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《西北大学》 2001年
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用RAPD标记检测庙台槭自然居群的遗传结构和遗传分化

李珊  
【摘要】: 庙台槭(Acer miaotaiense)是槭树科槭属的多年生乔木,为我国特有种,现 仅零星分布于陕西秦岭、巴山山地及甘肃天水一带,总计百余株个体,已被列为 国家三级珍稀濒危保护植物。庙台槭是槭属中较为原始的一类,在大巴山北坡有 分布东移的现象,对探讨该属的系统演化、地理分布及秦岭植物区系有相当重要 的价值。目前对庙台槭的研究较少且主要集中在生殖生物学领域,本文试图通过 RAPD分子标记研究庙台槭自然居群的遗传结构和种内遗传多样性,探讨导致其濒 危的可能原因,预测其遗传学命运并提出一些保护意见作为参考。 研究结果表明:用改良的CTAB法提取庙台槭总DNA的效果良好,可有效地 去除酚类化合物、多糖、小分子有机物等杂质的干扰,提取物可用于随后的多态 性分析。通过优化RAPD反应体系可得到清晰稳定可重复性高的扩增带型,最终反 应体系为:Taq酶(3U/μl)lul,PCR缓冲液(10×)3μl,MgCl_2(50mmol/L)1.5μl, dNTP(10mmol/L)0.6μl,引物(10mer)12μl,模板DNA(4ng/μl)3μl,纯净水 8.9μl。 用RAPD标记对庙台槭3个居群共39个个体进行了遗传多样性检测,20个10 碱基寡聚核苷酸引物共检测到128个位点,其中多态位点68个,多态位点比率为 53.13%。秦岭北坡居群、秦岭南坡和巴山居群、甘肃天水居群检测到的多态位点 数依次为:24、58、47个,多态位点比率分别为:18.75%、42.9%、32.78%。用Shannon 多样性指数估计3个居群的遗传多样性,得到了与多态位点比率相似的结果。说 明庙台槭的遗传多样性水平较低,这可能是导致庙台槭濒危的原因之一。庙台槭 居群的遗传分化系数(Gst)为0.4154,表明居群之间已有明显的遗传分化发生。 根据RAPD数据对庙台槭39个个体进行Ward聚类分析,结果可将39个个体 分开,3个居群都有明显的以彼此为中心聚集的趋势,说明居群之间已有较高程 度的遗传分化,居群内部个体之间的相似程度较高。各居群内的条带共享率较高、 欧氏距离均数、Nei遗传距离均数都较小,反映出居群内部有较高的一致度。产 生这种现象的可能原因是地理隔离形成小种群,使有效居群大小减小,引起近交 衰退,增加了居群内的纯合性。同时遗传漂变的发生可能造成一些等位基因的丢 失和另一些等位基因的固定使居群内遗传多样性减少。 用PCA法分析了遗传变异与生境间的关系,前三个主分量共代表了83.33%的 变异。X轴为第一主分量,代表了37.39%的变异,从个体的梯度变化规律来看, 此轴与纬度有关,基本上反映了纬度的差异。Y轴为第H个主分量,代表了26.30% 的变异,基本上反映了水分变化的趋势。Z轴代表第三个主分量,表示了19.64% 的变异,在很大程度上反映了温度变化的规律。PCA分析可将不同居群区分开, 结果与Ward聚类一致。 根据本文的结果,并结合以前的有关研究分析,导致庙台械濒危的可能原因 是:l)有性生殖过程存在障碍。2)地理隔离严重,基因流受阻,受遗传漂变影 响很大,遗传多样性水平较低。3)人为破坏十分严重。建议应采取的保护措施是: l)同时进行就地和迁地保护,迅速增加庙台械个体的数量。2)通过撒播种子或 利用营养繁殖来增加有效居群大小。3)加强宣传教育,提高公民保护意识。同时 建议将庙台械的种质资源纳入国家超低温种质保存库中。
【关键词】:庙台槭 遗传多样性 RAPD标记
【学位授予单位】:西北大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2001
【分类号】:Q949.7
【目录】:
  • 中文摘要5-7
  • 英文摘要7-9
  • 前言9-18
  • 一. 关于槭属9-10
  • 1.1 槭属的概况9
  • 1.2 槭属的研究9-10
  • 二. 关于庙台槭10-11
  • 2.1 庙台槭的概述10-11
