收藏本站
《中国科学院研究生院(水生生物研究所)》 2006年
收藏 | 手机打开
二维码
手机客户端打开本文

微卫星DNA及ISSR技术在原生动物中的应用研究

张文静  
【摘要】:首次把微卫星DNA以及相关的ISSR(inter simple sequence repeat)技术引入自由生活原生动物分子生物学领域。 一、对原生动物微卫星引物特异性和适用性进行了研究,采用寄生种类克氏锥虫的8个微卫星引物在4种自由生活的原生动物基因组上进行PCR扩增,取8条300-500bp扩增条带进行回收、克隆和测序。但测序结果所有种类都未得到相应微卫星DNA序列,表明在同一目以及更高分类单元扩不出相应的微卫星位点,原生动物微卫星引物特异性高。 二、运用探针杂交的方法从基因组中筛选微卫星位点。将随机引物分别对嗜热四膜虫和小眼虫进行随机多态DNA(RAPD,Random Amplification of Polymorphic DNA)扩增,建立部分基因组库,并通过Southern杂交和原位杂交,选择阳性核酸带测序。从70个RAPD体系中,独立筛选和鉴定8个微卫星位点序列,并估计了它们在基因组中的丰度。这是在自由生活原生动物中筛选微卫星的首次报道。研究表明:1)与哺乳动物相同,在这两种原生动物的基因组中CT重复显著多于GT重复;2)四膜虫总DNA中微卫星GT,CT重复的丰度显著小于小眼虫,并进一步探讨了原因可能是纤毛虫大核DNA的特性所致;3)发现大量的单核苷酸多聚A和T,推测是在逆转录转座时产生。 进而,运用ISSR技术对某些纤毛虫进行了遗传关系和种群遗传学的研究。 一、用13个ISSR引物对五株纤毛虫进行扩增,六个ISSR引物获得多态性片段。根据Nei氏遗传距离矩阵构建了五株纤毛虫的遗传关系树状图。UPGMA,NJ聚类图表明:两株嗜热四膜虫最先聚在一起;其次是褶累枝虫和多态喇叭虫聚在一起,然后再与嗜热四膜虫聚在一起;咽膜亚纲的绿草履虫形成独立的一枝。结果显示:1)缘毛亚纲纤毛虫可能是寡膜纲中较独特的一个类群,建议提升缘毛亚纲纤毛虫的分类地位;2)缘毛亚纲褶累枝虫与膜口亚纲嗜热四膜虫的亲缘关系近于咽膜亚纲绿草履虫,在寡膜纲中绿草履虫处于原始地位;3)五株纤毛虫基因组中均含有微卫星DNA序列:(GTG)_4、(GACA)_4、(AG)_8、(CAA)_6和(GAA)_6。 二、在五种缘毛类纤毛虫中进行遗传关系的ISSR研究,由UPGMA,NJ聚类图显示:伞形钟虫首先分离出来;螅状独缩虫和金龟累枝虫聚在一起。对比由核糖体小亚基RNA基因序列构建的系统发育树,发现:1)螅状独缩虫与累枝虫的关系近
【学位授予单位】:中国科学院研究生院(水生生物研究所)
【学位级别】:博士
【学位授予年份】:2006
【分类号】:Q789

【引证文献】
中国硕士学位论文全文数据库 前1条
1 孔焰;长江上游两种铜鱼属鱼类种间特异性ISSR分子标记及遗传多样性研究[D];西南大学;2010年
【参考文献】
中国期刊全文数据库 前4条
1 张亚平;从DNA序列到物种树[J];动物学研究;1996年03期
2 张文静,余育和,沈韫芬;微卫星DNA遗传分析在原生动物学中的研究进展[J];水生生物学报;2003年02期
3 张锡元,孙翀,晏婷婷,吴海,郑翌,李晓迎,缪炜,余育和,沈韫芬;螅状独缩虫(Cachesium polypinum)遗传多样性的RAPD分析[J];生物多样性;2000年03期
4 钱韦,葛颂,洪德元;采用RAPD和ISSR标记探讨中国疣粒野生稻的遗传多样性[J];植物学报;2000年07期
【共引文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 徐忠东;张雁;王伟;陶瑞松;;原生动物在环境监测中的应用研究[J];合肥师范学院学报;2009年06期
2 吴利;余育和;冯伟松;;PCR-DGGE技术在环境微型生物群落研究中的应用[J];合肥师范学院学报;2010年06期
3 张晗;高永超;沙伟;李汝玉;戴双;;紫萼藓科植物DNA提取及遗传多样性的分析[J];山东农业科学;2006年01期
