油松种群遗传多样性与环境相关性研究
【摘要】:本文采用ISSR分子标记技术,研究了河北承德大窝铺林场不同群落类型4个油松天然种群,和河北承德大窝铺林场、河南伏牛山宝天曼自然保护区、甘肃冶力关国家森林公园、宁夏贺兰山自然保护区、辽宁医巫闾山自然保护区、山东蒙山国家森林公园、山西太岳灵空山、陕西黄龙山蔡家川林场8个地区的油松天然种群的遗传多样性与种群分化;利用SPSS17.0等软件对影响其变异与分化的生物和非生物因子进行相关分析,探讨了油松对不同环境因子的适应机制。主要研究结果如下:
(1)采用改良的CTAB-free法加入较高含量的PVP去除多糖和其他次生代谢物,可以消除各种不同干扰物质对DNA提取的影响;利用氯仿:异戊醇(V:V=24:1)抽提2~3次,能够获得高质量的油松基因组DNA,满足后续试验要求。
(2)采用正交试验方法对影响油松ISSR-PCR反应体系的5个主要因素进行4水平的优化试验,建立最优反应体系如下:模板50~60ng;Mg2+ 2.5 mmol/L;4×dNTP 0.25 mmol/L;引物0.4μmol/L;Taq酶1U。根据最优体系筛选出13条扩增稳定、多态性丰富的引物,通过梯度PCR确定引物的退火温度,得到油松ISSR-PCR反应的最佳扩增程序:94℃预变性5min;94℃变性30s,53℃退火45s,72℃延伸2min,35个循环;72℃延伸7min。
(3)13条引物对承德大窝铺林场4个群落类型油松种群检测到180个位点,多态位点百分率(P)91.11%, Nei多样性指数(H)0.277 8,Shannon信息指数(I)0.424 9。混交林种群遗传多样性较纯林种群丰富。
(4)承德4个群落类型油松种群间遗传变异主要来自种群内部,遗传分化系数(Gst)为0.247 8。4个种群间基因流Nm为1.517 4,基因流可以发挥均质化作用,降低局部变异。种群Nei多样性指数和Shannon信息指数与林下灌木的Shannon-Wiener多样性指数呈极显著正相关,与Simpson多样性指数显著正相关,与林下草本均匀度极显著负相关。群落类型强烈影响着油松种群的多态位点比率,群落的复杂程度与油松种群的遗传多样性显著相关。
(5)13条引物对8个地区油松天然种群的样品进行PCR扩增,多态位点百分率(P)达90%以上, Nei多样性指数(H)分别为0.280 9、0.314 1,Shannon信息指数(I)分别为0.425 4、0.471 7。甘肃、宁夏、辽宁种群遗传多样性较低。
(6)8个地区天然油松种群间遗传变异主要来自种群内部。河北—河南—甘肃—宁夏试验组种群遗传分化系数Gst为0.268 9,基因流Nm为1.359 1,基因交流水平较低;辽宁—山东—山西—陕西试验组种群间遗传分化系数Gst为0.351 4,基因流Nm为0.922 7,种群发生了强烈的分化。UPGMA聚类分析表明生态型相近的地理种群首先聚类,种群遗传距离的与地理距离间无明显相关性。
(7)两试验组表现出对不同土壤因子的相关性,对不同气候因子表现为相反的相关关系,不同地域油松种群对各分布区土壤、气候因子从遗传上表现出不同的适应机制。
【关键词】:油松 遗传多样性 遗传分化 生态因子 相关性 【学位授予单位】:河北农业大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2011
【分类号】:S791.254
【目录】:
- 摘要4-5
- Abstract5-9
- 1 引言9-15
- 1.1 分子生态学与遗传多样性9
- 1.2 植物遗传多样性研究方法9-10
- 1.3 遗传多样性与环境相关性10-12
- 1.4 油松概况12-14
- 1.4.1 油松的地理分布12-13
- 1.4.2 油松的生物学特性13-14
- 1.5 本研究的目的和意义14-15
- 2 材料与方法15-24
- 2.1 研究地区自然概况15-18
- 2.1.1 河北承德大窝铺林场15-16
- 2.1.2 河南伏牛山宝天曼自然保护区16
- 2.1.3 甘肃冶力关森林公园16
- 2.1.4 宁夏贺兰山自然保护区苏峪口站16-17
- 2.1.5 辽宁医巫闾山国家自然保护区17
- 2.1.6 山东蒙山国家森林公园17
- 2.1.7 山西太岳灵空山17-18
- 2.1.8 陕西黄龙山蔡家川林场18
- 2.2 试验材料及仪器18-20
- 2.2.1 植物材料18-19
- 2.2.2 主要试剂19-20
- 2.2.3 主要仪器20
- 2.3 试验及分析方法20-24
- 2.3.1 油松基因组DNA 的提取20-21
- 2.3.2 ISSR-PCR 反应体系及程序的建立与优化21-22
- 2.3.3 ISSR 数据的统计分析22
- 2.3.4 生态环境因子的测定22-23
- 2.3.5 相关分析23-24
- 3 结果与分析24-39
- 3.1 油松基因组 DNA 提取24-25
- 3.2 油松ISSR-PCR 反应体系的建立25-26
- 3.2.1 正交试验的直观分析25
- 3.2.2 引物的筛选及退火温度的确定25-26
- 3.3 不同群落类型下油松的遗传多样性与种群分化26-29
- 3.3.1 不同群落类型油松种群的多态位点分析27
- 3.3.2 不同群落类型油松种群的遗传多样性27
- 3.3.3 不同群落类型油松种群的遗传分化27-28
- 3.3.4 不同群落类型油松种群遗传多样性与生物因子相关性分析28-29
- 3.4 不同地理区域油松的遗传多样性与种群分化29-34
- 3.4.1 不同地理区域油松的多态位点分析29-30
- 3.4.2 不同地理区域油松的遗传多样性30-31
- 3.4.3 不同地理区域油松的遗传分化31-32
- 3.4.4 不同地理区域油松种群间遗传一致度与遗传距离32-33
- 3.4.5 不同地理区域油松种群间遗传关系的聚类分析33-34
- 3.5 不同地理区域油松种群遗传多样性与气候土壤因子的相关分析34-39
- 4 讨论39-46
- 4.1 油松基因组 DNA 提取39
- 4.2 油松ISSR-PCR 最优反应体系的建立39-40
- 4.3 油松天然种群遗传多样性与遗传分化40-43
- 4.3.1 遗传多样性40-41
- 4.3.1.1 不同群落类型油松种群遗传多样性40
- 4.3.1.2 不同地域油松种群遗传多样性40-41
- 4.3.2 遗传分化与基因流41-42
- 4.3.2.1 不同群落类型油松种群遗传分化与基因流41-42
- 4.3.2.2 不同地域油松种群遗传分化与基因流42
- 4.3.3 遗传距离与地理分布关系42-43
- 4.4 油松天然种群遗传多样性与环境适应性43-45
- 4.4.1 群落类型影响下油松的遗传多样性43-44
- 4.4.2 气候条件对油松遗传多样性的影响44
- 4.4.3 土壤条件对油松遗传多样性的影响44-45
- 4.5 本研究的创新、不足及今后努力方向45-46
- 5 结论46-47
- 参考文献47-55
- 附录A55-58
- 在读期间发表的论文58-59
- 作者简历59-60
- 致谢60-61
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