基于形态特征和COI基因的粉螨重要类群系统发育研究(蜱螨亚纲:粉螨亚目)
【摘要】:
本论文基于粉螨形态特征与COI基因部分序列对粉螨重要类群的系统发育关系进行了探讨,主要结论如下:
1.基于粉螨55个形态特征的支序分析表明,粉螨亚目4科间关系为:麦食螨科+[粉螨科+(食甜螨科+嗜渣螨科)],麦食螨科与其它3科的亲缘关系较远。粉螨科5属间关系为:[(食粉螨属+食酪螨属)+粉螨属]+(嗜木螨属+皱皮螨属)。粉螨属4种间关系为:(粗脚粉螨+小粗脚粉螨)+(静粉螨+薄粉螨)。
2.对粉螨DNA提取的传统酚/氯仿抽提法进行了改进,改进的方法只采用20只粉螨,可简便快速地提取粉螨DNA。
3.测定的椭圆食粉螨3个不同地理种群间COI基因部分序列完全一致,腐食酪螨3个不同地理种群间COI基因部分序列也完全一致,未发现地理差异。
4.以粒形硬蜱和卵形硬蜱作为外群,基于COI部分序列构建粉螨的分子树,粉螨亚目4科间NJ树和MP树存在差别:(粉螨科+食甜螨科)+(麦食螨科+嗜渣螨科)(NJ树);[(粉螨科+麦食螨科)+嗜渣螨科]+食甜螨科)(MP树)。粉螨科5属间关系为:{[(食酪螨属+食粉螨属)+嗜木螨属]+粉螨属}+皱皮螨属。粉螨属4种间关系为:[(小粗脚粉螨+静粉螨)+薄粉螨]+粗脚粉螨。
5.结合形态树和分子树综合分析显示:粉螨亚目4科间形态树与分子树存在差别,COI基因在解决粉螨科间关系时应谨慎使用。形态树与分子树均表明,食粉螨属和食酪螨属亲缘关系较近,皱皮螨属独立为一支,与其它属亲缘关系较远,支持OConnor(1982)的粉螨分类系统,将皱皮螨属提升至皱皮螨科Suidasiidae。小粗脚粉螨和静粉螨亲缘关系较近,COI基因能较好地解决粉螨属内种间低级阶元的系统发育关系。
【关键词】:粉螨 DNA提取 COI基因 形态特征 系统发育 支序分析 【学位授予单位】:南昌大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2007
【分类号】:Q96
【目录】:
- 摘要3-4
- ABSTRACT4-8
- 第1章 前言8-16
- 1.1 粉螨分类学研究现状8-10
- 1.2 蜱螨的分子系统学研究概况10-14
- 1.2.1 分子系统学以及研究方法10-12
- 1.2.2 线粒体DNA在蜱螨分子系统学研究中的应用概况12-13
- 1.2.3 线粒体DNA COI基因在蜱螨分子系统学研究中的应用13-14
- 1.3 粉螨的系统发育研究概况14-15
- 1.4 研究的目的和意义15-16
- 第2章 基于形态特征的粉螨系统发育支序分析16-23
- 2.1 材料与方法16-18
- 2.1.1 材料采集和标本制作16-17
- 2.1.2 性状特征和特征分析17-18
- 2.2 结果与分析18-21
- 2.2.1 性状特征18-19
- 2.2.2 支序分析19-21
- 2.3 讨论21-23
- 第3章 粉螨DNA提取方法的改进23-30
- 3.1 材料与方法23-26
- 3.1.1 主要仪器和设备23-24
- 3.1.2 主要试剂及试剂的配制24
- 3.1.3 供试粉螨24
- 3.1.4 传统的酚/氯仿抽提法24-25
- 3.1.5 改进的方法25
- 3.1.6 DNA的琼脂糖凝胶电泳检测25
- 3.1.7 DNA的纯度及浓度检验25
- 3.1.8 改进方法提取的DNA的PCR扩增25-26
- 3.2 结果与分析26-28
- 3.2.1 改进方法提取椭圆食粉螨DNA最适宜样品数的确定26
- 3.2.2 两种方法提取的椭圆食粉螨DNA的电泳结果26-27
- 3.2.3 两种方法提取的椭圆食粉螨DNA的纯度和浓度27-28
- 3.2.4 改进方法提取的椭圆食粉螨DNA扩增28
- 3.3 讨论28-30
- 第4章 基于COI基因的粉螨系统发育研究30-53
- 4.1 材料与方法30-33
- 4.1.1 实验材料30-32
- 4.1.2 DNA的提取32
- 4.1.3 COI的PCR扩增32
- 4.1.4 扩增产物的检测32
- 4.1.5 PCR产物的纯化及目的片段序列的测定32
- 4.1.6 数据处理与分析32-33
- 4.1.7 系统发育分析33
- 4.2 结果与分析33-48
- 4.2.1 DNA提取、COI-PCR扩增及COI基因序列测定33-34
- 4.2.2 椭圆食粉螨和腐食酪螨不同地理种群COI基因序列分析34-35
- 4.2.3 粉螨亚目4科间系统发育研究35-41
- 4.2.4 粉螨科5属间系统发育研究41-44
- 4.2.5 粉螨属4种粉螨间系统发育研究44-48
- 4.3 讨论48-53
- 4.3.1 腐食酪螨不同地理种群COI基因序列比较分析48
- 4.3.2 粉螨亚目4科间系统发育关系48-49
- 4.3.3 粉螨科5属间系统发育关系49-50
- 4.3.4 粉螨属4种粉螨间系统发育关系50-51