4 李汝玉;李群;张文兰;张晗;宋国安;王东建;;利用SSR标记进行小麦品种鉴定和新品种保护研究[J];山东农业科学;2007年06期
5 陈静;胡晓辉;苗华荣;张建成;禹山林;;花生SRAP-PCR技术体系的优化[J];山东农业科学;2008年05期
6 王建成;段乃彬;李群;颜廷进;张文兰;戴双;;应用微核心种质进行作物重要经济性状的评价[J];山东农业科学;2008年08期
7 陈新;张士刚;魏海蓉;宗晓娟;王甲威;刘庆忠;;陕西核桃实生居群遗传多样性ISSR分析[J];山东农业科学;2012年05期
8 葛方兰;周小奎;;紫茉莉不同花色植株遗传变异的ISSR分析[J];安徽大学学报(自然科学版);2009年03期
9 徐晓毅;孙世群;褚巍;甘昊;;灰色局势决策法用于湖泊富营养化的评价[J];安徽化工;2007年05期
10 王在高;;因子分析法在巢湖富营养化评价中的应用[J];安徽建筑工业学院学报(自然科学版);2009年06期
中国重要会议论文全文数据库 前10条
1 张路;张启翔;潘会堂;;灰岩皱叶报春引种与利用研究进展[A];中国观赏园艺研究进展2011[C];2011年
2 张林;成海钟;周玉珍;娄晓鸣;吕文涛;张文婧;;62个朱顶红品种ISSR遗传多样性分析[A];中国球根花卉研究进展2011[C];2011年
3 方清茂;崔光红;黄璐琦;张美;周先建;;栽培与野生何首乌种质资源遗传多样性的ISSR分析[A];中药饮片质量分析与中药鉴别技术交流研讨会论文集[C];2009年
4 沈涛;党安荣;;基于GIS的北京山区非点源污染风险性研究[A];中国测绘学会第九次全国会员代表大会暨学会成立50周年纪念大会论文集[C];2009年
5 许宝红;肖调义;金红春;张婷;李德亮;陈开健;杨昌珍;刘寅初;;不同养殖类型水体浮游动物多样性调查与评价[A];中国南方十六省(市、区)水产学会渔业学术论坛第二十六次学术交流大会论文集(上册)[C];2010年
6 倪中福;张义荣;梁荣奇;刘广田;孙其信;;分子标记与小麦遗传多样性评价研究[A];21世纪作物科技与生产发展学术讨论会论文集[C];2002年
7 刘庆昌;翟红;王玉萍;;甘薯细胞工程与分子育种的研究现状[A];2003年全国作物遗传育种学术研讨会论文集[C];2003年
8 刘庆昌;翟红;王玉萍;;甘薯细胞工程与分子育种研究进展[A];中国作物学会2005年学术年会论文集[C];2005年
9 王英;庄南生;高和琼;黄东益;;甘蔗种质遗传基础的ISSR分析[A];中国作物学会2007年全国作物遗传育种学术研讨会论文集[C];2007年
10 谭围;王中铎;郭昱嵩;刘楚吾;刘丽;;四带笛鲷线粒体基因组序列结构及进化[A];经济发展方式转变与自主创新——第十二届中国科学技术协会年会(第三卷)[C];2010年
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 王勇;细基格孢属、匍柄霉属及其近似属的形态学与分子系统学研究[D];山东农业大学;2010年
2 伊珍珍;旋唇纲、寡膜纲和前口纲纤毛虫原生动物研究[D];中国海洋大学;2009年
3 苗贵东;半滑舌鳎微卫星标记开发、应用及遗传连锁图谱的构建[D];中国海洋大学;2010年
4 秦伟;新疆野苹果繁育特性及种质资源亲缘关系研究[D];新疆农业大学;2010年
5 钱一武;北京市门头沟区生态修复综合效益价值评估研究[D];北京林业大学;2011年
6 何小勇;翅荚木种源遗传多样性及其抗低温胁迫能力研究[D];中南林业科技大学;2007年
7 唐丽;湖南南天竹遗传多样性及园林利用评价体系研究[D];中南林业科技大学;2007年
8 郑维列;西藏色季拉山长鞭红景天种群生态学特性研究[D];中南林业科技大学;2010年
9 文亚峰;人心果品种资源亲缘关系及其授粉亲和性的研究[D];中南林业科技大学;2006年
