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《河北农业大学》 2002年
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棉花黄萎病菌基因组ISSR分子指纹分析

姜占发  
【摘要】: ISSR(Inter Simple Sequence Repeat)分子标记技术是近年来发展起来的一种新的分子生物学技术,目前主要应用于高等哺乳动物和植物的各领域的研究。本研究利用这种分子标记技术对来自我国12省、市、自治区及美国的共28株不同致病力的大丽轮枝菌进行了分子指纹分析,主要结果如下: 1.建立了稳定的具有广泛适用性的ISSR-PCR分析的反应体系及反应程序。研究以28份大丽轮枝菌基因组DNA为模板,对ISSR反应程序中的一些重要参数进行了摸索和优化试验,建立了一套应用体系和应用程序。本研究反应体系及反应程序为:25μl体系中含有1×Buffer(KCl 10mM、(NH_4)_2SO_4,8mM、10mM Tris-HCl(pH9.0)、NP-40)、2.0mM Mg~(2+)、200μMdNTP、ISSR-Primer 0.2μM、20ng模板DNA、1.5UTaqDNA聚合酶。反应程序为第一个循环:94℃3min、退火温度1min、72℃延伸1.5min,后35个循环为94℃30sec,退火温度1.5min,72℃延伸1.5min,最后一个循环完成后,在72℃延伸7min,然后在4℃保温。 2.本实验证明在真菌大丽轮枝菌中ISSR(inter simple sequence repeat)是普遍存在的。 3.从加拿大购进的Set#9的100个引物中筛选出14个具有高度多态性的ISSR引物。用14个ISSR引物在标准值为10以下时将28个菌系分为两个类群:ISG1,ISG2;在标准值为6以下时,将28个菌系分为7个亚群:SISG1,SISG2,SISG3,SISG4,SISG5,SISG6,SISG7。结果表明,ISSR多态性与致病能力强弱有关,说明致病能力的强弱可能是由位于重复序列之间的基因决定的;另外,亲缘关系及致病力与地理来源未表现出相关性。
【学位授予单位】:河北农业大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2002
【分类号】:S432.4

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【引证文献】
中国期刊全文数据库 前5条
1 袁庆华;张君艳;;苜蓿假盘菌ISSR反应体系优化及指纹图谱构建[J];草地学报;2008年01期
2 赵艳;洪坚平;张晓波;;胶质芽孢杆菌遗传多样性ISSR分析[J];草地学报;2010年02期
3 王兴龙;金则新;李钧敏;徐兴利;;接骨草ISSR扩增条件优化[J];江苏农业科学;2012年04期
4 张玉星;马艳芝;赵国芳;;梨属植物ISSR技术体系的建立与优化[J];中国农学通报;2011年06期
5 徐玉梅;刘小妹;王建明;;ISSR标记技术在植物病原真菌研究中的应用[J];中国农学通报;2011年09期
中国博士学位论文全文数据库 前2条
1 迟文娟;东北小麦白粉病菌群体遗传结构与分子检测技术研究[D];沈阳农业大学;2009年
2 朱荷琴;我国棉花黄萎病菌的致病力分化及致病相关基因的克隆与分析[D];西北农林科技大学;2013年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 尹志新;我国棉花黄萎病菌遗传多样性分析[D];中国农业科学院;2011年
2 李亚红;豫、鄂、渝三省(市)小麦白粉菌群体遗传结构研究[D];河南农业大学;2011年
3 刘艳军;棉花黄萎病菌系基于AFLP的遗传分化研究[D];河北农业大学;2003年
4 张君艳;不同地区苜蓿假盘菌培养性状研究和ISSR分子指纹分析[D];甘肃农业大学;2006年
