胶州湾超微型浮游真细菌16s rDNA RFLP 分析相关技术的研究--《中国科学院海洋研究所》2000年硕士论文

《中国科学院海洋研究所》 2000年

胶州湾超微型浮游真细菌16s rDNA RFLP 分析相关技术的研究

【摘要】： 通过生态学与分子生物学相结合的方法，对胶州湾超微型浮游真细菌从16s rDNA的角度分析其多样性，建立了一系列行之有效的方法，对于今后开展特定的超微型生物的研究提供了有益的借鉴。主要结果如下： 1.建立了行之有效的从极稀密度的海水中提取浮游细菌总基因组 DNA的方法，其得率约为0.3～0.5μg/L海水，并且提供了DNA 浓缩、纯化的一系列步骤，最后所制得的DNA其纯度和含量足以开展后续工作。 2.建立了可靠的具有较高转化效率的感受态细胞，并从多个途径来制备，并对各种方法的成败及注意事项进行了探讨。 3.对PCR反应的条件进行了深入的探讨，成功地从混合型基因组中扩增出细菌特异性引物（Universal 1406R和Eubacterial 68F）所对应的16s rDNA。并且对PCR的几个控制因子进行了分析，对于今后采用不同引物的高效扩增将提供有益的帮助。 4.深入地对TA克隆效率进行了探讨，较好地将PCR混合产物分离开，并成功地导入大肠杆菌DH5α菌株，并对重组质粒进行了初步的RFLP分析，为今后通过序列测定构建系统进化树奠定了基础。 5.RFLP分析表明胶州湾海水中至少含有7种亲缘关系较远的真细菌。

【关键词】：浮游真细菌 PCR TA克隆 RFLP
【学位授予单位】：中国科学院海洋研究所
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2000
【分类号】：Q178.53
【DOI】：CNKI:CDMD:2.2000.000941
【目录】：

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	【参考文献】
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前5条

1	焦念志,陈念红;原绿球藻──海洋生态学研究的新领域[J];海洋科学;1995年04期
2	焦念志,杨燕辉,ElizabethMann,SallieW.Chisholm,陈念红;我国东海发现原绿球藻的大量存在[J];科学通报;1998年06期
3	刘铁汉,周培瑾;嗜盐微生物[J];微生物学通报;1999年03期
4	徐毅,周培瑾;嗜盐古细菌的系统发育分析[J];微生物学报;1996年02期
5	辛明秀;低温微生物研究进展[J];微生物学报;1998年05期

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1	韩芬霞;陈春刚;王清华;;猪肾组织中DNA提取的研究[J];安徽农业科学;2006年04期
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3	褚忠志;于新;毕阳;杨林华;;产碱性蛋白酶菌株ZK202的鉴定及其诱变[J];安徽农业科学;2008年14期
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6	金来武;刘伟成;潘争艳;裘季燕;刘学敏;;拮抗链霉菌AFLP分析技术体系的研究[J];安徽农业科学;2009年18期
7	刘爱民;嗜盐菌的研究进展[J];安徽师范大学学报(自然科学版);2002年02期
8	高健,许晓风,乌慧玲,陈学平,周家昊;特异种质烟草全长cDNA文库的构建及质量分析[J];安徽农业大学学报;2004年01期
9	谢昆;陶宏征;王传铭;李河;林丽飞;王栋;;鸡柔嫩艾美耳球虫免疫调节型DNA疫苗pEtK2-IFN-γ的构建[J];安徽农业大学学报;2009年02期
10	周璟;盛红梅;安黎哲;;极端微生物的多样性及应用[J];冰川冻土;2007年02期