  • 2.2 庙台槭的研究11
  • 三. 庙台槭生长的自然环境11-14
  • 3.1 秦岭12-13
  • 3.2 大巴山13
  • 3.3 甘肃天水13-14
  • 四. 生物多样性14-17
  • 4.1 生物多样性概述14
  • 4.2 我国生物多样性状况14
  • 4.3 生物多样性研究的主要方法14-17
  • 4.3.1 等位酶14-15
  • 4.3.2 DNA分子标记15-17
  • 4.3.2.1 RFLP15-16
  • 4.3.2.2 RAPD16
  • 4.3.2.3 微卫星DNA16-17
  • 4.3.2.4 AFLP17
  • 4.3.2.5 DNA序列的测定17
  • 五. 本文研究内容、目的及意义17-18
  • 材料与方法18-23
  • 一. 材料18
  • 1.1 材料的采集18
  • 1.2 材料的生境及生长状况18
  • 二. 方法18-23
  • 2.1 总DNA的提取18-19
  • 2.2 总DNA纯度、浓度检测19-20
  • 2.2.1 DNA的电泳检测19
  • 2.2.2 DNA的分光光度计检测19-20
  • 2.3 引物筛选20
  • 2.4 扩增反应20-21
  • 2.5 扩增产物的电泳检测21
  • 2.6 数据统计21-23
  • 2.6.1 带的记录21
  • 2.6.2 多态位点比率21
  • 2.6.3 Shannon多样性指数21
  • 2.6.4 Nei的遗传分化指数21-22
  • 2.6.5 居群每代迁移数22
  • 2.6.6 群间、个体间遗传距离与聚类分析22
  • 2.6.7 主成分分析22-23
  • 试剂、药品与仪器23-24
  • 一. 主要试剂配方23
  • 1.1 DNA提取液组成成分23
  • 1.2 DNA洗涤缓冲液组成成分23
  • 1.3 蛋白抽提液23
  • 1.4 点样染料组成成分23
  • 1.5 TAE电泳缓冲液组成成分23
  • 1.6 随机引物23
  • 二. 主要药品23
  • 三. 主要实验仪器23-24
  • 结果与分析24-35
  • 一. 总DNA提取结果及其分析24
  • 二. RAPD体系优化结果24-28
  • 2.1 模板DNA的浓度24-25
  • 2.2 模板DNA的纯度、大小25-26
  • 2.3 Taq酶的浓度26
  • 2.4 dNTP的浓度26
  • 2.5 Mg~(2+)的浓度26-27
  • 2.6 引物的浓度27
  • 2.7 扩增程序27-28
  • 三. 遗传多样性水平的度量28-31
  • 3.1 多态位点比率29-30
  • 3.2 条带共享率30
  • 3.3 Shaanon多样性指数30-31
  • 四. 种内遗传关系31-34
  • 4.1 居群间的遗传关系31-33
  • 4.2 个体间的遗传关系33-34
  • 五. 遗传变异与生境的关系34-35
  • 讨论35-40
  • 一. 植物材料35-36
  • 二. DNA提取36
  • 三. 自然居群的遗传结构和遗传分化36-38
  • 3.1 庙台槭自然居群的遗传多样性水平36-37
  • 3.2 庙台槭自然居群间的遗传分化37-38
  • 四. 致濒因素38-39
  • 五. 遗传多样性保护39-40
  • 结论40-41
  • 参考文献41-46
  • 致谢46-47
  • 附图47-50

【引证文献】
中国期刊全文数据库 前3条
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【共引文献】
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10 吴敏;广州市青山绿地—城市林带林区生态功能研究[D];中南林业科技大学;2007年
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【同被引文献】
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