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《河北农业大学》 2007年
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用水稻基因芯片筛选小麦耐旱相关基因的研究

许州达  
【摘要】： 小麦耐旱机理的研究具有重要意义，为了了解小麦在干旱逆境条件下的基因转录规律，本研究采用PEG6000对耐旱小麦品种旱选10号进行拟旱处理，分别提取0、1、6和24小时植株的总RNA，经反转录荧光标记制备cDNA探针，并将其与水稻全基因组芯片进行杂交，扫描采集数据后并进行分析。结果表明，随着处理时间的延长，差异表达基因的数量增加，对差异基因进行功能分类，能量代谢途径相关基因所占比例随处理时间的延长而逐渐增加，大部分为光合作用相关基因，其总体表达趋势为上调，但Psbr和Rubisco编码基因的转录水平为下调，暗示它们在耐旱反应中发挥着一定作用。
【关键词】：小麦 耐旱 基因芯片 转录
【学位授予单位】：河北农业大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2007
【分类号】：S512.1
【目录】：
  • 摘要4-5
  • Abstract5-8
  • 1 综述8-17
  • 1.1 干旱及其对作物的影响8-9
  • 1.1.1 干旱对植物的影响8-9
  • 1.2 旱诱导基因的研究进展9-15
  • 1.2.1 功能蛋白和渗透调节因子10-12
  • 1.2.2 转录因子的研究12-14
  • 1.2.3 蛋白激酶14-15
  • 1.3 模拟干旱胁迫的材料15
  • 1.4 分离鉴定逆境相关基因的主要研究方法15-16
  • 1.5 本研究的目的和意义16-17
  • 2. 实验材料和方法17-24
  • 2.1 实验材料17-19
  • 2.1.1 小麦材料与拟旱处理17
  • 2.1.2 试剂17-18
  • 2.1.3 重要试剂18-19
  • 2.1.4 主要仪器19
  • 2.2 主要软件/操作平台19-20
  • 2.3 杂交实验设计20
  • 2.4 芯片杂交20-22
  • 2.4.1 RNA提取20
  • 2.4.2 反转录20-21
  • 2.4.3 cDNA的纯化21
  • 2.4.4 荧光探针的制备及纯化21
  • 2.4.5 芯片预杂交21
  • 2.4.6 芯片杂交21-22
  • 2.5 芯片数据采集及分析22-24
  • 2.5.1 芯片扫描22
  • 2.5.2 数据采集22
  • 2.5.3 数据分析22-23
  • 2.5.4 基因的功能注释23-24
  • 3. 结果24-31
  • 3.1 水稻oligo与小麦EST的比对24
  • 3.2 RNA提取结果24-25
  • 3.3 芯片杂交结果25-26
  • 3.4 数据采集26
  • 3.5 原始数据的标准化处理26-27
  • 3.6 差异表达基因及功能分类27-29
  • 3.7 差异表达基因的功能分析29-31
  • 4 讨论31-34
  • 4.1 应用水稻基因芯片筛选小麦耐旱基因的可靠性31
  • 4.2 芯片结果的可靠性31
  • 4.3 Ratio计算31
  • 4.4 小麦对干旱的适应反应31-32
  • 4.5 光合作用相关基因在耐旱机理中的作用32-34
  • 5 结论34-35
  • 参考文献35-42
  • 在读期间发表的学术论文42-43
  • 作者简历43-44
  • 致谢44

【引证文献】
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1 吴剑锋;基于基因芯片分析芜菁雌蕊退化突变体（tpa）与野生型的转录组差异[D];浙江大学;2011年
【参考文献】
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10 秦峰,李洁,张贵友,赵军,陈受宜,刘强;玉米中与DRE元件结合的转录因子的克隆和结构分析(英文)[J];Acta Botanica Sinica;2003年03期
【共引文献】
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5 陈霞;罗世巧;段翠芳;曾日中;;高等植物转录因子研究进展[J];安徽农学通报;2008年09期
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【同被引文献】
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2 记者 韩晓玲　实习生 华子博 通讯员 农宣;华中农大水稻团队发现重要基因[N];湖北日报;2010年
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4 记者 李斌;破译水稻基因追踪[N];新华每日电讯;2002年
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6 吴林寰;我国完成400多个水稻基因转基因克隆工作[N];粮油市场报;2010年
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9 通讯员 娄沂春 记者 马瑛瑛;浙大成功开发大容量水稻基因芯片[N];浙江日报;2001年
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