秦川牛Chemerin基因及其受体CMKLR1基因组织表达谱及多态性研究

【摘要】：Chemerin是最新被发现的一个脂肪因子,通过和其受体CMKLR1相互作用而产生调节脂肪分化、脂类代谢和免疫等多种反应。本实验以Chemerin基因及其受体基因CMKLR1为研究对象,首先采用实时定量PCR (qRT-PCR)方法检测它们在3头秦川牛(QC)组织中的表达谱;其次在324份秦川牛血样中采用PCR-SSCP方法对Chemerin基因的5’侧翼区、外显子区域和部分内含子区域进行了多态性分析,然后又采用直接测序与限制性内切酶片段长度多态性(RFLP)相结合的方法,对CMKLR1基因的编码区进行多态性检测,并将它们与秦川牛肉质性状进行关联分析,旨在探索Chemerin基因和其受体基因CMKLR1对秦川牛肉质性状的影响,试图找到影响秦川牛肉用性状的主效基因,为秦川牛的遗传改良奠定理论基础。 1. Chemerin基因与CMKLR1基因在秦川牛组织中的表达谱 Chemerin基因在秦川牛的多种组织中均表达,而在肝脏、肾脏和脂肪等组织中表达量最高;CMKLR1基因也在多种组织中表达,其中以脾脏、肾脏和脂肪等组织中的表达量最高;而它们在脂肪组织和肾脏组织中同时高表达。 2. Chemerin基因多态性及其与秦川牛肉质性状的关联分析 在Chemerin基因编码区和非编码区共发现四处多态位点,其中第二外显子868 bp处的A/G突变对秦川牛的眼肌面积、背膘厚、大理石花纹和系水力有显著影响;第五外显子2692 bp处的G/A突变对背膘厚和系水力有显著影响,推测该基因可能是影响秦川牛眼肌面积、背膘厚和系水力等肉质性状的主效基因或与之紧密连锁,为秦川牛的选育改良提供理论指导。 3. CMKLR1基因多态性及其与秦川牛肉质性状的关联分析 在CMKLR1基因编码区共检测到四处突变位点,其中在G264C位点发现一个Asul酶切位点,该位点的DD基因型和CD基因型个体的大理石花纹极显著高于AA型个体(P0.01);在C762T位点发现一个xmn1酶切位点,该位点RP基因型个体的大理石花纹显著高于RR基因型个体(P0.05)。由此我们推测该基因可能是影响背膘厚与大理石花纹等肉质性状的主效基因或与其紧密连锁,可以作为秦川牛标记辅助选择的候选基因。