收藏本站
《南昌大学》 2007年
加入收藏

基于形态特征和COI基因的粉螨重要类群系统发育研究(蜱螨亚纲:粉螨亚目)

吴太葆  
【摘要】: 本论文基于粉螨形态特征与COI基因部分序列对粉螨重要类群的系统发育关系进行了探讨,主要结论如下: 1.基于粉螨55个形态特征的支序分析表明,粉螨亚目4科间关系为:麦食螨科+[粉螨科+(食甜螨科+嗜渣螨科)],麦食螨科与其它3科的亲缘关系较远。粉螨科5属间关系为:[(食粉螨属+食酪螨属)+粉螨属]+(嗜木螨属+皱皮螨属)。粉螨属4种间关系为:(粗脚粉螨+小粗脚粉螨)+(静粉螨+薄粉螨)。 2.对粉螨DNA提取的传统酚/氯仿抽提法进行了改进,改进的方法只采用20只粉螨,可简便快速地提取粉螨DNA。 3.测定的椭圆食粉螨3个不同地理种群间COI基因部分序列完全一致,腐食酪螨3个不同地理种群间COI基因部分序列也完全一致,未发现地理差异。 4.以粒形硬蜱和卵形硬蜱作为外群,基于COI部分序列构建粉螨的分子树,粉螨亚目4科间NJ树和MP树存在差别:(粉螨科+食甜螨科)+(麦食螨科+嗜渣螨科)(NJ树);[(粉螨科+麦食螨科)+嗜渣螨科]+食甜螨科)(MP树)。粉螨科5属间关系为:{[(食酪螨属+食粉螨属)+嗜木螨属]+粉螨属}+皱皮螨属。粉螨属4种间关系为:[(小粗脚粉螨+静粉螨)+薄粉螨]+粗脚粉螨。 5.结合形态树和分子树综合分析显示:粉螨亚目4科间形态树与分子树存在差别,COI基因在解决粉螨科间关系时应谨慎使用。形态树与分子树均表明,食粉螨属和食酪螨属亲缘关系较近,皱皮螨属独立为一支,与其它属亲缘关系较远,支持OConnor(1982)的粉螨分类系统,将皱皮螨属提升至皱皮螨科Suidasiidae。小粗脚粉螨和静粉螨亲缘关系较近,COI基因能较好地解决粉螨属内种间低级阶元的系统发育关系。
【关键词】:粉螨 DNA提取 COI基因 形态特征 系统发育 支序分析
【学位授予单位】:南昌大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2007
【分类号】:Q96
【目录】:
  • 摘要3-4
  • ABSTRACT4-8
  • 第1章 前言8-16
  • 1.1 粉螨分类学研究现状8-10
  • 1.2 蜱螨的分子系统学研究概况10-14
  • 1.2.1 分子系统学以及研究方法10-12
  • 1.2.2 线粒体DNA在蜱螨分子系统学研究中的应用概况12-13
  • 1.2.3 线粒体DNA COI基因在蜱螨分子系统学研究中的应用13-14
  • 1.3 粉螨的系统发育研究概况14-15
  • 1.4 研究的目的和意义15-16
  • 第2章 基于形态特征的粉螨系统发育支序分析16-23
  • 2.1 材料与方法16-18
  • 2.1.1 材料采集和标本制作16-17
  • 2.1.2 性状特征和特征分析17-18
  • 2.2 结果与分析18-21
  • 2.2.1 性状特征18-19
  • 2.2.2 支序分析19-21
  • 2.3 讨论21-23
  • 第3章 粉螨DNA提取方法的改进23-30
  • 3.1 材料与方法23-26
  • 3.1.1 主要仪器和设备23-24
  • 3.1.2 主要试剂及试剂的配制24
  • 3.1.3 供试粉螨24
  • 3.1.4 传统的酚/氯仿抽提法24-25
  • 3.1.5 改进的方法25
  • 3.1.6 DNA的琼脂糖凝胶电泳检测25
  • 3.1.7 DNA的纯度及浓度检验25
