山梨醇转运子和SDH基因cDNA的克隆及其序列分析
【摘要】:
山梨醇是蔷薇科植物主要的光合产物、运输和贮藏物质,起着其他植物中蔗糖的作用。山梨醇转运子是蔷薇科植物运输山梨醇的重要酶。
本试验首先以“皇家嘎拉”苹果叶片为试材,根据报道的山梨醇转运子的保守区设计引物,经RT-PCR获得一条长度为581bp的片段,回收并进行测序。通过与GeneBank蛋白数据库比对分析发现其蛋白序列与三种苹果的序列MdSOT4、MdSOT6、MDSOT1同源性分别为95%、92%、92%;与酸樱桃(Prunus cerasus)、大豆(Glycine max)的同源性分别为78%、77%。应用SMART软件分析,该片断编码181个氨基酸,含有四个AgrB结构域,为一种跨膜蛋白结构。
其次,以“皇家嘎拉”苹果叶片为试材,根据已知的多种植物的山梨醇脱氢酶序列,设计扩增苹果保守区上下游引物SDH1和SDH2,PCR扩增获得了SDH基因cDNA,经克隆测序获得4个cDNA序列,约600bp。同源性表明:该基因与苹果中已克隆的SDH基因家族具有很高的同源性,达94~98%。同时与李、桃、番茄、马铃薯、拟南芥、水稻等也有很高的同源性,分别为87%、87%、82%、80%、80%、81%、80%。
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