中国螽(虫斯)总科昆虫的RAPD分析研究
【摘要】:核酸的分子系统学是从遗传学本质上研究生物之间关系的最精确、最直接
的方法,由于核酸的分子标记具有信息含量大、可供选择的分子类型多、易于确
定同源关系、取样限制少等诸多优于其它分子标记的特点,所以从70年代发展
至今己经成为分子系统学的主要方法,而目前应用的主要有以下几类方法:DNA
-DNA杂交法、RFLP(限制性片断长度多态性分析)技术、DNA指纹图谱技术
(DNAfp)、RAPD(随机扩增多态性 DNA)技术、AFLP(扩增的限制性片断长度多
态性)技术以及DNA序列分析技术。其中RAPD技术由于具有高效、快速、简便
等特点,自建立以来,很快就得到了广泛应用。
1. RAPD技术在昆虫学中的研究概述以及螽(虫斯)总科的系统学研究现状
RAPD技术是基于PCR技术的一项DNA分子多态检测技术,利用随机合成
的寡聚核苷酸序列为引物(一般为10bp)分别与 DNA的两条单链结合,在 DNA
聚合酶的作用下,对基因组的特定区域进行PCR扩增,其电泳结果为不同大小
和数目的DNA谱带即RAPD图谱,可反应出基因组相应区域的多态性。RAPD
技术可在对物种没有任何分子生物学研究的情况下,对其DNA进行多态性分析,
并直接运用于分类研究和系统推测,大量的研究已表明RAPD是一种优良的遗
传标记。
材料易保存、需量不大、无需分子生物学研究背景而又操作简便的RAPD
技术一出现就很快被昆虫学家所认可,并且被广泛地应用于种属的分类鉴定、种
下分类、系统发育等多项分子系统学研究中。但是,由于昆虫种类和数量的过于
庞大,目前的研究多集中于一些与人类生产生活关系较为密切的种类如蚊、蝇、
蚜虫等,其它昆虫的研究则相对较少。国内应用RAPD技术于昆虫学研究则更
为滞后。
螽(虫斯)属于昆虫(Insecta)直翅目(Orthoptera)长角亚目(Endifera)螽(虫斯)
总科(Tettigonioidea)。早在 2000多年前,螽(虫斯)就因其能发出动听的鸣声而引起
人类的兴趣。在中国,它们甚至还成为子孙繁盛的象征。这类昆虫与农林牧业关
系密切,有些种类曾造成严重危害,许多种类是重要的天敌昆虫,目前,全世界
己知约900属5000种以上。我国蔬撕总科昆虫超过300种,隶属于10科80余
属。传统的形态分类目前仍是荔撕系统学研究最主要的方法,近代新技术在菌撕
分类上应用的主要有发音和细胞学方法,分子系统学方面的研究很少,国外如
RitChie等口 997)研究报道了荔撕的 RAPD和呜声类型之变异性,国内陕西师范
大学动物研究所 1998年首次将 RAPD技术运用于泰撕总科的分子系统学研究
中,采用2条引物对12种泰撕总科昆虫进行了初步研究。
2.研究目的
本项研究是在前人的基础上,采用多条引物,对6科28属64种蠢撕总科昆
虫进行RAPD扩增,在分子水平上探讨这些种的分类地位和亲缘关系,从而丰
富泰蝴总科的分子系统学研究,并为传统的形态分类提供有力的佐证。
3.材料和方法
3*实验材料
本项研究所用的蠢撕标本,基本上是作者于 1998—2000年赴陕西、四川、
重庆、湖北、甘肃、云南、广西等地采集的,分属于6科28属64种,所有标本
均保存于无水乙醇中。
3.2实验方法
3.2.l基因组 DNA的提取及检测
本实验所采用的基因组 DNA提取方法参考了张迎春(1998)提取瓢虫基因
组 DNA的方法,对实验步骤做了部分修改。该方法的特点为:采用 2 X CTAB
缓冲液;只需CI溶液(氯仿:异戊醇=24:l)抽提一次;用冰冷异丙醇沉淀DNA。
对所提取的DNA样品,本文采用两种方法来检测,即凝胶电泳检测法和紫
