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《兰州大学》 2007年
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我国石鸡属鸟类系统地理结构及其种间杂交的研究

杨志松  
【摘要】: 大石鸡(Alectoris magna)是我国特有种,分布区狭窄,分化为两个亚种,即指名亚种(A. m. magna)和兰州亚种(A. m. lanzhouensis)。石鸡(Alectoris chukar)是广布种,亚种分化众多。两种石鸡属鸟类均是我国北方干早、半干旱荒漠环境的指示鸟类。青藏高原的隆升是造成我国北方干早环境的重要因素。伴随着更新世冰期的作用,可能对生活于干旱环境的石鸡属两种鸟类的进化历史和系统地理结构有重要影响。目前线粒体DNA分子标记普遍用于分析物种系统进化和遗传结构。本文结合线粒体DNA细胞色素b基因(Cytb)和线粒体DNA控制区基因(CR)作为分子标记,通过PCR直接测序方法研究大石鸡和石鸡的遗传和系统地理结构,以期达到如下目的:(1)说明西宁盆地的大石鸡的亚种归属问题;(2)比较大石鸡和石鸡Cytb基因的遗传差异;(3)阐明大石鸡整个分布区内的系统地理结构,说明采样范围内石鸡的系统地理结构;(4)推演它们的历史起源进化进程;(5)推测杂交发生的时间,进一步确定杂交范围;(6)比较两种分子标记在同一物种的差别。 本文共采集了大石鸡106个样本,石鸡48个样本用于细胞色素b序列测定分析;采集了大石鸡133个样本用于CR基因序列分析。 Cytb基因序列碱基含量和CR基因差异显著,后者的A+G含量明显高于前者;后者的序列变异率是前者的9倍。 大石鸡和石鸡的Cytb基因密码子偏倚指数CBI表明这两种石鸡的Cytb基因密码子存在偏倚,偏倚程度相近。两者总的碱基含量差异显著,密码子的三个位点中,最保守的密码子第二位点的碱基含量在种间没有显著差异。大石鸡13个地理种群间的碱基含量差异显著,三个种群组间的碱基含量差异也显著。石鸡种群中,单因素方差分析仅有密码子第三位点中的C、A、G含量在8个地理种群间差异显著,3个亚种之间的碱基含量差异不显著。 大石鸡Cytb基因序列828bp有8个多态位点,序列变异率为0.97%;8个替代中有6个是同义替代;T—C转换为A—G转换的1.5倍。石鸡Cytb基因序列有14个多态位点,序列变异率为1.69%:15个替代中有11个是同义替代;T—C转换(8次)略低于A—G转换,这和石鸡CR基因序列的嘧啶变异更高的结果不一致(黄族豪等,2004)。大石鸡和石鸡Cytb基因突变的方向主要是G向A、T向C突变。 从遗传距离和系统树看,西宁种群组的大石鸡应该属于兰州亚种,两者之间有一定的遗传分化。 根据Cytb基因序列分析碱基含量、遗传多样性,所采样区域内石鸡种群遗传分化比大石鸡更不明显,各种群没有形成明显的地理分化,它们之间较大石鸡有更大的基因流。 由于早更新世冰期和柴达木盆地的进一步内陷的作用,石鸡和大石鸡大约在190万年前发生分歧。大石鸡柴达木种群组和西宁种群组、兰州种群组之间分歧时间为27万年,西宁种群组和兰州种群组之间为19万年。推测大石鸡的扩散路线为从柴达木盆地向东扩散至兰州盆地,最后形成了以兰州盆地为中心向四周辐射逐步扩散的模式。西宁种群组的大石鸡是由兰州种群组返回扩散形成的。 大石鸡所有种群都经历过种群扩张。兰州种群组扩张所经历的时间为10.7万年,西宁种群组扩张的时间为11.7万年。石鸡肃北、祁丰和贺兰山种群可能经历过瓶颈效应,而后经历过种群爆发过程。 大石鸡种群分布属于“系统发生不连续,具有空间隔离”的地理格局。西宁种群组和兰州种群组属于“系统发生连续,具有部分空间隔离”的地理格局。从Cytb基因分化看,石鸡各地理种群间属于“系统发生连续,没有空间隔离”的地理格局。