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《扬州大学》 2008年
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鹅GH、PRL基因序列及其多态性与早期生长发育及屠宰性状的关联分析

赵文明  
【摘要】: 本试验对我国大、中、小三个地方鹅种狮头鹅、皖西白鹅和籽鹅的早期生长发育规律进行分析,同时以籽鹅、皖西白鹅、狮头鹅、四季鹅和浙东白鹅为研究对象,对GH基因外显子和内含子、PRL基因编码区全序列以及5’端序列进行PCR-SSCP检测和克隆测序,分别计算5个鹅品种(种群)突变位点的基因型频率和基因频率,比较不同鹅种间的基因型分布规律,并对GH基因和PRL基因多态性与鹅早期增重和屠宰性状进行关联分析。试验结果如下: 1.利用Logistic,Gompertz,Bertalanfy和Cubic 4种非线性动物生长模型拟合大、中和小型三个地方鹅种:狮头鹅、皖西白鹅和籽鹅1-11周龄的平均体重,进行早期生长发育规律及遗传参数分析。结果表明:4个方程均能很好地拟合三个鹅种的生长过程,拟合度都在0.99以上,但Gompertz模型更符合实际品种特性,为首选模型,由此模型估计狮头鹅、皖西白鹅和籽鹅生长的拐点时间分别为5.98周龄、5.11周龄和6.16周龄,相应的拐点体重分别为2115.77g、1499.08g和1049.62g。 2.对鹅GH基因外显子和内含子进行克隆测序,得到鹅GH基因编码区全序列,长度为651bp。与鸡GH基因cds的同源性为91.4%,与鸭的同源性高达98.5%,演绎成氨基酸后两者同源性分别为97.6%和99.9%;与人、鼠GH基因cds序列同源性分别为63.81%和74.31%,演绎成氨基酸后同源性分别为52.51%和72.81%。并获得了鹅GH基因4个内含子的序列,序列长度分别为1504bp、664bp、362bp和1144bp。 3.在鹅GH基因编码区上共检测到4个SNP位点,分别为外显子2的C39T、C74T突变和外显子4的T291C、G297C,仅外显子2的C74T突变导致导致编码的氨基酸由丙氨酸变为缬氨酸,其余位点均为“沉默”突变。外显子2多态性分析结果显示,籽鹅和皖西白鹅具有10种基因型,狮头鹅和四季鹅具有7种基因型,浙东白鹅具有8种基因型,在籽鹅、皖西白鹅和四季鹅中等位基因A为优势等位基因,狮头鹅和浙东白鹅中等位基因D为优势等位基因;外显子4多态性分析结果显示,所有5个鹅品种(种群)均具有3种基因型,除籽鹅外,其它4个品种(种群)中等位基因A均为优势等位基因。外显子多态位点上,所有鹅品种(种群)均处于Hardy– Weinberg平衡状态。 4. 4个内含子的7对引物扩增结果具有多态性,测序结果表明,内含子1的P6引物的SNP位点分别为A1066G和C1157T;内含子2的P10引物的SNP位点分别为C548T和T551C,P11引物的SNP位点分别为C548T和T551C;内含子3的P13引物多态性是由该段序列中的5个核苷酸的点突变和缺失造成,分别为A160G和C167G和T264C突变以及176bp处和231bp处分别存在两个碱基的重复和缺失。内含子4的P15的SNP位点为T130C;P18引物的SNP位点分别是G821A和C949T;P19引物的SNP位点为T1137C。 