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《中国科学院研究生院(海洋研究所)》 2005年
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栉孔扇贝和海湾扇贝遗传连锁图谱的构建研究

王玲玲  
【摘要】:本研究在栉孔扇贝和海湾扇贝种群分析中建立了 AFLP 和 EST-SSR 标记技 术,对海湾扇贝和栉孔扇贝一对一杂交亲本和 F1 子代家系进行了 AFLP 和 SSR 作图标记筛选,构建了初步的遗传连锁图谱。 应用7对AFLP引物组合分析扇贝群体遗传多样性的结果显示栉孔扇贝野生 种群和养殖群体多态位点比例分别为 0.756 和 0.728,平均杂合度分别为 0.226 和 0.209,两群体之间的遗传距离和近交系数分别为 0.0271 和 0.0386。研究表明, 我国栉孔扇贝养殖群体的遗传多样性低于野生种群,但两者之间尚未出现遗传分 化。 筛选 11 对 EST-SSR 标记检测海湾扇贝美国东海岸野生种群、我国南北方养 殖群体的遗传变异水平。美国野生种群和我国南北方养殖海湾扇贝群体的平均杂 合度分别为 0.4465,0.3984 和 0.4331。我国的养殖群体相对于美国的海湾扇贝野 生种群约有 23%的等位基因缺失,且杂合度降低。 由 60 个 F1 个体组成栉孔扇贝作图群体。74 对 AFLP 引物组合共产生 2831 位点,其中 603 个多态位点。共享图谱中,共 25 个标记构成了 5 个连锁群,总 图距 431.2 cM,平均图距 21.5 cM,雌性图谱包括 198 个标记,25 个连锁群覆盖 3130 cM。平均距离 18.1 cM。雄性图谱包含了 166 个标记在内的 23 个连锁群, 覆盖基因组长度为 2468 cM,平均图距 17.2 cM。父母本连锁图谱分别覆盖基因 组长度的 76.4% 和 77.1%。 57 对 AFLP 引物组合分析海湾扇贝杂交亲本和 97 个 F1 个体,共得到父、 母本分离标记 187 和 203 个,共分离标记 152 个。微卫星分析产生父、母本分离 标记 15 和 9 个,共分离标记1个。在所有分离标记中,偏分离标记 121 个,其 中 77 个(63.6%)为杂合子缺乏。共有 99 个标记构成共享图谱的 14 个连锁群, 总图距 1512 cM,平均图距 17.0 cM;雌性图谱由 150 个标记组成 20 个连锁群, 图谱总长度 2131.1cM,标记间的平均距离 16.4cM。在雄性图谱中,共有 151 个 标记被定位到 20 个连锁群中,总长度 2055.9 cM,平均距离为 15.7cM。雌雄性 图谱的覆盖率分别为 78.6%和 76.4%。微卫星位点 MSB6721 的定位说明海湾扇 贝雌性图谱第 8 连锁群与雄性图谱第 3 连锁群的同源。偏分离标记分别在雌性图 i WP=6 王玲玲 栉孔扇贝和海湾扇贝遗传连锁图谱的构建研究 博士学位论文 谱的 LG3,LG6,LG15,雄性图谱的 LG2,LG7 和 LG19 及共享图谱的 LG3, LG4,LG5,LG7,LG12 连锁群的聚集可能表明海湾扇贝作图群体中多个隐性致 死基因的存在。
【学位授予单位】:中国科学院研究生院(海洋研究所)
【学位级别】:博士
【学位授予年份】:2005
【分类号】:Q953

【引证文献】
中国期刊全文数据库 前1条
1 秦艳杰;刘晓;张海滨;张国范;;海湾扇贝杂交后代的微卫星鉴定[J];中国水产科学;2007年04期
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1 叶华;大黄鱼SSR遗传连锁图谱的构建及生长相关性状的QTL定位[D];湖南农业大学;2010年
2 刘贤德;皱纹盘鲍遗传图谱构建及生长相关性状的QTL定位[D];中国科学院研究生院(海洋研究所);2005年
3 秦艳杰;海湾扇贝遗传图谱构建及壳色基因、生长相关QTL的定位研究[D];中国科学院研究生院(海洋研究所);2006年
4 廖梅杰;鲢、鳙鱼遗传连锁图谱构建和鳙鱼蛋白感染因子基因的克隆[D];中国海洋大学;2007年