大石鸡和石鸡种群间属于“系统发生不连续,具有空间隔离”的地理格局。 8个大石鸡样本的Cytb基因呈石鸡的基因模式,但是在石鸡中没有发现大石鸡的基因模式。石鸡的基因向大石鸡单向渗透,为种间杂交的渐渗杂交类型。推算发生在六盘山周缘到礼县的杂交带长度大约为400km。杂交带宽度约为130km。发生杂交的时间(9万年)正是大石鸡兰州种群组扩散的时间(10.7万年)之后。 从Cytb基因序列表明,渐渗杂交的发生对大石鸡遗传多样性没有显著影响。杂种低的遗传多样性和单一的单倍型可能表明石鸡雌性个体和大石鸡雄性个体间的交配选择不是随机的,可能具有某种特定基因型的石鸡雌性才会选择同大石鸡雄性进行交配,从而造成杂种后代单一的基因型。不过这一推测尚需进一步研究。
【学位授予单位】:兰州大学
【学位级别】:博士
【学位授予年份】:2007
【分类号】:Q958

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【引证文献】
中国期刊全文数据库 前1条
1 宋森;刘迺发;;石鸡属鸟类研究现状[J];生态学报;2013年14期
【参考文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 施雅风,郑本兴,李世杰;青藏高原的末次冰期与最大冰期——对M.Kuhle的大冰盖假设的否定[J];冰川冻土;1990年01期
2 邓其祥;铜鸡×金鸡——自然杂交种的描述[J];动物学报;1974年01期
3 刘遒发,陈小勇,何德奎;兰州地区大石鸡栖息地选择[J];动物学报;1996年S1期
4 陈小勇,罗兰,刘乃发,何德奎;大石鸡的静止代谢率[J];动物学报;1999年01期
5 陈强,常城,刘迺发,E.Rand,V.Lucchini;两种邻域分布石鸡间的线粒体DNA渗透(英文)[J];动物学报;1999年04期
6 黄族豪,刘袍发;陇东黄土高原石鸡的分子系统地理结构(英文)[J];动物学报;2004年04期
7 肖金花,肖晖,黄大卫;生物分类学的新动向——DNA条形编码[J];动物学报;2004年05期
8 桂建芳;脊椎动物线粒体DNA的进化遗传学[J];动物学杂志;1990年01期
9 王继文;动物线粒体假基因的识别及其在进化生物学中的应用[J];动物学杂志;2004年03期
10 王亚明,周开亚;PCR介导的DNA序列系统分析在系统动物学中的应用[J];动物学杂志;1996年03期
中国博士学位论文全文数据库 前1条
1 陈妍珂;我国六盘山地区大石鸡和石鸡的渐渗杂交[D];兰州大学;2006年
【共引文献】
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1 王庆;傅洪拓;;核rDNA ITS区序列在水产动物研究中的应用[J];安徽农学通报;2007年11期
2 张运锋;黄光和;李希国;谭学林;;普通菜豆农艺性状相关性分析及主成分分析[J];安徽农学通报;2008年07期
3 宋洁;张小芳;刁雪淘;金梅;;线粒体DNA12SrRNA、16SrRNA研究进展[J];安徽农学通报;2008年09期
4 贺莹;;宁夏束颈蝗Cytb基因的Numt分析[J];安徽农学通报(上半月刊);2010年13期
5 朱美霞,刘海清,张月永;应用RAPD-PCR分析棉花A基因组的起源与进化[J];安徽农业科学;2004年06期
6 王杰;张旺生;张伟;肖清华;朱创鑫;;基于MapGIS的湟水流域地貌演化研究[J];安徽农业科学;2007年17期
7 黄族豪;肖宜安;龙进;;泰和乌鸡遗传多样性研究进展[J];安徽农业科学;2008年13期
8 温洪宇;韩宝平;周玉楼;吕爱军;杨柳;;嗜盐菌HBCC-3的培养特性及系统发育学分析[J];安徽农业科学;2008年14期
9 安金翠;葛淑俊;孟庆荣;王静华;孟义江;;甘草属种质资源与品种选育方法研究进展[J];安徽农业科学;2008年22期
