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《西北农林科技大学》 2011年
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黄牛HSP家族基因差异表达及经济性状相关基因遗传变异研究

张宝  
【摘要】:本研究应用PCR-RFLP、PCR-SSCP、DNA测序、GoldenGate基因分型法、qRT-PCR等分子生物学技术,研究美国荷斯坦牛胚泡率和受精率等繁殖性状相关基因表达差异、遗传变异及其遗传效应;揭示了5个中国黄牛品种,秦川牛、南阳牛、郏县红牛、晋南牛、中国荷斯坦牛和一个引入品种安格斯牛GHSR和FTO基因的遗传变异及其与生长性状的相关性。以期从RNA及DNA水平筛选调控黄牛经济性状的关键基因和具有显著效应的分子标记,为标记辅助选择和转基因育种提供遗传学依据。得到如下结果: 1. HSP基因家族在美国荷斯坦牛体外培养胚泡及退化胚胎中的表达差异分析 利用qRT-PCR技术研究发现,HSP家族的17个基因,在美国荷斯坦牛体外培养胚泡和退化胚胎中表达差异倍数从1.5倍至7.6倍;其中,9个基因(HSPE1,HSPH1,HSBP1和6个HSP70家族的基因)表现为中等的表达差异倍数。HSP70基因家族中的3个基因(HSPA2,HSPA5和HSPA8)在胚泡里高表达,而2个基因(HSPA9和HSPA14)在退化胚胎中高表达。依据HSP家族17个基因的差异表达倍数,筛选了DNAJC15,DNAJC19,DNAJC24和DNAJC27四个可能与胚泡率相关的候选基因进行后续分析。查阅Ensembl数据库获得,牛HSP家族17个基因中4个基因具有选择性剪接体。通过对4个基因10个不同转录本的研究揭示,不同的转录本在体外胚胎培养体系中具有不同的表达水平。 2.美国荷斯坦牛4个候选基因SNP检测及其与受精率和胚泡率的关联分析 利用DNA池结合测序的方法对筛选的DNAJC15,DNAJC19,DNAJC24和DNAJC27四个基因进行遗传变异的检测,并分析其与受精率和胚泡率等繁殖性状的相关性。发现美国荷斯坦牛4个候选基因存在14个SNPs,将位于编码区及调控区的9个SNPs进行基因分型。发现DNAJC15基因的5个SNPs和DNAJC27基因的3个SNPs分别存在高的连锁值。 关联分析发现,DNAJC27基因的一处突变位点(NC_007309:g. 36016 CG),具有GG和CC基因型个体的受精率分别为69.3%和62.2%,差异达到显著水平(P=0.034)。DNAJC15基因的一处突变位点(NW_001493020.2:g. 995593 GA),具有GG和AG基因型个体的的胚泡率分别为40.1%和28.1%,差异达到显著水平。 3.不同转录本和新转录序列在胚泡和退化胚胎中表达差异分析 利用qRT-PCR的技术,分析了5个基因(MYL6,NOP10,RNF187,RPS24,RPS28)的10个不同转录本及8个新转录序列(XLOC_000727,XLOC_001837,XLOC_001206,XLOC_001203,XLOC_001523,XLOC_000667,XLOC_001513,XLOC_000024)在美国荷斯坦牛体外培养胚泡和退化胚胎中的表达差异。发现5个基因的10个转录本均在退化胚胎中高表达,差异倍数的变化范围是1.93倍至11.22倍。8个新转录序列也均在退化胚胎中高表达,差异倍数变化范围从2倍至90倍。 4. 6个黄牛品种GHSR基因遗传变异检测及其与生长性状的关联分析 利用PCR-SSCP与测序技术相结合,发现黄牛GHSR基因的3’UTR区存在2处突变,建立了一种EcoRI PCR-RFLP的方法检测其中一处突变位点(XM_592014:c. 3566 AG)。