收藏本站
《西北农林科技大学》 2006年
收藏 | 手机打开
二维码
手机客户端打开本文

黄牛生长性能候选基因多态及其与生长发育相关性研究

杨东英  
【摘要】: 本研究以南阳牛、秦川牛、郏县红牛、西镇牛、鲁西牛和中国荷斯坦牛6个黄牛品种共542个个体为实验动物,利用PCR-SSCP和PCR-RFLP、DNA序列分析技术研究了以上6个黄牛品种Leptin基因第3外显子、DRB3基因第2外显子、Moystatin(GDF-8,生长抑素)基因第2外显子、Pit-1基因第4内含子(PIT4)、Pit-1基因第5内含子(PIT5)、calpastatin(CAST、钙蛋白酶抑制蛋白)基因共5个候选基因6个位点上的遗传变异,对黄牛群体遗传结构、遗传多态性及其与体重、体尺性状的关系做了分析和探讨,旨在获得相应的分子遗传学信息,找到经济性状的分子标记,为中国黄牛遗传资源的保护与利用、分子标记辅助育种的开展和肉牛以及奶牛生产性能的提高提供科学依据。以黄牛体重、体尺性状作为衡量牛生长发育的指标,运用最小二乘拟合线性模型,对所发现的多态位点与生长发育性状的关系进行了分析,探讨了候选基因作为影响中国黄牛生长发育候选基因的可能性,所获得结果如下: 1. Leptin基因第3外显子PCR-SSCP多态以及与黄牛生长发育性状的关系 PCR-SSCP检测结果表明,Leptin基因第3外显子存在多态位点,该多态位点由一对等位基因A、B控制,南阳牛、秦川牛、郏县红牛、西镇牛、鲁西牛和中国荷斯坦奶牛A等位基因频率分别为0.558,0.492,0.571,0.658,0.591,0.615;B等位基因频率分别为0.442,0.508,0.429,0.342,0.409,0.385;它们的基因杂合度/有效等位基因数/PIC值分别为0.493/1.973/0.371,0.499/1.999/0.374,0.489/1.96/0.369, 0.450/1.818/0.348,0.483/1.936/0.366,0.473/1.899/0.361。分析表明,秦川牛和南阳牛的遗传多态性最丰富,其次是郏县红牛、鲁西牛和中国荷斯坦奶牛,而西镇牛的遗传多态性较低。序列分析结果表明:Leptin基因exon 3多态的产生是第66位发生G→T、第67位产生A→C以及299处新的单核苷酸突变C→T的替换造成。不同基因型与体重、体尺等生长性状指标相关分析的结果表明:南阳牛群体内除12月龄的体高和日增重、18月龄的坐骨端宽和日增重外,6月龄、12月龄、18月龄、24月龄BB型个体的体斜长、胸围、体重、坐骨端宽、体高和日增重均显著的大于AB和AA型个体(P0.05);秦川牛群体内BB基因型个体十字部高显著高于群体AA型、AB型个体(P0.05),但在体重、胸围、体长指标上均无显著差异(P0.05);郏县红牛群体内AB与BB基因型个体在十字部高和坐骨端宽上显著高于群体AA型个体(P0.05),而群体内不同基因型个体的体重和体尺指标(体高、体斜长、胸围)无显著差异(P0.05)。 2. DRB3基因第2外显子多态以及与黄牛生长发育性状的关系 DRB3基因的PCR-SSCP分析结果表明:该多态位点由一对等位基因A、B控制,南阳牛、秦川牛、郏县红牛、西镇牛、鲁西牛和中国荷斯坦牛A/B等位基因频率分别为0.453/0.547,0.454/0.546,0.458/0.542,0.579/0.421,0.545/0.455,0.566/0.434;且它们的基因杂合度/有效等位基因数/PIC值分别为0.496/1.982/0.373,0.496/1.983/0.373,0.496/1.986/0.373,0.488/1.951/0.369,0.496/1.984/0.373,0.491/1.966/0.371。序列分析结果表明:DRB3基因exon 2多态的产生是第88位产生A→T、118处新的单核苷酸突变A→T以及165位G→A的替换造成。DRB3不同基因型与秦川牛群体内在体重、胸围、体长指标上均无显著差异(P0.05);但与十字部高显著相关,AB基因型个体显著高于AA型个体(P0.05);在坐骨端宽上AB、BB基因型个体显著高于AA型个体(P0.05)。 