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1	张明科;大白菜紫色性状的分子标记与QTL定位研究[D];西北农林科技大学;2008年
2	杨玉霞;荞麦种质资源遗传多样性研究[D];四川农业大学;2008年
3	郑璐;BC047440的原核表达、多克隆抗体制备及其在蛋白质水平表达的初步研究[D];第三军医大学;2008年
4	艾海新;耐盐硝基苯降解菌特性分析及其部分基因克隆[D];大连理工大学;2008年
5	王平;高盐含酚废水生物处理及微生物群落结构研究[D];大连理工大学;2009年
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1	马缨;四川白鹅prl外显子2和5SNP与产蛋性能关系的初探[D];西南大学;2009年
2	徐生才;家蚕和野桑蚕解毒酶活性的比较及野桑蚕CYP9A20V1基因的克隆与表达[D];苏州大学;2009年
3	李霞;六个miniSTR基因座群体遗传学研究[D];河北医科大学;2009年
4	温婵;免疫途径、剂量和佐剂对CVB3VP1蛋白免疫效果的影响[D];河北医科大学;2009年
5	李嘉;柯萨奇病毒B3腺病毒载体疫苗Ad/sVP1的构建及免疫效果的研究[D];河北医科大学;2009年
6	袁敏;低温厌氧生境中产甲烷古菌的分离、鉴定及菌群结构分析[D];中国农业科学院;2009年
7	李海云;高盐度废水处理中优势耐盐菌的鉴定及其生长特性初步研究[D];青岛大学;2009年
8	邓鸿;台湾海峡南部超微型生物生态学研究[D];厦门大学;2009年
9	王柏玲;一株中度嗜盐菌的分离、鉴定及系统发育分析[D];东北师范大学;2009年
10	李启琳;水牛瘤胃纤毛虫分子生态研究初探[D];广西大学;2008年

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前3条

1	周培瑾,徐毅,马允卿,刘宏迪;极端嗜盐菌 16S rDNA的PCR扩增[J];微生物学报;1994年01期
2	周培瑾;回顾过去开创未来——中国科学院微生物研究所建所35周年来的回顾与展望[J];微生物学报;1994年02期
3	徐毅,刘宏迪,周培瑾;艾丁嗜盐小盒菌B2菌株16S rRNA核苷酸序列[J];微生物学报;1995年02期

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1	黄红英,刘爱民,张林普;真细菌的渗透调节机制[J];微生物学通报;1999年03期
2	李凯年;用RT/RCR—RFLP测定鉴别IBDV株[J];畜牧兽医科技信息;1998年11期
3	程罗根;限制性片段长度多态性(RFLPS)及其原因[J];生物学杂志;1994年03期
4	叶学成,夏小翔,沈萍;具有真细菌启动子功能的盐生盐杆菌质粒DNA片段的结构与功能初步分析[J];云南大学学报(自然科学版);1999年S3期
5	刘春吉,王明理;RFLP分析过程中应注意的几个问题[J];遗传;1994年06期
6	贺林,严明,王世浚;中国汉族人线粒体DNA RFLP的初步研究[J];科学通报;1987年23期
7	魏建军,陈丙玺,杨亚萍,蔡富强,郭亦寿;RFLP诊断方法的改进[J];遗传;1993年02期
8	徐德强,黄静娟,张纪忠,范钦,刘东来;盐单胞菌属一新种——黄海盐单胞菌[J];微生物学报;1995年05期
9	程备久,凌杏元;利用RFLP进行数量基因定位及效应分析的原理与方法[J];生物数学学报;1994年S1期
10	黄德娟,李素云;两种重要的分子标记──RFLP和RAPD[J];抚州师专学报;1999年03期

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1	;Classification of Heterotic Groups with RFLP Markers among Maize Germplasm in China[A];21世纪玉米遗传育种展望——玉米遗传育种国际学术讨论会文集[C];2000年
2	鲍时翔;方再光;吴碧文;胡永华;黄惠琴;;海绵Suberites sp.体内细菌遗传多样性分析[A];2005热带亚热带微生物资源的遗传多样性与基因发掘利用研讨会论文集[C];2005年
3	朱建裕;黄玉屏;沈萍;;嗜盐古生菌rad25基因上游序列在三域生物中的启动子功能研究[A];第二届中国青年学者微生物遗传学学术研讨会论文集[C];2006年
4	沈萍;;嗜盐古生菌rad25基因上游序列在三域生物中的启动子功能研究[A];湖北省遗传学会、江西省遗传学会2006年学术年会暨学术讨论会论文摘要集[C];2006年
5	方再光;黄惠琴;孙前光;鲍时翔;;海绵Pachychalina sp.体内古菌、真细菌多样性的非培养分析[A];中国海洋生化学术会议论文荟萃集[C];2005年
6	熊毅;刘棋;朱伟;郭建刚;李华明;刘科;;狂犬病Nested-PCR检测技术的研究应用及RFLP分析[A];第六届全国会员代表大学暨第11次学术研讨会论文集（下）[C];2005年
7	王晓梅;王茜;戴伟;李晓东;陈帅君;马成学;;不同地区绒螯蟹线粒体12S-16S rDNA RFLP分析(英文)[A];中国动物学会北方七省市动物学会学术研讨会论文集[C];2005年
8	詹慧琴;额尔和花;张淑君;彭秀丽;龚炎长;;鸡催乳素基因内含子2RFLP检测及与产蛋性能关系的初步研究[A];家禽研究最新进展——第十一次全国家禽学术讨论会论文集[C];2003年
9	刘景芳;向华;;腾冲嗜热杆菌相关蛋白互作的研究[A];第二届中国青年学者微生物遗传学学术研讨会论文集[C];2006年
10	杨洋;黄玉屏;沈萍;;来源于极端嗜盐古生菌的RM07片段在三界生物-古生菌、真核生物和真细菌体内均具有启动子活性[A];首届中国青年学者微生物遗传学学术研讨会论文摘要集[C];2002年