  • 3.1.8 改进方法提取的DNA的PCR扩增25-26
  • 3.2 结果与分析26-28
  • 3.2.1 改进方法提取椭圆食粉螨DNA最适宜样品数的确定26
  • 3.2.2 两种方法提取的椭圆食粉螨DNA的电泳结果26-27
  • 3.2.3 两种方法提取的椭圆食粉螨DNA的纯度和浓度27-28
  • 3.2.4 改进方法提取的椭圆食粉螨DNA扩增28
  • 3.3 讨论28-30
  • 第4章 基于COI基因的粉螨系统发育研究30-53
  • 4.1 材料与方法30-33
  • 4.1.1 实验材料30-32
  • 4.1.2 DNA的提取32
  • 4.1.3 COI的PCR扩增32
  • 4.1.4 扩增产物的检测32
  • 4.1.5 PCR产物的纯化及目的片段序列的测定32
  • 4.1.6 数据处理与分析32-33
  • 4.1.7 系统发育分析33
  • 4.2 结果与分析33-48
  • 4.2.1 DNA提取、COI-PCR扩增及COI基因序列测定33-34
  • 4.2.2 椭圆食粉螨和腐食酪螨不同地理种群COI基因序列分析34-35
  • 4.2.3 粉螨亚目4科间系统发育研究35-41
  • 4.2.4 粉螨科5属间系统发育研究41-44
  • 4.2.5 粉螨属4种粉螨间系统发育研究44-48
  • 4.3 讨论48-53
  • 4.3.1 腐食酪螨不同地理种群COI基因序列比较分析48
  • 4.3.2 粉螨亚目4科间系统发育关系48-49
  • 4.3.3 粉螨科5属间系统发育关系49-50
  • 4.3.4 粉螨属4种粉螨间系统发育关系50-51
  • 4.3.5 形态特征和分子特征的比较51-53
  • 第5章 结论53-54
  • 致谢54-55
  • 参考文献55-59
  • 附录A 粉螨亚目12种粉螨和外群的COI基因部分序列排序图59-63
  • 附录B 粉螨部分种类COI基因测序荧光峰图63-67
  • 攻读学位期间的研究成果67

【参考文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 徐来祥,张知彬,宋铭晶,曹小平,王福生,张春光;福尔马林保存的动物标本基因组DNA的提取方法[J];动物学报;2002年02期
2 钟华,赖旭龙,魏荣平,刘中来;一种从大熊猫粪便中提取DNA的改进方法[J];动物学报;2003年05期
3 成新跃,周红章,张广学;分子生物学技术在昆虫系统学研究中的应用[J];动物分类学报;2000年02期
4 朴美花,陈学新,何俊华;膜翅目昆虫干标本的基因组DNA提取[J];动物分类学报;2002年04期
5 郑哲民,乔格侠;中国蝗总科昆虫科间系统发育关系支序分析(直翅目:蝗亚目)[J];动物分类学报;1998年03期
6 许升全,郑哲民;蝗总科昆虫雌性下生殖板及系统发育关系研究(直翅目)[J];昆虫分类学报;1999年02期
7 金道超;水螨群总科阶元系统发育的支序分析(蜱螨亚纲:水螨群)[J];昆虫学报;2000年03期
8 王备新,杨莲芳;线粒体DNA序列特点与昆虫系统学研究[J];昆虫知识;2002年02期
9 安瑞生,谭声江,陈晓峰;小型昆虫DNA提取时匀浆方法的改进[J];昆虫知识;2002年04期
10 温硕洋,何晓芳;一种适用于昆虫痕量DNA模板制备的方法[J];昆虫知识;2003年03期
中国硕士学位论文全文数据库 前2条
1 刘莹;两种人体蠕形螨超微结构和基因组提取的研究[D];山东大学;2005年