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6 马鸿文;苜蓿假盘菌产孢生物学特性和致病力分化及ISSR标记研究[D];甘肃农业大学;2007年
7 孟芳;紫花苜蓿抗褐斑病基因的ISSR和SCAR标记研究[D];北京林业大学;2008年
8 李丹;甘肃省中西部地区镰孢菌的分类研究[D];甘肃农业大学;2008年
9 刘艳玲;黄瓜霜霉菌卵孢子形成和rDNA-ITS序列分析[D];东北农业大学;2009年
10 赵贵元;转基因抗虫棉黄萎病发生模式和黄萎病菌遗传分化[D];河北农业大学;2010年
【参考文献】
中国期刊全文数据库 前10条
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5 马峙英,王省芬,张桂寅,李兴红,刘叔倩,吴立强,刘占国,孙济中,刘金兰;河北省棉花黄萎病菌致病性的研究[J];棉花学报;1997年01期
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8 章元寿,王建新,顾本康,李经仪,朱月英;用棉花黄萎病菌毒素快速检测棉花抗病性研究初报[J];南京农业大学学报;1991年01期
9 崔星明,吴畏,杨竹平;植物抗真菌和细菌病害基因工程育种策略[J];上海农业学报;1999年02期
10 李仕贵,王玉平,黎汉云,周开达,朱立煌;利用微卫星标记鉴定水稻的稻瘟病抗性[J];生物工程学报;2000年03期
【共引文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 郑敏;树立“两自”观念 注重课堂实践[J];安徽教育学院学报;2001年03期
2 周玉;赵鸣;马惠;夏晓明;;不同级别黄萎病对棉花主要产量性状的影响[J];山东农业科学;2008年09期
3 陈新;张士刚;魏海蓉;宗晓娟;王甲威;刘庆忠;;陕西核桃实生居群遗传多样性ISSR分析[J];山东农业科学;2012年05期
4 凌琪,王敏;大肠杆菌革兰氏染色影响因素分析[J];安徽建筑工业学院学报(自然科学版);2003年04期
5 陈凌云;刁英;杨新笋;胡中立;;DNA分子标记技术在甘薯遗传育种研究中的应用[J];安徽农学通报;2006年09期
6 陈德西;李仕贵;马炳田;向运佳;彭云良;;水稻抗稻瘟病育种研究进展[J];安徽农学通报;2008年17期
7 罗海燕;陈业渊;;ISSR分子标记及其应用[J];安徽农学通报;2008年19期
8 朴红梅;张英;李万良;穆楠;尹航;王玉民;;利用ISSR标记研究吉林省水稻品种的亲源关系[J];安徽农学通报;2008年19期
9 赵跃光;;分子水平上的微生物研究技术与方法进展[J];安徽农学通报(上半月刊);2009年17期
10 霍雨艳;田志宏;;SSR标记在水稻研究中的应用概况[J];安徽农学通报(上半月刊);2010年23期
中国重要会议论文全文数据库 前10条
1 李娜;黄建昌;廖飞雄;;中小花型蝴蝶兰DNA的提取和RAPD反应体系的建立[A];中国观赏园艺研究进展2011[C];2011年
2 刘振;赵洋;杨培迪;成杨;杨阳;;茶树SRAP反应体系优化及引物筛选[A];科技创新 转型升级 做大做强湖南特色茶叶——湖南省茶叶学会2011年学术年会论文集[C];2011年
3 方清茂;崔光红;黄璐琦;张美;周先建;;栽培与野生何首乌种质资源遗传多样性的ISSR分析[A];中药饮片质量分析与中药鉴别技术交流研讨会论文集[C];2009年
4 钟建兴;方民杰;;菊黄东方鲀、双斑东方鲀及其种间杂交子代的ISSR分析[A];中国南方十六省(市、区)水产学会渔业学术论坛第二十六次学术交流大会论文集(上册)[C];2010年
5 倪中福;张义荣;梁荣奇;刘广田;孙其信;;分子标记与小麦遗传多样性评价研究[A];21世纪作物科技与生产发展学术讨论会论文集[C];2002年
6 刘庆昌;翟红;王玉萍;;甘薯细胞工程与分子育种的研究现状[A];2003年全国作物遗传育种学术研讨会论文集[C];2003年
7 刘庆昌;翟红;王玉萍;;甘薯细胞工程与分子育种研究进展[A];中国作物学会2005年学术年会论文集[C];2005年