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1	馆陶县蔬菜医院王昕;硫酸铜防治黄瓜死秧效果好[N];河北科技报;2006年
2	罗明典;嗜极生物及其功能[N];科技日报;2002年
3	孙万儒;现实世界的微小造物主[N];中国教育报;2004年
4	燕民;生物技术在果树上的应用[N];农民日报;2000年
5	卧松编译;发现适合在火星上生存的微生物[N];中国教育资讯报;2002年
6	北京大学生命科学学院侯巧明;DNA识别遗传信息判断人[N];计算机世界;2001年
7	黄璐琦;分子生药学研究方兴未艾[N];中国医药报;2004年
8	记者李斌;我国承担的人类基因组“天书”接近完成[N];人民日报;2001年
9	王雪飞吴黎;中国生物信息学研究快速发展[N];健康报;2002年
10	简悦威教授（美）;DNA诊断技术的发展[N];陕西日报;2000年

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1	方再光;中国南海厚指海绵Pachylina sp.和皮海绵Suberites sp.体内真细菌和古细菌多样性研究[D];华南热带农业大学;2004年
2	杨洋;来源于嗜盐古生菌的RM07 DNA片段在三域模式生物中的启动子功能研究[D];武汉大学;2003年
3	朱建裕;嗜盐古生菌rad25基因上游序列在三域生物中的启动子功能研究[D];中南大学;2005年
4	张海涛;海绵放线菌的分离和多样性研究[D];中国科学院研究生院（大连化学物理研究所）;2006年
5	杨俊品;玉米分子遗传图谱构建及数量性状基因定位[D];四川农业大学;2001年
6	刘仁虎;油菜杂种优势分子标记剖析及菌核病抗性相关基因筛选[D];华中农业大学;2004年
7	郝家胜;鹅的部分品种和有关野雁的分子系统学和遗传多样性研究[D];南京师范大学;1997年
8	张方东;玉米S组CMS胞质育性相关基因的克隆与结构分析[D];华中农业大学;1999年
9	刘作易;虫草属及其无性型关系研究[D];华中农业大学;1999年
10	马朝芝;甘蓝型油菜遗传多样性和杂种优势的研究[D];华中农业大学;2002年

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1	潘晓驹;胶州湾超微型浮游真细菌16s rDNA RFLP 分析相关技术的研究[D];中国科学院海洋研究所;2000年
2	张旋;UP-PCR结合RFLP快速鉴定体液标本中的病原菌[D];青岛大学;2002年
3	柳承璋;浮游细菌遗传多样性分析的T－RFLP方法研究[D];中国海洋大学;2003年
4	贾俊涛;T-RFLP分析在细菌调查方面的应用[D];中国海洋大学;2003年
5	陈志彤;分子标记技术在泽泻上的应用[D];福建师范大学;2004年
6	赵守环;水稻RFLP-SSR连锁图谱的构建和稻米品质的QTL定位[D];福建农林大学;2003年
7	欧师琪;胞囊线虫（Heterodera & Globodera）的分子标记[D];吉林农业大学;2005年
8	杨波;烟草赤星病拮抗细菌筛选及其16S rDNA PCR-RFLP分析[D];浙江大学;2005年
9	高鹏;双位点保守基因特异性PCR-CE-RFLP快速鉴定病原菌[D];大连医科大学;2003年
10	王宪文;传染性支气管炎病毒地方分离株的RFLP和序列分析[D];河南农业大学;2002年