5 张振;基于微卫星和SNP标记的皱纹盘鲍遗传连锁图谱及其应用[D];中国科学院研究生院(海洋研究所);2010年
6 初冠囡;许氏平鲉(Sebastes schlegelii)微卫星标记筛选及遗传连锁图谱构建[D];中国海洋大学;2012年
中国硕士学位论文全文数据库 前4条
1 卢超;仿刺参(Apostichopus japonicus)AFLP遗传连锁图谱的构建[D];中国海洋大学;2010年
2 王宇;海湾扇贝近交衰退的遗传分子机理的研究[D];中国科学院研究生院(海洋研究所);2011年
3 于涛;栉孔扇贝(♀)×虾夷扇贝(♂)杂种优势遗传机理的研究[D];上海海洋大学;2011年
4 欧燕燕;华贵栉孔扇贝体色多态性研究及AFLP分析[D];广东海洋大学;2012年
【参考文献】
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10 王运涛,相建海;栉孔扇贝大规模死亡的原因探讨[J];海洋与湖沼;1999年06期
中国博士学位论文全文数据库 前1条
1 岳志芹;中国对虾抗病选育群体的遗传分析及遗传连锁图谱的构建[D];中国海洋大学;2003年
【共引文献】
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1 董艳敏;卢金东;刘栓桃;;分子标记技术在葫芦科瓜类作物中的应用进展[J];山东农业科学;2008年02期
2 丁照华;吴洪飞;刘治先;汪黎明;孟昭东;杨菲;张发军;;山东省主要审(认)定玉米杂交种种质分析[J];山东农业科学;2008年06期
3 石涛;王洪刚;何方;邓世民;高居荣;;小麦矮秆新基因的SSR标记[J];山东农业科学;2008年08期
4 商伟;张彦军;魏海忠;孔晓民;蒋飞;刘保申;;玉米SSR连锁图谱构建和粗缩病抗性QTL的初步定位[J];山东农业科学;2011年12期
5 张延明;曲敏;闫玉清;徐香玲;李集临;;EST-SSRs在小麦研究中的应用[J];安徽农学通报;2006年13期
6 叶建生;王兴强;马甡;阎斌伦;;双壳贝类的流行病学研究进展及其可持续发展养殖措施[J];安徽农学通报;2007年03期
7 王庆;傅洪拓;;核rDNA ITS区序列在水产动物研究中的应用[J];安徽农学通报;2007年11期
8 黄磊;唐光绪;田东;何庆元;;新型分子标记的开发和利用[J];安徽农学通报(上半月刊);2010年23期
9 鞠玉栋,李金泉;水稻微卫星标记的发展与应用[J];安徽农业科学;2005年10期
10 陈万光;张海艳;;分子遗传标记在鱼类遗传研究中的应用[J];安徽农业科学;2006年17期
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1 魏昕;潘光堂;;墨白964群体5轮混合选择遗传变异的分子生物学研究[A];2004全国玉米种质扩增、改良、创新与分子育种学术会议论文集[C];2004年
2 张仁和;薛吉全;毛建昌;马国胜;杨引福;;DNA分子标记与玉米种质研究[A];2004全国玉米种质扩增、改良、创新与分子育种学术会议论文集[C];2004年
3 赵久然;王凤格;郭景伦;;中国玉米品种标准DNA指纹库构建研究进展[A];2004’中国作物学会学术年会文集[C];2004年
4 刘晨临;何培青;胡晓颖;黄晓航;;分子遗传标记技术在海岸带生物入侵鉴别中的应用[A];中国海洋学会海洋生物工程专业委员会2005年学术年会论文集[C];2005年
5 何培青;刘晨临;胡晓颖;陈靠山;;我国引进海洋经济物种对本土资源遗传多样性的影响[A];中国海洋学会海洋生物工程专业委员会2005年学术年会论文集[C];2005年
6 余诞年;;番茄果重QTL-fw2.2研究进展及其遗传学和育种学意义[A];全国蔬菜遗传育种学术讨论会论文集[C];2002年
7 张洪溢;余诞年;王锐萍;李明芬;李其忠;;利用单位性状与RAPD技术对樱桃番茄种质资源遗传多样性进行的比较与分析[A];全国蔬菜遗传育种学术讨论会论文集[C];2002年
