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中国担子菌酵母的分类与分子系统学研究

王启明  
【摘要】:本文对分离自我国代表性地区和生态环境中的担子菌酵母进行了常规和分子分类系统学研究,对其物种多样性进行了初步调查,并探讨了基因突变检测技术单链构象多态性(SSCP)在酵母菌分类学研究中应用的可行性。 用形态观察和关键生理生化特征测定等常规分类学方法对分离自北京、河北、吉林、辽宁、山西、陕西、湖北、山东、甘肃、青海和新疆等地区的担子菌酵母3000 余株进行了研究,首先进行了属的鉴定。以常规和rDNA 序列分析相结合对代表和疑难菌株170 余株进行了详细的分类学研究,共鉴定出76 个种(包括10 个未确定的分类群),隶属于14 个属。其中新种24 个(已发表7 个),分布在Bensingtonia、Bullera、Cryptococcus、Dioszegia、Pseudozyma、Sporobolomyces和Tilletiopsis 属中。如此高频度新种的发现,表明我国担子菌酵母物种多样性非常丰富,更多新分类群有待被发现。 基于18S rDNA、ITS 区(包括5.8S rDNA)和26S rDNA D1/D2 区序列构建的系统发育树表明,本文所鉴定的种分布在担子菌的层菌纲(Hymenomycetes)、锈菌纲(Urediniomycete)和黑粉菌纲(Ustilaginomycetes)内10 多个大类群中。通过新分类群在系统树上的不断加入,使担子菌酵母各类群间的系统发育关系更加明确。在层菌纲的Tremellales 大类群中划分出了两个新分支,分别为Huiaensis clade和Victoriae clade;在层菌纲的Trichosporonales 大类群中划分出Humicola clade;在锈菌纲的Agaricostilbum lineage 大类群中划分出了Ciliata clade 和Ruber clade两个新分支。这些新分支的确立,对担子菌酵母分类系统更自然化的调整具有重要意义。 本文的分子系统学研究结果表明,掷孢子的产生与否并不反映担子菌酵母类群间的系统演化关系,但是,掷孢子的形态与其它指标相结合对属及属以上等级的划分却有很好的应用前景。例如,本研究发现了一产生对称性掷孢子的新种Sporobolomyces symmetricus sp. nov.,在系统发育树上与其聚在一起并形成一个高支持率独立分支的其他种,包括Sporobolomyces gracilis、Sporobolomyces vermiculatus、Sporobolomyces coprosmae 和Sporobolomyces oryzicola,也产生对称性掷孢子,而包括模式种在内的Sporobolomyces 属其它种则产生典型的不对称


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