庙台槭的概述10-11
- 2.2 庙台槭的研究11
- 三. 庙台槭生长的自然环境11-14
- 3.1 秦岭12-13
- 3.2 大巴山13
- 3.3 甘肃天水13-14
- 四. 生物多样性14-17
- 4.1 生物多样性概述14
- 4.2 我国生物多样性状况14
- 4.3 生物多样性研究的主要方法14-17
- 4.3.1 等位酶14-15
- 4.3.2 DNA分子标记15-17
- 4.3.2.1 RFLP15-16
- 4.3.2.2 RAPD16
- 4.3.2.3 微卫星DNA16-17
- 4.3.2.4 AFLP17
- 4.3.2.5 DNA序列的测定17
- 五. 本文研究内容、目的及意义17-18
- 材料与方法18-23
- 一. 材料18
- 1.1 材料的采集18
- 1.2 材料的生境及生长状况18
- 二. 方法18-23
- 2.1 总DNA的提取18-19
- 2.2 总DNA纯度、浓度检测19-20
- 2.2.1 DNA的电泳检测19
- 2.2.2 DNA的分光光度计检测19-20
- 2.3 引物筛选20
- 2.4 扩增反应20-21
- 2.5 扩增产物的电泳检测21
- 2.6 数据统计21-23
- 2.6.1 带的记录21
- 2.6.2 多态位点比率21
- 2.6.3 Shannon多样性指数21
- 2.6.4 Nei的遗传分化指数21-22
- 2.6.5 居群每代迁移数22
- 2.6.6 群间、个体间遗传距离与聚类分析22
- 2.6.7 主成分分析22-23
- 试剂、药品与仪器23-24
- 一. 主要试剂配方23
- 1.1 DNA提取液组成成分23
- 1.2 DNA洗涤缓冲液组成成分23
- 1.3 蛋白抽提液23
- 1.4 点样染料组成成分23
- 1.5 TAE电泳缓冲液组成成分23
- 1.6 随机引物23
- 二. 主要药品23
- 三. 主要实验仪器23-24
- 结果与分析24-35
- 一. 总DNA提取结果及其分析24
- 二. RAPD体系优化结果24-28
- 2.1 模板DNA的浓度24-25
- 2.2 模板DNA的纯度、大小25-26
- 2.3 Taq酶的浓度26
- 2.4 dNTP的浓度26
- 2.5 Mg~(2+)的浓度26-27
- 2.6 引物的浓度27
- 2.7 扩增程序27-28
- 三. 遗传多样性水平的度量28-31
- 3.1 多态位点比率29-30
- 3.2 条带共享率30
- 3.3 Shaanon多样性指数30-31
- 四. 种内遗传关系31-34
- 4.1 居群间的遗传关系31-33
- 4.2 个体间的遗传关系33-34
- 五. 遗传变异与生境的关系34-35
- 讨论35-40
- 一. 植物材料35-36
- 二. DNA提取36
- 三. 自然居群的遗传结构和遗传分化36-38
- 3.1 庙台槭自然居群的遗传多样性水平36-37
- 3.2 庙台槭自然居群间的遗传分化37-38
- 四. 致濒因素38-39
- 五. 遗传多样性保护39-40
- 结论40-41
- 参考文献41-46
- 致谢46-47
- 附图47-50
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|
| 1 |
曹小勇,陈恺;濒危植物庙台槭生殖生物学研究1.花序和花的形态及发育[J];西北植物学报;1997年05期 |
| 2 |
曹小勇,陈恺;庙台槭濒危原因的讨论[J];西北植物学报;1996年05期 |
| 3 |
赵先贵,肖玲,毛富春;槭树科花粉形态的研究[J];西北植物学报;1998年02期 |
| 4 |
陈永久,张亚平;随机扩增多态DNA影响因素的研究[J];动物学研究;1997年02期 |
| 5 |
曹小勇;濒危植物庙台槭生殖生物学研究──Ⅱ.大小孢子发生和雌雄配子体发育[J];汉中师范学院学报(自然科学);1999年03期 |
| 6 |
汪小全,邹喻苹,张大明,洪德元,刘正宇;银杉遗传多样性的RAPD分析[J];中国科学C辑:生命科学;1996年05期 |
| 7 |
夏铭,栾非时,李景鹏;RAPD影响因素的研究及实验条件的优化进[J];植物研究;1999年02期 |
| 8 |
黄敏仁,李宽钰,许农;RELP在林木遗传育种中的应用[J];世界林业研究;1993年03期 |
| 9 |
刘列钊,陈万权,李加纳;小麦随机扩增多态性DNA的反应体系探索[J];生物技术;2000年03期 |
| 10 |
傅萼辉,徐惠珠,陈建国;红糖槭(Acer rubrum L.)茎段离体培养研究[J];武汉植物学研究;1989年02期 |
|
|
|
|
|
| 1 |
张冬梅;马晓;苏金乐;钱又宇;;挪威槭叶片花色素苷的提取及稳定性研究[J];安徽农业科学;2006年13期 |
| 2 |
张安世;邢智峰;刘永英;张为民;;SRAP分子标记及其应用[J];安徽农业科学;2007年09期 |
| 3 |
柳李旺,汪隆植,龚义勤,邓代信;几种茄属植物基因组DNA提取与RAPD分析[J];安徽农业科学;1997年03期 |
| 4 |
何志斌,赵文智;荒漠绿洲区人工梭梭林土壤水分空间异质性的定量研究[J];冰川冻土;2004年02期 |
| 5 |
祁振声;陆贵巧;谷建才;杨华生;;“枫”的误传与“槭”的误订[J];北京林业大学学报(社会科学版);2006年02期 |
| 6 |
张俊卫,包满珠,陈龙清;梅、桃、李、杏、樱的RAPD分析[J];北京林业大学学报;1998年02期 |
| 7 |
韩永伟,王堃,张汝民,姚云峰,范春艳;吉兰泰地区退化梭梭蒸腾生态生理学特性[J];草地学报;2002年01期 |
| 8 |
韩冰,王学敏,易津,赵萌莉,杨燕燕;驼绒藜属植物种质资源遗传多样性RAPD分析[J];草地学报;2003年02期 |
| 9 |
盛晋华,乔永祥,刘宏义,翟志席,郭玉海;梭梭根系的研究[J];草地学报;2004年02期 |
| 10 |
马进;王小德;;天目山槭树植物种质资源与开发价值评价[J];长江大学学报(自科版)农学卷;2005年02期 |
|