8 王晓武;娄平;何杭军;杨宝军;张延国;赵建军;;利用芥蓝X青花菜DH群体构建AFLP连锁图谱[A];蔬菜分子育种研讨会论文集[C];2004年
9 柳李旺;龚义勤;伏兵;汪隆植;;萝卜品种遗传多样性的SSR标记初步分析[A];蔬菜分子育种研讨会论文集[C];2004年
10 易金鑫;侯喜林;;我国茄子主要地方品种与选育品种遗传多样性分析[A];蔬菜分子育种研讨会论文集[C];2004年
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1 韩英鹏;多环境、多遗传背景下不同发育时期大豆籽粒重的QTL分析[D];哈尔滨师范大学;2010年
2 刘永刚;基于微卫星DNA标记的马铃薯桃蚜不同种群遗传分化研究[D];甘肃农业大学;2010年
3 刘名;太平洋鲱和大头鳕的群体遗传学研究[D];中国海洋大学;2010年
4 程洁;栉孔扇贝(Chlamys farreri)大片段基因组文库的构建及应用分析[D];中国海洋大学;2010年
5 于海洋;牙鲆微卫星标记的筛选和美洲牡蛎抗病相关基因SNP的初步分析[D];中国海洋大学;2010年
6 张天时;中国对虾(Fenneropenaeus chinensis)育种的模型分析与遗传参数评估[D];中国海洋大学;2010年
7 金波昌;池塘养殖刺参(Apostichopus japonicus)食物来源的稳定同位素法研究[D];中国海洋大学;2010年
8 白洁;太平洋牡蛎分子标记的开发与应用研究[D];中国海洋大学;2010年
9 张立楠;鲢遗传连锁图谱的构建及精子竞争对性别间重组率差异的影响[D];中国海洋大学;2010年
10 苗贵东;半滑舌鳎微卫星标记开发、应用及遗传连锁图谱的构建[D];中国海洋大学;2010年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 朱银城;猪PGM1基因的序列、表达谱及多态性分析[D];华中农业大学;2010年
2 刘敏;基于SSR、ISSR和RAPD对大豆疫霉菌的遗传多样性研究[D];华中农业大学;2010年
3 李良;湖北省油茶优良单株遗传多样性及品质初步分析[D];华中农业大学;2010年
4 林兵;甘蓝型油菜A8连锁群种子含油量QTL簇解析及连锁累赘分析[D];华中农业大学;2010年
5 刘健;甘蓝型油菜C2连锁群种子含油量QTL簇及品质性状的分析[D];华中农业大学;2010年
6 石伟平;二倍体马铃薯遗传群体构建和抗低温糖化分析[D];华中农业大学;2010年
7 董巍;分子标记辅助选择改良光温敏核不育系的稻瘟病抗性和稻瘟病抗性基因的初步定位[D];华中农业大学;2010年
8 汪航;“柏拉玛地”玉米大斑病无病斑型抗性基因HtNB的定位[D];华中农业大学;2010年
9 张璜;水稻抗寒性分析评价及QTL初步定位[D];华中农业大学;2010年
10 李良良;应用分子标记技术选育高肌内脂肪含量大白猪新品系[D];华中农业大学;2010年
【同被引文献】
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1 唐建淮;简峰;;杂种优势原理新解[J];安徽农业科学;2008年28期
2 汪德耀,刘汉英;牡蛎人工杂交的初步研究[J];动物学报;1959年03期
3 张于光,李迪强,饶力群,肖启明,刘丹;东北虎微卫星DNA遗传标记的筛选及在亲子鉴定中的应用[J];动物学报;2003年01期
4 王伟继;孔杰;董世瑞;栾生;王清印;;中国明对虾AFLP分子标记遗传连锁图谱的构建[J];动物学报;2006年03期
5 曹哲明;丁炜东;俞菊华;曹丽萍;吴婷婷;;草鱼全同胞鱼苗不同个体甲基化位点的差异[J];动物学报;2007年06期
6 丁炜东;曹丽萍;曹哲明;;草鱼种质相关SRAP及SCAR的分子标记[J];动物学报;2008年03期
7 李思发,吕国庆,L.贝纳切兹;长江中下游鲢鳙草青四大家鱼线粒体DNA多样性分析[J];动物学报;1998年01期
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9 周丽青,杨爱国,刘志鸿,杜方勇,张立敬,王清印;栉孔扇贝(♀)×虾夷扇贝(♂)受精细胞学观察[J];动物学杂志;2003年04期