8 刘永建;黄玉碧;潘光堂;荣廷昭;;CIMMYT玉米“Pob.43-C11”改良群体的遗传多样性(英文)[A];2005年全国作物遗传育种学术研讨会暨中国作物学会分子育种分会成立大会论文集(一)[C];2005年
9 刘传光;江奕君;毛兴学;高云;刘军;林青山;李晓芳;;水稻与玉米远缘杂交改良籼稻温敏两用核不育系的SSR分析[A];2005年全国作物遗传育种学术研讨会暨中国作物学会分子育种分会成立大会论文集(一)[C];2005年
10 王英;庄南生;高和琼;黄东益;;甘蔗种质遗传基础的ISSR分析[A];中国作物学会2007年全国作物遗传育种学术研讨会论文集[C];2007年
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 林荔辉;应用分子和常规技术通过籼粳交选育亲籼型水稻雄性不育系[D];福建农林大学;2010年
2 何小勇;翅荚木种源遗传多样性及其抗低温胁迫能力研究[D];中南林业科技大学;2007年
3 唐丽;湖南南天竹遗传多样性及园林利用评价体系研究[D];中南林业科技大学;2007年
4 邱桔;城市生态风险评价研究[D];中南林业科技大学;2006年
5 闫小玲;基于cpDNA单倍型和SSR分析的银杏群体遗传结构和谱系地理学研究[D];浙江大学;2010年
6 叶华;大黄鱼SSR遗传连锁图谱的构建及生长相关性状的QTL定位[D];湖南农业大学;2010年
7 刘凤楼;大麦成株叶锈病抗性基因的发掘、分子标记及遗传研究[D];西北农林科技大学;2010年
8 曾兴权;小麦抗条锈病种质的鉴定及其抗性相关基因的差异表达和克隆[D];西北农林科技大学;2010年
9 荣立苹;东北地区野生百合种质资源及遗传多样性研究[D];沈阳农业大学;2010年
10 王丽丽;大白菜核基因雄性不育系定向转育及分子标记辅助育种研究[D];沈阳农业大学;2010年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 杨丹;湖北省油菜菌核病病菌多样性研究[D];华中农业大学;2010年
2 刘敏;基于SSR、ISSR和RAPD对大豆疫霉菌的遗传多样性研究[D];华中农业大学;2010年
3 潘慧;杏鲍菇优良杂交子的初步选育[D];华中农业大学;2010年
4 王瑞文;紫薇开花生物学特性及杂交育种的初步研究[D];华中农业大学;2010年
5 罗杨;柑橘变异材料的遗传鉴定与品质分析[D];华中农业大学;2010年
6 董巍;分子标记辅助选择改良光温敏核不育系的稻瘟病抗性和稻瘟病抗性基因的初步定位[D];华中农业大学;2010年
7 吴茜;中国香菇自然种质遗传多样性SRAP和IGS2分析[D];华中农业大学;2010年
8 史认辉;棉花抗黄萎病鉴定技术研究[D];华中农业大学;2010年
9 韩芳;甘蓝型油菜A3染色体遗传连锁图谱的构建[D];华中农业大学;2010年
10 杨勇;青藏高原一年生野生大麦的农艺性状及品质性状分析[D];华中农业大学;2010年
【同被引文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 王清和,吴洵耻,吴传德,潘大陆,胡茂荣;山东省棉花黄萎病菌生理型鉴定(一)——鉴定技术试验[J];山东农业科学;1980年01期
2 唐玉兰,刘泉姣,刘青春;山东省小麦白粉菌类型及群体毒性基因分析[J];山东农业科学;1995年03期
3 李林峰;科学防治大棚黄瓜霜霉病[J];安徽科技;2005年Z1期
4 罗海燕;陈业渊;;ISSR分子标记及其应用[J];安徽农学通报;2008年19期
5 李淑英,吴德祥,路曦结,产焰坤;棉花黄萎病致病机理及抗病育种研究进展[J];安徽农业科学;2001年04期
6 许阳,李东潮,李晓丽,王飞雪,徐青,张明辉;单核苷酸多态性在大豆育种中的应用[J];安徽农业科学;2004年05期
7 邓百万,陈文强;海藻酸钠包埋保藏对食药用菌种活性的影响[J];安徽农业科学;2005年03期
8 张安世;邢智峰;刘永英;张为民;;SRAP分子标记及其应用[J];安徽农业科学;2007年09期