2 许睿;运用ISSR分子标记对腐食酪螨不同种群遗传多样性的研究[D];南昌大学;2007年
【共引文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 谢永芳,舒坤贤,梁亦龙,袁帅,张继承;小鼠胚胎发育中期肠细胞增殖与凋亡的研究[J];癌变.畸变.突变;2005年01期
2 王子良,许丽艳,李恩民;质粒制备和反应温度对嵌套缺失技术的影响[J];癌变.畸变.突变;2005年02期
3 康振桥;季艳霞;杨志勇;苏光;崔彦芝;;血管内皮生长因子亚型在人乳腺癌细胞中的表达差异[J];癌变.畸变.突变;2006年03期
4 安刚;黄天华;谢庆东;王德刚;;pCXN2-mIZUMO对C57BL/6小鼠生育能力的影响[J];癌变.畸变.突变;2007年04期
5 朱斌;杨罗艳;赵晓昆;;膀胱癌多药耐药基因MDR-1与金属硫蛋白-3表达的关系[J];癌变.畸变.突变;2007年05期
6 毕玉平,廖俊杰,单雷,王兴军,徐平丽;番茄双抗TMV和CMV基因工程的研究[J];山东农业科学;1997年06期
7 单雷,毕玉平,王兴军,徐平丽,李广存;双抗TMV和CMV转基因番茄后代的遗传分析[J];山东农业科学;1998年04期
8 葛宏华,孙莉宁,张其瑞;家蚕血淋巴蛋白的发育变化和BmLSP的纯化[J];安徽大学学报(自然科学版);2001年03期
9 李朝品;江佳佳;王慧勇;贺骥;;淮南储藏物粉螨防制研究[J];安徽大学学报(自然科学版);2006年01期
10 王北艳;曹宁;汤晖;;苜蓿中华根瘤菌电转条件的优化[J];安徽农学通报;2008年11期
中国重要会议论文全文数据库 前10条
1 王恩东;徐学农;雷仲仁;王静;吴圣勇;高玉林;;释放巴氏新小绥螨及与挂放诱虫板结合对大棚黄瓜上西方花蓟马种群的控制作用[A];植保科技创新与病虫防控专业化——中国植物保护学会2011年学术年会论文集[C];2011年
2 王春花;成军;郎振为;吴煜;杨艳杰;张黎颖;刘妍;;基因表达谱芯片技术筛选XTP3蛋白反式调节基因[A];第一届全国人工肝及血液净化学术年会暨全国人工肝及血液净化攻关协作组成立大会论文集[C];2004年
3 唐南洪;王晓茜;李秀金;陈燕凌;;构建特异高表达人谷氨酰胺合成酶基因(hGS)的肝细胞[A];第三届全国重型肝病及人工肝血液净化学术年会论文集(上册)[C];2007年
4 樊继德;孔庆国;张梅;于喜艳;;子房注射法获得转基因甜瓜植株[A];中国园艺学会第七届青年学术讨论会论文集[C];2006年
5 商庆龙;谷鸿喜;;HPV16 L1蛋白在大肠杆菌中的表达、纯化及免疫原性研究[A];庆祝黑龙江省免疫学会成立十周年(1993—2003)论文集[C];2003年
6 陈振文;赵太云;孙贺娟;路静;王迎;孟霞;曹争和;王钜;;微卫星DNA与生化标记分析对长爪沙鼠群体遗传分析的比较[A];中国实验动物学会第七届学术年会论文集[C];2006年
7 王革;王妍;何凌冰;乔刚;朱一松;王君艳;;酵母分泌表达重组人神经生长因子[A];山东省药学会2006年生化与生物技术药物学术研讨会论文集[C];2006年
8 任华;顾建华;孙竹筠;沈万赟;吴鹰;周忠良;;RT-PCR法检测斑马鱼(Danio rerio)卵黄蛋白原mRNA表达[A];2005年上海市动物学会学术会议论文集[C];2005年
9 马珺;陈云霜;王爱善;李仲逵;;珍稀鸟类东方鹳的性别鉴定[A];2005年上海市动物学会学术会议论文集[C];2005年
