垦殖与自然恢复黑土微生物群落结构及生态功能的季节变化
【摘要】:东北黑土有机碳含量较高,是土壤碳库的重要组成部分。土壤有机碳变化与土地利用方式、气候条件及土壤微生物群落结构关系密切。黑土区气候四季分明,土壤温湿度及地表覆盖物变化明显,这些都预示着土壤微生物群落结构及功能可能存在季节性差异。本论文以中国科学院海伦农业生态试验站为研究平台,选取垦殖3种不同的施肥处理(无肥NoF、化肥CF和化肥配施有机肥CFM)和自然恢复黑土(NR)为研究对象,于不同季节采集土壤样品,通过测定可溶性有机碳、微生物量碳研究土壤活性有机碳库季节性结构组成;采用PCR-DGGE和克隆测序相结合的方法研究土壤微生物群落结构季节性变化规律;通过Biolog法比较微生物对底物碳源利用上的差异,同时测定土壤呼吸和土壤酶活性,解析土壤微生物生态功能的季节性差异,主要研究结果如下:
土壤微生物量碳的最高值都出现在积雪融化期,NR处理土壤微生物量碳5个采样时期平均值较NoF、CF和CFM处理分别提高102%、89%和52%;土壤可溶性有机碳含量总体表现为夏季比冬季高;同一处理在不同季节土壤呼吸差异显著,4种处理在不同温度条件下的土壤呼吸具有相似的变化趋势,均表现为NR处理高于垦殖处理。NR处理的过氧化氢酶、转化酶和磷酸酶活性在5个采样时期均具有较高活性,而NR处理的脲酶活性只在作物生长季节较高。单施化肥或化肥配施有机肥可以提高转化酶、磷酸酶和脲酶活性,而单施化肥有抑制过氧化氢酶活性的作用。除垦殖的3种施肥处理土壤转化酶活性较稳定、季节性变化不显著外,所有处理4种土壤酶活性均表现出明显的季节性变化。5个采样时期的土壤微生物量碳与土壤酶活性之间的正相关关系体现不明显。
采用PCR-DGGE和克隆测序相结合的方法研究土壤细菌和真菌群落结构的季节性变化规律,结果表明,垦殖处理与自然恢复处理相比,前者改变了土壤微生物群落结构;土壤细菌群落结构在植物非生长季节3个采样时期相似度高而在植物生长季节相似度较低;真菌对植被、土壤理化性状和垦殖的敏感性要高于细菌,真菌在作物生长季节(2007年8月28日)和作物收获期(2006年10月15日)的土壤样品群落相似度较高。DGGE条带的测序结果显示,不可培养微生物比例较高,变形杆菌门(Proteobacteria(α-, β-and γ-))和放线菌门(Actinobacteria)是细菌的主要成员;担子菌门(Ascomycota)和子囊菌门(Basidiomycota)是真菌的主要成员。
黑土区氨氧化细菌分布在目前已知的cluster1、cluster2、cluster3、cluster4、cluster7、cluster9和cluster10当中,其中Nitrosospira cluster3是黑土区农田当中的优势氨氧化细菌。土地利用方式改变了氨氧化细菌的群落结构,同时垦殖与自然恢复黑土当中的氨氧化细菌也存在季节性变化,表现为有作物生长季节之间以及非作物生长季节之间群落相似性较高。另外,本研究还发现一类目前尚不能分类到任何已知氨氧化细菌cluster当中的、黑土区特有的氨氧化细菌类群。
对4℃、15℃和28℃培养温度下4个处理黑土微生物代谢功能研究表明,在同一采样时期不同培养温度下,随着培养温度的升高每个处理的微生物代谢活性提高,不同采样季节垦殖与自然恢复处理在3个培养温度下微生物对碳源的代谢能力总体均呈现NR>CFM>CF>NoF变化趋势。微生物在积雪融化期2009年3月27日对碳源的利用能力较强。28℃培养温度下,NoF处理较其它3种处理微生物代谢活性有较大不同,夏季作物生长季节CF、CFM和NR3个处理细菌群落对碳源的利用能力差异最大。
【关键词】:黑土 细菌 真菌 氨氧化细菌 群落结构 土壤酶 Biolog
【学位授予单位】:中国科学院研究生院(东北地理与农业生态研究所)
【学位级别】:博士
【学位授予年份】:2012
【分类号】:S154.36
【目录】:
【学位授予单位】:中国科学院研究生院(东北地理与农业生态研究所)
【学位级别】:博士
【学位授予年份】:2012
【分类号】:S154.36
【目录】:
- 摘要5-7
- ABSTRACT7-12
- 第一章 绪论12-30
- 第一节 选题背景与研究意义12-13
- 第二节 国内外研究进展13-27
- 一、 土壤微生物在生态系统中的作用和功能13-14
- (一) 土壤微生物对土壤发育、肥力维持和养分循环具有重要意义13
- (二) 土壤微生物对植物生长的作用13-14
- (三) 土壤微生物可以促进腐殖酸的形成14
- 二、 土壤微生物多样性及相关指标14-17
- (一) 土壤微生物多样性14-15
