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《西北农林科技大学》 2009年
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中国家马mtDNA Cyt b基因遗传多样性与母系起源研究

秦芳  
【摘要】: 本文利用PCR和生物信息学技术对我国13个家马品种(宁强马、哈萨克马、贵州马、关中马、蒙古马、焉耆马、河曲马、柴达木马、巴里坤马、玉树马、利川马、大通马和岔口驿马)共计323个个体的线粒体DNA (mtDNA) Cyt b基因1140 bp全序列的遗传多样性与母系起源进行分析,获得的主要研究结果如下: (1)获得了中国13个家马品种323个个体的线粒体细胞色素b(Cyt b)基因1140bp全序列和核苷酸的组成比例。在所分析的13个家马品种323条Cyt b基因序列中,T、C、A、G 4种核苷酸的平均比例分别为26.5%、32.2%、28.1%、13.2%。A+T含量为54.6%,G+C含量为45.4%,A+T含量明显高于G+C含量,符合哺乳动物线粒体DNA碱基组成的基本比例。 (2)获得了13个家马品种323个个体Cyt b基因全序列的单倍型和多态位点。13个家马品种323条Cyt b基因序列中,检测到73种单倍型,74个核苷酸多态位点,没有发现碱基的插入与缺失,其中包括35个简约信息位点,39个单一多态信息位点,约占所测核苷酸长度的6.49%,其中有69个转换,3个颠换,2个转换与颠换共存。 (3)中国家马具有丰富的mtDNA Cyt b基因遗传多样性。13个家马品种单倍型多样度和核苷酸多样度在各品种中的分布分别为0.706~0.975和0.00279~0.00488,均以宁强马最小,蒙古马最大,平均单倍型多样度和核苷酸多样度分别为0.917和0.00409,表明中国家马具有丰富的遗传多样性。 (4)中国家马mtDNA Cyt b基因密码子使用不均衡。由于密码子兼并现象,导致家马mtDNA Cyt b基因氨基酸替代的数量不多,20个氨基酸突变只有2个是由于密码子第三位碱基替换引起的;密码子使用非常不均衡,同义密码子的使用表现出强烈的偏倚性。 (5)中国家马具有7个mtDNA Cyt b基因支系。mtDNA Cyt b序列的NJ系统发育树表明,中国家马分为Ⅰ-Ⅶ7个支系,表明为多母系起源。Ⅲ、Ⅳ、Ⅴ、Ⅶ为主要分布支系,这4个支系的单倍型占总单倍型的78%以上;贵州马和哈萨克马在7个支系中都有分布。
【学位授予单位】:西北农林科技大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2009
【分类号】:S821

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1 苏锐;中国家马的遗传多样性与母系起源研究[D];西北农林科技大学;2008年
2 张长禹;五种实蝇的分子系统发育分析与分子快速鉴定研究[D];华中农业大学;2007年
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