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《西北农林科技大学》 2010年
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小麦与条锈菌互作过程中活性氧和防御基因的防御反应及抗病相关基因的鉴定与功能验证

王晓敏  
【摘要】:小麦条锈病是由条形柄锈菌小麦专化型(Puccinia striiformis Westend f. sp. tritici Eriks. Henn.)引起的一种重要的小麦(Triticum aestivum L.)气传叶部病害,也是我国乃至世界上所有产麦国家危害最严重的世界性小麦病害之一。以多年来国内外专家学者的研究和生产实践证明,合理利用抗病基因,培育和推广高效、稳定、广谱、持久的抗病品种是控制与治理小麦条锈病最经济、安全、有效的途径。优良的抗病种质与基因资源是产生突破性抗病育种的物质基础;深入研究小麦的抗病机制,是抗病育种的必由之路;加强对小麦与条锈菌互作过程中的组织学、组织化学和分子生物学方面的研究,为阐明小麦与条锈菌互作的分子机制奠定了坚实的基础,对抗病防治和抗病遗传育种工作具有重要的理论和指导意义。 本文一方面,采用光学显微镜和组织化学研究方法,通过比较由携带Yr10的抗病小麦品种Moro和感病品种Fielder与条锈菌组成的非亲和与亲和体系互作反应的不同,阐明病原菌的发展、寄主的过敏性反应和活性氧(ROS)的积累在细胞学上的关系;并利用实时定量PCR (qRT-PCR),对一系列防御相关基因在非亲和与亲和组合中进行表达谱的研究,将细胞学反应与基因表达调控相结合,对Yr10介导的对条锈菌的防御反应中涉及的关键因素进行揭示。 另一方面,本文从实验室前期以小麦品种水源11与条锈菌生理小种CYR23为材料,利用抑制性差减杂交技术已经构建完成的非亲和条锈菌诱导的小麦叶片cDNA文库或NCBI小麦EST数据库中,共挑选了3个候选基因。通过电子克隆结合RT-PCR技术,克隆得到这3个基因全长序列,它们分别为:小麦含CBS结构域的蛋白基因、小麦EF-手型钙结合蛋白基因和小麦受翻译调节的肿瘤蛋白基因;通过生物信息学比对和分析了解这些基因的基本特征;利用qRT-PCR技术,分析这些基因在对条锈菌侵染的防御反应、非生物胁迫和环境影响等过程中的分子特征和表达谱;利用基因枪转化法在洋葱表皮细胞对小麦EF-手型钙结合蛋白基因和小麦受翻译调节的肿瘤蛋白基因进行瞬时表达,明确其亚细胞定位;运用BSMV-VIGS技术对小麦受翻译调节的肿瘤蛋白基因进行功能分析。通过这些实验,初步明确这3个基因在小麦与条锈菌互作体系中的分子生物学功能。具体研究内容和结果如下: 1.在小麦抗病品种Moro (携带Yr10抗条锈病基因)和感病品种Fielder中,至接种后6~12 d,条锈菌在叶片中的侵入和定殖非常相似。但是在此之后,Moro发生活性氧迸发和过敏性坏死反应阻止了病原菌的进一步扩展。在非亲和组合中,防御信号分子基因于接种后较早期2~6 d特异上调表达,病程相关蛋白(Pathogenesis-related Protein,PR-protein)基因则于接种后4~14 d有特异的上调表达。结果表明识别反应发生在寄主与病原菌互作早期,而阻止病原菌发展的关键的PR-蛋白介导的防御反应发生在互作后期。本研究是第一次在谷类锈菌中将详细的形态学方面的防御反应,包括活性氧迸发和HR,与已经注释的防御基因的表达谱相结合,以目前的寄主与病原菌互作模式阐明了Yr10和条锈菌的关系。 2.