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《甘肃农业大学》 2016年
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牦牛PPARα、PPARγ、PPARδ基因的多态性与生长性状相关性研究

纪永吉  
【摘要】:肌内脂肪含量是影响牦牛肉质品质的一个重要因素,可直接影响其肉的嫩度和风味。过氧化物酶体增殖激活受体PPARα、PPARγ和PPARδ基因是调控牦牛肌内脂肪沉积的相关候选基因。牦牛生长性状与脂肪沉积之间具有一定的关联系,因此,揭示牦牛PPARα、PPARγ和PPARδ基因的遗传变异特征,及牦牛生长性状显著相关的候选分子标记,为牦牛分子育种积累资料。以192头牦牛血样为材料,通过DNA池测序和PCR-HRM(英文全写,HRM)等技术检测PPARα、PPARγ和PPARδ基因的SNPs。利用DNA混合池、直接测序法和高分辨率溶解曲线对PPARα、PPARγ、PPARδ进行基因分型,分析其在牦牛群体中基因多态性,并对192头牦牛在上述位点的多样性与其生长性状进行关联分析,以期为牦牛遗传资源的保护利用与新品种选育提供科学依据。本研究主要获得了以下结果:1.PPARα基因多态性与生长性状相关性分析牦牛PPARα基因中发现三个SNPs。遗传变异特征分析显示,SNP1(g.44399A/C)、SNP2(g.53261A/G)和SNP3(g.61281T/C)位点属于中度多态性。连锁不平衡和单倍型分析表明,牦牛PPARα基因SNP1(g.44399A/C)多态位点和SNP2(g.53261G/A)多态位点之间为弱连锁,牦牛PPARα基因SNP1(g.44399A/C)多态位点和SNP3(g.61281T/C)多态位点之间为弱连锁,而牦牛PPARα基因SNP2(g.53261G/A)多态位点和SNP3(g.61281T/C)多态位点之间为强连锁,单倍型CAT属于优势单倍型(频率为48.2%)。方差分析表明,单个的SNP与牦牛生长性状有着显著或极显著的关联。牦牛PPARα基因的3个SNPs与其生长性状显著相关。2.PPARγ基因多态性与生长性状性分析牦牛PPARγ基因外显子中仅发现1个SNP。遗传变异特征分析显示,SNP(g.87362T/C)位点属于高度多态性。方差分析表明,该SNP与牦牛生长性状有着显著或极显著的关联。牦牛PPARγ基因SNP与其生长性状显著相关。3.PPARδ基因多态性与生长性状相关性分析牦牛PPARδ基因内含子中发现2个SNPs。遗传变异特征分析显示,SNP1(g.10045A/G)和SNP2(g.10226A/G)位点属于中度多态性。连锁不平衡和单倍型分析表明,牦牛PPARδ基因2个多态位点之间为弱连锁,单倍型AA属于优势单倍型(频率为42.2%)。方差分析表明,单个的SNP与牦牛生长性状有着显著或极显著的关联。牦牛PPARδ基因的2个SNPs均与其生长性状显著相关。
【学位授予单位】:甘肃农业大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2016
【分类号】:S823.85

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