3. GDF-8基因第2外显子多态以及与黄牛生长发育性状的关系 PCR-SSCP分析结果显示:GDF-8基因exon 2存在多态位点,该多态位点由一对等位基因A、B控制,南阳牛、秦川牛、郏县红牛、西镇牛、鲁西牛和中国荷斯坦牛A/B等位基因频率分别为0.425/0.575,0.431/0.569,0.58/0.42,0.632/0.368,0.432/0.568,0.533/0.467;它们的基因杂合度/有效等位基因数/PIC值分别为0.489/1.955/0.369,0.49/1.962/0.37,0.487/1.95/0.368,0.465/1.87/0.357,0.491/1.963/0.37,0.498/1.991/0.374。序列分析结果表明:在该片段196 bp处有一个C→G的突变;331 bp处有一个C→A的突变。GDF-8不同基因型与秦川牛群体内体重、体尺指标均无显著相关(P0.05);但BB基因型个体坐骨端宽显著高于AA型个体(P0.05)。 4. PIT4基因多态以及与黄牛生长发育性状的关系 PCR-RFLP分析结果显示:PIT4基因存在多态位点,该多态位点由一对等位基因A、B控制,南阳牛、秦川牛、郏县红牛、西镇牛、鲁西牛和中国荷斯坦牛A/B等位基因频率分别为0.565/0.435,0.638/0.362,0.542/0.458,0.526/0.474,0.545/0.455,0.566/0.434;且它们的基因杂合度/有效等位基因数/PIC值分别为0.492/1.967/0.371 ,0.462/1.858/0.355 , 0.496/1.986/0.373 , 0.499/1.994/0.374 , 0.496/1.984/0.373 ,0.491/1.966/0.371。1~4岁的郏县红牛群体内,体长和胸围指标上AB型个体显著高于AA型个体(P0.05)。在其它体尺指标上无显著性影响。 5. PIT5基因多态以及与黄牛生长发育性状的关系 PIT5基因的PCR-SSCP分析结果显示:该多态位点由一对等位基因A、B控制,南阳牛、秦川牛、郏县红牛、西镇牛、鲁西牛和中国荷斯坦牛A/B等位基因频率分别为0.444/0.556,0.477/0.523,0.538/0.462,0.421/0.579,0.523/0.477,0.475/0.525;且它们的基因杂合度/有效等位基因数/PIC值分别为0.494/1.975/0.372,0.499/1.996/0.374,0.497/1.988/0.374,0.488/1.951/0.369,0.499/1.996/0.374,0.499/1.995/0.374。 6. CAST基因多态以及与黄牛生长发育性状的关系 PCR-RFLP分析结果显示:CAST基因存在一个XbaI酶切位点,将该座位两个等位基因分别命名为等位基因A和B,南阳牛、秦川牛、郏县红牛、西镇牛、鲁西牛和中国荷斯坦奶牛A/B等位基因频率分别为0.524/0.476,0.469/0.531,0.507/0.493,0.447/0.553,0.409/0.591,0.352/0.648;且它们的基因杂合度/有效等位基因数/PIC值分别为0.499/1.996/0.374 , 0.498/1.992/0.374 , 0.500/2.000/0.375 , 0.494/1.978/0.372 ,0.483/1.936/0.367, 0.456/1.840/0.352。对CAST的两种XbaI酶切纯合基因型AA、BB进行测序,结果发现该XbaI酶切多态是由于962 bp处C→G的突变造成,等位基因A的该位点为G,因此无XbaI酶切位点。 7. 6基因座位的Hardy-Weinberg平衡检验 南阳牛在6基因座位均处于Hardy-Weinberg非平衡状态;而西镇牛、鲁西牛在6基因座位均处于Hardy-Weinberg平衡状态;秦川牛在Leptin、CAST基因座位处于处于Hardy-Weinberg非平衡状态;郏县红牛在DRB3、GDF-8、PIT4、CAST基因座位处于Hardy-Weinberg非平衡状态;中国荷斯坦牛在Leptin、DRB3、GDF-8、PIT5基因座位处于Hardy-Weinberg非平衡状态。