9 陈剑山;郑服丛;;ITS序列分析在真菌分类鉴定中的应用[J];安徽农业科学;2007年13期
10 张莉;马慧宁;陈文霞;吴旭双;李国英;;石河子地区棉花黄萎病菌致病型监测研究[J];安徽农业科学;2007年16期
中国重要会议论文全文数据库 前3条
1 许红;张求东;;湖北麦区小麦白粉病发生规律研究——田间消长规律[A];小麦白粉病测报与防治技术研究[C];2000年
2 刘帆;骆勇;马占鸿;;我国小麦条锈菌主要流行小种CY32的SSR标记[A];中国植物病理学会2007年学术年会论文集[C];2007年
3 朱荷琴;冯自力;赵丽红;刘雪英;师勇强;李志芳;尹志新;;我国棉花黄萎病菌的致病力分化及落叶型菌株的分布[A];中国植物病理学会2010年学术年会论文集[C];2010年
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 陈翠霞;南方玉米锈病的抗病性鉴定、抗病基因的遗传分析、分子标记和精细定位[D];山东农业大学;2002年
2 曹丽华;中国小麦条锈菌生理小种分子标记的研究[D];西北农林科技大学;2003年
3 张莉;新疆棉花枯、黄萎病菌群体变异监测及分子检测[D];西北农林科技大学;2004年
4 陈庆河;稻瘟病菌群体遗传多样性及其无毒基因的遗传分析与分子标记定位[D];南京农业大学;2005年
5 陈旭升;棉花黄萎病菌致萎毒素的生理生化特性研究[D];南京农业大学;1998年
6 周延清;三种经济植物遗传多样性的ISSR和RAPD分析、fad基因克隆和农杆菌介导的遗传转化[D];西北大学;2005年
7 王红梅;棉花抗黄萎病遗传及分子标记研究[D];华中农业大学;2005年
8 张桂寅;棉花黄萎病抗性表现及其基因表达的研究[D];河北农业大学;2005年
9 王子迎;大豆疫霉群体遗传结构及致病相关基因的筛选和功能分析[D];南京农业大学;2006年
10 肖海峻;鹅观草种质资源遗传多样性研究[D];中国农业科学院;2007年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 吴佳徽;黄栌林土壤微生物多样性研究[D];北京林业大学;2011年
2 尹志新;我国棉花黄萎病菌遗传多样性分析[D];中国农业科学院;2011年
3 裴旭;向日葵黄萎病菌的遗传多样性研究[D];内蒙古农业大学;2011年
4 陈瑞辉;棉花黄萎病菌(Verticillium dahliae Kleb)的群体遗传[D];南京农业大学;2000年
5 邹亚飞;棉花黄萎病菌(Verticillium dahliae)致病型AFLP分析与分子鉴定研究[D];西南农业大学;2001年
6 刘鹏;棉花黄萎病菌VD-8菌系单克隆抗体的制备[D];河北农业大学;2002年
7 张立荣;小麦抗叶锈基因Lr37的ISSR分子标记[D];河北农业大学;2002年
8 罗琼;小麦白粉菌群体多样性RAPD分析及无毒性遗传分析[D];中国农业科学院;2002年
9 孙志栋;棉花DNA分子标记连锁图谱构建及基因定位[D];浙江大学;2003年
10 刘艳军;棉花黄萎病菌系基于AFLP的遗传分化研究[D];河北农业大学;2003年
【二级引证文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 毕波;王瑜;袁庆华;;SCAR分子标记在植物抗病育种中的应用[J];安徽农业科学;2010年30期
2 文静;;ISSR分子标记技术在植物病原菌研究中的应用[J];安徽农业科学;2010年36期
3 吴波;高丹;潘超美;张寿文;;吴茱萸ISSR-PCR反应体系优化[J];安徽农业科学;2011年32期
4 赵艳;洪坚平;张晓波;;胶质芽孢杆菌遗传多样性ISSR分析[J];草地学报;2010年02期
5 毕波;王瑜;袁庆华;高建明;;苜蓿褐斑病抗性相关分子标记验证[J];草地学报;2011年04期
6 曾亮;李敏权;杨晓明;赵丽娟;杨发荣;;豌豆ISSR-PCR反应体系的建立和优化[J];草地学报;2012年03期