- (二) 土壤微生物生物量15-16
- (三) 土壤酶活性16-17
- 三、 土壤微生物多样性研究方法17-23
- (一) 传统的培养方法17-18
- (二) 新型的培养方法18
- (三) 生理生化研究方法18-23
- 四、 影响土壤微生物多样性的因素23-26
- (一) 土地管理方式23-24
- (二) 植被24-25
- (三) 季节变化25-26
- 五、 土壤功能微生物类群——氨氧化细菌26-27
- 第三节 研究内容、技术路线和创新点27-30
- 一、 主要研究内容27-28
- (一) 可溶性有机碳、微生物量碳、土壤呼吸和土壤酶季节性变化研究27-28
- (二) 微生物群落结构季节性变化研究28
- (三) 微生物群落功能季节性变化研究28
- 二、 技术路线28-29
- 三、 创新点29-30
- 第二章 微生物量碳、可溶性有机质、土壤呼吸和土壤酶季节性变化30-51
- 前言30-31
- 第一节 材料与方法31-37
- 一、 实验区概况与试验处理31
- 二、 试验材料与设备31-37
- (一) 试验材料31-32
- (二) 主要仪器设备32
- (三) 试验方法32-37
- 第二节 结果与分析37-47
- 一、 土壤基础理化指标37
- 二、 土壤微生物量碳的季节性变化37-38
- 三、 土壤可溶性有机碳的季节性变化38-40
- 四、 土壤呼吸的季节性变化40-41
- 五、 土壤酶活性的季节性变化41-47
- (一) 过氧化氢酶活性的季节性变化41-42
- (二) 转化酶活性的季节性变化42-44
- (三) 磷酸酶活性的季节性变化44-45
- (四) 脲酶活性的季节性变化45-47
- 第三节 讨论与结论47-51
- 一、 土壤微生物量碳季节性变化47
- 二、 土壤可溶性有机碳季节性变化47-48
- 三、 土壤呼吸季节性变化48-49
- 四、 土壤酶活性季节性变化49-51
- 第三章 真菌和细菌群落结构季节性变化51-75
- 前言51-52
- 第一节 材料与方法52-57
- 一、 实验区概况与试验处理52
- 二、 试验材料与试验方法52-57
- (一) 试验材料52
- (二) 主要仪器设备52
- (三) 试验方法52-57
- 第二节 结果与分析57-73
- 一、 微生物总 DNA 的提取及 PCR 扩增结果57-59
- (一) 微生物总 DNA 的提取57
- (二) PCR 扩增结果57-59
- 二、 真菌和细菌群落结构 DGGE 分析59-73
- (一) 真菌群落结构 DGGE 分析59-65
- (二) 细菌群落结构 DGGE 分析65-71
- (三) DGGE 图谱中代表性条带的测序分析71-73
- 第三节 讨论73-75
- 第四章 氨氧化细菌群落结构的季节性变化75-95
- 前言75-76
- 第一节 材料与方法76-78
- 一、 实验区概况与试验处理76
- 二、 试验材料与试验方法76-78
- (一) 试验材料76
- (二) 主要仪器设备76
- (三) 试验方法76-78
- 第二节 结果与分析78-92
- 一、 微生物总 DNA 的提取及 PCR 扩增结果78
- (一) 微生物总 DNA 的提取78
- (二) 氨氧化细菌 amoA 基因的 PCR 扩增结果78
- 二、 氨氧化细菌群落结构 DGGE 图谱分析78-79
- 三、 氨氧化细菌克隆在氨基酸水平上与 NCBI 比对结果79-86
- 四、 氨氧化细菌系统发育分析86-90
- 五、氨氧化细菌群落结构UniFrac分析90-92
- 第三节 讨论92-95
- 第五章 黑土微生物代谢功能的季节变化95-104
- 前言95-96
- 第一节 材料与方法96-99
- 一、 实验区概况与试验处理96
- 二、 试验材料与试验方法96-99
- (一) 试验材料96
- (二) 主要仪器设备96
- (三) 试验方法96-99
- 第二节 结果与分析99-102
- 一、 细菌群落 Biolog 单孔颜色平均值变化99-101
- 二、 细菌群落碳源代谢功能多样性的主成分分析101-102
- 第三节 讨论102-104
- 第六章 结论与展望104-106
- 一、研究结论104-105
- 二、研究展望105-106
- 参考文献106-118
- 发表论文目录118-119
- 致谢119
| 【相似文献】 | ||
|
|||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||