秦川牛在DRB3、GDF-8、PIT4、PIT5基因,而郏县红牛在Leptin、PIT5基因和中国荷斯坦奶牛在PIT4、CAST基因处于Hardy-Weinberg平衡状态。 8. 6个黄牛品种6基因座位的基因型分布χ2独立性检验 在Leptin外显子3位点上,郏县红牛同南阳牛、秦川牛以及中国荷斯坦牛同郏县红牛的基因型分布存在极显著性差异;在DRB3外显子2位点上,中国荷斯坦牛同南阳牛、秦川牛的基因型分布存在极显著性和显著性差异;在GDF-8外显子2位点上,秦川牛、郏县红牛与南阳牛存在极显著性差异;郏县红牛、西镇牛、中国荷斯坦牛与秦川牛的基因型分布存在显著性差异;PIT-4基因多态位点基因型分布仅在郏县红牛与秦川牛间存在极显著性差异;PIT-5位点上郏县红牛与南阳牛的基因型分布存在极显著性差异;中国荷斯坦牛与南阳牛、秦川牛、郏县红牛的基因型分布存在极显著性差异;中国荷斯坦奶牛与鲁西牛的基因型分布存在显著性差异;CAST位点上中国荷斯坦牛与南阳牛、秦川牛、郏县红牛的基因型分布存在极显著性差异;与西镇牛、鲁西牛的基因型分布存在显著性差异。
【学位授予单位】:西北农林科技大学
【学位级别】:博士
【学位授予年份】:2006
【分类号】:S823

手机知网App
【相似文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 王铁峰;张宇;钱爱东;;牛非结核分枝杆菌分离与鉴定[J];中国兽医杂志;2011年06期
2 陆兆静;;提高牛人工授精效率之对策研究[J];畜牧与饲料科学;2011年05期
3 王永生;郭梦尧;张乃生;王国卿;;子宫内膜炎患牛子宫黏液内念珠菌的分离及体外溶血活性鉴定[J];中国畜牧兽医;2011年08期
4 王子恒;邓立新;;中西医结合治疗母牛慢性子宫内膜炎[J];黑龙江畜牧兽医;2011年13期
5 唐湘宁;;牛的饲养与防病技术初探[J];黑龙江科技信息;2011年22期
6 陈渊;朱家增;邓立新;李小波;贺丛;贺秀媛;;牛瘤胃酸中毒发病机制与防治的研究进展[J];中国畜牧兽医;2011年06期
7 蒋泽贵;;牛瘤胃积食的中西医结合疗法[J];畜牧兽医科技信息;2011年06期
8 陈龙;;硫酸铜法对牛早期妊娠诊断的效果观察[J];青海畜牧兽医杂志;2011年04期
9 乔利敏;李向臣;乔富强;姚华;张文秀;关伟军;马月辉;;利用亮甲酚蓝染色法预测牛卵母细胞发育潜能的研究[J];畜牧兽医学报;2011年09期
10 吴师;李华慧;覃现才;;人绒毛膜促性腺激素(HCG)对母牛受胎率的影响[J];中国奶牛;2011年12期
中国重要会议论文全文数据库 前10条
1 楚秋霞;徐照学;施巧婷;魏成斌;辛晓玲;陆涛峰;贾海芳;;牛BoLA-DRA基因的原核表达载体的构建及表达分析[A];中国牛业健康发展与科技创新——中国畜牧兽医学会第七届养牛学分会2009年学术研讨会论文集[C];2009年
2 王子恒;邓立新;;牛慢性子宫内膜炎的诊断及中西医治疗浅析[A];中国畜牧兽医学会兽医产科学分会第五届全体会议第十次学术研讨会论文集[C];2009年
3 王振玲;李玉冰;王栋;李显和;吴克红;;采用二维电泳对牛精子蛋白分离研究[A];京津冀畜牧兽医科技创新交流会暨新思想、新观点、新方法论坛论文集[C];2008年
4 张吉鹍;包赛娜;;脂肪酸钙在牛业中的开发与科学利用[A];《2009中国牛业进展》论文集[C];2009年
5 高雪;吴慧光;许尚忠;陈金宝;任红艳;;基于生物信息学对牛CAPN1基因的SNPs筛查与验证[A];中国动物遗传育种研究进展——第十五次全国动物遗传育种学术讨论会论文集[C];2009年
6 禹学礼;栗颖华;邓雯;孟雨;;牛腔前卵泡卵母细胞体外受精研究[A];河南省畜牧兽医学会第七届理事会第二次会议暨2008年学术研讨会论文集[C];2008年
7 黄永震;张恩平;王璟;淮永涛;马亮;蓝贤勇;雷初朝;张春雷;王居强;陈宏;;四个牛品种NPM1基因插入/缺失突变的研究[A];中国动物遗传育种研究进展——第十五次全国动物遗传育种学术讨论会论文集[C];2009年
8 王璟;蓝贤勇;马亮;淮永涛;黄永震;房兴堂;王居强;雷初朝;陈宏;;四个牛品种PRDM16基因多态及其与生长性状的关联分析[A];中国动物遗传育种研究进展——第十五次全国动物遗传育种学术讨论会论文集[C];2009年