分析发现,郏县红牛与南阳牛该突变位点基因型分布不符合哈代温伯格平衡(P 0.05);其他黄牛品种均符合哈代温伯格平衡(P0.05)。6个黄牛群体该基因座遗传多态性比较丰富,均处于中度多态。关联分析发现,3566 AG位点的不同基因型与南阳牛、秦川牛和郏县红牛的生长性状均没有相关性(P 0.05)。 5. 6个黄牛品种FTO基因遗传变异检测及单倍型分析 利用PCR-SSCP及测序技术相结合,发现黄牛FTO基因存在10个SNPs,其中,5个同义突变,2个错义突变,3个SNPs位于内含子区。位于外显子4的1处突变21474616 GC (Q261H)位于FTO蛋白的催化核心,且引起了氨基酸的酸碱性变化。群体遗传学分析结果显示,6个黄牛群体FTO基因10个SNPs的等位基因频率均较低。单倍型分析揭示,南阳牛和秦川牛存在两个单倍型域,郏县红牛存在3个单倍型域,且三个黄牛品种单倍型域均由21496304 CT和21505443 AG的两处突变分开。
【学位授予单位】:西北农林科技大学
【学位级别】:博士
【学位授予年份】:2011
【分类号】:S823.81

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【参考文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 杨菲菲;;基因差异表达的研究方法[J];现代农业科技;2007年17期
2 陈宏;张春雷;;中国肉牛分子育种研究进展[J];中国牛业科学;2008年04期
3 任宝波,王玉艳,王纯净,李士泽,杨焕民;HSP70家族的分类及基因结构与功能[J];动物医学进展;2005年01期
4 刘庆华;梁学武;;娟姗和荷斯坦奶牛HSPA1A基因SSCP多态性与耐热性能的相关分析[J];福建农业学报;2006年04期
5 陈宇;方梅霞;徐海平;谢亮;张德祥;聂庆华;;GHSR基因三个SNP位点与鸡生产性状的关联性分析[J];广东农业科学;2010年08期
6 王丹;仲庆振;孙泽威;娄玉杰;;热应激对肉鸡的影响及热休克蛋白70的研究进展[J];中国畜牧兽医;2011年01期
7 朱勇飞,张天宝;热休克蛋白与胚胎发育的关系[J];国外医学(卫生学分册);2004年05期
8 郑磊,颜晓慧;热应激时热休克蛋白70及其细胞保护作用[J];国外医学(卫生学分册);1999年04期
9 郭榕;李勇;;一种新的基因克隆方法——消减杂交差异显示分析方法[J];国际遗传学杂志;2006年03期
10 向阳;安长新;;HSP70基因与睾丸生精细胞凋亡[J];中国热带医学;2010年07期
中国重要会议论文全文数据库 前1条
1 韩雪蕾;蒋腾飞;崔晓刚;刘榜;;猪FTO基因的多态性检测及与经济性状的关联分析[A];第十二次全国畜禽遗传标记研讨会论文集[C];2010年
中国博士学位论文全文数据库 前4条
1 杨焕民;应激肉牛几种组织中HSPs表达的研究[D];中国人民解放军军需大学;2002年
2 孙培明;肉鸡热应激损伤与热休克蛋白70表达的研究[D];南京农业大学;2006年
3 蓝贤勇;山羊重要功能基因遗传分析及其与经济性状的关系[D];西北农林科技大学;2007年
4 吴刚;基于SAGE数据库挖掘技术筛选分析前列腺癌相关新基因[D];第三军医大学;2006年
【共引文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 朱勇飞,朱江波,周宏元,张天宝;HSP47在小鼠腭裂和短肢发生过程中的表达[J];癌变.畸变.突变;2005年05期
2 朱勇飞;朱江波;万旭英;朱玉平;张天宝;;Hsp60基因在小鼠腭和肢正常与异常发生过程中的表达[J];癌变.畸变.突变;2007年04期
3 吴义景,吴娟,周芬;标记辅助选择在畜禽育种中的应用[J];安徽农业科学;2003年05期