10 赵博;十字花科植物分子系统发育研究[D];武汉大学;2010年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 杨丹;湖北省油菜菌核病病菌多样性研究[D];华中农业大学;2010年
2 潘慧;杏鲍菇优良杂交子的初步选育[D];华中农业大学;2010年
3 王瑞文;紫薇开花生物学特性及杂交育种的初步研究[D];华中农业大学;2010年
4 罗杨;柑橘变异材料的遗传鉴定与品质分析[D];华中农业大学;2010年
5 郑瑜;银杏核心种质构建初探[D];华中农业大学;2010年
6 胡佳;鲟形目部分种类基于线粒体COⅠ基因的分子进化研究[D];华中农业大学;2010年
7 闫小丹;八倍体小偃麦与天蓝偃麦草杂交后代的分子细胞遗传学研究[D];哈尔滨师范大学;2010年
8 隋丰阳;松嫩平原部分地区湖泊、泡沼藻类植物的初步研究[D];哈尔滨师范大学;2010年
9 吴颖靖;鄱阳湖湖区水体营养盐分布格局及富营养化动态分析[D];中南林业科技大学;2009年
10 卫泽;棉花分子图谱构建、偏分离位点的比较作图和棉花品种遗传多样性分析[D];山东农业大学;2010年
【同被引文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 熊国强,邓思明,臧增嘉,许学龙;中国沿海日本鳗鲡幼苗群体鉴别研究[J];动物学报;1992年03期
2 李思发,朱泽闻,邹曙明,赵金良,蔡完其;鲂属团头鲂、三角鲂及广东鲂种间遗传关系及种内遗传差异[J];动物学报;2002年03期
3 李国庆,伍育源,秦志峰,刘运莲;鱼类遗传多样性研究[J];水产科学;2004年08期
4 韩晓磊;徐建荣;郁建峰;伊纪峰;杨家新;许璞;;鳡遗传多样性的ISSR分析[J];水产科学;2009年09期
5 刘建康,曹文宣;长江流域的鱼类资源及其保护对策[J];长江流域资源与环境;1992年01期
6 曹文宣;长江上游特有鱼类自然保护区的建设及相关问题的思考[J];长江流域资源与环境;2000年02期
7 曹文宣;;有关长江流域鱼类资源保护的几个问题[J];长江流域资源与环境;2008年02期
8 杜诚,卢迈新,叶星,劳海华,黄樟翰,白俊杰;5个罗非鱼群体的遗传分析与分子标记[J];大连水产学院学报;2005年01期
9 冷永智;何立太;魏清和;;葛洲坝水利枢纽截流后长江上游铜鱼的种群生物学及资源量估算[J];淡水渔业;1984年05期
10 刘乐和;;长江葛洲坝水利枢纽兴建后对中、上游主要经济鱼类影响的综合评价[J];淡水渔业;1991年03期
中国博士学位论文全文数据库 前3条
1 刘云国;三种重要海水养殖鱼类的分子遗传学研究[D];中国海洋大学;2005年
2 袁万安;法医鱼类学种属鉴别初步研究[D];四川大学;2006年
3 高欣;长江珍稀及特有鱼类保护生物学研究[D];中国科学院研究生院(水生生物研究所);2007年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 王希道;不同鳗鱼种群遗传结构和种质鉴定分子遗传标记研究[D];南京农业大学;2000年
2 杨慧荣;用RAPD技术研究几种鲷科鱼类的遗传变异和系统进化[D];华中农业大学;2003年
3 曾祥波;鲢、鳙和草鱼仔幼鱼耳石形态及种类鉴别中的应用[D];华中农业大学;2001年
4 房新英;RAPD和ISSR技术在牙鲆遗传多样性研究中的应用[D];中国海洋大学;2005年
5 严莉;长江铜鱼种群生物学及遗传多样性分析[D];华中农业大学;2005年
6 吴兴兵;7种重要养殖鱼类的同工酶和ISSR分析[D];南京师范大学;2006年
7 龚金波;中国近海两种鲷科鱼类遗传结构及遗传多样性分析[D];华中农业大学;2006年
8 李娇;江鳕微卫星标记筛选鉴定及黑龙江地区群体遗传多样性分析[D];吉林大学;2007年
9 李飞;三峡库区内外长吻鮠(Leiocasis longirostris Günther)线粒体控制区的遗传多样性研究[D];西南大学;2007年