9 龙塔;潘耀谦;董发明;佘锐萍;;血管内皮生长因子在牛流行型白血病肿瘤组织的表达及其意义[A];中国畜牧兽医学会兽医病理学分会第十六次学术研讨会、中国病理生理学会动物病理生理专业委员会第十五次学术研讨会论文集[C];2009年
10 田万强;昝林森;林清;辛亚平;田成山;;不同培养条件对牛卵母细胞体外成熟的影响[A];中国奶牛协会2007年会论文集(上册)[C];2007年
中国重要报纸全文数据库 前10条
1 魏胜权;“晶牛”印象[N];常德日报;2005年
2 本报记者 王旗;三次套现 大摩告别蒙牛[N];财经时报;2005年
3 赵付立;为了乡亲们增收致富[N];中国特产报;2005年
4 刘国能;俯首甘为孺子牛[N];深圳商报;2004年
5 吉林北方万盛 江桂华;G金牛能否成为“金牛”[N];证券日报;2005年
6 祁泽;怎样识别病牛[N];中国畜牧报;2005年
7 广西大学 杨膺白;重视科学养好牛[N];中国畜牧兽医报;2005年
8 乾丰;慢牛才能走得远[N];中国经营报;2005年
9 陈贵善;种用牛的选择[N];湖北科技报;2005年
10 韩素芹;洪灾过后防牛出血性败血病[N];河南科技报;2005年
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 胡艳;母源性leptin对肉鸡子代早期生长和肝脏脂肪代谢的影响[D];南京农业大学;2008年
2 袁丽霞;鸡下丘脑食欲和能量稳态调节相关基因表达的品种差异以及leptin的程序化作用[D];南京农业大学;2009年
3 杨东英;黄牛生长性能候选基因多态及其与生长发育相关性研究[D];西北农林科技大学;2006年
4 饶开晴;Leptin对鸡胚卵黄膜和尿囊膜基因表达及血管形成的影响[D];南京农业大学;2009年
5 陈丽梅;牛免疫球蛋白lambda轻链恒定区序列的克隆与研究[D];中国农业大学;2005年
6 戴汉川;几种不同鱼类肥胖基因的克隆与鲤肥胖基因的表达研究[D];华中农业大学;2005年
7 Hubdar Ali Kaler;鸡输卵管特异性表达tPA和leptin的研究[D];南京农业大学;2011年
8 宋岳强;家鸭leptin受体cDNA的克隆分析及外源leptin对家鸭生殖机能的影响[D];厦门大学;2008年
9 张立;牛羊胚胎工程技术产业化研究与应用[D];西北农林科技大学;2005年
10 安立龙;牛胚胎干细胞的分离与克隆[D];西北农业大学;1999年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 张浩林;野生雄性达乌尔黄鼠中kisspeptin/GPR54与leptin受体在下丘脑中的表达及对睾丸的调节作用[D];北京林业大学;2012年
2 徐成权;SOCS3以负反馈抑制leptin信号通路的方式调节猪脂肪细胞分化[D];西北农林科技大学;2010年
3 杨小福;自然和超排卵周期leptin变化及颗粒细胞leptin和leptin受体mRNA的表达[D];浙江大学;2001年
4 刘朋飞;蛋内注射瘦素对肉鸡出雏后早期骨骼肌生长的影响[D];南京农业大学;2010年
5 郎翠红;IL-1β和leptin对子宫内膜细胞分泌ICAM-1和MMP9的影响[D];青岛大学;2011年
6 郭贺;Leptin基因佐剂及蛋白对小鼠树突状细胞和淋巴细胞的影响[D];暨南大学;2010年
7 王秀春;血清leptin及apelin活性与颈动脉粥样硬化关系研究[D];泰山医学院;2012年
8 夏郁彬;维持性血液透析患者ghrein和leptin血浆水平的研究[D];汕头大学;2010年
9 梁静;母猪日粮蛋白水平对仔猪脂肪沉积的影响及leptin介导的脂肪代谢调控研究[D];南京农业大学;2010年
10 张锐;蛋内注射leptin对肉鸡肝脏胆固醇代谢相关基因及microRNA表达的影响[D];南京农业大学;2011年
 快捷付款方式  订购知网充值卡  订购热线  帮助中心
  • 400-819-9993
  • 010-62791813
  • 010-62985026