在内含子1中只有P6对引物存在多态性,多态性分析结果显示,籽鹅和皖西白鹅具有4种基因型,狮头鹅、浙东白鹅和四季鹅具有3种基因型,在5个鹅品种(种群)中等位基因A均为优势等位基因;内含子2的P10和P11对引物存在多态性且基因型完全对应;所有5个鹅品种(种群)均具有3种基因型,除籽鹅外,等位基因A均为优势等位基因;内含子3的P13对引物存在多态性,狮头鹅、籽鹅和皖西白鹅具有3种基因型,浙东白鹅和四季鹅具有2种基因型,在5个鹅品种(种群)中等位基因B均为优势等位基因;内含子4的P15、P18和P19检测到多态性;引物对P15除四季鹅外,其它4个品种具有3种基因型,在5个鹅品种(种群)中等位基因A均为优势等位基因;内含子4引物对P18皖西白鹅、浙东白鹅和四季鹅具有5种基因型,狮头鹅具有4种基因型,而籽鹅只具有3种基因型,在5个鹅品种(种群)中,狮头鹅等位基因E均为优势等位基因,而籽鹅不具有E等位基因,浙东白鹅E等位基因的频率也相对较高;引物对P19皖西白鹅、浙东白鹅、籽鹅和四季鹅具有3种基因型,而狮头鹅只具有2种基因型,在5个鹅品种(种群)中,籽鹅和四季鹅M为优势等位基因,而皖西白鹅、浙东白鹅和狮头鹅N为优势等位基因。在内含子4引物对P19的多态位点中,只有籽鹅和四季鹅处于Hardy– Weinberg平衡状态(P0.05);其它内含子多态位点中,所有鹅品种(种群)均处于Hardy– Weinberg平衡状态(P0.05)。 5.对鹅GH基因所有检测到的SNPs的多态性与早期体重和屠宰性状进行关联分析,结果表明鹅GH基因外显子2、内含子3和内含子4的多态位点上对早期增重和屠宰性状存在显著的基因型效应,对于鹅早期增重和屠宰性状,外显子2的多态位点CD和DD基因型是有利基因型,在狮头鹅和浙东白鹅中的优势等位基因D可能是有利基因。内含子3的多态位点上最有利基因型是BB基因型。内含子4上NN基因型对鹅生长具有一定的促进作用,N基因可能是鹅早期增重和屠宰性状的有利基因。 6.利用多对引物扩增的方式,本试验克隆测序了鹅PRL基因编码区以及5’端调控区的全序列,cds序列全长为690bp,5’端序列全长为836bp。将所获得序列与鸡和鸭的PRL基因cds序列比较,发现与鸡PRL基因cds序列的同源性为92.8%,与鸭的同源性高达98.7%,演绎成氨基酸后两者同源性分别为93.3%和98.3%。 7.在鹅PRL基因的5’端调控区检测到C135G、C201T、C278Abp和T827G突变,在内含子2的32bp和33bp处检测到2个核苷酸GA的缺失/插入,但是在编码区没有发现突变位点。多态性分析结果5′端调控区引物对P3中,籽鹅、皖西白鹅和狮头鹅具有3种基因型,四季鹅和浙东白鹅只具有2种基因型,在5个鹅品种(种群)中等位基因A均为优势等位基因;内含子2多态位点所有5个鹅品种(种群)除浙东白鹅外均具有3种基因型,在5个鹅品种(种群)中等位基因B均为优势等位基因;所有多态位点中,所有鹅品种(种群)均处于Hardy– Weinberg平衡状态(P0.05). 8.对于鹅早期增重和屠宰性状,PRL基因仅仅在5’端调控区的多态位点上存在显著的基因型效应,AA和AB基因型的个体6~10周龄体重显著高于BB基因型个体,AA和AB基因型的个体间6~10周龄体重差异不显著;对于屠宰性状而言,AA和AB基因型的个体活重、屠体重、半净膛重、全净膛重和内脏重也显著高于BB基因型个体,AA和AB基因型的个体间屠宰性状差异不显著。因此,对于鹅早期增重和屠宰性状, AA和AB基因型为有利基因型。
【学位授予单位】:扬州大学
【学位级别】:博士
【学位授予年份】:2008
【分类号】:S835

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【引证文献】
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2 陈清;赵文明;程金花;乔娜;王学斌;徐琪;陈国宏;;鹅GH基因内含子3多态性及其与体重和屠宰性能相关分析[J];扬州大学学报(农业与生命科学版);2008年01期