10 刘晓,张国范,赵洪恩;皱纹盘鲍“中国红”品系的选育[J];动物学杂志;2003年04期
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1 张建勇;中国对虾(Fenneropenaeus chinensis)基因组SNP标记的开发与应用[D];中国海洋大学;2011年
2 岳志芹;中国对虾抗病选育群体的遗传分析及遗传连锁图谱的构建[D];中国海洋大学;2003年
3 万俊芬;鲍与扇贝遗传育种中的分子标记研究[D];中国海洋大学;2003年
4 李莉;长牡蛎的分子标记筛选和遗传图谱构建[D];中国科学院研究生院(海洋研究所);2003年
5 熊立仲;基因表达水平上水稻杂种优势的分子生物学基础研究[D];华中农业大学;1999年
6 蒋曹德;猪DNA甲基化与杂种表现的关系及遗传多样性分析[D];华中农业大学;2004年
7 郑怀平;海湾扇贝两个养殖群体数量性状及壳色遗传研究[D];中国科学院研究生院(海洋研究所);2005年
8 刘贤德;皱纹盘鲍遗传图谱构建及生长相关性状的QTL定位[D];中国科学院研究生院(海洋研究所);2005年
9 吕振明;栉孔扇贝和虾夷扇贝杂交过程中的细胞与分子遗传学分析[D];中国海洋大学;2006年
10 董世瑞;形态标记与微卫星标记在中国对虾遗传选育中的应用研究[D];中国海洋大学;2006年
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1 刘合露;华贵栉孔扇贝橙色闭壳肌个体富集类胡萝卜素原因的初步研究[D];汕头大学;2011年
2 王宣朋;鲤鱼遗传连锁图谱的构建及饲料转化率性状的QTL定位[D];上海海洋大学;2011年
3 邬思荣;湛江北部湾深水海域马氏珠母贝四种壳色选育系F_5的生长速度、生长模型及其遗传多样性的SSR分析[D];广东海洋大学;2011年
4 陈金涛;华贵栉孔扇贝(Chlamys nobilis)不同壳色选育系的建立及其生长发育研究[D];广东海洋大学;2011年
5 葛芹玉;白鲢与团头鲂遗传连锁图谱的构建[D];南京农业大学;2002年
6 陈大鹏;文蛤种质及遗传多样性RAPD和ISSR分析[D];南京师范大学;2004年
7 陈省平;AFLP标记在扇贝种质鉴定及其遗传结构分析中的应用[D];中国海洋大学;2004年
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9 陈微;牙鲆微卫星分子标记的筛选及多态性检测[D];中国海洋大学;2005年
10 谢中国;大黄鱼(♀)与鮸鱼(♂)杂交及其子代的遗传分析[D];湖南农业大学;2006年
【二级引证文献】
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1 马向丽;毕玉芬;张凤仙;;紫花苜蓿杂交后代遗传变异的AFLP分析[J];草原与草坪;2010年02期
2 油九菊;黄桂菊;范嗣刚;陈飞飞;郝博飞;曲妮妮;喻达辉;;合浦珠母贝微卫星标记的家系筛选[J];广东农业科学;2012年13期
3 王春德;刘保忠;李继强;刘升平;;紫扇贝与海湾扇贝种间杂交的研究[J];海洋科学;2009年10期
4 林斌彬;张子平;王艺磊;张雅芝;;AFLP技术发展及其在水产生物学研究中的应用[J];集美大学学报(自然科学版);2008年01期
5 李建立;王春德;李朝霞;蔡德泉;张金盛;;紫扇贝和海湾扇贝杂交家系的生长和通径分析[J];海洋科学;2012年08期
6 刘庆明;李猛;马爱军;王新安;黄智慧;郭建丽;;应用高分辨率熔解曲线(HRM)开发大菱鲆(Scophthalmus maximus)SNP标记的研究[J];海洋与湖沼;2012年06期
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10 赵海燕;李池陶;石连玉;贾智英;胡雪松;;德国镜鲤选育系F_4天津群体中不同体型的遗传结构分析[J];水产学杂志;2009年01期