10 张金洲;项智锋;王清华;李学斌;赵海涛;张廷虎;郭玉娇;;利用RAPD标签分析3种鲤科鱼群体的遗传变异[J];安徽农业科学;2008年23期
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1 段修军;孙国波;王日君;董飚;卞友庆;;太湖鹅微卫星标记与生长性状的相关研究[A];安全优质的家禽生产——第十五次全国家禽学术讨论会论文集[C];2011年
2 唐建军;;关于遗传生态学中的几个问题[A];青年生态学者论丛(一)[C];1991年
3 薛梦林;;冬枣采后黑斑病拮抗菌的筛选与鉴定[A];微生物实用技术生态环境应用学术研讨会论文集[C];2008年
4 苏智慧;;大步甲虫亚科的平行进化和快速形态分化(英文)[A];生命科学与生物技术:中国科协第三届青年学术年会论文集[C];1998年
5 ;Species Discrimination of Four Crabs (Genus Scylla) by Mitochondrial COI Gene[A];经济发展方式转变与自主创新——第十二届中国科学技术协会年会(第三卷)[C];2010年
6 张进江;丁林;;青藏高原东西向伸展及其地质意义[A];中国科学院地质与地球物理研究所二○○三学术论文汇编·第二卷(青藏高原)[C];2003年
7 陈贺海;汉景泰;丁仲礼;孙会国;郭正府;;藏南乌郁盆地晚新生代沉积序列的时代及其区域构造意义[A];中国科学院地质与地球物理研究所2007学术论文汇编(第七卷)[C];2008年
8 蔡旭;方伟武;;基于极大似然估计的分子序列修正Kimura双参数距离[A];中国运筹学会第七届学术交流会论文集(中卷)[C];2004年
9 易金鑫;侯喜林;;我国茄子主要地方品种与选育品种遗传多样性分析[A];蔬菜分子育种研讨会论文集[C];2004年
10 林能锋;许斌福;;石首鱼类的系统发育研究概况[A];2008年福建省科协第八届学术年会农业分会场论文集[C];2008年
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1 郭雪江;睾丸蛋白表达谱的研究[D];南京医科大学;2009年
2 张成玲;烟草脉带花叶病毒、芜菁花叶病毒和马铃薯Y病毒的遗传结构分析[D];山东农业大学;2010年
3 王勇;细基格孢属、匍柄霉属及其近似属的形态学与分子系统学研究[D];山东农业大学;2010年
4 孙庆华;我国葡萄根瘤蚜遗传分化研究及翅型分化相关基因的筛选[D];山东农业大学;2009年
5 于红;牡蛎良种选育的遗传学基础研究[D];中国海洋大学;2010年
6 刘冬雁;川西高原甘孜黄土记录的早更新世晚期以来的古气候变化[D];中国海洋大学;2009年
7 伊珍珍;旋唇纲、寡膜纲和前口纲纤毛虫原生动物研究[D];中国海洋大学;2009年
8 肖永双;西北太平洋五种海洋鱼类的分子系统地理学研究[D];中国海洋大学;2010年
9 苗贵东;半滑舌鳎微卫星标记开发、应用及遗传连锁图谱的构建[D];中国海洋大学;2010年
10 卞晓东;鱼卵、仔稚鱼形态生态学基础研究[D];中国海洋大学;2010年
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1 胡佳;鲟形目部分种类基于线粒体COⅠ基因的分子进化研究[D];华中农业大学;2010年
2 万珊;柑橘粉虱对柑橘叶片挥发物的行为反应及其遗传分化研究[D];华中农业大学;2010年
3 韩芳;甘蓝型油菜A3染色体遗传连锁图谱的构建[D];华中农业大学;2010年
4 陈静;利用杀配子染色体诱导小麦—二倍体长穗偃麦草3E染色体易位研究[D];哈尔滨师范大学;2010年