10 马勋;陆承平;;猪戊型肝炎病毒新疆分离株全基因序列的分析[A];中国科协2005年学术年会“新疆现代农业论坛”论文专集[C];2005年
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 刘永刚;基于微卫星DNA标记的马铃薯桃蚜不同种群遗传分化研究[D];甘肃农业大学;2010年
2 王敏晓;分子标记在中国近海浮游桡足类研究中的应用[D];中国科学院研究生院(海洋研究所);2010年
3 徐昭焕;中国麦长管蚜的种群分化[D];山东农业大学;2011年
4 尹淑艳;针叶小爪螨种内分化研究[D];山东农业大学;2011年
5 杨丽红;柑橘全爪螨Panonychus citri(McGregor)对热胁迫的响应机制研究[D];西南大学;2011年
6 袁明龙;柑橘全爪螨种群遗传结构及全线粒体基因组序列分析[D];西南大学;2011年
7 罗其花;中国小蜂螨自然种系构成、流行病学调查及寄生生物学研究[D];中国农业科学院;2011年
8 郑大睿;等钳蠊螨的生物学、生态学及其应用研究[D];中山大学;2011年
9 杜文兴;中国地方鹅种遗传资源多样性与分类地位的研究[D];南京农业大学;2011年
10 张健;吉林省天牛科昆虫分类学研究[D];东北师范大学;2011年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 胡佳;鲟形目部分种类基于线粒体COⅠ基因的分子进化研究[D];华中农业大学;2010年
2 陈冲;烟粉虱生物型鉴定、抗药性监测、杀虫剂的配方筛选及其增效生化机理研究[D];华中农业大学;2010年
3 万珊;柑橘粉虱对柑橘叶片挥发物的行为反应及其遗传分化研究[D];华中农业大学;2010年
4 印展;山东蝗虫分类研究[D];山东农业大学;2010年
5 贺丽敏;COⅠ和ITS2基因序列在蒲螨属分子鉴定中的应用研究[D];河北师范大学;2010年
6 王德明;基于16S rRNA和12S rRNA的叶蜂科昆虫分子系统学研究[D];中南林业科技大学;2010年
7 杨金玲;中国异蚤蝇属部分种类分子系统发育分析[D];沈阳大学;2011年
8 张媛;丽金龟科部分种类线粒体基因序列比较及在分子系统学研究中的作用[D];沈阳大学;2011年
9 孙娜;金龟子Cyt b、CO Ⅰ序列比较及在分子系统学研究中的作用[D];沈阳大学;2010年
10 赵利伟;白蛾周氏啮小蜂繁育特性及遗传多态性研究[D];沈阳农业大学;2010年
【二级参考文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 徐来祥,朱圣庚;小鼠4.5S RNA逆转座子对Luc基因表达的影响[J];动物学报;2000年03期
2 李明,魏辅文,饶刚,方盛国,冯祚建;非损伤性取样法在保护遗传学研究中的应用[J];动物学报;2001年03期
3 王义权,周开亚,徐珞珊,徐国钧;不同固定剂保存动物组织标本对RAPD反应的影响[J];动物学杂志;1999年01期
4 陈燕茹,许秀华,赵中明,张文霞,戴灼华;Drosophila immigrans果蝇随机扩增DNA多态性初步分析[J];北京大学学报(自然科学版);1997年02期
5 张立荣,徐大庆,刘大群;SSR和ISSR分子标记及其在植物遗传育种研究中的应用[J];河北农业大学学报;2002年01期
6 谢禾秀,刘素兰,徐业华,徐荫祺;蠕形螨的分类和一新亚种(蜱螨目:蠕形螨科)[J];动物分类学报;1982年03期
