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《兰州大学》 2006年
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若干中草药活性组分与几种球状蛋白质相互作用的研究

何文英  
【摘要】:中药多是组方应用,中药的药效主要体现为方剂的药效,阐明方剂中活性组分发挥作用的物质基础,探讨其作用原理对推进中药现代化、实现中药现代化具有至关重要的意义。蛋白质是生命科学的重要研究对象,从细胞分裂到细胞运动,从代谢到免疫,已知的生物功能没有一个是离开蛋白质能实现的。而作为药物的一种非常重要的运输载体,蛋白质与药物的相互作用不仅影响药物在体内分布,而且还影响药物在体内的代谢与排泄方式;从药物的有效性来看,仅仅是未与蛋白质发生作用的部分具有生物活性,而且药物的药代动力学行为很大程度依赖于键合现象,因此研究药物与蛋白质的相互作用已成为生命科学、化学和临床医学研究领域的重要研究课题之一。在研究药物与蛋白质相互作用的各种方法中,针对测定溶液中的蛋白质分子构象变化主要借助于多种光谱手段和技术,其中,紫外与荧光技术因灵敏度高、选择性强、用样量少、方法简便以及能提供较多的物理参数等优点,在药物与生物大分子之间的相互作用研究中已得到广泛应用;傅立叶变换红外光谱(FTIR)技术是测定蛋白质二级结构的一种强有力手段,适用于不同状态、不同浓度及不同环境中蛋白质的测定;圆二色性光谱(CD)法也是分析蛋白质二级结构的常用手段。本论文在总结前人工作的基础上,综合各种实验技术及化学信息学,主要进行了以下几方面的创新性研究: (1)选择中药活性组分中结构相近或相似的同分异构体体系作为研究对象,结合多种光谱技术以及分子模拟等多种方法进行综合性地研究了它们与不同蛋白质的相互作用; (2)将三种球状蛋白质(血清白蛋白、人免疫球蛋白和溶菌酶)作为模型蛋白,利用以上多种光谱技术定性和定量地研究了药物对蛋白质二级结构的影响; (3)应用傅立叶变换红外光谱技术(FT-IR)中的二阶导数法和曲卷积法,定量分析了不同药物与三种蛋白相互作用时,对蛋白质二级结构的影响变化;并且取得了与圆二色光谱法(CD)基本一致的结果; (4)详细研究了中药活性组分愈创木酚与两种蛋白质相互作用的荧光增强效应,并且用荧光偏振法分析了药物对蛋白质结构在分子水平上的作用情况;
【关键词】:
【学位授予单位】:兰州大学
【学位级别】:博士
【学位授予年份】:2006
【分类号】:R284;R285
【DOI】:CNKI:CDMD:1.2006.088482
【目录】:
  • 中文摘要10-13
  • 英文摘要13-17
  • 第一章 中药小分子与蛋白质相互作用研究进展17-106
  • 1.1 引言17-19
  • 1.2.中药现代化的研究19-26
  • 1.2.1.中药研究的回顾与现状19-20
  • 1.2.2.中药现代化研究的问题20-23
  • 1.2.2.1.中西医药学融合的问题20-21
  • 1.2.2.2.中药走向世界医学的问题21-23
  • 1.2.3.中药现代化研究的新方法23-26
  • 1.2.3.1 于研究中药扩展的细胞层次的ADME/Tox平台23-24
  • 1.2.3.2 功能基因组学与生物芯片技术在中药研发中的应用24-25
  • 1.2.3.3 中药色谱指纹图谱技术的应用25
  • 1.2.3.4 中药制剂与纳米技术25-26
  • 1.3.蛋白质的结构、功能和性质26-55
  • 1.3.1 蛋白质在生命过程中的作用26-28
  • 1.3.2 蛋白质的结构28-33
  • 1.3.2.1 一级结构29-30
  • 1.3.2.2 二级结构30-32
  • 1.3.2.3 超二级结构32
  • 1.3.2.4 三级结构32
  • 1.3.2.5 四级结构32-33
  • 1.3.3.蛋白质的性质33-34