4 余刚;罗军;薛瑞;权松安;王伟;周占琴;绳贺军;王荣;;陕北白绒山羊H-FABP基因多态性及其与部分生产性能的相关研究[J];安徽农业科学;2007年28期
5 詹凯;董卫星;肖扬书;许月英;赵瑞宏;;优质鸡蛋研发现状及安徽优质蛋鸡业科技策略[J];安徽农业科学;2008年09期
6 杨葆春;刘永福;;八眉猪肥育和胴体性能及与部分品种的比较分析[J];安徽农业科学;2009年30期
7 薛茂云;赵宝华;吕玲;刘萍;高琴;戴鼎震;;鸽热休克蛋白70基因的扩增与同源性比较[J];安徽农业科学;2010年36期
8 陈曦;;6种模式生物热休克蛋白70家族的进化分析[J];安徽农业科学;2011年02期
9 扎西;;祁连县白藏羊选育技术研究[J];安徽农业科学;2011年02期
10 范强;田长永;俞美子;;基于ASP的种畜BLUP育种值的程序设计[J];安徽农业科学;2011年08期
中国重要会议论文全文数据库 前10条
1 詹凯;肖扬书;许月英;钱坤;;优质鸡蛋研发现状及安徽优质蛋鸡业发展科技策略[A];现代农业理论与实践——安徽现代农业博士科技论坛论文集[C];2007年
2 许海云;李秀琴;;生猪杂交种利用的关键技术[A];河南省畜牧兽医学会第七届理事会第二次会议暨2008年学术研讨会论文集[C];2008年
3 吴志星;;浅谈畜禽业的高效安全养殖技术[A];河北省畜牧兽医科技创新论坛论文集[C];2007年
4 彭晓青;刘凤华;颜培实;;中草药复合制剂对热应激条件下猪生产性能和血液生化指标的影响[A];第九届中国实验动物科学年会(2010新疆)论文集[C];2010年
5 赵娜娜;艾辉;王伟娜;陈冲;李神斌;王国秀;;棉铃虫HSP70基因cNDA片段的克隆与分析[A];华中昆虫研究(第6卷)[C];2010年
6 王晓亮;顾宪红;郑冬梅;吴振;;热应激条件下热休克蛋白70(HSP70)诱导剂和抑制剂对鸡肠黏膜HSP70表达规律的影响[A];畜牧业环境、生态、安全生产与管理——2010年家畜环境与生态学术研讨会论文集[C];2010年
7 耿繁军;陈美凯;;如何在小群体母牛中开展种牛培育[A];全国养牛科学研讨会暨中国畜牧兽医学会养牛学分会第六届会员代表大会论文集[C];2005年
8 胡林勇;张英汉;南小红;张金川;;秦川牛部分体量性状的遗传参数估测[A];全国养牛科学研讨会暨中国畜牧兽医学会养牛学分会第六届会员代表大会论文集[C];2005年
9 许锋;王金梅;王继文;;不同优质鸡品种蛋品质比较分析研究[A];中国家禽业——机遇与挑战——第十三次全国家禽学术讨论会论文集[C];2007年
10 肖凡;张德祥;;浅谈我国优质鸡发展的现状和趋势[A];中国家禽业——机遇与挑战——第十三次全国家禽学术讨论会论文集[C];2007年
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 吴成龙;皱纹盘鲍抗氧化基因的克隆及其在营养调控下表达的研究[D];中国海洋大学;2010年
2 赵珺;高温热应激环境对雄性小鼠生殖机能影响及其分子机理的研究[D];东北师范大学;2010年
3 韩瑞丽;鸡visfatin和PRDM16基因遗传变异及其效应与表达研究[D];西北农林科技大学;2010年
4 陈赛娟;不同被毛密度獭兔皮肤组织的差异表达基因筛选和CCNA2基因的多态性检测及其与被毛密度的相关性研究[D];河北农业大学;2011年
5 李蓓;蒙古马毛色性状相关基因多态性分析及组织表达研究[D];内蒙古农业大学;2011年
6 彭建伟;鞘内纤溶治疗脑室出血的实验与临床观察研究[D];郑州大学;2011年
7 赵荣兰;新发现甲状腺激素受体β亚型的研究[D];天津医科大学;2011年
8 曾献存;新疆绵羊遗传多样性及主要经济性状候选基因研究[D];石河子大学;2010年
9 汪代华;天府肉羊种质特性及重要候选功能基因研究[D];四川农业大学;2010年
