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《仲恺农业工程学院》 2019年
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广东省珍稀植物DNA条形码与分子鉴定

刘雅思  
【摘要】:广东省地处中国大陆南部,属南亚热带和热带季风气候,具有丰富的植物资源,而其中有一些是珍稀濒危植物。造成植物珍稀濒危的原因有多种,其主要原因是人类过度采伐和利用。为更好的保护珍稀濒危物种,首先是要对物种进行鉴定。本研究通过对目前国际上主要植物DNA条形码候选序列(rbcL、matK、ycf1、ITS2)进行比较和评价,筛选适合鉴定广东省珍稀濒危植物的DNA条形码。本研究以广东省大部分珍稀植物为材料,利用改良CTAB法提取植物DNA,使用rbcL、matK、ycf1序列的通用引物进行扩增和双向测序,ITS2进行克隆测序,并将所得结果进行序列校正和拼接,最终以各序列的扩增和测序成功率、构建的NJ树和ML树、相似性搜索法确定样本支持率等指标对不同候选序列进行评价。主要研究结果如下:1.本研究选用四条候选DNA条形码(rbcL、matK、ycf1、ITS2)对79种植物的202份样品进行扩增测序,其中有70种为广东省珍稀濒危植物。在四条候选DNA条形码中,rbcL扩增和测序成功率最高,分别为97.52%、97.03%;ITS2扩增和测序成功率均为76.24%;matK的扩增和测序成功率分别为59.90%、57.92%;ycf1的扩增和测序成功率最低,分别为50.50%、49.50%。2.通过对各科植物的四条DNA条形码分析表明,ITS2序列的变异位点最多,而rbcL序列的变异位点最少。同时,基于各项指标评价表明ITS2序列鉴定成功率最高,为69%;ycf1序列次之,为59%;rbcL序列和matK序列的鉴定成功率分别为42%和40%。
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