新疆阜康绿洲沙漠过渡带碱蓬种群分子生态学初步研究——基于RAPD分析
【摘要】:
本研究采用随机扩增多态DNA(RAPD)分析方法,研究了新疆阜康沙漠绿洲过渡带藜科植物碱蓬(Suaeda acuminata)的种群遗传结构和遗传多样性。在新疆阜康绿洲沙漠过渡带中,碱蓬作为较适应其环境的优势种,对绿洲沙漠过渡带生态系统稳定性的维持起着重要作用。本文旨以RAPD技术为分析手段,研究沙漠绿洲过渡带碱蓬的种群遗传结构及种内遗传多态性,探讨遗传变异的空间分布及其与绿洲沙漠过渡带生态因子的关系。主要结果如下:
采用16个引物对过渡带碱蓬5个亚种群93个体进行RAPD扩增和分析,共检测得到90个位点,除了一个位点外其余均为多态,多态位点比率(PPB)达98.9%,表明碱蓬种群内存在很高的遗传多样性。5个碱蓬亚种群遗传多样性由高到低排列顺序为:亚种群4>亚种群2>亚种群5>亚种群3>亚种群1。RAPD数据的Shannon指数(I)分析显示,碱蓬种群总的多样性(Hsp)为0.5386,遗传变异的72.32%(Hpop/Hsp)存在于亚种群内,27.68%的变异(Hsp-Hpop/Hsp)存在于亚种群间。Nei指数估算碱蓬种群总的基因多样性(HT)为0.3627,亚种群内基因多样性(Hs)占总多样性的71.29%,亚种群间的遗传分化系数(GST)为28.71%,与Shannon指数分析结果基本一致。5个亚种群两两间遗传距离范围为0.0393-0.3643,遗传距离最大的是亚种群2和4,最小的是2和3亚种群。碱蓬每代迁入亚种群的个体数(Nm值)仅为0.6208,作为一个远交种,碱蓬亚种群间的基因流是很低的。
绿洲沙漠过渡带碱蓬土壤因子11项指标分别与碱蓬多态位点比率和Shannon多样性指数进行相关性分析,结果表明:碱蓬的遗传多样性水平与土壤的电导率
(CO,P<0.01),含水量(W)、Mg++(P<0.05)均呈显著的正相关,而与土壤其他生态因子的相关性不显著(P>0.05)。同时,随着土壤pH值的降低,碱蓬的遗传多样性水平有上升的趋势。碱蓬亚种群间的遗传距离与地理距离没有明显的相关关系。
碱蓬亚种群间的遗传一致度、遗传距离以及聚类分析结果显示,在新疆阜
西北大学生命科学学院硕士学位论文
康沙漠绿洲过渡带中,碱蓬种群己经发生明显的遗传分化;这种遗传变异的发生
与所研究亚种群在过渡带中的地理位置无关,而与其所处的微生境有关。长期对
所处微生境的适应和亚种群间有限的基因交流是导致碱蓬种群分化的可能原因。
【关键词】:分化 遗传变异 绿洲沙漠过渡带 RAPD 碱蓬 土壤因子 相关性
【学位授予单位】:西北大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2002
【分类号】:Q943;Q948
【目录】:
【学位授予单位】:西北大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2002
【分类号】:Q943;Q948
【目录】:
- 中文摘要6-8
- 英文摘要8-10
- 1. 植物分子生态学研究进展10-21
- 1.1 前言10-11
- 1.2 分子生态学的产生背景11-13
- 1.3 分子生态学的概念和研究目的13-14
- 1.4 分子生态学的研究内容14-17
- 1.4.1 分子种群生物学14-16
- 1.4.2 分子环境遗传学16
- 1.4.3 分子适应16-17
- 1.5 分子生态学研究的主要实验技术方法17-20
- 1.5.1 等位酶分析技术17-18
- 1.5.2 RFLP分析技术18
- 1.5.3 RAPD分析技术18-19
- 1.5.4 DNA和蛋白质序列测定与分析技术19-20
- 1.6 结束语20-21
- 2. 本研究的目的、方法和意义21-23
- 2.1 藜科介绍21
- 2.2 研究对象和研究方法21-22
- 2.2.1 研究对象21-22
- 2.2.2 研究方法22
- 2.3 本研究的目地和意义22-23
- 3. 碱蓬的RAPD分析23-42
- 3.1 材料与方法23-28
- 3.1.1 研究地区自然概况23
- 3.1.2 样品采集23-24
- 3.1.3 土壤理化性状分析方法24
- 3.1.4 总DNA的提取24
- 3.1.5 随机扩增引物筛选24-25
- 3.1.6 随机扩增及产物检测25-26
- 3.1.7 实验用试剂、药品与仪器26-27
- 3.1.8 数据统计及分析27-28
- 3.2 研究结果28-37
- 3.2.1 5个亚种群土壤环境资料28-29
- 3.2.2 碱篷的多态位点比率29-31
- 3.2.3 碱篷的Shannon多样性指数和Nei基因多样性指数31-34
- 3.2.4 碱篷亚种群的遗传距离与聚类分析34-36
- 3.2.5 遗传多样性指标与生态因子之间的相关性36
- 3.2.6 碱蓬亚种群间遗传距离与地理隔离的相关性及显著性检验分析36-37
- 3.3 讨论37-42
- 3.3.1 碱篷的遗传多样性37
- 3.3.2 碱蓬的种群遗传结构37-39
- 3.3.3 碱蓬的基因流39-40
- 3.3.4 碱篷的遗传多样性与环境因子的关系40-41
- 3.3.5 碱蓬的遗传距离与地理距离的关系41-42
- 参考文献42-47
- 致谢47-48
| 【引证文献】 | ||
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| 【参考文献】 | ||
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| 【共引文献】 | ||
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| 【同被引文献】 | ||
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| 【二级引证文献】 | ||
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| 【二级参考文献】 | ||
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| 【相似文献】 | ||
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