10 梁春年;牦牛MSTN和IGF-IR基因的克隆及SNPs与生长性状相关性研究[D];甘肃农业大学;2011年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 苏海林;全基因组选择简化模拟方法研究和贝类育种网络评估分析系统的开发[D];山东农业大学;2010年
2 许金根;淮猪新品系IGF—1和Pit—1基因多态性及其与生长性状的关联分析[D];安徽农业大学;2010年
3 李少斌;放牧型羔羊肉生产优化杂交组合筛选和藏绵羊DRB1基因第2外显子多态性分析[D];甘肃农业大学;2010年
4 张浩;甘肃肉羊新品种群GH、GHR & Leptin遗传变异及其与体重的相关分析[D];甘肃农业大学;2010年
5 刘根娣;兰州大尾羊生长发育规律与屠宰性能及肉质分析研究[D];西北民族大学;2010年
6 李培娟;河北荷斯坦牛体型性状分析[D];河北工程大学;2010年
7 楚康康;小尾寒羊无角性状的DNA标记及其差异表达基因的筛选研究[D];河北农业大学;2011年
8 杨清芳;五个山羊品种遗传多样性的微卫星分析[D];河北农业大学;2011年
9 林毅;膳食色氨酸对小鼠摄食的影响[D];江南大学;2010年
10 夏俊峰;牛磺鹅去氧胆酸抗小鼠热应激的研究[D];山东农业大学;2011年
【二级参考文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 孙立军,陈忠平,黄强;基因差异表达的高通量分析及其在肿瘤研究中的应用[J];癌症;2002年05期
2 陈奕,丁健;热休克蛋白90——癌症治疗的新靶点[J];癌症;2004年08期
3 吴刚;彭亮;靳风烁;李黔生;;数据库挖掘法高通量筛选分析前列腺癌相关基因[J];癌症;2006年05期
4 张文利;高雪芹;韩金祥;王国强;岳龙涛;;HSP60、HSP70、HSP90α在结直肠癌组织中的表达及其与病理组织学分级的关系[J];癌症;2009年06期
5 穆玉云,李如治,黄昌澍;乳牛耐热性指标的检测[J];安徽农业大学学报;1993年01期
6 张英汉;论牛的肉用、役用经济类型划分的意义和方法(BPI指数)[J];黄牛杂志;2001年02期
7 李向阳;张嘉保;;草原红牛肉用性状微卫星标记研究[J];中国牛业科学;2006年01期
8 陈智华;顾磊;钟金城;胡汉傈;李子良;;大额牛Bola-DRB3基因第2外显子的PCR-RFLP多态性分析[J];中国牛业科学;2007年02期
9 王泽英;黄金明;王长法;刘延鑫;李大齐;仲跻峰;王根林;;荷斯坦牛血红细胞Na~+-K~+-ATP酶活力与其耐热性的相关性研究[J];中国牛业科学;2009年03期
10 杨鸿,黄生宁,张晨晖,温进坤,周爱儒,汤健;大鼠自发性高血压和心肌肥厚时热休克蛋白70基因表达的研究[J];北京医科大学学报;1994年S1期
中国博士学位论文全文数据库 前6条
1 雷雪芹;牛、羊多胎性状的DNA分子标记研究[D];西北农林科技大学;2002年
2 杨焕民;应激肉牛几种组织中HSPs表达的研究[D];中国人民解放军军需大学;2002年
3 孙维斌;秦川牛肉用性状及八个黄牛品种遗传关系的DNA分子标记研究[D];西北农林科技大学;2003年
4 闵令江;山羊肉用性能候选基因遗传分析及生长发育性状QTL定位[D];西北农林科技大学;2005年
5 冯京海;环境高温对肉鸡线粒体功能及胸肌品质的影响[D];中国农业科学院;2006年
6 孙培明;肉鸡热应激损伤与热休克蛋白70表达的研究[D];南京农业大学;2006年
中国硕士学位论文全文数据库 前9条
1 龚远英;肉鸡急性热应激损伤与应激损伤机理的研究[D];南京农业大学;2001年
2 宁章勇;肉仔鸡热应激机理的研究[D];山东农业大学;2002年