外分光光度计检测法。凝胶电泳检测法采用浓度为 1%的琼脂糖凝胶,EB(溪化
乙锭)染色。电泳后置于紫外检测仪上观察结果,如有必要,可用一次成像系统
记录。使用核酸/蛋白质分析仪检测核酸样品的OD值,通过波长260urn的OD
值,计算DNA样品的浓度,通过波长260urn与280urn的OD比值考量DNA样
厂且品纯度,OD260/280值在l.6至l.8间时为较纯的DNA,大于l.8,说明样品中
RNA未除尽;小于1石,说明样品存在有蛋白质。
3.2.2 RAPD扩增
反应体系(总体积20 v帅0下表所示:
扩增反应程序为:预变性:94℃,lmill45s:变性:94℃,305:退火:37OC,
lmin30s;延伸:72OC,Zmin;45个循环,循环后,在72C延伸10min。
扩增产物用琼脂糖凝胶电泳检测,具体步骤与基因组DNA凝胶电泳检测类
似,只是琼脂糖凝胶浓度为1.5%,结果记录同DNA样品提取部分。根据记录实
验结果的照片统计原始数据,统计时只记录清晰的条带,将每一引物扩增每一样
品产生的每一条带作为性状看待,当某一扩增带出现时,记作“l”,否则为“0”,
统计实验结果用于聚类分析,聚类分析采用系统聚类法,利用SPSS软件包进行,
建立数据文件后用 Average Linkage Between Groups法构建聚类图。
4.结果分析与讨论
CTAB tZ是一种常用的基因组DNA提取方法,但一般都用来提取植物组织
的基因组DNA,
【关键词】:RAPD 螽(虫斯)总科 直翅目 中国 【学位授予单位】:陕西师范大学
【学位级别】:博士
【学位授予年份】:2000
【分类号】:Q969
【目录】:
- <中文摘要>3-9
- <关键词>9-10
- <英文摘要>10-11
- <英文关键词>11-14
- 1.绪论14-33
- 1.1 生物系统学的发展与分子系统学14-15
- 1.2 核酸分子系统学的研究概述15-20
- 1.3 RAPD技术简介20-25
- 1.4 RAPD技术应用概况25-27
- 1.5 RAPD技术在昆虫分子系统学方面研究概述27-29
- 1.6 螽(虫斯)总科的系统学研究概述29-33
- 2.材料和方法33-42
- 2.1 试剂,设备及耗材33-35
- 2.2 实验材料35-38
- 2.3 实验方法38-42
- 3.实验结果42-73
- 3.1 基因组DNA提取样品的检测42-44
- 3.2 露螽科不同种属的RAPD扩增结果44-49
- 3.3 拟叶螽科不同种属的RAPD扩增结果49-52
- 3.4 蛩螽科不同种属的RAPD扩增结果52-57
- 3.5 日本纺织娘不同种群的RAPD扩增结果57-61
- 3.6 螽(虫斯)科不同种属的RAPD扩增结果61-67
- 3.7 草螽科不同种属的RAPD扩增结果67-73
- 4.讨论73-80
- 4.1 基因组DNA提取方法的探讨73
- 4.2 日本纺织娘种群遗传多态性研究结果的讨论73-75
- 4.3 螽(虫斯)总科5个科种属间聚类分析结果的讨论75-77
- 4.4 RAPD技术在系统学研究中的适用性77
- 4.5 RAPD技术的稳定性及其反应条件的优化77-78
- 4.6 RAPD技术用于昆虫系统学研究的优越性78-79
- 4.7 分子系统学的局限性79-80
- 5.结论80-82
- 6.致谢82-83
- <引文>83-90
- 8.图版及说明90-102
|
|
|
|
| 1 |
王义权,周开亚,秦树臻;用RAPD标记检测六种蛇基因组DNA多态性[J];动物学报;1996年02期 |
| 2 |