小麦含CBS结构域蛋白的基因TaCDCP1 (Triticum aestivum CBS domain containing protein 1),开放阅读框654 bp,编码217个氨基酸;TaCDCP1拟编码的蛋白预测具有两个典型的CBS保守结构域,不含跨膜区,无信号肽,定位在叶绿体基质内;经过同源比对,TaCDCP1氨基酸序列与大麦、水稻和玉米等的同源序列的相似性较高;该基因在小麦叶中的表达量显著高于在根和茎中的;在小麦与条锈菌的非亲和与亲和组合中,TaCDCP1基因均受到条锈菌诱导,非亲和组合表达量在侵染前期(接种后18~48 h)高于亲和组合,而在侵染后期(接种后96~120 h)低于亲和组合;外源植物激素脱落酸诱导该基因上调表达,苄基腺嘌呤、乙烯、赤霉素、茉莉酸甲酯和水杨酸处理后,其表达量在不同程度上受到抑制;TaCDCP1在低温和干旱条件下表达量上调,经机械伤害和高盐处理后表达量无明显差异。以上表明TaCDCP1可能通过脱落酸等信号途径参与小麦对条锈菌的防御反应,同时参与低温和干旱环境下的防御反应。结果对于明确CBS结构域的功能以及CBS结构域蛋白尤其是TaCDCP1在小麦与条锈菌互作中的作用奠定了基础。 3.小麦EF-手型钙结合蛋白基因TaCab1 (Triticum aestivum calcium binding EF-hand protein 1),DNA序列没有内含子,开放阅读框651 bp,编码216个氨基酸;TaCab1拟编码的蛋白预测具有一个信号肽,一个跨膜区域,一个油体钙蛋白保守结构域(caleosin conserved domain)和一个单独的EF-手型基序;TaCab1与大麦中EF-手型钙结合蛋白基因BCI-4编码的蛋白同源性高达92 %;洋葱表皮细胞的瞬时表达结果显示TaCab1基因编码一个跨膜蛋白;TaCab1的表达可能受到钙离子浓度的调控;该基因在小麦叶中的表达量显著高于在根和茎中;尽管在非亲和与亲和组合中表达整体表现为相似的上调趋势,TaCab1在亲和组合中的表达量显著高于在非亲和组合中的;在水杨酸处理后2~24 h,TaCab1的表达整体保持上调,在其他不同激素和非生物胁迫处理下,TaCab1基因于处理早期被诱导,且均有不同程度的上调表达,但均无水杨酸处理后上调幅度大。以上表明,TaCab1可能通过水杨酸信号途径参与小麦对条锈菌的防御反应负调控,同时参与对环境压力的基础抗性反应。这些结果揭示了TaCab1在小麦应对生物与非生物胁迫和条锈菌致病过程中发挥的作用,为进一步研究TaCab1在小麦与条锈菌互作中的特殊功能奠定基础。 4.小麦受翻译调节的肿瘤蛋白基因TaTCTP1 (Triticum aestivum translationally controlled tumor protein 1),该基因DNA序列全长1647bp,包含4个内含子序列和5个外显子序列;该基因开放阅读框为507 bp,编码168个氨基酸,预测其不含跨膜区,无信号肽;具有Mss4-like和Mss4/TCTP-associated超家族保守结构域以及TCTP_1和TCTP_2两个TCTP保守结构特征区;TaTCTP1与小麦受翻译调节的肿瘤蛋白TaTCTP序列(GenBank登录号为AAM34280)同源性高达98 %;亚细胞定位结果表明TaTCTP1编码一个胞浆蛋白;该基因的表达可能受到钙离子浓度的调控;该基因在小麦根、茎和叶中表达水平一致;TaTCTP1受小麦条锈菌诱导表达,非亲和组合表达量在侵染前期(接种后12~48 h)高于亲和组合,于接种后18 h在非亲和组合中出现第一个表达高峰,而在侵染后期(接种后96~120 h),虽然非亲和组合中TaTCTP1出现第二个表达高峰,但在亲和组合中TaTCTP1有较高的相对表达量;TaTCTP1基因仅在乙烯、高盐和低温处理早期被诱导表达,对于其他激素包括水杨酸、茉莉酸等的处理,干旱和伤害处理后,其表达量基本无变化。利用BSMV-VIGS分析,TaTCTP1沉默后的水源11植株在挑战接种CYR23后,小麦叶片由原来的抗病反应型变为感病反应型,产生大量孢子;在挑战接种CYR31后,小麦叶片的症状与对照的反应型一致。以上结果表明,TaTCTP1可能通过乙烯信号途径参与对低温和高盐等逆境的抗性反应,并在小麦对条锈菌的抗病途径中发挥着十分重要的作用,这为进一步研究TaTCTP1在小麦与条锈菌互作中的特殊功能奠定基础。