3 付旭彬;肉鸡急性热应激损伤及其机理的研究[D];南京农业大学;2002年
4 邓桂馨;肉牛CAST基因和HFABPL基因多态性及其与肉品质性状关系的研究[D];中国农业科学院;2003年
5 张海涛;小尾寒羊朊蛋白核心片段的基因克隆、原核表达、纯化与鉴定[D];南京农业大学;2003年
6 李军乔;高温环境对肉仔鸡血液生化指标、热应激蛋白(HSP72)转录及肉品质的影响[D];河北农业大学;2004年
7 蓝贤勇;西农萨能奶山羊经济性状的DNA分子标记及5个山羊品种DNA多态性研究[D];西北农林科技大学;2004年
8 党瑞华;五个肉牛群体屠宰性状的DNA分子标记研究[D];西北农林科技大学;2005年
9 吴慧光;肉牛Calpain 1基因的SNPs筛查及其与肉质相关性分析[D];河北农业大学;2006年
【相似文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 王力生,李全,黄金虎,樊阳明,张献礼;不同年龄的中国荷斯坦牛血液性状比较研究[J];安徽农业科学;1996年S2期
2 杨世军,杨文,王东光,王旭东,贾定国,李树明;加拿大荷斯坦牛与中国荷斯坦牛生产性能对比[J];中国奶牛;1998年05期
3 吴红岳,徐庆林,丁猛;产犊季节、胎次对荷斯坦牛产奶量的影响[J];中国奶牛;2003年05期
4 ;河南实施荷斯坦牛良种登记[J];北方牧业;2004年03期
5 艾晓杰,吴晓林,朱勇琪,吴忠贤,董德宽,韩正康;大豆黄酮对荷斯坦牛乳中蛋白质和脂肪含量的影响[J];中国奶牛;2005年06期
6 刘海林;肖兵南;李志才;任慧波;高帅;段洪峰;;不同品系荷斯坦牛抗热应激能力的研究[J];中国奶牛;2007年06期
7 段玉;;对大理邓川荷斯坦牛育种(改良)工作的建议[J];中国畜禽种业;2008年05期
8 桑国俊;;胚胎移植荷斯坦牛泌乳性能测定[J];中国牛业科学;2009年01期
9 T.Tomita;陈健秋;;为改良肉奶质量在眉什麻和荷斯坦牛之间采用的交叉杂交法[J];中国畜牧兽医;1984年05期
10 李瑞斌;;奶牛跗关节病的治疗[J];江西畜牧兽医杂志;1990年02期
中国重要会议论文全文数据库 前10条
1 刘力;邹莉萝;赵凤茹;;国内外部分荷斯坦牛个体和群体高产的情况简介[A];首届中国奶业大会论文集(上册)[C];2010年
2 范颖;金丰久;魏成凤;王绍蓬;;引进美国原种荷斯坦牛生产性能的调查报告[A];首届中国奶业大会论文集(上册)[C];2010年
3 丁建芳;李苍松;何发亮;;HSP声波反射法地质勘察技术研究[A];第八届全国工程地质大会论文集[C];2008年
4 霍鲜鲜;金曙光;刘锋;;内蒙古不同地区荷斯坦牛乳中常规营养成分及氨基酸含量的比较研究[A];首届中国奶业大会论文集(上册)[C];2010年
5 张宝;陈宏;Hasan khatib;;荷斯坦奶牛HSP基因表达差异研究及其遗产变异与繁殖性状的关联分析[A];中国畜牧兽医学会养牛学分会2011年学术研讨会论文集[C];2011年
6 赵鹏;麻柱;李艳华;朱玉林;薛建华;吴胜权;宣柏华;孙凤俊;;青年荷斯坦牛性控胚胎产业化生产研究[A];第三届中国奶牛发展大会论文集[C];2008年
7 王哲;赵权;;猪带绦虫六钩蚴HSP克隆和表达及差异蛋白研究[A];中国畜牧兽医学会家畜寄生虫学分会第六次代表大会暨第十一次学术研讨会论文集[C];2011年
8 陆东林;魏殿辉;王鹏;王菊芳;朱兵山;;克隆荷斯坦牛的生长、繁育和生产性能[A];中国奶业协会年会论文集2008(上册)[C];2008年
9 钱凯;陆东林;张占英;魏殿辉;;克隆荷斯坦牛乳成分初步分析[A];第三届中国奶牛发展大会论文集[C];2008年
10 金曙光;霍鲜鲜;刘锋;;不同放牧季节对内蒙古荷斯坦牛乳中常规营养成分及氨基酸含量的影响[A];首届中国奶业大会论文集(上册)[C];2010年