7 成新跃,周红章,张广学;分子生物学技术在昆虫系统学研究中的应用[J];动物分类学报;2000年02期
8 张爱环,李云瑞;中国华皱皮螨属一新种(蜱螨亚纲:粉螨科)[J];动物分类学报;2002年03期
9 张亚平,施立明;动物线粒体DNA多态性的研究概况[J];动物学研究;1992年03期
10 王文,施立明;一种改进的动物线粒体DNA提取方法[J];动物学研究;1993年02期
【相似文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 解萌;侯清柏;梁醒财;;卷象科昆虫无损形态的DNA提取方法[J];昆虫知识;2008年03期
2 郭建军;张平;;急流水螨科、属(亚属)系统发育关系分析[J];西南大学学报(自然科学版);2011年02期
3 郑俊娟;林琦;何培新;贺新生;;中国垂幕菇属新记录种——瘤核垂幕菇的形态学鉴定及ITS系统发育分析[J];菌物研究;2011年01期
4 王俊峰;陈红漫;尚宏丽;阚国仕;;耐高温海藻糖合酶产生菌鉴定及生长特性研究[J];生物技术;2007年02期
5 张合彩;陈广文;孙健;刘德增;;三肠亚目(扁形动物门:涡虫纲:序列目)涡虫系统发育研究进展[J];河南师范大学学报(自然科学版);2009年02期
6 郑晨娜;金春英;方柏山;;高产黑色素放线菌G-HD-4的分离及鉴定[J];食品科学;2009年11期
7 杨胜远;韦锦;李云;姚虹;黄月丹;;一株产抗菌活性物质解淀粉芽孢杆菌的筛选及鉴定[J];食品科学;2010年21期
8 张永强;王宁;詹祥江;张正旺;;一种从雉类孵化卵壳中提取DNA的方法[J];动物学杂志;2006年06期
9 江红;林如;张慧;谢阳;;一株来源于海洋的抗肿瘤放线菌的分离鉴定[J];微生物学通报;2009年03期
10 袁献温;杨瑞丽;;一株具有抗肿瘤活性的海洋放线菌的分离和鉴定[J];微生物学通报;2009年01期
中国重要会议论文全文数据库 前10条
1 聂玲玲;宋宏;唐峻;姚方杰;;榆耳研究概况[A];第八届海峡两岸菌物学学术研讨会论文集[C];2007年
2 卫功庆;温铁峰;刘忠军;邹兴淮;;圈养条件对成年东北林蛙形态及生产性能的影响[A];中国动物学会两栖爬行动物学分会2005年学术研讨会暨会员代表大会论文集[C];2005年
3 陈连根;鞠瑞亭;曹宏伟;秦俊;;文殊兰夜蛾生物学特性研究[A];农业生物灾害预防与控制研究[C];2005年
4 陈连根;王祝英;;上海棒蝠蛾属一新记录(鳞翅目:蝙蝠蛾科)[A];科技创新与绿色植保——中国植物保护学会2006学术年会论文集[C];2006年
5 潘晓洁;常锋毅;康丽娟;李小燕;李根保;刘永定;沈银武;;滇池和洱海鱼腥藻的形态特征和16S rRNA基因分析[A];中国海洋湖沼学会藻类学分会第七届会员大会暨第十四次学术讨论会论文摘要集[C];2007年
6 崇桂琴;;强直性脊柱炎的体质辩证分析[A];中医体质判定标准研究——2006中华中医药学会第四届全国中医体质学术研讨会论文集[C];2006年
7 彭立新;王明启;;榛属植物花粉的形态[A];中国园艺学会首届青年学术讨论会论文集[C];1994年
8 靳二辉;彭克美;唐丽;位兰;王岩;李升和;宋卉;杜安娜;王家乡;;泰和乌鸡脑桥六个神经核团的细胞构筑[A];中国畜牧兽医学会动物解剖学及组织胚胎学分会第十四次学术研讨会论文集[C];2006年
9 刘晓君;张琼华;姚霜;;昆明地区恒牙初期安Ⅱ~2错患者X线颅颌形态特征的研究[A];第五次全国口腔正畸学术会议论文汇编[C];1997年
