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《甘肃农业大学》 2005年
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中国南方主要地方山羊品种遗传多样性及进化特征的研究

刘宁  
【摘要】: 测定了饲养在中国的11个家养山羊品种(包括4个引进品种)72个个体的线粒体DNA(mtDNA)控制区(D-环)全序列,结果表明控制区全序列长度为1,212bp或1,213bp,共检测到276个变异(突变)位点,占分析位点总数的22.56%,其中简约信息位点175个,单一多态位点81个,所有这些突变均为两核苷酸间的变异;同时,本次试验在中国本地山羊的序列中也检测到T?C,G?A颠换的发生。颠换发生的频率在0.0825%(简阳大耳羊)~0.66%(昭通山羊)之间,其中,马头山羊、榕江小香羊的核苷酸序列的颠换发生率均为0.413%,与作为外群参与分析的野生山羊(Capra aegagrus和Capra falconeri)的颠换发生频率(0.436%)相似。在碱基的1,075位有一个核苷酸的插入/缺失。所有序列的Tajima D中性检验结果不显著(P 0.10或0.05 P 0.10),说明序列均为选择性中性,同时也表明中国南方山羊品种在过去没有出现群体扩张。无论国内家养山羊,还是引进品种均表现出了较高的核苷酸多样度(Pi)和单倍型多样性(H)。整个家山羊群体的平均核苷酸差异数为19.475,核苷酸多样度为(1.608±0.09)%,这些差异共定义了60种单倍型,单倍型多样性为0.977。其中,中国家养山羊7个品种有40种单倍型,引进的4个品种有20种单倍型。中国南方山羊的单倍型多样性(0.973)比引进品种(0.903)高,但引进品种的核苷酸多样性(1.731%)、单倍型间的平均距离(0.0187)、单倍型间的平均核苷酸差异数(19.475)高于中国南方山羊品种(分别为1.531%、0.0151和18.554),但差异均不显著(P0.05)。表明中国家养山羊的遗传多样性较为丰富,且品种间表现出弱的遗传结构。 将本研究测定的73条mtDNA的D环全序列与文献报道的76条家山羊序列、2种野山羊(角猾羊和捻角山羊)的D环序列结合分析发现,文献报道的单倍型仅有3种在中国南方地方山羊品种中存在。各家养山羊品种间平均核苷酸差异数为19.475(7.50~30.42),平均核苷酸差异率为1.607%(0.619%~2.512%)。品种间的Kimura双参数距离变异较大(0.0008~0.0315)。许多品种都具有独特的单倍型类型,只有2种单倍型在品种间有共享。各单倍型在品种间和品种内的分布和频率也不平衡,显示出山羊mtDNA控制区(CR,D-loop)序列具有较为丰富的遗传多样性,尤其是在国内地方山羊品种(系)中,D-loop序列的核苷酸单倍型之间没有共享性,大多数为各品种(系)所特有的单倍型。
【学位授予单位】:甘肃农业大学
【学位级别】:博士
【学位授予年份】:2005
【分类号】:S827

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【引证文献】
中国期刊全文数据库 前2条
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中国硕士学位论文全文数据库 前1条
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【参考文献】
中国期刊全文数据库 前10条
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中国博士学位论文全文数据库 前2条
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【共引文献】
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中国重要会议论文全文数据库 前10条
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中国博士学位论文全文数据库 前10条
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【同被引文献】
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中国博士学位论文全文数据库 前4条
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中国硕士学位论文全文数据库 前1条
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【二级引证文献】
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中国硕士学位论文全文数据库 前1条
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【二级参考文献】
中国期刊全文数据库 前10条
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【相似文献】
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中国重要报纸全文数据库 前10条
1 赵华君 袁大坤;加大控制区内建筑物清理力度[N];巴中日报;2011年
2 记者 胡德荣;亚洲人群遗传多样性研究获最新成果[N];健康报;2009年
3 记者 吴姗;黄金山新区出台农民建房新规[N];黄石日报;2009年
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5 胡云章;绚丽的民族文化 丰富的遗传多样性[N];大众科技报;2008年
6 记者 李仁丰;线粒体DNA影响放疗敏感性[N];健康报;2000年
7 张桂香;中国地方水牛的遗传多样性[N];农民日报;2004年
8 本报记者 游雪晴;中国的人类遗传多样性研究成果丰硕[N];科技日报;2001年
9 记者 刘欣 陈云芬;保护和利用作物遗传多样性 控制病虫害促进可持续农业发展国际执委会会议在昆举行[N];云南日报;2007年
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中国博士学位论文全文数据库 前10条
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3 周晓平;13种鹭科(Aves:Ardeidae)鸟类系统关系及黄嘴白鹭遗传多样性的研究[D];厦门大学;2008年
4 张蓓;朱鹮线粒体DNA及MHC Ⅱ类B基因的多态性研究[D];浙江大学;2005年
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7 车永和;小麦族P基因组植物的遗传多样性与系统演化研究[D];西北农林科技大学;2004年
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中国硕士学位论文全文数据库 前10条
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3 薛芹;黑斑原鮡线粒体DNA序列的遗传多样性分析[D];华中农业大学;2005年
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6 殷玲;基于微卫星标记及线粒体基因序列的云南省6个东方蜜蜂(Apis cerena)群体遗传多样性及遗传分化研究[D];扬州大学;2009年
7 刘亚楠;威海海域松江鲈鱼mtDNA控制区遗传多样性的分析[D];山东大学;2009年
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