【关键词】:小麦 小麦条锈菌 活性氧 防御基因 抗病相关基因 功能验证
【学位授予单位】:西北农林科技大学
【学位级别】:博士
【学位授予年份】:2010
【分类号】:S435.121.42
【目录】:
  • 摘要6-9
  • ABSTRACT9-17
  • 第一章 文献综述17-51
  • 1.1 植物的抗性机制17-22
  • 1.1.1 植物抗病机制模型17-18
  • 1.1.2 植物抗病遗传的基础模式18-20
  • 1.1.3 植物的抗病基因20-22
  • 1.2 植物与病原菌互作的分子机制22-34
  • 1.2.1 胞外信号分子的识别23
  • 1.2.2 胞内信号转导23-32
  • 1.2.3 植物防卫反应的启动32-34
  • 1.3 基因功能研究技术34-45
  • 1.3.1 生物信息学数据分析34-35
  • 1.3.2 基因时空表达谱的分析35-36
  • 1.3.3 植物基因功能的验证36-45
  • 1.3.4 蛋白的亚细胞定位45
  • 1.4 小麦条锈病的发生、危害及研究现状45-50
  • 1.4.1 小麦条锈病的发生和危害45-46
  • 1.4.2 小麦条锈病的研究进展46-50
  • 1.5 本研究目的意义50-51
  • 第二章 小麦与条锈菌互作过程中活性氧和防御基因的防御反应51-74
  • 2.1 前言51-53
  • 2.2 材料、试剂及仪器53
  • 2.2.1 材料53
  • 2.2.2 试剂53
  • 2.2.3 仪器53
  • 2.3 实验方法53-58
  • 2.3.1 培养和接种53-54
  • 2.3.2 病情调查54
  • 2.3.3 组织学研究54
  • 2.3.4 透射电子显微镜法对条锈菌侵染过程的观察54-55
  • 2.3.5 DAB 染色法对H_2O_2 的组织化学定位55
  • 2.3.6 防御基因表达研究55-58
  • 2.4 结果与分析58-70
  • 2.4.1 条锈菌在叶片上病症和病情发展情况58-59
  • 2.4.2 小麦与条锈菌不同组合中的组织学观察59-62
  • 2.4.3 小麦寄主与条锈菌细胞的超微结构观察62
  • 2.4.4 HR 细胞坏死62-65
  • 2.4.5 H_2O_2 在亲和与非亲和组合中的积累65-67
  • 2.4.6 防御基因的表达谱67-70
  • 2.5 讨论与结论70-74
  • 第三章 含CBS 结构域的小麦TACDCP1 基因的克隆及表达特征分析74-96
  • 3.1 前言74-75
  • 3.2 材料、试剂及仪器75
  • 3.2.1 材料75
  • 3.2.2 试剂75
  • 3.2.3 仪器75
  • 3.3 实验方法75-86
  • 3.3.1 接种和采样75-76
  • 3.3.2 RNA 提取及质量检测76-78
  • 3.3.3 cDNA 第一链的合成及检测78-79
  • 3.3.4 基因全长的电子克隆和RT-PCR 扩增79-80
  • 3.3.5 PCR 产物的回收纯化80
  • 3.3.6 PCR 产物与载体的连接80-81
  • 3.3.7 感受态细胞的制备及转化81-82
  • 3.3.8 质粒DNA 的小量制备82-83
  • 3.3.9 质粒的酶切鉴定83
  • 3.3.10 基因片段的序列测定83-84
  • 3.3.11 基因全长的序列拼接及分析84