3 郑云;龚道清;吴伟;赵旭庭;段修军;顾志良;;鹅Myostatin基因单核苷酸多态性检测及群体遗传分析[J];畜牧兽医学报;2008年10期
4 王健;董飚;段修军;孙国波;杨廷桂;朱善元;;6个鹅种GH基因单核苷酸多态性检测及群体遗传分析[J];中国兽医学报;2010年08期
5 段修军;董飚;王健;孙国波;赵万里;;6个白鹅品种GH基因第2外显子多态性研究[J];安徽农业大学学报;2010年01期
6 段修军,王丽华,赵旭庭,扶国才,赵万里,张军;隆太杂交仔鹅血清酶活性与同工酶型、体重关系[J];畜牧兽医杂志;2003年06期
7 程金花;赵文明;包文斌;陈清;乔娜;王学斌;张康宁;赵旭庭;陈国宏;;皖西白鹅Pit-1基因插入/缺失多态性及其对早期体重的影响[J];农业生物技术学报;2008年03期
8 凌天星;邢军;吴信生;陈清;程金花;赵文明;陈国宏;;浙东白鹅与句容四季鹅生产性能的比较[J];中国家禽;2007年17期
9 汤青萍;章双杰;陈宽维;徐国银;谈为忠;;中国地方鹅种生长曲线拟合和比较分析[J];青岛农业大学学报(自然科学版);2010年01期
10 杜智恒;杨春山;白秀娟;;北极狐GH基因的单核苷酸多态性及其与生长性状的关联性分析[J];东北农业大学学报;2010年04期
中国重要会议论文全文数据库 前10条
1 潘爱銮;杜金平;皮劲松;申杰;梁振华;蒲跃进;;分子遗传标记在鹅育种中的研究进展[A];中国家禽业——机遇与挑战——第十三次全国家禽学术讨论会论文集[C];2007年
2 武淑兰;李渊;;DNMT3B基因启动子-149位单核苷酸多态性与急性白血病的关系[A];第九届全国实验血液学会议论文摘要汇编[C];2003年
3 郑涓;;SIRT1单核苷酸多态性与中国武汉地区汉族人群超重的相关性研究[A];中华医学会第十次全国内分泌学学术会议论文汇编[C];2011年
4 束婧婷;李慧芳;张学余;韩威;陈宽维;;鸡AIRC基因多态性及其对鸡肉肌苷酸含量的遗传效应分析[A];第四届中国畜牧科技论坛论文集[C];2009年
5 高英堂;刘娟娟;杜智;王伟丽;刘彤;王毅军;杨斌;;IL-10、ALDH2单核苷酸多态性与肝病的相关性研究[A];天津市生物医学工程学会第29届学术年会暨首届生物医学工程前沿科学研讨会论文集[C];2009年
6 刘娟娟;高英堂;杜智;杨斌;经翔;王毅军;王凤梅;刘彤;;IL-10基因启动子区单核苷酸多态性与HBV感染后疾病转归的研究[A];天津市生物医学工程学会第30次学术年会暨生物医学工程前沿科学研讨会论文集[C];2010年
7 周庆辉;王金花;黄秀峰;林朝文;杨园园;吴联滔;吴玉梅;;MMP14基因单核苷酸多态性在广西百色地区壮族人群中的分布[A];中国解剖学会2011年年会论文文摘汇编[C];2011年
8 陈立功;万洪全;吴力力;王宝安;;不同基因型新城疫病毒强毒株对鹅的致病性[A];中国畜牧兽医学会2004学术年会暨第五届全国畜牧兽医青年科技工作者学术研讨会论文集(下册)[C];2004年
9 郝萍;金艳花;杨康鹃;;KCNJ11基因单核苷酸多态性与胰岛素分泌异常(英文)[A];中国的遗传学研究——遗传学进步推动中国西部经济与社会发展——2011年中国遗传学会大会论文摘要汇编[C];2011年
10 王金花;黄秀峰;周庆辉;林朝文;杨园园;韦叶生;黄昌盛;吴联滔;吴玉梅;何兰凤;;广西百色地区壮族妇女脂联素基因单核苷酸多态性与骨密度的关系研究[A];中国解剖学会2011年年会论文文摘汇编[C];2011年
中国重要报纸全文数据库 前10条