中国重要报纸全文数据库 前10条
1 田萍 蔡森 姚武群;温湿指数(THI)对荷斯坦牛产奶量影响的研究[N];中国畜牧报;2004年
2 曾利群;和利时自动化系统出新[N];中国高新技术产业导报;2000年
3 全国畜牧总站 王志刚 张金松 邱小田 史建民;中德牛业发展合作项目简介[N];农民日报;2011年
4 于丽萍;优良奶牛的选择[N];西藏日报;2002年
5 韩学梅 成彩燕 毛清;选购高产奶牛的要点及注意事项[N];山西科技报;2003年
6 中国网通公司 薛晨 王安;国际IDC市场的启示[N];中国计算机报;2001年
7 太原市小店区亲贤街办兽医站 韩六五;提高奶牛生产性能的综合技术措施[N];山西科技报;2009年
8 记者 高岚;网擎:按级别给服务[N];中国计算机报;2000年
9 特约记者 田浩 通讯员 付汝晨;古勒巴格村壮大经济有实招[N];伊犁日报(汉);2008年
10 南京农业大学 颜培实 教授;“福利”为高产奶牛带来高产[N];中国畜牧报;2004年
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 张宝;黄牛HSP家族基因差异表达及经济性状相关基因遗传变异研究[D];西北农林科技大学;2011年
2 杨帆;腹型HSP儿童血清差异蛋白质组学的研究[D];吉林大学;2012年
3 刘庆华;娟荷杂交牛耐热性能研究[D];南京农业大学;2009年
4 王平;荷斯坦牛生长与营养代谢相关基因表达及INSR基因遗传变异研究[D];西北农林科技大学;2012年
5 冯华;1.实验性蛛网膜下腔出血后脑继发性损害的病理基础与药物干预研究 2.大鼠实验性微波辐照后BBB损伤的特点与药物治疗的初步研究[D];第四军医大学;1997年
6 樊新忠;山东荷斯坦奶牛群体改良的方案和技术研究[D];山东农业大学;2008年
7 李秋凤;日粮营养调控对奶牛养分消化代谢、泌乳及精液品质的影响[D];河北农业大学;2012年
8 周洲;肺炎嗜衣原体热休克蛋白经ERK、NF-κB信号通路调控HUVEC分泌炎症因子[D];南华大学;2011年
9 徐秀容;DGAT1和DGAT2基因多态性与牛部分经济性状相关性的研究[D];西北农林科技大学;2004年
10 胡风华;基于以太网的存储系统研究[D];中国科学院研究生院(计算技术研究所);2005年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 王哲;猪带绦虫六钩蚴HSP的克隆表达及差异蛋白研究[D];吉林农业大学;2011年
2 陈水福;HSP_(70)/内源性抗过氧化酶介导的阿魏酸钠对急性心肌细胞损伤的延迟保护作用[D];南昌大学;2009年
3 廖旭东;公牛HSP基因多态性与精液品质及后裔性能的相关分析[D];南京农业大学;2011年
4 张润锋;陕西荷斯坦牛遗传多态性与泌乳性状关系的分子标记研究[D];西北农林科技大学;2004年
5 兰恒宇;乙酰淀粉填充水性高分子异氰酸酯胶粘剂研制及HSP表征[D];东北林业大学;2010年
6 叶东东;新疆呼图壁种牛场荷斯坦牛遗传参数估计和动物模型BLUP遗传评定研究[D];新疆农业大学;2011年
7 李吉涛;中国荷斯坦奶牛催乳素基因5‘调控区多态性及其与产奶性状关系的研究[D];山东农业大学;2004年
8 罗红霞;HSP表达与乳腺癌细胞侵袭转移能力的相关性研究[D];重庆医科大学;2005年
9 李培娟;河北荷斯坦牛体型性状分析[D];河北工程大学;2010年
10 程维杰;荷斯坦牛HSP70-1基因多态性与耐热性及乳腺炎抗性的关联分析[D];石河子大学;2009年
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