  • 3.3.12 目的基因的表达特征分析84-86
  • 3.4 结果与分析86-93
  • 3.4.1 小麦叶片总RNA 的提取86
  • 3.4.2 TaCDCP1 的全长cDNA 克隆86-88
  • 3.4.3 TaCDCP1 的序列分析88-91
  • 3.4.4 TaCDCP1 基因组织特异性表达分析91-92
  • 3.4.5 TaCDCP1 基因受条锈菌诱导的表达分析92
  • 3.4.6 TaCDCP1 基因受生物及非生物胁迫的表达分析92-93
  • 3.5 讨论与结论93-96
  • 第四章 小麦EF-手型钙结合蛋白基因TACAB1 的克隆、表达特征分析及其初步功能验证96-115
  • 4.1 前言96-97
  • 4.2 材料、试剂及仪器97
  • 4.2.1 材料97
  • 4.2.2 试剂97
  • 4.2.3 仪器97
  • 4.3 实验方法97-102
  • 4.3.1 样品处理与采集97
  • 4.3.2 TaCab1 基因的电子克隆97-98
  • 4.3.3 基因全长的序列拼接及分析98
  • 4.3.4 基因组全长克隆98-99
  • 4.3.5 实时定量PCR 分析99
  • 4.3.6 瞬时表达与亚细胞定位分析99-102
  • 4.4 结果与分析102-112
  • 4.4.1 TaCab1 的全长cDNA 克隆102-103
  • 4.4.2 TaCab1 的序列分析103-107
  • 4.4.3 TaCab1 基因组全长107
  • 4.4.4 TaCab1 基因受钙离子诱导的表达分析107-108
  • 4.4.5 TaCab1 基因组织特异性表达分析108-109
  • 4.4.6 TaCab1 基因受条锈菌诱导的表达分析109-110
  • 4.4.7 TaCab1 基因受生物及非生物胁迫下的表达分析110-111
  • 4.4.8 TaCab1 亚细胞定位111-112
  • 4.5 讨论与结论112-115
  • 第五章 小麦受翻译调节的肿瘤蛋白基因TATCTP1 的克隆、表达特征分析及其功能验证115-137
  • 5.1 前言115-116
  • 5.2 材料、试剂及仪器116
  • 5.2.1 材料116
  • 5.2.2 试剂116
  • 5.3 实验方法116-120
  • 5.3.1 TaTCTP1 基因的电子克隆和RT-PCR 扩增116
  • 5.3.2 基因全长的序列拼接及分析116-117
  • 5.3.3 基因组全长的克隆117
  • 5.3.4 实时定量PCR 分析117
  • 5.3.5 瞬时表达与亚细胞定位分析117
  • 5.3.6 BSMV 诱导小麦的基因沉默117-120
  • 5.4 结果与分析120-133
  • 5.4.1 TaTCTP1 的全长cDNA 克隆120-121
  • 5.4.2 TaTCTP1 的序列分析121-124
  • 5.4.3 TaTCTP1 基因组全长124-126
  • 5.4.4 TaTCTP1 基因受钙离子诱导的表达分析126-127
  • 5.4.5 TaTCTP1 基因组织特异性表达分析127
  • 5.4.6 TaTCTP1 基因在条锈菌诱导下的表达分析127-129
  • 5.4.7 TaTCTP1 基因受生物及非生物胁迫下的表达分析129
  • 5.4.8 TaTCTP1 亚细胞定位129-130
  • 5.4.9 TaTCTP1 基因沉默结果分析130-133
  • 5.5 讨论与结论133-137
  • 全文结论137-139
  • 参考文献139-162
  • 附录162-163
  • 致谢163-165
  • 作者简介165