沈曦,周开亚,王义权;中国蝮属蛇类的RAPD分析[J];动物学报;1999年01期 |
| 3 |
宋林生,相建海,李晨曦,周令华,刘瑞玉,樊拥军;用RAPD标记研究对虾属六个种间的亲缘关系[J];动物学报;1998年03期 |
| 4 |
王亚明,周开亚;PCR介导的DNA序列系统分析在系统动物学中的应用[J];动物学杂志;1996年03期 |
| 5 |
邵红光;关于节肢动物系统分类与进化的分子佐证[J];动物分类学报;2000年01期 |
| 6 |
张亚平,施立明;动物线粒体DNA多态性的研究概况[J];动物学研究;1992年03期 |
| 7 |
王文,施立明;一种改进的动物线粒体DNA提取方法[J];动物学研究;1993年02期 |
| 8 |
刘宪伟;中国蛩螽族三新属七新种(直翅目:螽蟖总科:蛩螽科)[J];动物学研究;2000年03期 |
| 9 |
陈自明,陈毅峰;用RAPD技术对特化等级裂腹鱼类亲缘关系的探讨[J];动物学研究;2000年04期 |
| 10 |
兰宏,王文,施立明;麂属动物陈旧皮张标本的DNA提取及PCR扩增[J];动物学研究;1995年02期 |
|
|
|
|
|
| 1 |
谢永芳,舒坤贤,梁亦龙,袁帅,张继承;小鼠胚胎发育中期肠细胞增殖与凋亡的研究[J];癌变.畸变.突变;2005年01期 |
| 2 |
王子良,许丽艳,李恩民;质粒制备和反应温度对嵌套缺失技术的影响[J];癌变.畸变.突变;2005年02期 |
| 3 |
康振桥;季艳霞;杨志勇;苏光;崔彦芝;;血管内皮生长因子亚型在人乳腺癌细胞中的表达差异[J];癌变.畸变.突变;2006年03期 |
| 4 |
安刚;黄天华;谢庆东;王德刚;;pCXN2-mIZUMO对C57BL/6小鼠生育能力的影响[J];癌变.畸变.突变;2007年04期 |
| 5 |
朱斌;杨罗艳;赵晓昆;;膀胱癌多药耐药基因MDR-1与金属硫蛋白-3表达的关系[J];癌变.畸变.突变;2007年05期 |
| 6 |
杜传印;王玉军;李斯深;李常保;刘洪祥;田纪春;;烟草AFLP银染分析体系的建立[J];山东农业科学;2007年05期 |
| 7 |
毕玉平,廖俊杰,单雷,王兴军,徐平丽;番茄双抗TMV和CMV基因工程的研究[J];山东农业科学;1997年06期 |
| 8 |
单雷,毕玉平,王兴军,徐平丽,李广存;双抗TMV和CMV转基因番茄后代的遗传分析[J];山东农业科学;1998年04期 |
| 9 |
葛宏华,孙莉宁,张其瑞;家蚕血淋巴蛋白的发育变化和BmLSP的纯化[J];安徽大学学报(自然科学版);2001年03期 |
| 10 |
宁恕龙;周立志;赵天飙;侯银续;梁君;王新建;;小哺乳动物研究标本的简易保存和制作方法[J];安徽大学学报(自然科学版);2007年03期 |
|
|
|
|
|
| 1 |
余嗣明,曾仕廉,袁艺,杜经元,孙家玉;家蚕酯酶同工酶与品种亲缘关系及杂种优势的研究[J];安徽大学学报(自然科学版);1998年02期 |
| 2 |
许晓风,程遐年,邹运鼎;褐飞虱不同生物型基因组DNA的RAPD分析[J];安徽农业大学学报;2000年01期 |
| 3 |
段家龙,钱万英,谢小冬,胡三梅;家蚕中几种同工酶研究初报(简报)[J];安徽农业大学学报;1994年04期 |
| 4 |
钱万英,段家龙,胡家硕,张勇;应用酯酶同工酶分析法研究家蚕品种的亲缘关系[J];安徽农业大学学报;1997年04期 |
| 5 |
段家龙,钱万英;桑蚕组织液中酸性磷酸酶、过氧化物酶同工酶研究[J];安徽农业大学学报;1998年01期 |
| 6 |