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 于海洋;牙鲆微卫星标记的筛选和美洲牡蛎抗病相关基因SNP的初步分析[D];中国海洋大学;2010年
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3 李加琦;皱纹盘鲍配套杂交体系的建立、评价及应用[D];中国科学院研究生院(海洋研究所);2011年
4 李荣华;四种重要养殖贝类有效繁殖群体数量研究[D];中国海洋大学;2011年
5 王明玲;养殖皱纹盘鲍杂交种对土著群体遗传结构的影响及种间渐渗杂交的遗传分析[D];中国海洋大学;2011年
6 张留所;凡纳滨对虾分子标记筛选、连锁图谱构建和QTL定位[D];中国科学院研究生院(海洋研究所);2006年
7 田燚;中国对虾育种方法研究与遗传连锁图谱的构建[D];中国科学院研究生院(海洋研究所);2007年
8 廖梅杰;鲢、鳙鱼遗传连锁图谱构建和鳙鱼蛋白感染因子基因的克隆[D];中国海洋大学;2007年
9 战爱斌;栉孔扇贝(Chlamys farreri)微卫星标记的筛选及应用[D];中国海洋大学;2007年
10 刘清华;牙鲆Paralichthys olivaceus(♀)×夏鲆Paralichthys dentaus(♂)分子遗传学及数量遗传学研究[D];中国科学院研究生院(海洋研究所);2008年
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1 徐亘博;半滑舌鳎等九种海水鱼微卫星分子标记的开发和应用[D];中国海洋大学;2010年
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4 张鹏;鲢InDel-RFLP标记开发及其在遗传多样性分析、连锁图谱构建中的应用[D];中国海洋大学;2011年
5 王宣朋;鲤鱼遗传连锁图谱的构建及饲料转化率性状的QTL定位[D];上海海洋大学;2011年
6 于涛;栉孔扇贝(♀)×虾夷扇贝(♂)杂种优势遗传机理的研究[D];上海海洋大学;2011年
7 胡晓宁;22个紫花苜蓿品种遗传关系分析及杂交后代鉴定[D];西北农林科技大学;2008年
8 吴岁寒;孔雀鱼蛋白质感染因子蛋白基因的克隆及功能分析[D];中国海洋大学;2008年
9 赵冬梅;马铃薯晚疫病菌SSR基因型多样性及其有性F1代菌株分析[D];河北农业大学;2009年
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【二级参考文献】
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3 孔晓瑜;刘亚军;喻子牛;宋林生;;栉孔扇贝和海湾扇贝线粒体16S rRNA基因片段的比较研究[A];中国动物学会、中国海洋湖沼学会贝类学分会第五次代表大会暨第九次学术讨论会论文集[C];1999年
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5 王春德;刘保忠;李继强;刘升平;;紫扇贝与海湾扇贝种间杂交的研究[A];中国动物学会、中国海洋湖沼学会贝类学会分会第十四次学会研讨会论文摘要汇编[C];2009年
6 胡丽萍;黄晓婷;孙妍;包振民;;紫扇贝(Argopecten purpuratus)与海湾扇贝(Argopecten irradians)种间杂交子代的鉴定分析[A];中国的遗传学研究——遗传学进步推动中国西部经济与社会发展——2011年中国遗传学会大会论文摘要汇编[C];2011年
7 宋林生;胥炜;李红蕾;郭希明;相建海;;海湾扇贝cDNA文库构建及EST分析[A];甲壳动物学分会成立20周年暨刘瑞玉院士从事海洋科教工作55周年学术研讨会论文(摘要)集[C];2002年
8 张守都;李莉;张国范;;海湾扇贝(Argopecten irradians)多阶段选择育种[A];中国动物学会、中国海洋湖沼学会贝类学会分会第十四次学会研讨会论文摘要汇编[C];2009年