  • 1.3.4 维系和稳定蛋白质高级结构的因素34-37
  • 1.3.5.球蛋白分子结构的一般规律37-38
  • 1.3.6.血清白蛋白的结构、功能和性质38-42
  • 1.3.6.1 血清白蛋白的结构38-40
  • 1.3.6.2 白蛋白的生理功能40
  • 1.3.6.3 人血清白蛋白的晶体结构与活性部位的确定40-42
  • 1.3.7 人免疫球蛋白的结构、功能和性质42-48
  • 1.3.7.1 人免疫球蛋白的基本结构42-45
  • 1.3.7.2 免疫球蛋白的功能和性质45-47
  • 1.3.7.3 免疫球蛋白的活性部位47-48
  • 1.3.8.酶蛋白—溶菌酶的结构、功能和性质48-55
  • 1.3.8.1 溶菌酶的结构和性质48-51
  • 1.3.8.2 酶蛋白分子的功能51-53
  • 1.3.8.3 溶菌酶的活性与活性部位53-55
  • 1.4.药物与蛋白质相互作用的研究方法55-84
  • 1.4.1.紫外光谱法57-58
  • 1.4.2.荧光光谱法58-67
  • 1.4.2.1.荧光淬灭法59-64
  • 1.4.2.2 光增强法即敏化荧光法64-66
  • 1.4.2.3.同步荧光光谱66
  • 1.4.2.4.荧光偏振66-67
  • 1.4.3.傅立叶变换红外光谱法67-71
  • 1.4.4.圆二色谱法71-75
  • 1.4.4.1 多肽二级结构的测定72-73
  • 1.4.4.2 蛋白质二级结构的测定73-75
  • 1.4.4.3 核酸的一级结构测定75
  • 1.4.5.瑞利共振光散射技术75-78
  • 1.4.6.用于预测药物-蛋白质相互作用的计算机技术78-83
  • 1.4.6.1 分子模拟技术78-81
  • 1.4.6.2.定量结构-性质/活性关系81-83
  • 1.4.7.应用于蛋白质与药物相互作用研究的其它方法83-84
  • 1.5.植物药活性组分与蛋白质相互作用的研究现状84-88
  • 1.6.对研究药物与蛋白质相互作用的现状提出的问题88-91
  • 参考文献91-106
  • 第二章 山姜素和豆蔻明与三种球状蛋白质相互作用的研究106-161
  • 2.1.引言106-107
  • 2.2 实验部分107-109
  • 2.2.1 试剂和仪器107
  • 2.2.2 实验方法107-109
  • 2.3.结果与讨论109-157
  • 2.3.1 山姜素和豆蔻明与人血清白蛋白(HSA)的相互作用研究109-128
  • 2.3.1.1 山姜素和豆蔻明与HSA相互作用的荧光淬灭机理109-112
  • 2.3.1.2 结合常数及结合位点数的计算112-114
  • 2.3.1.3 结合距离的计算114-116
  • 2.3.1.4 键合模式的确定116-118
  • 2.3.1.5.判定药物影响HSA二级结构的定性依据118-119
  • 2.3.1.6.判定药物影响HSA二级结构的定量依据119-124
  • 2.3.1.7 药物在血清白蛋白上结合位置的确定124-128
  • 2.3.2 山姜素和豆蔻明与人免疫球蛋白(IgG)的相互作用研究128-144
  • 2.3.2.1 山姜素和豆蔻明对IgG的荧光淬灭作用128-131
  • 2.3.2.2 结合常数,结合位点数及结合距离的计算131-134
  • 2.3.2.3 键合模式的确定134-135
  • 2.3.2.4.判定药物影响IgG二级结构的定性和定量依据135-141
  • 2.3.2.5.分子模拟141-144
  • 2.3.3 山姜素和豆蔻明与溶菌酶(LYSO)的相互作用研究144-155
  • 2.3.3.1 山姜素和豆蔻明对溶菌酶(LYSO)的荧光淬灭作用144-146
  • 2.3.3.2 结合常数,结合位点数及结合距离的计算146-148