- 4.3.5 形态特征和分子特征的比较51-53
- 第5章 结论53-54
- 致谢54-55
- 参考文献55-59
- 附录A 粉螨亚目12种粉螨和外群的COI基因部分序列排序图59-63
- 附录B 粉螨部分种类COI基因测序荧光峰图63-67
- 攻读学位期间的研究成果67
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| 1 |
徐来祥,张知彬,宋铭晶,曹小平,王福生,张春光;福尔马林保存的动物标本基因组DNA的提取方法[J];动物学报;2002年02期 |
| 2 |
钟华,赖旭龙,魏荣平,刘中来;一种从大熊猫粪便中提取DNA的改进方法[J];动物学报;2003年05期 |
| 3 |
成新跃,周红章,张广学;分子生物学技术在昆虫系统学研究中的应用[J];动物分类学报;2000年02期 |
| 4 |
朴美花,陈学新,何俊华;膜翅目昆虫干标本的基因组DNA提取[J];动物分类学报;2002年04期 |
| 5 |
郑哲民,乔格侠;中国蝗总科昆虫科间系统发育关系支序分析(直翅目:蝗亚目)[J];动物分类学报;1998年03期 |
| 6 |
许升全,郑哲民;蝗总科昆虫雌性下生殖板及系统发育关系研究(直翅目)[J];昆虫分类学报;1999年02期 |
| 7 |
金道超;水螨群总科阶元系统发育的支序分析(蜱螨亚纲:水螨群)[J];昆虫学报;2000年03期 |
| 8 |
王备新,杨莲芳;线粒体DNA序列特点与昆虫系统学研究[J];昆虫知识;2002年02期 |
| 9 |
安瑞生,谭声江,陈晓峰;小型昆虫DNA提取时匀浆方法的改进[J];昆虫知识;2002年04期 |
| 10 |
温硕洋,何晓芳;一种适用于昆虫痕量DNA模板制备的方法[J];昆虫知识;2003年03期 |
|
|
|
|
|
| 1 |
谢永芳,舒坤贤,梁亦龙,袁帅,张继承;小鼠胚胎发育中期肠细胞增殖与凋亡的研究[J];癌变.畸变.突变;2005年01期 |
| 2 |
王子良,许丽艳,李恩民;质粒制备和反应温度对嵌套缺失技术的影响[J];癌变.畸变.突变;2005年02期 |
| 3 |
康振桥;季艳霞;杨志勇;苏光;崔彦芝;;血管内皮生长因子亚型在人乳腺癌细胞中的表达差异[J];癌变.畸变.突变;2006年03期 |
| 4 |
安刚;黄天华;谢庆东;王德刚;;pCXN2-mIZUMO对C57BL/6小鼠生育能力的影响[J];癌变.畸变.突变;2007年04期 |
| 5 |
朱斌;杨罗艳;赵晓昆;;膀胱癌多药耐药基因MDR-1与金属硫蛋白-3表达的关系[J];癌变.畸变.突变;2007年05期 |
| 6 |
毕玉平,廖俊杰,单雷,王兴军,徐平丽;番茄双抗TMV和CMV基因工程的研究[J];山东农业科学;1997年06期 |
| 7 |
单雷,毕玉平,王兴军,徐平丽,李广存;双抗TMV和CMV转基因番茄后代的遗传分析[J];山东农业科学;1998年04期 |
| 8 |
葛宏华,孙莉宁,张其瑞;家蚕血淋巴蛋白的发育变化和BmLSP的纯化[J];安徽大学学报(自然科学版);2001年03期 |
| 9 |
李朝品;江佳佳;王慧勇;贺骥;;淮南储藏物粉螨防制研究[J];安徽大学学报(自然科学版);2006年01期 |
| 10 |
王北艳;曹宁;汤晖;;苜蓿中华根瘤菌电转条件的优化[J];安徽农学通报;2008年11期 |
|
|
|
|
|
| 1 |
徐来祥,朱圣庚;小鼠4.5S RNA逆转座子对Luc基因表达的影响[J];动物学报;2000年03期 |
| 2 |
李明,魏辅文,饶刚,方盛国,冯祚建;非损伤性取样法在保护遗传学研究中的应用[J];动物学报;2001年03期 |
| 3 |
王义权,周开亚,徐珞珊,徐国钧;不同固定剂保存动物组织标本对RAPD反应的影响[J];动物学杂志;1999年01期 |
| 4 |
陈燕茹,许秀华,赵中明,张文霞,戴灼华;Drosophila immigrans果蝇随机扩增DNA多态性初步分析[J];北京大学学报(自然科学版);1997年02期 |
| 5 |
张立荣,徐大庆,刘大群;SSR和ISSR分子标记及其在植物遗传育种研究中的应用[J];河北农业大学学报;2002年01期 |
| 6 |
谢禾秀,刘素兰,徐业华,徐荫祺;蠕形螨的分类和一新亚种(蜱螨目:蠕形螨科)[J];动物分类学报;1982年03期 |
| 7 |
成新跃,周红章,张广学;分子生物学技术在昆虫系统学研究中的应用[J];动物分类学报;2000年02期 |
| 8 |
张爱环,李云瑞;中国华皱皮螨属一新种(蜱螨亚纲:粉螨科)[J];动物分类学报;2002年03期 |
| 9 |
张亚平,施立明;动物线粒体DNA多态性的研究概况[J];动物学研究;1992年03期 |
| 10 |
王文,施立明;一种改进的动物线粒体DNA提取方法[J];动物学研究;1993年02期 |
|