7 史娟;王华荣;钟少林;;苜蓿假盘菌与苜蓿叶片亲和性互作的超微结构特征[J];草业学报;2012年05期
8 王华荣;史娟;任斌;;苜蓿褐斑病菌离体叶片接种方法及侵染途径观察[J];草业科学;2012年12期
9 李亚立;王建明;;植物病害的分子检测技术及其应用[J];农业技术与装备;2011年02期
10 卢明艳;赵晨辉;苏斯瑶;梁英海;宋洪伟;张冰冰;;苹果ISSR-PCR影响因素研究及引物筛选[J];吉林农业科学;2013年06期
中国博士学位论文全文数据库 前7条
1 台莲梅;马铃薯早疫病菌多样性和侵染过程及品种抗病机制研究[D];黑龙江八一农垦大学;2011年
2 王瑜;紫花苜蓿抗褐斑病基因的ISSR、SRAP以及AFLP分子标记研究[D];中国农业科学院;2009年
3 曾亮;豌豆种质资源遗传多样性分析及白粉病抗性评价[D];甘肃农业大学;2012年
4 窦彦霞;烟草根黑腐病菌Thielaviopsis basicola致病力分化与遗传多样性研究[D];西南大学;2012年
5 王兴红;中国柑橘黑斑病相关的叶点霉属真菌种类、遗传多样性和快速诊断技术研究[D];浙江大学;2012年
6 朱荷琴;我国棉花黄萎病菌的致病力分化及致病相关基因的克隆与分析[D];西北农林科技大学;2013年
7 秦卫华;湖北天鹅洲麋鹿生境中接骨草生态位研究[D];南京林业大学;2013年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 石琳;川、甘、陕三省小麦白粉菌的群体遗传结构研究[D];吉林农业大学;2011年
2 张萍;三裂叶豚草锈菌侵染机制及其分子变异的研究[D];辽宁师范大学;2011年
3 尹志新;我国棉花黄萎病菌遗传多样性分析[D];中国农业科学院;2011年
4 毕波;紫花苜蓿褐斑病抗性基因分子标记研究[D];中国农业科学院;2011年
5 苏银玲;芝麻枯萎病病原菌分离、鉴定及种质抗枯萎病特性研究[D];南京农业大学;2011年
6 马宏棋;普通小麦抗白粉病新基因的发掘和分子标记定位[D];南京农业大学;2010年
7 薛爱琴;胶质类芽孢杆菌的表型及遗传多样性分析[D];浙江理工大学;2011年
8 王玉萍;我国玉米大斑病病原菌变异研究[D];西北农林科技大学;2007年
9 孟芳;紫花苜蓿抗褐斑病基因的ISSR和SCAR标记研究[D];北京林业大学;2008年
10 陈元平;四川稻曲病菌群体多样性研究[D];四川农业大学;2008年
【二级参考文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 王清和,吴洵耻,吴传德,潘大陆,胡茂荣;山东省棉花黄萎病菌生理型鉴定(一)——鉴定技术试验[J];山东农业科学;1980年01期
2 王振山;马峙英;曲健木;;棉花枯黄萎病的抗性基因效应分析[J];河北农业大学学报;1989年02期
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4 房卫平,王家典,孙玉堂,马惠平;我国棉花黄萎病研究进展与高抗黄萎病新种质豫2067[J];河南农业科学;1998年01期
5 刘西剑,陈长永;湖北省棉花黄萎病菌菌系致病力测定[J];华中农业大学学报;1989年03期
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7 陈旭升,陈永萱,黄骏麒;棉花黄萎病菌株VD8外泌毒蛋白的生化特性[J];江苏农业学报;1998年02期
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9 章元寿;王建新;刘经芬;方中达;;大丽轮枝菌毒素的分离、提纯及生物测定[J];真菌学报;1989年02期
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【相似文献】
中国期刊全文数据库 前10条
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中国重要会议论文全文数据库 前10条