10 郭金峰;三个黄颡鱼群体遗传多样性的微卫星标记分析[D];山东农业大学;2007年
【二级参考文献】
中国期刊全文数据库 前6条
1 兰宏,张文艳,王文,宿兵,施立明;滇金丝猴的随机扩增多态DNA与遗传多样性分析[J];中国科学C辑:生命科学;1996年03期
2 张锡元,张德春,杨代淑,邓凤姣,余来宁,方耀林;长江鲢遗传多样性的随机扩增多态DNA分析[J];水产学报;1999年S1期
3 施立明;;遗传多样性及其保存[J];生物科学信息;1990年04期
4 陈宜瑜;;淡水生态系统中的若干生物多样性问题[J];生物科学信息;1990年05期
5 张德春,张锡元,杨代淑,余来宁,方耀林,邓凤姣,刘思扬;长江鳙遗传多样性的研究[J];武汉大学学报(自然科学版);1999年06期
6 谢中稳,葛颂,洪德元;从普通野生稻硅胶干燥的小量叶片中制备DNA用于RAPD分析和总DNA库的建立(英文)[J];植物学报;1999年08期
【相似文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 徐玲玲;岳敏;吴艳花;顾为望;陈振文;;西藏小型猪群体遗传结构分析[J];中国比较医学杂志;2009年02期
2 朱泽远;王亚菊;施用晖;乐国伟;;荧光标记微卫星分析人工饲养中华绒螯蟹的遗传多样性[J];中国海洋大学学报(自然科学版);2007年04期
3 田强;刘健;廖正录;张芸;史忠辉;陈祥;张勇;简承松;;利用微卫星标记分析贵州白水牛与普通水牛的遗传多样性与亲缘关系[J];动物学杂志;2007年04期
4 吉磊;区又君;李加儿;;卵形鲳鲹3个养殖群体的微卫星多态性分析[J];热带海洋学报;2011年03期
5 张文静;余育和;沈韫芬;颜庆云;;七株眼虫基于微卫星DNA指纹图谱的区分和关系分析[J];湖泊科学;2006年03期
6 全迎春;孙效文;梁利群;;东北大口鲇2个群体的微卫星DNA多态分析(英文)[J];遗传学报;2006年10期
7 廖小林,俞小牧,谭德清,童金苟;长江水系草鱼遗传多样性的微卫星DNA分析[J];水生生物学报;2005年02期
8 张文静,余育和,沈韫芬;微卫星DNA遗传分析在原生动物学中的研究进展[J];水生生物学报;2003年02期
9 李作洲;暴朝霞;黄宏文;;药用植物天麻(Gastrodia elata Bl.)的等位酶遗传变异及其变型间的遗传关系[J];植物科学学报;2011年01期
10 常青,曹发华,朱立峰,张保卫,周开亚;长江下游地区夜鹭种群微卫星变异及遗传多样性[J];动物学报;2005年04期
中国重要会议论文全文数据库 前10条
1 陈智华;田风贵;钟金城;;牛种的遗传多样性及其系统分化研究[A];中国畜牧兽医学会家畜生态学分会第七届全国代表大会暨学术研讨会论文集[C];2008年
2 李木旺;侯成香;苗雪霞;徐安英;孙平江;张月华;黄勇平;;用ISSR方法进行家蚕品种间的分子系统学研究[A];中国蚕学会第四届青年学术研讨会会议论文集[C];2004年
3 李本金;兰成忠;陈庆河;赵健;翁启勇;;福建省晚疫病菌SRAP遗传多样性分析[A];中国植物病理学会2009年学术年会论文集[C];2009年
4 王志勇;刘建秀;;狗牙根种质资源遗传多样性与亲缘关系的ISSR分析[A];中国植物学会七十五周年年会论文摘要汇编(1933-2008)[C];2008年
5 刘双;杨焕民;吴秀芬;唐峰;;利用微卫星标记分析6个品种鹅的遗传多样性[A];中国畜牧兽医学会2006学术年会论文集(上册)[C];2006年
6 李喜凤;杜云锋;张红梅;郝哲;;蒲公英属4种植物遗传关系与遗传多样性的RAPD分析[A];第十届全国中药和天然药物学术研讨会论文集[C];2009年
7 肖炜;张沅;孙东晓;王志刚;;中国地方猪种血液蛋白遗传多样性的研究[A];第七届北京青年科技论文评选获奖论文集[C];2003年
8 林郑和;陈常颂;陈荣冰;;我国39个茶树品种的RAPD分析[A];第二届热带亚热带植物资源的遗传多样性与基因发掘利用研讨会论文集[C];2006年