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3 彭云良 杨家秀 罗林明 廖化明;四川小麦条锈病发生的特点[N];四川科技报;2006年
4 彭云良 杨家秀 罗林明 廖化明;小麦条锈病防治对策[N];四川科技报;2006年
5 供稿 张家川县连五乡农业服务中心 窦耀武;小麦条锈病的防治对策[N];天水日报;2007年
6 师晓京;陇南小麦条锈病基因控制技术体系建成[N];农民日报;2007年
7 何明;要重视防治小麦条锈病[N];四川科技报;2006年
8 中国农业科学院植物保护研究所 陈万权;防治条锈病 从源头抓起[N];农民日报;2005年
9 河南农业大学 孙治强;巧用硕丰481、高能红钾 加强小麦锈病防治[N];湖北科技报;2007年
10 本报记者 郭军;从生活身边感受气候变暖[N];陕西日报;2008年
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 汤春蕾;条锈菌与小麦互作中效应蛋白及诱导寄主细胞坏死基因的鉴定与功能分析[D];西北农林科技大学;2013年
2 马金彪;小麦与条锈菌亲和互作表达序列标签(EST)分析和条锈菌转录基因物理图谱构建[D];西北农林科技大学;2010年
3 王晓杰;小麦与条锈菌互作机理研究及抗条锈相关基因的功能分析[D];西北农林科技大学;2009年
4 郭萍;小麦抗条锈性的自由基分子机理[D];西北农林科技大学;2002年
5 李红兵;水稻对小麦叶锈菌的非寄主抗性研究及条锈菌侵染的小麦叶片蛋白质组学分析[D];西北农林科技大学;2011年
6 刘博;条锈菌诱导的小麦β-1,3-葡聚糖酶基因的表达特征分析及条锈菌基因功能验证体系建立的探索[D];西北农林科技大学;2010年
7 蒋选利;小麦与条锈菌(Puccinia striiformis West.)相互作用的超微结构、细胞化学和分子细胞学研究[D];西北农林科技大学;2002年
8 于秀梅;条锈菌诱导的小麦抑制差减杂交文库构建(SSH)及其表达序列标签(ESTs)研究[D];西北农林科技大学;2006年
9 张宏昌;小麦成株抗条锈病的组织学和细胞学研究及小麦非寄主抗蚕豆锈病的机理研究[D];西北农林科技大学;2012年
10 李在峰;中国小麦品种条锈鉴定及抗条锈新基因YrZH84的分子标记[D];中国农业科学院;2006年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 邓麟;小麦中与条锈菌互作相关基因的克隆以及表达谱和功能的初步分析[D];西北农林科技大学;2010年
2 刘博;条锈菌诱导的小麦β-1,3-葡聚糖酶基因编码区的克隆与原核表达[D];西北农林科技大学;2006年
3 郑大勇;西南地区小麦条锈菌群体毒性分析[D];四川农业大学;2009年
4 王艳飞;小麦与条锈菌非亲和互作的cDNA文库构建及表达序列标签分析[D];西北农林科技大学;2007年
5 段迎辉;三个小麦抗条锈病相关基因的分子特征分析[D];西北农林科技大学;2008年
6 马金彪;条锈菌诱导的小麦叶片cDNA文库构建及表达序列标签分析[D];西北农林科技大学;2006年
7 余宇;小麦类甜蛋白TLP基因的克隆与原核表达[D];西北农林科技大学;2007年
8 屈志鹏;小麦与条锈菌亲和互作cDNA文库高通量ESTs分析平台构建及相关分析[D];西北农林科技大学;2007年
9 宋晓贺;普通小麦—柔软滨麦草易位系抗条锈性遗传分析和分子标记[D];西北农林科技大学;2008年
10 李晶;小麦的转基因研究和两种荒漠植物的离体再生[D];西北大学;2003年
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