1 张昕;简桂良;周益军;林玲;;土壤中落叶型棉花黄萎病菌检测方法的建立及其应用[A];中国植物病理学会2010年学术年会论文集[C];2010年
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6 刘冰江;李敏;刘润进;;AM真菌对棉花根内防御性酶活性的影响[A];中国植物病理学第七届青年学术讨论会论文集[C];2005年
7 简桂良;卢美光;孙涛;杨伟;陈大军;;阳光消毒对棉花枯萎病和黄萎病影响的初步研究[A];农业生物灾害预防与控制研究[C];2005年
8 石磊岩;王莉梅;;北方棉区棉花黄萎病菌的RAPD分析与落叶型菌系研究[A];“植物保护21世纪展望”——植物保护21世纪展望暨第三届全国青年植物保护科技工作者学术研讨会文集[C];1998年
9 毛连纲;颜冬冬;谢红薇;李园;王秋霞;郭美霞;曹坳程;;顺-1,3-二氯丙烯与反-1,3-二氯丙烯室内抑菌活性的初步研究[A];植保科技创新与病虫防控专业化——中国植物保护学会2011年学术年会论文集[C];2011年
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中国重要报纸全文数据库 前3条
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2 双军 玉华 思峰 叔明;海状元818棉花专用肥的防治效能[N];兵团日报(汉);2004年
3 王棉;棉花黄萎病的传播和消长规律[N];中华合作时报;2004年
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 徐飞;落叶型棉花黄萎病菌在华中棉区广泛分布及其原因分析[D];华中农业大学;2012年
2 朱荷琴;我国棉花黄萎病菌的致病力分化及致病相关基因的克隆与分析[D];西北农林科技大学;2013年
3 陈旭升;棉花黄萎病菌致萎毒素的生理生化特性研究[D];南京农业大学;1998年
4 赵付安;棉花黄萎病菌诱导陆地棉和野生棉差异表达分析及抗病相关基因克隆[D];河南大学;2012年
5 毛岚;棉花黄萎病菌的遗传多样性分析[D];西北农林科技大学;2009年
6 刘建国;新疆棉花长期连作的土壤环境效应及其化感作用的研究[D];南京农业大学;2008年
7 孟宪鹏;海岛棉抗病相关ERF转录因子的克隆与鉴定[D];中国农业科学院;2009年
8 龚明福;新疆苦豆子内生细菌多样性及其抗菌作用研究[D];西北农林科技大学;2011年
9 胡林峰;孜然种子提取物抑菌作用研究[D];西北农林科技大学;2008年
10 邸垫平;玫瑰黄链霉菌Men-myco-93-63活性组分的制备及相关基因克隆研究[D];河北农业大学;2006年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 肖蕊;土壤棉花黄萎病菌的分子检测[D];西北农林科技大学;2011年
2 章如意;江苏省棉花黄萎病菌致病力分化和分子检测[D];扬州大学;2010年
3 尹志新;我国棉花黄萎病菌遗传多样性分析[D];中国农业科学院;2011年
4 赵鸣;山东省主要棉区棉花黄萎病菌致病力分化及其生物学特性的研究[D];山东农业大学;2010年
5 李卫;陕西棉花黄萎病菌致病力分化及其营养亲和性研究[D];西北农林科技大学;2010年
6 郝荷荷;湖北省棉花黄萎病菌与品种的互作研究[D];华中农业大学;2011年
7 刘培源;棉花黄萎病菌致病类型快速检测技术的研究[D];石河子大学;2010年
8 冯自力;棉花黄萎病菌Vd08284弱毒相关病毒研究[D];华中农业大学;2013年
9 刘燕霞;棉花黄萎病菌ISSR反应体系优化及其遗传多样性分析[D];西北农林科技大学;2010年
10 余真真;土壤棉花黄萎病菌微菌核分子定量检测技术研究[D];西北农林科技大学;2012年
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