9 武艳平;马月辉;韩俊文;;微卫星DNA检测五个山羊品种的遗传多样性[A];第十次全国畜禽遗传标记研讨会论文集[C];2006年
10 王含彦;魏育明;颜泽洪;郑有良;;硬粒小麦EST-SSR变异与群体遗传结构分析[A];第九届西南三省一市生物化学与分子生物学学术交流会论文集[C];2008年
中国重要报纸全文数据库 前10条
1 本报记者 游雪晴;中国的人类遗传多样性研究成果丰硕[N];科技日报;2001年
2 记者 胡德荣;亚洲人群遗传多样性研究获最新成果[N];健康报;2009年
3 李倩;我国永生细胞库初具规模[N];人民日报;2007年
4 胡云章;绚丽的民族文化 丰富的遗传多样性[N];大众科技报;2008年
5 山东省淡水水产研究所 杨玲 巩俊霞 张延华 郑慧丽;原生动物引起的鳃病[N];江苏农业科技报;2006年
6 李倩;不同民族永生细胞库建设取得进展[N];大众科技报;2007年
7 记者 刘欣 陈云芬;保护和利用作物遗传多样性 控制病虫害促进可持续农业发展国际执委会会议在昆举行[N];云南日报;2007年
8 赵春光;如何防治龟鳖原生动物寄生虫病[N];中国渔业报;2004年
9 记者 耀辉;云南5成果喜获国家科技奖[N];云南经济日报;2006年
10 刘燕玲;深入研究珍稀濒危中药资源保护[N];健康报;2006年
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 张文静;微卫星DNA及ISSR技术在原生动物中的应用研究[D];中国科学院研究生院(水生生物研究所);2006年
2 杨述林;1.十八个中国地方猪品种遗传多样性分析  2.猪特定群体定位QTL的效率研究[D];华中农业大学;2004年
3 马殿荣;杂草稻遗传多样性及其对稻田生态系统影响的研究[D];沈阳农业大学;2009年
4 李锡香;黄瓜种质遗传多样性的形态和分子评价及其亲缘关系研究[D];中国农业科学院;2002年
5 陈庆山;大豆灰斑病种质资源遗传多样性的RAPD和SSR分析[D];东北农业大学;2001年
6 杨晓军;藏系绵羊遗传多样性及其品种(系)分化的研究[D];甘肃农业大学;2001年
7 白史且;中国假俭草遗传多样性研究[D];四川大学;2002年
8 蔡礼鸿;枇杷属的等位酶遗传多样性和种间关系及品种鉴定研究[D];华中农业大学;2000年
9 马朝芝;甘蓝型油菜遗传多样性和杂种优势的研究[D];华中农业大学;2002年
10 刘振虎;中国苜蓿品种资源遗传多样性研究[D];北京林业大学;2004年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 闫景娟;中国新疆八个绵羊群体微卫星DNA的遗传多样性研究[D];内蒙古农业大学;2004年
2 周裕华;人工雌核发育鲢及其近交后代微卫星分子标记研究[D];华中农业大学;2007年
3 刘晓燕;濒危植物华东黄杉遗传多样性分析及保育[D];南昌大学;2007年
4 杨致荣;SSR标记鉴定水稻AA组种质资源的遗传多样性及其遗传关系[D];山西农业大学;2004年
5 殷玲;基于微卫星标记及线粒体基因序列的云南省6个东方蜜蜂(Apis cerena)群体遗传多样性及遗传分化研究[D];扬州大学;2009年
6 朱柏芳;中国特有濒危植物穗花杉的遗传多样性分析及其保育[D];南昌大学;2005年
7 文自翔;小豆种质资源遗传多样性的RAPD分析及生态类群遗传关系研究[D];新疆农业大学;2004年
8 陈卫国;利用SSR标记分析27个玉米群体的遗传关系[D];山西农业大学;2005年
9 王效宁;海南普通野生稻(Oryza rufipogon Griff.)遗传多样性研究[D];华南热带农业大学;2006年
10 钟昌松;普通和特用玉米遗传多样性的SSR标记研究[D];西南交通大学;2006年
 快捷付款方式  订购知网充值卡  订购热线  帮助中心
  • 400-819-9993
  • 010-62791813
  • 010-62985026