  • 2.3.3.3 键合模式的确定148-149
  • 2.3.3.3 判定药物影响LYSO二级结构的定性和定量依据149-155
  • 2.3.4. 共存离子对药物-蛋白相互作用的影响155-157
  • 2.4 结论157-158
  • 参考文献158-161
  • 第三章 补骨脂素和异补骨素与HSA和IgG相互作用的研究161-203
  • 3.1.引言161-162
  • 3.2 实验部分162-164
  • 3.2.1 试剂和仪器162
  • 3.2.2 实验方法162-164
  • 3.3.结果与讨论164-200
  • 3.3.1 补骨脂素和异补骨脂素与人血清白蛋白(HSA)的相互作用研究164-185
  • 3.3.1.1 补骨脂素和异补骨脂素与HSA相互作用的荧光淬灭机理164-166
  • 3.3.1.2 结合常数结合位点数及结合距离的计算166-171
  • 3.3.1.3 键合模式的确定171-173
  • 3.3.1.4.判定药物影响HSA二级结构的定性依据173-174
  • 3.3.1.5.判定药物影响HSA二级结构的定量依据174-182
  • 3.3.1.6 药物在血清白蛋白上结合位置的确定182-185
  • 3.3.2 补骨素和异补骨素与人免疫球蛋白(IgG)的相互作用研究185-200
  • 3.3.2.1 补骨素和异补骨素对IgG的荧光淬灭作用185-188
  • 3.3.2.2 结合常数,结合位点数及结合距离的计算188-191
  • 3.3.2.3 键合模式的确定191-192
  • 3.3.2.4.判定药物影响IgG二级结构的定性和定量依据192-198
  • 3.3.2.5.分子模拟198-200
  • 3.4 结论200-201
  • 参考文献201-203
  • 第四章 紫草素与血清白蛋白和溶菌酶相互作用的研究203-229
  • 4.1.引言203-204
  • 4.2 实验部分204-206
  • 4.2.1 试剂和仪器204
  • 4.2.2 实验方法204-206
  • 4.3.结果与讨论206-225
  • 4.3.1 紫草素与HSA和LYSO相互作用的荧光光谱及淬灭机理206-209
  • 4.3.2 结合常数及结合位点数的计算209-211
  • 4.3.3 结合距离的计算211-213
  • 4.3.4 键合模式的确定213-214
  • 4.3.5.判定药物影响蛋白二级结构的定性依据和定量依据214-221
  • 4.3.6.药物在血清白蛋白上结合位置的确定221-224
  • 4.3.7.共存离子对药物-蛋白相互作用的影响224-225
  • 4.4.结论225-226
  • 参考文献226-229
  • 第五章 基于愈创木酚的荧光增敏研究与蛋白质的相互作用229-256
  • 5.1.引言229-230
  • 5.2 实验部分230-232
  • 5.2.1 试剂和仪器230
  • 5.2.2 实验方法230-232
  • 5.3.结果与讨论232-252
  • 5.3.1 分子模拟232-236
  • 5.3.2 愈创木酚与HSA和IgG相互作用的荧光光谱和紫外光谱236-238
  • 5.3.3 愈创木酚与HSA和IgG相互作用的荧光偏振研究238-241
  • 5.3.4 药物与蛋白键合的结合常数与结合距离241-244
  • 5.3.5.键合模式的确定244-245
  • 5.3.6 判定药物影响蛋白二级结构的定性依据和定量依据245-252
  • 5.4 结论252-253
  • 参考文献253-256
  • 已发表或待发表论文目录256-258
  • 致谢258-260
  • 攻读博士学位期间获奖情况260
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