1 童炳强;五成葡萄牙人体重严重超标[N];中国食品报;2009年
2 莫言;是谁在说假话?[N];21世纪药店;2010年
3 健康时报特约记者 卢桥 王亮;想健康,先控制好体重[N];健康时报;2009年
4 黄兴华;保持健康体重贵在吃动平衡[N];中国食品质量报;2009年
5 记者 李凯 王妍;川菜换台菜,“团团”“圆圆”体重先降后升[N];新华每日电讯;2008年
6 ;跑步未必让人变瘦,反可能增加体重[N];新华每日电讯;2010年
7 北京大学公共卫生学院教授 李可基;孩子,每天运动1小时[N];健康报;2009年
8 本报记者 许琦敏;20岁以后体重上升需警惕[N];文汇报;2009年
9 记者 蔚宁;两成珠海人体重超标[N];珠海特区报;2008年
10 记者 唐江澎 匡春林 实习生 周游;11岁男孩体重竟达76公斤[N];长沙晚报;2010年
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 赵文明;鹅GH、PRL基因序列及其多态性与早期生长发育及屠宰性状的关联分析[D];扬州大学;2008年
2 余自强;抗血小板胶原受体糖蛋白VI单克隆抗体的制备和功能研究[D];苏州大学;2005年
3 季从亮;鸡肉IMP含量相关候选基因SNP筛查及其用于地方鸡种群体遗传结构分析的研究[D];扬州大学;2005年
4 李会晨;遗传性非息肉病性结直肠癌的分子遗传及临床病理研究[D];第二军医大学;2005年
5 史丽;人类CYP2A13基因SNPs及其与喉、咽、鼻恶性肿瘤危险性的相关性研究[D];山东大学;2005年
6 李艳芸;HLA-DRB1基因编码区SNPs的分析及其与宫颈癌的相关性研究[D];天津医科大学;2006年
7 刘丽波;精神分裂症相关基因的遗传学研究[D];吉林大学;2006年
8 李源;杀伤细胞免疫球蛋白样受体基因与子痫前期相关性的研究[D];吉林大学;2007年
9 周崇俊;Friend型鼠白血病病毒全基因测序及白藜芦醇抗Friend病毒实验研究[D];广州中医药大学;2007年
10 汪颖;单体型和基因型问题的优化模型和算法[D];大连理工大学;2007年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 陈清;鹅核型分析和GH、GHR基因多态性与生长性状关联研究[D];扬州大学;2008年
2 陈义权;三个鹅品种myostatin基因的研究[D];扬州大学;2006年
3 颜文锦;京海黄鸡Myostatin基因单核苷酸多态性与相关性状的关系研究[D];扬州大学;2007年
4 黄毅;鹅黑素皮质素受体-4基因(MC4R)单核苷酸多态性分析与生产性状相关研究[D];四川农业大学;2009年
5 薛恺;南阳牛Myf5、Pou1f1以及GH基因多态性及其与生长发育性状关系的研究[D];西北农林科技大学;2006年
6 吕纳强;HLA-DQ基因与大动脉炎[D];中国协和医科大学;2007年
7 吴水晶;β防御素1基因启动子区域-688G/C单核苷酸多态性与重症脓毒症发生发展的相关性研究[D];浙江大学;2008年
8 王丹妮;COMT基因遗传多态性与汉族人白癜风易感性关联分析[D];安徽医科大学;2009年
9 张来军;Oligophrenin-1基因单核苷酸多态性与秦巴山区智力及精神发育迟滞的关联分析[D];西北大学;2005年
10 李培凯;5-HT1B受体基因G861C、A-161T位点多态性与基诺族酒依赖相关性研究[D];昆明医学院;2007年
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