5 闫小丹;八倍体小偃麦与天蓝偃麦草杂交后代的分子细胞遗传学研究[D];哈尔滨师范大学;2010年
6 张东阳;黑粒小麦的分子细胞遗传学及抗氧化性研究[D];哈尔滨师范大学;2010年
7 黄雅琴;双胚苗水稻的生物学特征研究[D];郑州大学;2010年
8 李悦;中国莴苣属及其近缘属植物系统学关系的初步研究[D];郑州大学;2010年
9 郭彦斌;利用mtDNA D-loop区研究10个绵羊品种的遗传多样性、起源及遗传分化[D];山东农业大学;2010年
10 王健;文蛤线粒体基因组序列测定及进化分析[D];辽宁师范大学;2010年
【同被引文献】
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1 徐叔鹰,张维信,徐德馥,徐齐治,石生仁;青藏高原东北边缘地区冰缘发展探讨[J];冰川冻土;1984年02期
2 刘遒发,陈小勇,何德奎;兰州地区大石鸡栖息地选择[J];动物学报;1996年S1期
3 陈小勇,罗兰,刘乃发,何德奎;大石鸡的静止代谢率[J];动物学报;1999年01期
4 侯鹏,卫明,张立勋,刘迺发;大石鸡边缘种群的遗传结构[J];动物学报;2002年03期
5 黄族豪,刘袍发;陇东黄土高原石鸡的分子系统地理结构(英文)[J];动物学报;2004年04期
6 陈玉琴;俞诗源;;红腹锦鸡、石鸡和雉鸡的部分血液生理生化指标[J];动物学报;2007年04期
7 马新年;杨志松;刘迺发;金园庭;;石鸡繁殖期栖息地的特征[J];动物学杂志;2006年03期
8 杨志松;刘迺发;;基于细胞色素b基因研究两种石鸡的渐渗杂交[J];重庆师范大学学报(自然科学版);2009年04期
9 周晓禹;王晓明;姜振华;;贺兰山石鸡越冬期栖息地的选择[J];东北林业大学学报;2008年04期
10 周晓禹;王晓明;姜振华;;贺兰山石鸡越冬期昼间行为时间分配及活动规律[J];东北林业大学学报;2008年05期
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1 陈妍珂;我国六盘山地区大石鸡和石鸡的渐渗杂交[D];兰州大学;2006年
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1 于宏丽;我国石鸡分子生态学研究[D];兰州大学;2008年
【二级参考文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 李书春;黄山松一新变种——杉松[J];安徽农学院学报;1981年01期
2 邓其祥;铜鸡×金鸡——自然杂交种的描述[J];动物学报;1974年01期
3 余其兴,H.H.霍巴特;黑水鸡与家鸡染色体带型同源性比较研究[J];动物学报;1990年02期
4 武云飞,谭齐佳;青藏高原鱼类区系特征及其形成的地史原因分析[J];动物学报;1991年02期
5 吴乃虎,王钢锋,阎景智,郭玲,严绍颐,秦鹏春;草鱼和鲤鱼线粒体 DNA 的分离纯化及其 COI 基因的分子克隆[J];动物学报;1991年04期
6 刘遒发,陈小勇,何德奎;兰州地区大石鸡栖息地选择[J];动物学报;1996年S1期
7 唐朝忠,温伟业,杨爱玲,卫泽珍,孟秀莲,王建民;褐马鸡血液生理生化指标及雏鸟矿物元素含量测定[J];动物学报;1997年01期
8 沈曦,周开亚,王义权;中国蝮属蛇类的RAPD分析[J];动物学报;1999年01期
9 陈强,常城,刘迺发,E.Rand,V.Lucchini;两种邻域分布石鸡间的线粒体DNA渗透(英文)[J];动物学报;1999年04期
10 江建平,周开亚;从12SrRNA基因序列研究中国蛙科24种的进化关系[J];动物学报;2001年01期
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1 沈浪;陈小勇;;生物冰期避难所与冰期后的重新分布[A];生态学的新纪元——可持续发展的理论与实践[C];2000年