9 于宗赫;;海州湾深水区域两种养殖方式栉孔扇贝生长与免疫特征的比较[A];中国动物学会、中国海洋湖沼学会贝类学会分会第十四次学会研讨会论文摘要汇编[C];2009年
10 孙福新;王颖;吴志宏;;栉孔扇贝对铜的累积与排出特征研究[A];中国动物学会、中国海洋湖沼学会贝类学会分会第十四次学会研讨会论文摘要汇编[C];2009年
中国重要报纸全文数据库 前10条
1 通讯员 陈悦 宏伟 宋辉 YMG记者 申吉忠;野生栉孔扇贝长岛再次现身[N];烟台日报;2010年
2 晓梅;栉孔扇贝杂交苗繁育及养殖技术通过验收[N];中国渔业报;2010年
3 通讯员 邢桂方 记者 王建高;首个“中科红”海湾扇贝南移成功[N];科技日报;2005年
4 通讯员 刘洋记者 王建高;海湾扇贝国家标准发布[N];科技日报;2008年
5 王丽;怎样提高海湾扇贝孵化率[N];中国海洋报;2002年
6 王京宝;扇贝将缺货五十万吨[N];农民日报;2003年
7 本报记者 缪翼;青岛贝复苏以改良品种为契机[N];中国渔业报;2009年
8 孟庆良;海湾扇贝养殖与加工[N];中国渔业报;2007年
9 任德建;引起栉孔扇贝死亡的是球形病毒[N];中国渔业报;2004年
10 李明;美洲帘蛤有望替代栉孔扇贝[N];中国海洋报;2002年
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 王玲玲;栉孔扇贝和海湾扇贝遗传连锁图谱的构建研究[D];中国科学院研究生院(海洋研究所);2005年
2 李娟;海湾扇贝抗氧化相关基因的克隆、表达和结构分析[D];中国科学院研究生院(海洋研究所);2010年
3 林听听;栉孔扇贝(Chlamys farreri)血细胞酶联免疫检测试剂盒的研制与应用[D];中国海洋大学;2011年
4 郭琳;海湾扇贝Myostatin研究及其单核苷酸多态性分析[D];中国科学院研究生院(海洋研究所);2012年
5 刘保忠;海湾扇贝群体遗传学和扇贝科分子系统演化的研究[D];中国科学院研究生院(海洋研究所);2003年
6 朱玲;扇贝丝氨酸蛋白酶及其抑制剂基因的克隆与表达[D];中国科学院研究生院(海洋研究所);2006年
7 高强;栉孔扇贝与海湾扇贝免疫学比较研究[D];中国科学院研究生院(海洋研究所);2007年
8 张明亮;栉孔扇贝生理活动对近海碳循环的影响[D];中国科学院研究生院(海洋研究所);2011年
9 程洁;栉孔扇贝(Chlamys farreri)大片段基因组文库的构建及应用分析[D];中国海洋大学;2010年
10 赵建民;扇贝大防御素和G型溶菌酶的基因克隆与重组表达[D];中国科学院研究生院(海洋研究所);2006年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 赵芙钗;栉孔扇贝和海湾扇贝的生殖腺的基本营养成分分析及其多糖的免疫活性测定[D];中国海洋大学;2012年
2 胥炜;海湾扇贝和栉孔扇贝EST分析及C型凝集素基因的克隆与分析[D];中国科学院研究生院(海洋研究所);2004年
3 吴龙涛;扇贝免疫相关因子基因的克隆与表达分析[D];中国科学院研究生院(海洋研究所);2004年
4 石芳芳;栉孔扇贝和海湾扇贝免疫防御特性的比较研究[D];中国科学院研究生院(海洋研究所);2006年
5 王宇;海湾扇贝近交衰退的遗传分子机理的研究[D];中国科学院研究生院(海洋研究所);2011年
6 贺桂珍;养殖扇贝类立克次氏体和病毒性病原研究[D];中国海洋大学;2003年
7 王斌;γ-氨基丁酸对栉孔扇贝免疫防御的影响[D];鲁东大学;2012年
8 邸炜鹏;氨海水与5-羟色胺对栉孔扇贝解剖卵体外促熟作用的研究[D];中国海洋大学;2010年
9 赵美丽;栉孔扇贝对石油烃蓄积及响应的初步研究[D];国家海洋局第一海洋研究所;2011年
10 秦贞奎;栉孔扇贝(Chlamys farreri)性别分化相关基因的筛选以及两个相关基因的表达分析[D];中国海洋大学;2011年
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