王义权,周开亚,秦树臻;用RAPD标记检测六种蛇基因组DNA多态性[J];动物学报;1996年02期 |
| 7 |
沈曦,周开亚,王义权;中国蝮属蛇类的RAPD分析[J];动物学报;1999年01期 |
| 8 |
郑哲民,汪桂玲,黄原;斑腿蝗科11种蝗虫RAPD带型的变异[J];动物学报;2001年04期 |
| 9 |
宋林生,相建海,李晨曦,周令华,刘瑞玉,樊拥军;用RAPD标记研究对虾属六个种间的亲缘关系[J];动物学报;1998年03期 |
| 10 |
王亚明,周开亚;PCR介导的DNA序列系统分析在系统动物学中的应用[J];动物学杂志;1996年03期 |
|
|
|
|
|
| 1 |
伍律;我国蝮蛇种下分类的研究[J];动物学报;1977年03期 |
| 2 |
赵尔宓,吴贯夫,武祥福,陈远聪,江明恃,张景康,徐科;我国蝮属蛇毒的聚丙烯酰胺凝胶电泳比较——兼论蛇毒电泳在毒蛇分类上的应用价值[J];动物学报;1981年03期 |
| 3 |
吴乃虎,王钢锋,阎景智,郭玲,严绍颐,秦鹏春;草鱼和鲤鱼线粒体 DNA 的分离纯化及其 COI 基因的分子克隆[J];动物学报;1991年04期 |
| 4 |
王义权,周开亚,秦树臻;用RAPD标记检测六种蛇基因组DNA多态性[J];动物学报;1996年02期 |
| 5 |
王亚明,周开亚;PCR介导的DNA序列系统分析在系统动物学中的应用[J];动物学杂志;1996年03期 |
| 6 |
苟德明,王智新;动物线粒体DNA特性及其多态性研究进展[J];黄牛杂志;1996年04期 |
| 7 |
朱本忠,范寿祥,束漱玖;中国等翅目昆虫名录[J];白蚁科技;1994年01期 |
| 8 |
郑哲民,任炳忠;吉林省克蚱属一新种(蚱总科:蚱科)[J];东北师大学报(自然科学版);1996年01期 |
| 9 |
黄顺友,陈宜瑜;中甸重唇鱼和裸腹重唇鱼的系统发育关系及其动物地理学分析[J];动物分类学报;1986年01期 |
| 10 |
张方耀,李参,高其康;八种散白蚁和一种异白蚁翅面微刻点的扫描电镜观察──(等翅目:鼻白蚁科)[J];动物分类学报;1994年01期 |
|
|
|
|
|
| 1 |
杨集昆;介绍一些日本的昆虫图谱[J];昆虫知识;1956年02期 |
| 2 |
付建玉,韩宝瑜;茶小绿叶蝉优势种的归属的分子依据[J];科技通报;2005年05期 |
| 3 |
代金霞,郑哲民;RAPD技术在鞘翅目昆虫中的应用概况[J];宁夏农学院学报;2003年01期 |
| 4 |
张建珍,郭亚平,张敏,欧晓红,马恩波;云南三种稻蝗基因组DNA的RAPD多态性分析[J];动物分类学报;2005年03期 |
| 5 |
宋爱云,陈辉,董林水;RAPD分子标记在鉴定香樟优选株和普通株中的应用[J];应用与环境生物学报;2003年03期 |
| 6 |
耿艳红;南松剑;王雪峰;王领超;;猪链球菌山东分离株随机扩增DNA(RAPD)分析的研究[J];山东农业大学学报(自然科学版);2006年03期 |
| 7 |
杨隽,李云龙,李馨,孙孝文;RFLP、RAPD及其遗传标记[J];生物技术通报;1996年02期 |
| 8 |
李汝刚;朱莉;伍宁丰;范云六;伍晓明;钱秀珍;;我国芥菜型油菜品种遗传多样性初探[J];生物技术通报;1997年05期 |
| 9 |
章彦,金芜军,李莹,刘学义,方宣钧;与大豆孢囊线虫病抗性相关的RAPD标记[J];高技术通讯;1998年11期 |
| 10 |
朱有勇,王云月,DilbagSMultani,BruceRLyon;澳大利亚棉花黄萎病菌DNA多态性及其地理分布相关性研究(英文)[J];菌物系统;1999年04期 |
|