10 王朝阳;;“生态杀手”黄顶菊的发生危害与治理对策[A];河南省植物保护研究进展Ⅱ(下)[C];2007年
中国重要报纸全文数据库 前10条
1 市农广校;我市主要地下害虫形态特征与防治方法[N];通辽日报;2006年
2 肖庆丰;滑坡的形态特征及分类[N];中国水利报;2008年
3 陈文霞;标样种子的安全贮藏技术[N];山西科技报;2007年
4 周贵银;大牛股的形态特征[N];上海证券报;2006年
5 ;中医药发展的形态特征 科学?文化[N];中国中医药报;2001年
6 周兆山;大鱼际掌纹形态特征与哮喘的相关性研究[N];中国中医药报;2005年
7 张勋;墙体裂缝的生成原因及其形态特征[N];伊犁日报(汉);2007年
8 张荔子;消毒和DNA提取正在进行[N];健康报;2005年
9 陈思行;金丝鱼的原产地及形态特征[N];东方城乡报;2006年
10 ;形态特征与生活条件[N];山东科技报;2001年
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 顾泽茂;鱼类锥虫分类与系统发育研究[D];中国科学院研究生院(水生生物研究所);2007年
2 刘丽;中国青藓科(Brachytheciaceae)植物分子系统学研究[D];华东师范大学;2007年
3 王旭丽;中国苹果树腐烂病菌的种类:rDNA-ITS序列和表型比较研究[D];西北农林科技大学;2007年
4 朱威;中国蚤蝇科系统发育研究(双翅目)[D];沈阳农业大学;2008年
5 陈卫民;西北干旱半干旱地区骆驼刺、黄芪及外来物种—刺槐根瘤菌多样性和系统发育研究[D];西北农林科技大学;2009年
6 严学兵;披碱草属植物遗传多样性研究[D];中国农业大学;2005年
7 韩瑾;当代中国古典舞教学体系的构建与发展[D];中国艺术研究院;2006年
8 王桂芝;中国华北地区东方蜜蜂多样性及其分类研究[D];山东农业大学;2007年
9 韩如旸;石油降解细菌的表型特性和系统发育分析[D];浙江大学;2002年
10 袁崇喜;辽宁义县早白垩世萨比鸟类的再研究[D];中国地质大学(北京);2005年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 吴太葆;基于形态特征和COI基因的粉螨重要类群系统发育研究(蜱螨亚纲:粉螨亚目)[D];南昌大学;2007年
2 高艳;寄生蜂形态特征和28SrDNA序列与系统发育关系的初步研究[D];河南农业大学;2003年
3 李献;微生物脱氮除硫(S~(2-))的研究[D];广西大学;2005年
4 杨静;基于分形理论的图像压缩编码研究[D];重庆大学;2005年
5 薛焱;不同居群及株系盾叶薯蓣的形态、生理特性研究[D];华中农业大学;2005年
6 王汝毅;根癌农杆菌介导红曲霉转化库的构建及转化子性质研究[D];华中农业大学;2005年
7 王赫;黄花苜蓿幼苗抗旱性及遗传多样性研究[D];东北师范大学;2006年
8 金玉花;砾石球生物接触氧化反应器中微生物群落结构及主要功能[D];东北师范大学;2006年
9 王莹;海洋抗菌活性物质产生菌的筛选及系统分类研究[D];浙江大学;2006年
10 彭秀;淹水胁迫对中华蚊母形态特征及生理生化特性影响的研究[D];四川农业大学;2006年
 快捷付款方式  订购知网充值卡  订购热线  帮助中心
  • 400-819-9993
  • 010-62791813
  • 010-62985026