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1 王继文;中国主要家鹅品种分子系统进化研究[D];四川农业大学;2003年
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1 张荫荪,梁拴柱,陈容伯;石鸡的一新亚种——鄂尔多斯石鸡(鸡形目:雉科)[J];动物分类学报;1989年04期
2 陈爱葵,冯肇松,李爱群;鹌鹑和石鸡的核型及C带研究[J];华南师范大学学报(自然科学版);1999年02期
3 刘迺发,杨友桃;石鸡青海亚种的生态[J];动物学研究;1982年01期
4 ;石鸡[J];西藏人文地理;2007年01期
5 张德禄,马正学,马尚盛,李建真,胡春香;石鸡胃的血液供应[J];西北师范大学学报(自然科学版);2003年04期
6 黄族豪,刘袍发;陇东黄土高原石鸡的分子系统地理结构(英文)[J];动物学报;2004年04期
7 张信文,高金岗,陈翊霞,吴岳领,邢德勇;石鸡、八哥和红嘴相思鸟生理常数的研究[J];海南师范学院学报(自然科学版);2002年02期
8 周晓禹;王晓明;姜振华;;贺兰山石鸡越冬期昼间行为时间分配及活动规律[J];东北林业大学学报;2008年05期
9 马新年;杨志松;刘迺发;金园庭;;石鸡繁殖期栖息地的特征[J];动物学杂志;2006年03期
10 陈玉琴;俞诗源;;红腹锦鸡、石鸡和雉鸡的部分血液生理生化指标[J];动物学报;2007年04期
中国重要会议论文全文数据库 前5条
1 王建萍;郭建荣;;芦芽山自然保护区石鸡繁殖生态的研究[A];中国动物科学研究——中国动物学会第十四届会员代表大会及中国动物学会65周年年会论文集[C];1999年
2 何志虎;;陈仓、宝鸡得名与宝鸡建城[A];“宝鸡建城历史与得名”学术研讨会论文集[C];2007年
3 王宏波;;附录一 宝鸡建城历史与得名资料辑录[A];“宝鸡建城历史与得名”学术研讨会论文集[C];2007年
4 霍彦儒;;也谈“宝鸡”名称之由来[A];“宝鸡建城历史与得名”学术研讨会论文集[C];2007年
5 刘宏岐;;“宝鸡”名称的几个问题[A];“宝鸡建城历史与得名”学术研讨会论文集[C];2007年
中国重要报纸全文数据库 前10条
1 公务员 钱兆成;“注石鸡”——人们不能承受之重[N];健康报;2011年
2 ;石鸡的饲养管理技术[N];中国畜牧兽医报;2009年
3 江国旺;深山石鸡走俏沿海餐桌[N];上饶日报;2010年
4 俞盛荣余进;让特色养殖与旅游精彩互动[N];抚州日报;2008年
5 秦鸥;打击精度为5米 震惊西方的“苏尔卡”[N];中国国防报;2004年
6 记者 燕澜月 实习生 马晓英;工程总投资2.97亿元[N];甘肃经济日报;2009年
7 何志虎;宝鸡因何而得名?[N];宝鸡日报;2007年
8 司小平;两江八河春满园[N];甘肃经济日报;2008年
9 本报记者 贾霞 通讯员 赵健;东升村:特色种养业富了村民[N];巴彦淖尔日报(汉);2009年
10 翟屯建;徽菜[N];黄山日报;2005年
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1 宋森;石鸡的分子生态及系统地理学研究[D];兰州大学;2011年
2 包新康;我国高山鹑类分子系统发生研究[D];兰州大学;2010年
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1 于宏丽;我国石鸡分子生态学研究[D];兰州大学;2008年
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